Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1719
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1719, 225 aa
1>>>pF1KE1719 225 - 225 aa - 225 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0540+/-0.000565; mu= 16.1271+/- 0.035
mean_var=65.6482+/-12.897, 0's: 0 Z-trim(113.1): 37 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.158293
statistics sampled from 13736 (13773) to 13736 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.784), E-opt: 0.2 (0.423), width: 16
Scan time: 2.440
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 ( 225) 1520 354.9 2.4e-98
CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 247) 911 215.8 1.9e-56
CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 243) 901 213.5 9.2e-56
CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 245) 823 195.7 2.1e-50
CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 ( 252) 780 185.9 2e-47
CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 ( 181) 716 171.2 3.8e-43
CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 199) 713 170.6 6.6e-43
CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 192) 705 168.7 2.3e-42
CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 226) 705 168.8 2.6e-42
CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX ( 255) 705 168.8 2.9e-42
CCDS9298.1 FGF9 gene_id:2254|Hs108|chr13 ( 208) 380 94.5 5.3e-20
CCDS5998.1 FGF20 gene_id:26281|Hs108|chr8 ( 211) 373 92.9 1.6e-19
CCDS75996.1 FGF16 gene_id:8823|Hs108|chrX ( 207) 350 87.7 6.1e-18
CCDS34021.1 FGF5 gene_id:2250|Hs108|chr4 ( 268) 334 84.1 9.5e-17
CCDS12037.1 FGF22 gene_id:27006|Hs108|chr19 ( 170) 319 80.5 7.1e-16
CCDS10131.1 FGF7 gene_id:2252|Hs108|chr15 ( 194) 305 77.4 7.2e-15
CCDS8194.1 FGF4 gene_id:2249|Hs108|chr11 ( 206) 293 74.7 5.1e-14
CCDS3950.1 FGF10 gene_id:2255|Hs108|chr5 ( 208) 270 69.4 2e-12
CCDS8527.1 FGF6 gene_id:2251|Hs108|chr12 ( 208) 268 68.9 2.7e-12
CCDS4275.1 FGF1 gene_id:2246|Hs108|chr5 ( 155) 251 65.0 3.1e-11
>>CCDS11105.1 FGF11 gene_id:2256|Hs108|chr17 (225 aa)
initn: 1520 init1: 1520 opt: 1520 Z-score: 1879.0 bits: 354.9 E(32554): 2.4e-98
Smith-Waterman score: 1520; 100.0% identity (100.0% similar) in 225 aa overlap (1-225:1-225)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KE1 VMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
190 200 210 220
>>CCDS9501.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (247 aa)
initn: 912 init1: 763 opt: 911 Z-score: 1126.8 bits: 215.8 E(32554): 1.9e-56
Smith-Waterman score: 911; 61.6% identity (83.0% similar) in 224 aa overlap (2-225:3-225)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPAR
::.::.::::::..:: .:: ...:: : ...::. .:. ..::::. : . :
CCDS95 MAAAIASGLIRQKRQAREQHWDRPSASRRRSSPSKNRGLCNGNLVDIFSKVRIFGLKKRR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSA
: .::::::::.:.::::.::: .:::...:: .:... : :::::::::::.::..
CCDS95 LRR-QDPQLKGIVTRLYCRQGYYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGV
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEG
: : :.:::.:: :: : :: ::.::: :::::::.:.: ::::..:::::.:::.:::
CCDS95 KTGLYIAMNGEGYLYPSELFTPECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 QVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
:.:::::::::: ::::::: ::::::.:::::.: :. :. .:
CCDS95 QAMKGNRVKKTKPAAHFLPKPLEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGK
180 190 200 210 220 230
CCDS95 PVNKSKTT
240
>>CCDS3301.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 (243 aa)
initn: 916 init1: 804 opt: 901 Z-score: 1114.6 bits: 213.5 E(32554): 9.2e-56
Smith-Waterman score: 901; 61.3% identity (85.1% similar) in 222 aa overlap (2-221:3-223)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVCP-RGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPA
::.:::::::::..:: ...: ...:: : . .:::....: ..::::.:.::
CCDS33 MAAAIASSLIRQKRQARESNSDRVSASKRRSSPSKDGRSLCERHVLGVFSKVRFCSGRK-
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 RP-DRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQ
:: : ::::::::::.:: .::..:: .:::.:.:: ...:..: :::::::::::.::
CCDS33 RPVRRRPEPQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGTKDENSDYTLFNLIPVGLRVVAIQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDK
..: . :.:::.:: :::: :: ::.::: :::::::.:.:.::::..:::::.:::.:
CCDS33 GVKASLYVAMNGEGYLYSSDVFTPECKFKESVFENYYVIYSSTLYRQQESGRAWFLGLNK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 EGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
:::.:::::::::: ..::.:: .:: ::.::::: . : . :
CCDS33 EGQIMKGNRVKKTKPSSHFVPKPIEVCMYREPSLHEIGEKQGRSRKSSGTPTMNGGKVVN
180 190 200 210 220 230
CCDS33 QDST
240
>>CCDS14665.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (245 aa)
initn: 817 init1: 715 opt: 823 Z-score: 1018.2 bits: 195.7 E(32554): 2.1e-50
Smith-Waterman score: 823; 58.7% identity (80.0% similar) in 225 aa overlap (2-225:3-223)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAALASSLIRQKREVREPGGSRPVSAQRRVC-PRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPA
::.:::::::::..:: : .: . : : :. :.:. : ..:.:.: :..
CCDS14 MAAAIASSLIRQKRQAREREKS---NACKCVSSPSKGKTSCDKNKLNVFSRVKLFGSKKR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 RPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQS
: : ::::::::::::. :::..:: . ::.:.:: .. :..: :::::::::::.::.
CCDS14 R-RRRPEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 AKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKE
.. :.:::.:: ::.: :: ::.::: ::::::: :.: .:::..:::.:::::.::
CCDS14 VQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 GQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
:..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::.. : : :. .:
CCDS14 GEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGG
180 190 200 210 220 230
CCDS14 KSMSHNEST
240
>>CCDS9500.1 FGF14 gene_id:2259|Hs108|chr13 (252 aa)
initn: 771 init1: 771 opt: 780 Z-score: 965.0 bits: 185.9 E(32554): 2e-47
Smith-Waterman score: 780; 65.7% identity (85.7% similar) in 175 aa overlap (52-225:57-230)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 RPVSAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGP-EPQLKGIVTKLFCRQG
::: . . ...: .::::::::.:.::::
CCDS95 RVSKLLDCFSPKSMWFLWNIFSKGTHMLQCLCG-KSLKKNKNPTDPQLKGIVTRLYCRQG
30 40 50 60 70 80
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 FYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFT
.::: .:::...:: .:... : :::::::::::.::..: : :.:::.:: :: : ::
CCDS95 YYLQMHPDGALDGTKDDSTNSTLFNLIPVGLRVVAIQGVKTGLYIAMNGEGYLYPSELFT
90 100 110 120 130 140
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 AECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKL
::.::: :::::::.:.: ::::..:::::.:::.::::.:::::::::: :::::::
CCDS95 PECKFKESVFENYYVIYSSMLYRQQESGRAWFLGLNKEGQAMKGNRVKKTKPAAHFLPKP
150 160 170 180 190 200
210 220
pF1KE1 LEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
::::::.:::::.: :. :. .:
CCDS95 LEVAMYREPSLHDVGETVPKPGVTPSKSTSASAIMNGGKPVNKSKTT
210 220 230 240 250
>>CCDS46983.1 FGF12 gene_id:2257|Hs108|chr3 (181 aa)
initn: 737 init1: 716 opt: 716 Z-score: 888.1 bits: 171.2 E(32554): 3.8e-43
Smith-Waterman score: 716; 66.2% identity (87.9% similar) in 157 aa overlap (65-221:5-161)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT
:::::::::.:: .::..:: .:::.:.::
CCDS46 MESKEPQLKGIVTRLFSQQGYFLQMHPDGTIDGT
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY
...:..: :::::::::::.::..: . :.:::.:: :::: :: ::.::: ::::::
CCDS46 KDENSDYTLFNLIPVGLRVVAIQGVKASLYVAMNGEGYLYSSDVFTPECKFKESVFENYY
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV
:.:.:.::::..:::::.:::.::::.:::::::::: ..::.:: .:: ::.::::: .
CCDS46 VIYSSTLYRQQESGRAWFLGLNKEGQIMKGNRVKKTKPSSHFVPKPIEVCMYREPSLHEI
100 110 120 130 140 150
220
pF1KE1 PEASPSSPPAP
: . :
CCDS46 GEKQGRSRKSSGTPTMNGGKVVNQDST
160 170 180
>>CCDS55512.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (199 aa)
initn: 723 init1: 705 opt: 713 Z-score: 883.8 bits: 170.6 E(32554): 6.6e-43
Smith-Waterman score: 713; 61.1% identity (82.9% similar) in 175 aa overlap (55-225:3-177)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 SAQRRVCPRGTKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARP----DRGPEPQLKGIVTKLFCRQG
:. ..: : . :::::::::::. :::
CCDS55 MSGKVTKPKEEKDASKEPQLKGIVTKLYSRQG
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 FYLQANPDGSIQGTPEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFT
..:: . ::.:.:: .. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: ::
CCDS55 YHLQLQADGTIDGTKDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFT
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 AECRFKECVFENYYVLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKL
::.::: ::::::: :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: :::::::
CCDS55 PECKFKESVFENYYVTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKP
100 110 120 130 140 150
210 220
pF1KE1 LEVAMYQEPSLHSVPEASPSSPPAP
:.::::.:::::.. : : :. .:
CCDS55 LKVAMYKEPSLHDLTEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
160 170 180 190
>>CCDS14664.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (192 aa)
initn: 723 init1: 705 opt: 705 Z-score: 874.1 bits: 168.7 E(32554): 2.3e-42
Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:10-170)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT
:::::::::::. :::..:: . ::.:.::
CCDS14 MALLRKSYSEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY
.. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: ::::::
CCDS14 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV
: :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::..
CCDS14 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL
100 110 120 130 140 150
220
pF1KE1 PEASPSSPPAP
: : :. .:
CCDS14 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
160 170 180 190
>>CCDS55511.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (226 aa)
initn: 744 init1: 705 opt: 705 Z-score: 873.1 bits: 168.8 E(32554): 2.6e-42
Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:44-204)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT
:::::::::::. :::..:: . ::.:.::
CCDS55 KKESPFRAKCHEIFCCPLKQVHHKENTEPEEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT
20 30 40 50 60 70
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY
.. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: ::::::
CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
80 90 100 110 120 130
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV
: :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::..
CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL
140 150 160 170 180 190
220
pF1KE1 PEASPSSPPAP
: : :. .:
CCDS55 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
200 210 220
>>CCDS55513.1 FGF13 gene_id:2258|Hs108|chrX (255 aa)
initn: 745 init1: 705 opt: 705 Z-score: 872.4 bits: 168.8 E(32554): 2.9e-42
Smith-Waterman score: 705; 64.6% identity (85.7% similar) in 161 aa overlap (65-225:73-233)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 TKSLCQKQLLILLSKVRLCGGRPARPDRGPEPQLKGIVTKLFCRQGFYLQANPDGSIQGT
:::::::::::. :::..:: . ::.:.::
CCDS55 KKESPFRAKCHEIFCCPLKQVHHKENTEPEEPQLKGIVTKLYSRQGYHLQLQADGTIDGT
50 60 70 80 90 100
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PEDTSSFTHFNLIPVGLRVVTIQSAKLGHYMAMNAEGLLYSSPHFTAECRFKECVFENYY
.. :..: :::::::::::.::... :.:::.:: ::.: :: ::.::: ::::::
CCDS55 KDEDSTYTLFNLIPVGLRVVAIQGVQTKLYLAMNSEGYLYTSELFTPECKFKESVFENYY
110 120 130 140 150 160
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 VLYASALYRQRRSGRAWYLGLDKEGQVMKGNRVKKTKAAAHFLPKLLEVAMYQEPSLHSV
: :.: .:::..:::.:::::.:::..::::.:::.: ::::::: :.::::.:::::..
CCDS55 VTYSSMIYRQQQSGRGWYLGLNKEGEIMKGNHVKKNKPAAHFLPKPLKVAMYKEPSLHDL
170 180 190 200 210 220
220
pF1KE1 PEASPSSPPAP
: : :. .:
CCDS55 TEFSRSGSGTPTKSRSVSGVLNGGKSMSHNEST
230 240 250
225 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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