FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1831, 349 aa
1>>>pF1KE1831 349 - 349 aa - 349 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3793+/-0.000946; mu= 16.8408+/- 0.057
mean_var=84.1184+/-16.607, 0's: 0 Z-trim(106.9): 28 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.139839
statistics sampled from 9249 (9276) to 9249 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.65), E-opt: 0.2 (0.285), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 2473 508.7 2.9e-144
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 2026 418.5 4.1e-117
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 1232 258.4 7.1e-69
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 1232 258.4 7.4e-69
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 1212 254.3 1.1e-67
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 1206 253.1 2.6e-67
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CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 1183 248.5 6.8e-66
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 1144 240.6 1.5e-63
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 1143 240.4 1.7e-63
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CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 1131 238.0 9.5e-63
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 1124 236.6 2.5e-62
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 1106 232.9 2.7e-61
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 976 206.7 2.5e-53
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 910 193.4 2.5e-49
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 905 192.4 4.9e-49
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 840 179.3 4.4e-45
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 840 179.3 4.5e-45
CCDS31045.1 WNT9A gene_id:7483|Hs108|chr1 ( 365) 835 178.3 9e-45
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 827 176.6 2.7e-44
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 708 152.7 4.9e-37
CCDS2426.1 WNT10A gene_id:80326|Hs108|chr2 ( 417) 683 147.6 1.7e-35
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 666 144.2 1.7e-34
CCDS82147.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 329) 603 131.4 1e-30
>>CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 (349 aa)
initn: 2473 init1: 2473 opt: 2473 Z-score: 2703.5 bits: 508.7 E(32554): 2.9e-144
Smith-Waterman score: 2473; 100.0% identity (100.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 NLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE1 ADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
310 320 330 340
>>CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 (349 aa)
initn: 2011 init1: 2011 opt: 2026 Z-score: 2216.1 bits: 418.5 E(32554): 4.1e-117
Smith-Waterman score: 2026; 77.9% identity (94.0% similar) in 349 aa overlap (1-349:1-349)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
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CCDS26 MNRKARRCLGHLFLSLGMVYLRIGGFSSVVALGASIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVT
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CCDS26 VIGEGSQMGLDECQFQFRNGRWNCSALGERTVFGKELKVGSREAAFTYAIIAAGVAHAIT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKNARRLM
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CCDS26 AACTQGNLSDCGCDKEKQGQYHRDEGWKWGGCSADIRYGIGFAKVFVDAREIKQNARTLM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQVEV
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CCDS26 NLHNNEAGRKILEENMKLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPQFRELGYVLKDKYNEAVHVEP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 VRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRTSPG
::::: ..::::.::. ::.:::.:::::::::::::::: .::::::::: ::.:.:
CCDS26 VRASRNKRPTFLKIKKPLSYRKPMDTDLVYIEKSPNYCEEDPVTGSVGTQGRACNKTAPQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KE1 ADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
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CCDS26 ASGCDLMCCGRGYNTHQYARVWQCNCKFHWCCYVKCNTCSERTEMYTCK
310 320 330 340
>>CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (372 aa)
initn: 1236 init1: 429 opt: 1232 Z-score: 1350.0 bits: 258.4 E(32554): 7.1e-69
Smith-Waterman score: 1232; 52.2% identity (78.0% similar) in 322 aa overlap (31-349:46-361)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
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CCDS84 QLKTEGSLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMR
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110
pF1KE1 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALG-EKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAV
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CCDS84 SVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAI
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEG-WKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIK-KNAR
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CCDS84 TRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDAR
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQ
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CCDS84 ALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQ
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRT
: ... . .: .: .:.. .:::::...::.:: : :.::.:: ::.:..:
CCDS84 VMATQDG----ANFTAARQ--GYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKT
260 270 280 290 300
300 310 320 330 340
pF1KE1 SPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
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CCDS84 SKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWL
310 320 330 340 350 360
CCDS84 DQT
370
>>CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 (391 aa)
initn: 1236 init1: 429 opt: 1232 Z-score: 1349.7 bits: 258.4 E(32554): 7.4e-69
Smith-Waterman score: 1232; 52.2% identity (78.0% similar) in 322 aa overlap (31-349:65-380)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAII
:::: .::..::::. ::: .:: :: .
CCDS84 ASARLGLACLLLLLLLTLPARVDTSWWYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMR
40 50 60 70 80 90
70 80 90 100 110
pF1KE1 VIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALG-EKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAV
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CCDS84 SVGEGAREWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAI
100 110 120 130 140 150
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEG-WKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIK-KNAR
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CCDS84 TRACSQGELSVCSCDPYTRGRHHDQRGDFDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLKDAR
160 170 180 190 200 210
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYNAAVQ
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CCDS84 ALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQ
220 230 240 250 260 270
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRLCNRT
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CCDS84 VMATQDG----ANFTAARQ--GYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKT
280 290 300 310 320
300 310 320 330 340
pF1KE1 SPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
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CCDS84 SKGTDGCEIMCCGRGYDTTRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWL
330 340 350 360 370 380
CCDS84 DQT
390
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 1168 init1: 397 opt: 1212 Z-score: 1328.5 bits: 254.3 E(32554): 1.1e-67
Smith-Waterman score: 1212; 49.4% identity (73.3% similar) in 352 aa overlap (3-349:8-351)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSR
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CCDS22 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGV
... . .:::..:.::::::: :::::.: :::. . :.:::::.:::..:::
CCDS22 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 AHAVTAACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKN
: ::: :::.:.: .::::: .: : :..:.::: .. ::. ::. :::.:: .:.
CCDS22 AFAVTRACSSGELEKCGCDRTVHGVSPQ--GFQWSGCSDNIAYGVAFSQSFVDVRERSKG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 A---RRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKY
: : ::::::::::::.. .:..::::::::::: .:::: ..: ::.::: ::::.
CCDS22 ASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKTCWRAVPPFRQVGHALKEKF
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NAAVQVEVVR--ASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQ
..:..:: : .:: : : :.. . . ::::.: ::..::.: .: .::.
CCDS22 DGATEVEPRRVGSSRALVP---RNAQFKPHT---DEDLVYLEPSPDFCEQDMRSGVLGTR
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KE1 GRLCNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
:: ::.:: . :::. .:::::..: : . .:.::::::::::: :.. .:. ::.
CCDS22 GRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCRQCQRLVELHTCR
300 310 320 330 340 350
>>CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 (359 aa)
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Smith-Waterman score: 1206; 49.4% identity (74.8% similar) in 326 aa overlap (32-349:42-359)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 HRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSRPDAIIV
.::. .:...:::.: :: .:: . .
CCDS85 LLSSWAQLLTDANSWWSLALNPVQRPEMFIIGAQPVCSQLPGLSPGQRKLCQLYQEHMAY
20 30 40 50 60 70
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGVAHAVTA
:::::. ::.:::.::: :::::. . .:::. ...::::.:::.:..::::..:..
CCDS85 IGEGAKTGIKECQHQFRQRRWNCSTADNASVFGRVMQIGSRETAFTHAVSAAGVVNAISR
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170
pF1KE1 ACSQGNLSNCGCDREKQGYYNQAEGWKWGGCSADVRYGIDFSRRFVDAREIKKN------
:: .:.::.:::.: . . . : ::::. .:.:: :...:::::: .::
CCDS85 ACREGELSTCGCSRTARPK-DLPRDWLWGGCGDNVEYGYRFAKEFVDAREREKNFAKGSE
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 --ARRLMNLHNNEAGRKVLEDRMQLECKCHGVSGSCTTKTCWTTLPKFREVGHLLKEKYN
.: ::::.::::::... .. ::::::::::. :::: : .::.:: :::::.
CCDS85 EQGRVLMNLQNNEAGRRAVYKMADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLAEFRKVGDRLKEKYD
200 210 220 230 240 250
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 AAVQVEVVRASRLRQPTFLRIKQLRSYQKPMETDLVYIEKSPNYCEEDAATGSVGTQGRL
.:. ..:.: .::. . . .: ::::.. ::.:: .. .:::.::::::
CCDS85 SAAAMRVTRKGRLELVN-------SRFTQPTPEDLVYVDPSPDYCLRNESTGSLGTQGRL
260 270 280 290 300
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pF1KE1 CNRTSPGADGCDTMCCGRGYNTHQYTKVWQCNCKFHWCCFVKCNTCSERTEVFTCK
::.:: : :::. :::::::: . ..: .:.:::::::::.:. :.: .. . ::
CCDS85 CNKTSEGMDGCELMCCGRGYNQFKSVQVERCHCKFHWCCFVRCKKCTEIVDQYICK
310 320 330 340 350
>>CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 (365 aa)
initn: 715 init1: 715 opt: 1183 Z-score: 1296.7 bits: 248.5 E(32554): 6.6e-66
Smith-Waterman score: 1183; 47.9% identity (73.8% similar) in 332 aa overlap (26-349:42-365)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MHRNFRKWIFYVFLCFGVLYVKLGALSSVVALGANIICNKIPGLAPRQRAICQSR
.: : .::. .:... ::. :. .:.
CCDS58 LVALAIFFSFAQVVIEANSWWSLGMNNPVQMSEVYIIGAQPLCSQLAGLSQGQKKLCHLY
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PDAIIVIGEGAQMGINECQYQFRFGRWNCSALGEKTVFGQELRVGSREAAFTYAITAAGV
: . :::::. ::.::::::: :::::.. . .:::. ...::::.:::::..::::
CCDS58 QDHMQYIGEGAKTGIKECQYQFRHRRWNCSTVDNTSVFGRVMQIGSRETAFTYAVSAAGV
80 90 100 110 120 130
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180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270 280
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CCDS58 CK
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CCDS46 VNAMSRACREGELSTCGCSRAARPK-DLPRDWLWGGCGDNIDYGYRFAKEFVDARERERI
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CCDS46 HAKGSYESARILMNLHNNEAGRRTVYNLADVACKCHGVSGSCSLKTCWLQLADFRKVGDA
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CCDS46 LKEKYDSAAAMRLNSRGKLVQVN-------SRFNSPTTQDLVYIDPSPDYCVRNESTGSL
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::
CCDS46 CK
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CCDS57 VAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHSLFGRVLLRSSRESAFVYAISSAGVVFAITRACS
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CCDS57 QGEVKSCSCDPKKMGSAKDSKGIFDWGGCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGKDARALMNL
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CCDS57 HNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGSCTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQV-VMN
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CCDS57 ----QDGTGFTVANER-FKKPTKNDLVYFENSPDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRGMD
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CCDS57 SCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAVRCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
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CCDS11 GLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPLLCGSIPGLVPKQLRFCRNYIEIM
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CCDS11 PSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVHAIASAGVAFA
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CCDS11 VTRSCAEGTSTICGCDSHHKG--PPGEGWKWGGCSEDADFGVLVSREFADARENRPDARS
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CCDS11 AMNKHNNEAGRTTILDHMHLKCKCHGLSGSCEVKTCWWAQPDFRAIGDFLKDKYDSASEM
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CCDS11 VVEKHRESRGWVET-LRAKY-SLFKPPTERDLVYYENSPNFCEPNPETGSFGTRDRTCNV
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]