Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1807
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1807, 323 aa
1>>>pF1KE1807 323 - 323 aa - 323 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5571+/-0.000479; mu= 14.6737+/- 0.030
mean_var=75.2462+/-15.171, 0's: 0 Z-trim(108.3): 59 B-trim: 102 in 1/50
Lambda= 0.147854
statistics sampled from 16354 (16412) to 16354 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.55), E-opt: 0.2 (0.192), width: 16
Scan time: 7.090
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005130 (OMIM: 106490) annexin A3 [Homo sapiens] ( 323) 2083 454.2 1.6e-127
NP_001307627 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [ ( 321) 1110 246.7 4.9e-65
NP_001144 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [Hom ( 321) 1110 246.7 4.9e-65
XP_016859432 (OMIM: 106491) PREDICTED: annexin A4 ( 321) 1110 246.7 4.9e-65
NP_001265338 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 2 ( 472) 1103 245.3 1.9e-64
NP_665876 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1103 245.3 2e-64
NP_001265337 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 ( 505) 1103 245.3 2e-64
NP_665875 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1103 245.3 2e-64
XP_011538038 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 505) 1103 245.3 2e-64
NP_001265336 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 ( 505) 1103 245.3 2e-64
NP_001148 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Ho ( 505) 1103 245.3 2e-64
XP_005269798 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 605) 1103 245.3 2.3e-64
XP_005268489 (OMIM: 114070) PREDICTED: annexin A6 ( 667) 1071 238.5 2.9e-62
NP_001146 (OMIM: 114070) annexin A6 isoform 1 [Hom ( 673) 1071 238.5 2.9e-62
NP_001145 (OMIM: 131230,614391) annexin A5 [Homo s ( 320) 1048 233.4 4.7e-61
XP_005269799 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1005 224.4 4.2e-58
XP_011538037 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1005 224.4 4.2e-58
XP_006717877 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1005 224.4 4.2e-58
XP_006717876 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 ( 542) 1005 224.4 4.2e-58
XP_011516911 (OMIM: 151690) PREDICTED: annexin A1 ( 346) 985 220.0 5.5e-57
NP_000691 (OMIM: 151690) annexin A1 [Homo sapiens] ( 346) 985 220.0 5.5e-57
XP_016870146 (OMIM: 151690) PREDICTED: annexin A1 ( 357) 985 220.0 5.7e-57
NP_001180473 (OMIM: 114070) annexin A6 isoform 2 [ ( 641) 982 219.5 1.4e-56
XP_016877579 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 339) 963 215.3 1.4e-55
NP_001002857 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [ ( 339) 963 215.3 1.4e-55
NP_001129487 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [ ( 339) 963 215.3 1.4e-55
NP_004030 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 2 [Hom ( 339) 963 215.3 1.4e-55
XP_016877580 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 339) 963 215.3 1.4e-55
NP_001002858 (OMIM: 151740) annexin A2 isoform 1 [ ( 357) 963 215.3 1.5e-55
NP_001035173 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 2 [ ( 327) 958 214.3 2.9e-55
XP_006718014 (OMIM: 602396) PREDICTED: annexin A8 ( 351) 958 214.3 3e-55
XP_011538398 (OMIM: 602396) PREDICTED: annexin A8 ( 448) 958 214.3 3.7e-55
NP_001307808 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 4 [ ( 426) 948 212.2 1.6e-54
NP_001307809 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 3 [ ( 448) 948 212.2 1.6e-54
NP_001147 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 1 [Hom ( 466) 948 212.2 1.7e-54
XP_016871652 (OMIM: 186360) PREDICTED: annexin A7 ( 466) 948 212.2 1.7e-54
NP_004025 (OMIM: 186360) annexin A7 isoform 2 [Hom ( 488) 948 212.2 1.7e-54
XP_016871651 (OMIM: 186360) PREDICTED: annexin A7 ( 488) 948 212.2 1.7e-54
NP_009124 (OMIM: 608008) annexin A10 [Homo sapiens ( 324) 904 202.7 8.4e-52
NP_001307631 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform c [ ( 237) 877 196.9 3.5e-50
XP_016859433 (OMIM: 106491) PREDICTED: annexin A4 ( 237) 877 196.9 3.5e-50
NP_004297 (OMIM: 602573) annexin A13 isoform a [Ho ( 316) 873 196.1 8e-50
NP_001258631 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 1 [ ( 365) 871 195.7 1.2e-49
NP_001003954 (OMIM: 602573) annexin A13 isoform b ( 357) 867 194.9 2.1e-49
NP_001307629 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform b [ ( 299) 819 184.6 2.2e-46
NP_001258632 (OMIM: 602396) annexin A8 isoform 3 [ ( 265) 751 170.0 4.7e-42
XP_011529873 (OMIM: 608008) PREDICTED: annexin A10 ( 344) 720 163.5 5.7e-40
XP_016877582 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 222) 714 162.1 9.7e-40
XP_011519779 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 222) 714 162.1 9.7e-40
XP_016877581 (OMIM: 151740) PREDICTED: annexin A2 ( 222) 714 162.1 9.7e-40
>>NP_005130 (OMIM: 106490) annexin A3 [Homo sapiens] (323 aa)
initn: 2083 init1: 2083 opt: 2083 Z-score: 2410.2 bits: 454.2 E(85289): 1.6e-127
Smith-Waterman score: 2083; 100.0% identity (100.0% similar) in 323 aa overlap (1-323:1-323)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASIWVGHRGTVRDYPDFSPSVDAEAIQKAIRGIGTDEKMLISILTERSNAQRQLIVKEY
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pF1KE1 QAAYGKELKDDLKGDLSGHFEHLMVALVTPPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QAAYGKELKDDLKGDLSGHFEHLMVALVTPPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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310 320
pF1KE1 SAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD
:::::::::::::::::::::::
NP_005 SAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD
310 320
>>NP_001307627 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [Homo (321 aa)
initn: 1110 init1: 1110 opt: 1110 Z-score: 1288.6 bits: 246.7 E(85289): 4.9e-65
Smith-Waterman score: 1110; 53.5% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (10-323:8-321)
10 20 30 40 50 60
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:::. :. ::....::..:.:::: .::.:. :..:::: : :
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: .... :::.: : .:: ::: :.:: :...:..:. : :::. .:. :..::::
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::.:::..::::: :: .:: :. .: .::::. :::::: .:::.: :: ::: :
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: ::.::::::. .:: .:::::
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>>NP_001144 (OMIM: 106491) annexin A4 isoform a [Homo sa (321 aa)
initn: 1110 init1: 1110 opt: 1110 Z-score: 1288.6 bits: 246.7 E(85289): 4.9e-65
Smith-Waterman score: 1110; 53.5% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (10-323:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASIWVGHRGTVRDYPDFSPSVDAEAIQKAIRGIGTDEKMLISILTERSNAQRQLIVKEY
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... :..: ::::..:::.::...:...:: ...:...:...::::::.: :::::..:
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: .... :::.: : .:: ::: :.:: :...:..:. : :::. .:. :..::::
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pF1KE1 ILYKAGENRWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEYRNISQKDIVDSIKGELSGHFEDLL
::.:::..::::: :: .:: :. .: .::::. :::::: .:::.: :: ::: :
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pF1KE1 LAIVNCVRNTPAFLAERLHRALKGIGTDEFTLNRIMVSRSEIDLLDIRTEFKKHYGYSLY
::::.:.:: :..::.:....::.:::. :: :.::::.:::.::::..::. :: :::
NP_001 LAIVKCMRNKSAYFAEKLYKSMKGLGTDDNTLIRVMVSRAEIDMLDIRAHFKRLYGKSLY
240 250 260 270 280 290
310 320
pF1KE1 SAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD
: ::.::::::. .:: .:::::
NP_001 SFIKGDTSGDYRKVLLVLCGGDD
300 310 320
>>XP_016859432 (OMIM: 106491) PREDICTED: annexin A4 isof (321 aa)
initn: 1110 init1: 1110 opt: 1110 Z-score: 1288.6 bits: 246.7 E(85289): 4.9e-65
Smith-Waterman score: 1110; 53.5% identity (81.8% similar) in 314 aa overlap (10-323:8-321)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MASIWVGHRGTVRDYPDFSPSVDAEAIQKAIRGIGTDEKMLISILTERSNAQRQLIVKEY
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XP_016 MAMATKGGTVKAASGFNAMEDAQTLRKAMKGLGTDEDAIISVLAYRNTAQRQEIRTAY
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pF1KE1 QAAYGKELKDDLKGDLSGHFEHLMVALVTPPAVFDAKQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTR
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XP_016 KSTIGRDLIDDLKSELSGNFEQVIVGMMTPTVLYDVQELRRAMKGAGTDEGCLIEILASR
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pF1KE1 TSRQMKDISQAYYTVYKKSLGDDISSETSGDFRKALLTLADGRRDESLKVDEHLAKQDAQ
: .... :::.: : .:: ::: :.:: :...:..:. : :::. .:. :..::::
XP_016 TPEEIRRISQTYQQQYGRSLEDDIRSDTSFMFQRVLVSLSAGGRDEGNYLDDALVRQDAQ
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pF1KE1 ILYKAGENRWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEYRNISQKDIVDSIKGELSGHFEDLL
::.:::..::::: :: .:: :. .: .::::. :::::: .:::.: :: ::: :
XP_016 DLYEAGEKKWGTDEVKFLTVLCSRNRNHLLHVFDEYKRISQKDIEQSIKSETSGSFEDAL
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::::.:.:: :..::.:....::.:::. :: :.::::.:::.::::..::. :: :::
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240 250 260 270 280 290
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: ::.::::::. .:: .:::::
XP_016 SFIKGDTSGDYRKVLLVLCGGDD
300 310 320
>>NP_001265338 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 2 [Hom (472 aa)
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Smith-Waterman score: 1103; 52.4% identity (80.4% similar) in 317 aa overlap (7-323:156-472)
10 20 30
pF1KE1 MASIWVGHRGTVRDYPDFSPSVDAEAIQKAIRGIGT
: :::. : : :.: :::...::..:.::
NP_001 PLPGQQQPVPSYPGYPGSGTVTPAVPPTQFGSRGTITDAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGT
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pF1KE1 DEKMLISILTERSNAQRQLIVKEYQAAYGKELKDDLKGDLSGHFEHLMVALVTPPAVFDA
::. .:. : ::: ::: :. ...::::.: :::..:::.::. ..::. :..::
NP_001 DEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILALMKTPVLFDI
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pF1KE1 KQLKKSMKGAGTNEDALIEILTTRTSRQMKDISQAYYTVYKKSLGDDISSETSGDFRKAL
..:...::.::.: :::::..:..........:: . .::.: . : :.::: :.. :
NP_001 YEIKEAIKGVGTDEACLIEILASRSNEHIRELNRAYKAEFKKTLEEAIRSDTSGHFQRLL
250 260 270 280 290 300
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pF1KE1 LTLADGRRDESLKVDEHLAKQDAQILYKAGENRWGTDEDKFTEILCLRSFPQLKLTFDEY
..:..: :::: .:: ::..::: :: ::::: ::::.::. .:: :: .: .:.::
NP_001 ISLSQGNRDESTNVDMSLAQRDAQELYAAGENRLGTDESKFNAVLCSRSRAHLVAVFNEY
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pF1KE1 RNISQKDIVDSIKGELSGHFEDLLLAIVNCVRNTPAFLAERLHRALKGIGTDEFTLNRIM
. .. .:: :: :.:: .:. .::.:.:..:::::.::::..:..: :: . :: :::
NP_001 QRMTGRDIEKSICREMSGDLEEGMLAVVKCLKNTPAFFAERLNKAMRGAGTKDRTLIRIM
370 380 390 400 410 420
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pF1KE1 VSRSEIDLLDIRTEFKKHYGYSLYSAIKSDTSGDYEITLLKICGGDD
::::: ::::::.:.:. :: ::: :..::::::. :::::::.:
NP_001 VSRSETDLLDIRSEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND
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>>NP_665876 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Homo s (505 aa)
initn: 1551 init1: 1096 opt: 1103 Z-score: 1277.6 bits: 245.3 E(85289): 2e-64
Smith-Waterman score: 1103; 52.4% identity (80.4% similar) in 317 aa overlap (7-323:189-505)
10 20 30
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Smith-Waterman score: 1103; 52.4% identity (80.4% similar) in 317 aa overlap (7-323:189-505)
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>>NP_665875 (OMIM: 602572) annexin A11 isoform 1 [Homo s (505 aa)
initn: 1551 init1: 1096 opt: 1103 Z-score: 1277.6 bits: 245.3 E(85289): 2e-64
Smith-Waterman score: 1103; 52.4% identity (80.4% similar) in 317 aa overlap (7-323:189-505)
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pF1KE1 MASIWVGHRGTVRDYPDFSPSVDAEAIQKAIRGIGT
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>>XP_011538038 (OMIM: 602572) PREDICTED: annexin A11 iso (505 aa)
initn: 1551 init1: 1096 opt: 1103 Z-score: 1277.6 bits: 245.3 E(85289): 2e-64
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XP_011 PLPGQQQPVPSYPGYPGSGTVTPAVPPTQFGSRGTITDAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGT
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NP_001 PLPGQQQPVPSYPGYPGSGTVTPAVPPTQFGSRGTITDAPGFDPLRDAEVLRKAMKGFGT
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NP_001 DEQAIIDCLGSRSNKQRQQILLSFKTAYGKDLIKDLKSELSGNFEKTILALMKTPVLFDI
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pF1KE1 RNISQKDIVDSIKGELSGHFEDLLLAIVNCVRNTPAFLAERLHRALKGIGTDEFTLNRIM
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NP_001 QRMTGRDIEKSICREMSGDLEEGMLAVVKCLKNTPAFFAERLNKAMRGAGTKDRTLIRIM
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NP_001 VSRSETDLLDIRSEYKRMYGKSLYHDISGDTSGDYRKILLKICGGND
460 470 480 490 500
323 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 17:27:31 2016 done: Sun Nov 6 17:27:32 2016
Total Scan time: 7.090 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]