Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1848
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1848, 365 aa
1>>>pF1KE1848 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8475+/-0.000782; mu= 15.4592+/- 0.047
mean_var=95.3057+/-19.175, 0's: 0 Z-trim(111.1): 33 B-trim: 299 in 1/49
Lambda= 0.131376
statistics sampled from 12122 (12152) to 12122 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.737), E-opt: 0.2 (0.373), width: 16
Scan time: 3.080
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 2557 494.4 6.2e-140
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 1540 301.7 6.5e-82
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 1232 243.3 2.3e-64
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 847 170.3 2.3e-42
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 835 168.1 1.1e-41
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 819 165.0 8.8e-41
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 794 160.3 2.3e-39
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 761 154.1 1.9e-37
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 761 154.1 1.9e-37
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 738 149.7 3.7e-36
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 738 149.7 3.7e-36
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 724 147.0 2.3e-35
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 715 145.3 6.7e-35
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 712 144.7 1.1e-34
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 699 142.3 6.2e-34
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 674 137.5 1.6e-32
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 674 137.6 1.7e-32
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 597 123.0 4.1e-28
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 597 123.0 4.2e-28
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 564 116.8 3.5e-26
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 557 115.4 8.4e-26
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 403 86.2 4.9e-17
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 403 86.2 5.1e-17
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 389 83.5 3e-16
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 295 65.7 7.1e-11
>>CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 (365 aa)
initn: 2557 init1: 2557 opt: 2557 Z-score: 2625.7 bits: 494.4 E(32554): 6.2e-140
Smith-Waterman score: 2557; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLDGSPLARWLAAAFGLTLLLAALRPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHYKACD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MLDGSPLARWLAAAFGLTLLLAALRPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHYKACD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRASLLKRGFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRASLLKRGFK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKFVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKFVK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EFLGRRSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFHEVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 EFLGRRSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFHEVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPSFCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 KHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPSFCL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AGRFSPGTAGRRCHREKNCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQREEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AGRFSPGTAGRRCHREKNCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQREEV
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 YTCKG
:::::
CCDS31 YTCKG
>>CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 (357 aa)
initn: 1222 init1: 452 opt: 1540 Z-score: 1584.1 bits: 301.7 E(32554): 6.5e-82
Smith-Waterman score: 1540; 61.2% identity (82.9% similar) in 356 aa overlap (12-364:6-356)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLDGSPLARWLAAAFGLTLLLAALRPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQ--AHYKA
: :.. ::: .:.:::::: : :: .: : :: :: :
CCDS11 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CDRLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRASLLKRG
:: ::: :.:...:::.::.:::: .:. .. :::::::: :::::.::::. .:::::
CCDS11 CDLLKLSRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRM--GLLKRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKF
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CCDS11 FKETAFLYAVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VKEFLG-RRSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFH
...::: .:..::::::.: ::. ::.:..:.:..::::::::::::.:::::.::.::.
CCDS11 LSNFLGSKRGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EVGKHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPS
:.:. :: .:..:.::.:.:::: :. .: : .:. . ::. .::...::::
CCDS11 ETGQVLKLRYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPAR---QGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPS
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FCLAGRFSPGTAGRRCHREKNCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQR
:: ...::::::: : :: .: :.:::::..::::.:. :.:::.:::::::.::.:.
CCDS11 FCRPSKYSPGTAGRVCSREASCSSLCCGRGYDTQSRLVAFSCHCQVQWCCYVECQQCVQE
290 300 310 320 330 340
360
pF1KE1 EEVYTCKG
: :::::
CCDS11 ELVYTCKH
350
>>CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 (329 aa)
initn: 1187 init1: 452 opt: 1232 Z-score: 1269.1 bits: 243.3 E(32554): 2.3e-64
Smith-Waterman score: 1232; 60.3% identity (82.1% similar) in 302 aa overlap (12-310:6-302)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLDGSPLARWLAAAFGLTLLLAALRPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQ--AHYKA
: :.. ::: .:.:::::: : :: .: : :: :: :
CCDS82 MRPPPALALAGLCLLALPAAAASYFGLTGREVLTPFPGLGTAAAPAQGGAHLKQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CDRLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRASLLKRG
:: ::: :.:...:::.::.:::: .:. .. :::::::: :::::.::::. .:::::
CCDS82 CDLLKLSRRQKQLCRREPGLAETLRDAAHLGLLECQFQFRHERWNCSLEGRM--GLLKRG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKF
:::::::::.:::.:::.::.:::::::::::::..: ::.:.::::: ::::::::.::
CCDS82 FKETAFLYAVSSAALTHTLARACSAGRMERCTCDDSPGLESRQAWQWGVCGDNLKYSTKF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VKEFLG-RRSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFH
...::: .:..::::::.: ::. ::.:..:.:..::::::::::::.:::::.::.::.
CCDS82 LSNFLGSKRGNKDLRARADAHNTHVGIKAVKSGLRTTCKCHGVSGSCAVRTCWKQLSPFR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 EVGKHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPS
:.:. :: .:..:.::.:.:::: :. .: : .:. . ::. .::...::::
CCDS82 ETGQVLKLRYDSAVKVSSATNEALGRLELWAPAR---QGSLTKGLAPRSGDLVYMEDSPS
240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FCLAGRFSPGTAGRRCHREKNCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQR
:: ...::::::
CCDS82 FCRPSKYSPGTAGWSAVARSQLITTSTSRIQAILPSQLPE
290 300 310 320
>>CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 (370 aa)
initn: 779 init1: 254 opt: 847 Z-score: 874.0 bits: 170.3 E(32554): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 847; 37.0% identity (64.9% similar) in 373 aa overlap (7-363:7-369)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLDGSPLARWLAAAFGLTL--LLAAL--RPSAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHY
: :..:.. :.: : ::: :. ..:... : : : . :
CCDS87 MGLWALLPGWVSATLLLALAALPAALAANSSGRWWGIVNVASSTNL---LTDSKSLQLVL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KACDRLKLERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVSMSALECQFQFRFERWNC-TLEGRYR-ASL
. .: : :::::. :..::. ... ... .. ::..::: .:::: : : . ...
CCDS87 EPSLQL-LSRKQRRLIRQNPGILHSVSGGLQSAVRECKWQFRNRRWNCPTAPGPHLFGKI
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LKRGFKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKY
..:: .::::..::.:::.::..:..:: : .: :::: . :.::::.::. .
CCDS87 VNRGCRETAFIFAITSAGVTHSVARSCSEGSIESCTCDYRRRGPGGPDWHWGGCSDNIDF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SSKFVKEFLGR-RSSKDLRARVDFHNNLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQL
. : .::. ....::: ...::: .: .. . .. :::::.:::::::::: .:
CCDS87 GRLFGREFVDSGEKGRDLRFLMNLHNNEAGRTTVFSEMRQECKCHGMSGSCTVRTCWMRL
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 APFHEVGKHLKHKYETALKVGSTTNEAAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTP---ELV
.. :: :. ... : .: :. :. :.. :: . : .::
CCDS87 PTLRAVGDVLRDRFDGASRV------LYGNRGSNRASRAELLRLEPEDPAHKPPSPHDLV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 HLDDSPSFCL-AGRF-SPGTAGRRCHREK----NCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVR
... ::.:: .::. . ::::: :. . .:: .:::::: :... ::. :.: .
CCDS87 YFEKSPNFCTYSGRLGTAGTAGRACNSSSPALDGCELLCCGRGHRTRTQRVTERCNCTFH
300 310 320 330 340 350
350 360
pF1KE1 WCCYVECRQCTQREEVYTCKG
:::.: ::.::. . .. :
CCDS87 WCCHVSCRNCTHTRVLHECL
360 370
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 583 init1: 392 opt: 835 Z-score: 862.1 bits: 168.1 E(32554): 1.1e-41
Smith-Waterman score: 835; 39.0% identity (67.6% similar) in 318 aa overlap (59-364:38-349)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 AYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHYKACDRLK-LERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVS
:... : .:: .:. : . .. :...
CCDS33 WIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIVIGEGAQ
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 MSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRA--SLLKRGFKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGR
:. :::.:::: ::::. :. . . :. : .:.:: :::..::..::.. ::: :
CCDS33 MGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVTAACSQGN
70 80 90 100 110 120
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 MERCTCD-EAPDLENR-EAWQWGGCGDNLKYSSKFVKEFL-GRRSSKDLRARVDFHNNLV
. : :: : :. :.:.::::. ...:. : ..:. .:. .:. : ...::: .
CCDS33 LSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLMNLHNNEA
130 140 150 160 170 180
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 GVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFHEVGKHLKHKYETALKVGSTTNEAAG
: ::.. .. :::::::::::..::: : :.:::. ::.::..:..: :..
CCDS33 GRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQV-----EVV-
190 200 210 220 230 240
270 280 290 300 310
pF1KE1 EAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPELVHLDDSPSFCL--AGRFSPGTAGRRCHREK---
.:. . : : : .::... ::..: :. : :: :: :.: .
CCDS33 RASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPGA
250 260 270 280 290 300
320 330 340 350 360
pF1KE1 -NCESICCGRGHNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQREEVYTCKG
.:...:::::.::.. . . :.:. .:::.:.: :..: ::.:::
CCDS33 DGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
310 320 330 340
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 712 init1: 335 opt: 819 Z-score: 845.7 bits: 165.0 E(32554): 8.8e-41
Smith-Waterman score: 819; 39.3% identity (70.3% similar) in 323 aa overlap (57-364:41-351)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SAAYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHYKACDRLK-LERKQRRMCRRDPGVAETLVEA
..:..:: : ..: .::.:. : ... ..
CCDS22 RLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRNLEVMDSVRRG
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 VSMSALECQFQFRFERWNC-TLEGR-YRASLLKRGFKETAFLYAISSAGLTHALAKACSA
.... :::.::: .:::: ::.. .... .: .:.::.:::::::.. :...:::.
CCDS22 AQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGVAFAVTRACSS
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190
pF1KE1 GRMERCTCDEAPDLENREAWQWGGCGDNLKYSSKFVKEFLG-RRSSKDL---RARVDFHN
:..:.: ::.. . ...::.::.::. :. : . :. :. :: :: ...::
CCDS22 GELEKCGCDRTVHGVSPQGFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHN
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 NLVGVKVIKAGVETTCKCHGVSGSCTVRTCWRQLAPFHEVGKHLKHKYETALKVGSTTNE
: .: :.: . ... :::::::::: :.:::: . ::..::. ::.:.. : .: .
CCDS22 NEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEV---EPR
200 210 220 230 240
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AAGEAGAISPPRGRASGAGGSDPLPRTPE-LVHLDDSPSFCLAGRFSP--GTAGRRCHRE
.: . :. : .. . :.: : ::.:. ::.:: : :: :: :..
CCDS22 RVGSSRALVPRNAQFK--------PHTDEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTRGRTCNKT
250 260 270 280 290
320 330 340 350 360
pF1KE1 KN----CESICCGRG-HNTQSRVVTRPCQCQVRWCCYVECRQCTQREEVYTCKG
.. :: .::::: :..: ... : :.:. .:::.:.:::: . :..::.
CCDS22 SKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAER-CSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 669 init1: 390 opt: 794 Z-score: 820.1 bits: 160.3 E(32554): 2.3e-39
Smith-Waterman score: 794; 38.1% identity (63.8% similar) in 318 aa overlap (59-364:38-349)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 AYFGLTGSEPLTILPLTLEPEAAAQAHYKACDRLK-LERKQRRMCRRDPGVAETLVEAVS
:... : .:: .:. : . .. :. .
CCDS26 CLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIVIGEGSQ
10 20 30 40 50 60
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 MSALECQFQFRFERWNCTLEGRYRA--SLLKRGFKETAFLYAISSAGLTHALAKACSAGR
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CCDS26 MGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAITAACTQGN
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CCDS84 GANFTAARQGYR-RAT---------RT-DLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTS
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CCDS84 QT
390
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]