Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1574
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1574, 683 aa
1>>>pF1KE1574 683 - 683 aa - 683 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5949+/-0.00106; mu= 17.5731+/- 0.063
mean_var=63.2610+/-12.273, 0's: 0 Z-trim(103.7): 26 B-trim: 252 in 1/50
Lambda= 0.161252
statistics sampled from 7531 (7543) to 7531 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.594), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 3.820
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs108|chr5 ( 683) 4404 1033.7 0
CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 781) 2000 474.5 2.5e-133
CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 809) 2000 474.5 2.6e-133
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CCDS66530.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 749) 1992 472.6 8.9e-133
CCDS81764.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 808) 1992 472.6 9.5e-133
CCDS9364.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 ( 836) 1992 472.6 9.8e-133
>>CCDS47266.1 TGFBI gene_id:7045|Hs108|chr5 (683 aa)
initn: 4404 init1: 4404 opt: 4404 Z-score: 5530.5 bits: 1033.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4404; 100.0% identity (100.0% similar) in 683 aa overlap (1-683:1-683)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
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CCDS47 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
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CCDS47 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KDGTPPIDAHTRNLLRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCIA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTVF
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550 560 570 580 590 600
pF1KE1 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS
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CCDS47 APTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGIGALVRLKSLQGDKLEVS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF
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CCDS47 LKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQASAF
610 620 630 640 650 660
670 680
pF1KE1 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
:::::::::::::::::::::::
CCDS47 SRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
670 680
>>CCDS53864.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 (781 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 2000 Z-score: 2507.0 bits: 474.5 E(32554): 2.5e-133
Smith-Waterman score: 2000; 45.5% identity (76.2% similar) in 686 aa overlap (1-682:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
CCDS53 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
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CCDS53 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
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CCDS53 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
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CCDS53 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
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CCDS53 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
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CCDS53 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
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CCDS53 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
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CCDS53 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV
.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
CCDS53 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
CCDS53 FVPTNDAFKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 EVSLKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQA
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CCDS53 FLKEVNDTLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYP-ADTPVG-NDQLLEILNKLIKYI
600 610 620 630 640 650
660 670 680
pF1KE1 SA-FSRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
. : :.: . . ::. : ..:
CCDS53 QIKFVRGSTFKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIID
660 670 680 690 700 710
>>CCDS66531.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 (809 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 2000 Z-score: 2506.8 bits: 474.5 E(32554): 2.6e-133
Smith-Waterman score: 2000; 45.5% identity (76.2% similar) in 686 aa overlap (1-682:1-677)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
CCDS66 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
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CCDS66 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
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CCDS66 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
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CCDS66 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
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CCDS66 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
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CCDS66 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
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CCDS66 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
.: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::.
CCDS66 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV
.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
CCDS66 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
CCDS66 FVPTNDAFKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 EVSLKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQA
.. :... ::. : :::.::::.::. ..: : :. : .:.: . ...:
CCDS66 FLKEVNDTLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYP-ADTPVG-NDQLLEILNKLIKYI
600 610 620 630 640 650
660 670 680
pF1KE1 SA-FSRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
. : :.: . . ::. : ..:
CCDS66 QIKFVRGSTFKEIPVTVYRPTLTKVKIEGEPEFRLIKEGETITEVIHGEPIIKKYTKIID
660 670 680 690 700 710
>>CCDS45034.1 POSTN gene_id:10631|Hs108|chr13 (779 aa)
initn: 1425 init1: 1312 opt: 1996 Z-score: 2502.0 bits: 473.6 E(32554): 4.8e-133
Smith-Waterman score: 1996; 45.3% identity (76.5% similar) in 684 aa overlap (1-680:1-675)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MALFVRLLALALALALGPAATLAGPAKSPYQLVLQHSRLRGRQHGPNVCAVQKVIGTNRK
: :. ...: : : ..: :.. :. .: :::.:::..::::::.:...::..:
CCDS45 MIPFLPMFSLLLLLIVNPIN-----ANNHYDKILAHSRIRGRDQGPNVCALQQILGTKKK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YFTNCKQWYQRKICGKSTVISYECCPGYEKVPGEKGCPAALPLSNLYETLGVVGSTTTQL
::..::.::...:::..:.. ::::::: .. : :::::.::....: :::.::.::::
CCDS45 YFSTCKNWYKKSICGQKTTVLYECCPGYMRMEGMKGCPAVLPIDHVYGTLGIVGATTTQR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YTDRTEKLRPEMEGPGSFTIFAPSNEAWASLPAEVLDSLVSNVNIELLNALRYHMVGRRV
:.: . ::: :.:: :::: :::::::: .: ... .: ::::.::::::. ::...:.
CCDS45 YSDAS-KLREEIEGKGSFTYFAPSNEAWDNLDSDIRRGLESNVNVELLNALHSHMINKRM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LTDELKHGMTLTSMYQNSNIQIHHYPNGIVTVNCARLLKADHHATNGVVHLIDKVISTIT
:: .::.:: . :::.: .. :.:::::.:::::::...... :::::::.::.:.. :
CCDS45 LTKDLKNGMIIPSMYNNLGLFINHYPNGVVTVNCARIIHGNQIATNGVVHVIDRVLTQIG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NNIQQIIEIEDTFETLRAAVAASGLNTMLEGNGQYTLLAPTNEAFEKIPSETLNRILGDP
..::..:: :: . ..:::. .: . : .:..::.:::::::::.: .:.::.::
CCDS45 TSIQDFIEAEDDLSSFRAAAITSDILEALGRDGHFTLFAPTNEAFEKLPRGVLERIMGDK
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EALRDLLNNHILKSAMCAEAIVAGLSVETLEGTTLEVGCSGDMLTINGKAIISNKDILAT
: . :.. :::.. .:.:.:..: :::::.:.:.::.:: .:.:: ....:::...
CCDS45 VASEALMKYHILNTLQCSESIMGGAVFETLEGNTIEIGCDGDSITVNGIKMVNKKDIVTN
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NGVIHYIDELLIPDSAKTLFELAAESDVSTAIDLFRQAGLGNHLSGSERLTLLAPLNSVF
::::: ::..::::::: ..:::.... .: :: : ::.. : . . :::::.:..:
CCDS45 NGVIHLIDQVLIPDSAKQVIELAGKQQ-TTFTDLVAQLGLASALRPDGEYTLLAPVNNAF
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 KDGTPPIDAHTRNL-LRNHIIKDQLASKYLYHGQTLETLGGKKLRVFVYRNSLCIENSCI
.: : .: . .: :.:::.: ... . ::.:: :::.:::.:::::::...::::::.
CCDS45 SDDTLSMDQRLLKLILQNHILKVKVGLNELYNGQILETIGGKQLRVFVYRTAVCIENSCM
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 AAHDKRGRYGTLFTMDRVLTPPMGTVMDVLKGDNRFSMLVAAIQSAGLTETLNREGVYTV
.:.:: :.. . ... : .. . :: :.::: ... ...: : : :.. : .:.
CCDS45 EKGSKQGRNGAIHIFREIIKPAEKSLHEKLKQDKRFSTFLSLLEAADLKELLTQPGDWTL
480 490 500 510 520 530
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pF1KE1 FAPTNEAFRALPPRERSRLLGDAKELANILKYHIGDEILVSGGI--GALVRLKSLQGDKL
:.:::.::... .:. :. : . : ::. ::. .... :. :. ::. ::.:.
CCDS45 FVPTNDAFKGMTSEEKEILIRDKNALQNIILYHLTPGVFIGKGFEPGVTNILKTTQGSKI
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 EVSLKNNVVSVNKEPVAEPDIMATNGVVHVITNVLQPPANRPQERGDELADSALEIFKQA
.. :... ::. : :::.::::.::. ..: : :. : .:.: . ...:
CCDS45 FLKEVNDTLLVNELKSKESDIMTTNGVIHVVDKLLYP-ADTPVG-NDQLLEILNKLIKYI
600 610 620 630 640 650
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pF1KE1 SA-FSRASQRSVRLAPVYQKLLERMKH
. : :.: . . ::. ....
CCDS45 QIKFVRGSTFKEIPVTVYKPIIKKYTKIIDGVPVEITEKETREERIITGPEIKYTRISTG
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