Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1572
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1572, 860 aa
1>>>pF1KE1572 860 - 860 aa - 860 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.3861+/-0.000437; mu= 20.0768+/- 0.027
mean_var=66.4948+/-13.746, 0's: 0 Z-trim(110.1): 79 B-trim: 527 in 1/48
Lambda= 0.157282
statistics sampled from 18339 (18400) to 18339 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.216), width: 16
Scan time: 10.080
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001136093 (OMIM: 606237) transforming growth fa ( 860) 5694 1301.8 0
NP_004248 (OMIM: 606237) transforming growth facto ( 860) 5694 1301.8 0
NP_001315575 (OMIM: 606237) transforming growth fa ( 824) 5289 1209.8 0
XP_016860828 (OMIM: 606237) PREDICTED: transformin ( 440) 2938 676.2 8.7e-194
XP_016877528 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 518) 198 54.5 1.4e-06
XP_016877527 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 751) 198 54.6 2e-06
NP_056104 (OMIM: 612188) vam6/Vps39-like protein i ( 875) 198 54.7 2.3e-06
NP_001288067 (OMIM: 612188) vam6/Vps39-like protei ( 886) 198 54.7 2.3e-06
XP_016877526 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 860) 193 53.5 4.9e-06
XP_016877525 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 871) 193 53.5 4.9e-06
XP_011519706 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 896) 193 53.5 5.1e-06
XP_011519705 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39- ( 907) 193 53.5 5.1e-06
>>NP_001136093 (OMIM: 606237) transforming growth factor (860 aa)
initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6975.4 bits: 1301.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5694; 100.0% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVH
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KE1 THCAASRHTNPSSSSPGTRT
::::::::::::::::::::
NP_001 THCAASRHTNPSSSSPGTRT
850 860
>>NP_004248 (OMIM: 606237) transforming growth factor-be (860 aa)
initn: 5694 init1: 5694 opt: 5694 Z-score: 6975.4 bits: 1301.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5694; 100.0% identity (100.0% similar) in 860 aa overlap (1-860:1-860)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_004 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVH
790 800 810 820 830 840
850 860
pF1KE1 THCAASRHTNPSSSSPGTRT
::::::::::::::::::::
NP_004 THCAASRHTNPSSSSPGTRT
850 860
>>NP_001315575 (OMIM: 606237) transforming growth factor (824 aa)
initn: 5289 init1: 5289 opt: 5289 Z-score: 6479.0 bits: 1209.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5289; 99.5% identity (99.6% similar) in 807 aa overlap (1-807:1-807)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATFTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPSGARIKGAA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRVQIVKEVSTAEQPLAVAVDGHFL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CLALTTQYIIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGLGMFATVAGISQ
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGHILQDFEGRVIVA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQAGFIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDTALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVID
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGKGAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVH
:::::::::::::::::::::: . :
NP_001 RRTMQVALGLARSENLIYTYDKTGIAGRGTADARGSSRENGDGT
790 800 810 820
>>XP_016860828 (OMIM: 606237) PREDICTED: transforming gr (440 aa)
initn: 2938 init1: 2938 opt: 2938 Z-score: 3600.1 bits: 676.2 E(85289): 8.7e-194
Smith-Waterman score: 2938; 100.0% identity (100.0% similar) in 440 aa overlap (421-860:1-440)
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 LPTSSSFTRSHPPLHEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDT
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 MAKCKRFLMSYLNEVRSTEVANGYKEDIDT
10 20 30
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 ALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALLKLYAEADHDSLLDLLVTENFCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWV
40 50 60 70 80 90
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 NIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEELVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 NIVNGDVQDSTRSDLYEYIVDFLTYCLDEELVWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPLDEQQ
100 110 120 130 140 150
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 KNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 KNSFNPDDIINCLKKYPKALVKYLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEVLLQRASASGK
160 170 180 190 200 210
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 GAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GAEATETQAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLPMESAILHGKLGEHEKALHILVHEL
220 230 240 250 260 270
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 QDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYLHAGPTAHELAVAAVDLLNRHATEFDA
280 290 300 310 320 330
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 AQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHARRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 AQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHARRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSI
340 350 360 370 380 390
820 830 840 850 860
pF1KE1 QLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVHTHCAASRHTNPSSSSPGTRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 QLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVHTHCAASRHTNPSSSSPGTRT
400 410 420 430 440
>>XP_016877528 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39-like (518 aa)
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350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VMYRRILQQAGFIQFAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHP---P
..: ....::: ::::. ..: :
XP_016 MFTFHIDPTHVMGLYPDLLPTDYRKQLQYPNPLP
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410 420 430 440 450
pF1KE1 LHEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNE----------VRSTEVANGYK---EDIDT
. :.:.. . . ... . :.. ::. ...: . .. : . :::
XP_016 VLSGAELEKAHLALIDYLTQKRSQLVKKLNDSDHQSSTSPLMEGTPTIKSKKKLLQIIDT
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460 470 480 490 500
pF1KE1 ALLKLYAEADHDSLLDLLVTEN-FCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLW
.::: : ... . :: :: : . .: :.: .:: : .::. .. :.:.
XP_016 TLLKCYLHTNVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAHKYSELIILYEKKGLHEKALQVL
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pF1KE1 VNIVNGDVQDSTRSDL--YEYIVDFLTYCLDEEL--VWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRP
: : . .. : : .: :..: . :.: ...:. :::. : :...::.
XP_016 V-----DQSKKANSPLKGHERTVQYLQHLGTENLHLIFSYSVWVLRDFPEDGLKIFTE--
160 170 180 190 200
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pF1KE1 LDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKAL-VKYLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEV--LL
: . .:. : ... : . :.: . ::::.. . ..:. : :: :.: :.
XP_016 -DLPEVESLPRDRVLGFLIENFKGLAIPYLEHIIHVWEETGSRFHNCLIQLYCEKVQGLM
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 QRASAS---GK-----GAEATET---QAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLPMESAI
.. : :: : : : . :: .:. :. : :. . :: : :.
XP_016 KEYLLSFPAGKTPVPAGEEEGELGEYRQKLLMFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLEERAL
270 280 290 300 310 320
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pF1KE1 LHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYL-----HA
: :..:.::.:: : :: :.: ::.:: . :. .... .:: .:: :
XP_016 LLGRMGKHEQALFIYVHILKDTRMAEEYCHKHYD-RNKDGNKDVYLSLLRMYLSPPSIHC
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 -GPTAHELAV------AAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIH
:: :: ::...:. : ...:....:..:: . ... . :: ..... .
XP_016 LGPIKLELLEPKANLQAALQVLELHHSKLDTTKALNLLPANTQINDIRIFLEKVLEENAQ
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 ARRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLV
.: :: .: ..: : ... . . ....:.:..:.. . . .:.::::: .:
XP_016 KKRFNQVLKNLLHAEFLRVQEERILHQQVKCIITEEKVCMVCKKKIGNSAFARYPNGVVV
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pF1KE1 HTHCAASRHTNPSSSSPGTRT
: : :...::...
XP_016 HYFC--SKEVNPADT
510
>>XP_016877527 (OMIM: 612188) PREDICTED: vam6/Vps39-like (751 aa)
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pF1KE1 EPVPSGARIKGAATFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRV--QIVKEVS
.:. .::.. .:... ..:: .. . :
XP_016 MCV-AVKKK-LQLYF-WKDREFHELQGDFS
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170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TAEQPLAVAVDGHFLCLALTTQY-IIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLA
. . : ..: . .:... .: .:. . : ..::: ... :.: .. . . .
XP_016 VPDVPKSMAWCENSICVGFKRDYYLIRVDGKGSIKELFP-TGKQLEPLVAPLADGK-VAV
30 40 50 60 70 80
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: : . . :: .:. ..:.. .. . ::.::. ... .... . :..
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pF1KE1 FKEGHILQDFEGRVI-VATSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPK
... ... . . .: ::... :. :.:.:. :::.:: ... : :: ::. . . .
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pF1KE1 EKFQVMYRRILQQAGFIQFAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHP
:: : ... : . .: : : .: :. ..: . : ....::: ::::. ..:
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pF1KE1 ---PLHEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNE----------VRSTEVANGYK---E
:. :.:.. . . ... . :.. ::. ...: . .. : .
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270 280 290 300 310 320
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:::.::: : ... . :: :: : . .: :.: .:: : .::. .. :
XP_016 IIDTTLLKCYLHTNVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAHKYSELIILYEKKGLHEKA
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.:. : : . .. : : .: :..: . :.: ...:. :::. : :...:
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pF1KE1 TKRPLDEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKAL-VKYLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEV
:. : . .:. : ... : . :.: . ::::.. . ..:. : :: :.:
XP_016 TE---DLPEVESLPRDRVLGFLIENFKGLAIPYLEHIIHVWEETGSRFHNCLIQLYCEKV
440 450 460 470 480 490
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pF1KE1 --LLQRASAS---GK-----GAEATET---QAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLPM
:... : :: : : : . :: .:. :. : :. . ::
XP_016 QGLMKEYLLSFPAGKTPVPAGEEEGELGEYRQKLLMFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLE
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pF1KE1 ESAILHGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYL---
: :.: :..:.::.:: : :: :.: ::.:: . :. .... .:: .::
XP_016 ERALLLGRMGKHEQALFIYVHILKDTRMAEEYCHKHYD-RNKDGNKDVYLSLLRMYLSPP
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pF1KE1 --HA-GPTAHELAV------AAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMR
: :: :: ::...:. : ...:....:..:: . ... . :: ...
XP_016 SIHCLGPIKLELLEPKANLQAALQVLELHHSKLDTTKALNLLPANTQINDIRIFLEKVLE
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pF1KE1 DSIHARRTMQVALGLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPN
.. . .: :: .: ..: : ... . . ....:.:..:.. . . .:.::::
XP_016 ENAQKKRFNQVLKNLLHAEFLRVQEERILHQQVKCIITEEKVCMVCKKKIGNSAFARYPN
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pF1KE1 GGLVHTHCAASRHTNPSSSSPGTRT
: .:: : :...::...
XP_016 GVVVHYFC--SKEVNPADT
740 750
>>NP_056104 (OMIM: 612188) vam6/Vps39-like protein isofo (875 aa)
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.: ..:.:. . : :::.. :.:: . .:
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10 20 30 40
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: .: . . . .:.: .......: .. :. : .:.: . ..:... . . .. :::.
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:. . . . ...:. .::.. .:... ..:: .. . :. . : ..: .
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110 120 130 140 150 160
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.:... .: .:. . : ..::: ... :.: .. . . .: : . . :
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: .:. ..:.. .. . ::.::. ... .... . :.. ... ... . .
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pF1KE1 VI-VATSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQVMYRRILQQ
.: ::... :. :.:.:. :::.:: ... : :: ::. . . .:: : ... : .
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pF1KE1 AGFIQFAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHP---PLHEYADLNQ
.: : : .: :. ..: . : ....::: ::::. ..: :. :.:..
NP_056 YAFNLFCQKRFDESMQVFAKLGTDPTHVMGLYPDLLPTDYRKQLQYPNPLPVLSGAELEK
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 LTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNE----------VRSTEVANGYK---EDIDTALLKLYAEA
. . ... . :.. ::. ...: . .. : . :::.::: : ..
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pF1KE1 DHDSLLDLLVTEN-FCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWVNIVNGDVQ
. . :: :: : . .: :.: .:: : .::. .. :.:. : : .
NP_056 NVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAHKYSELIILYEKKGLHEKALQVLV-----DQS
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.. : : .: :..: . :.: ...:. :::. : :...::. : . .:.
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: ... : . :.: . ::::.. . ..:. : :: :.: :... :
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:: : : : . :: .:. :. : :. . :: : :.: :..:.::
NP_056 GKTPVPAGEEEGELGEYRQKLLMFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLEERALLLGRMGKHE
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pF1KE1 KALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYL-----HA-GPTAHELA
.:: : :: :.: ::.:: . :. .... .:: .:: : :: ::
NP_056 QALFIYVHILKDTRMAEEYCHKHYD-RNKDGNKDVYLSLLRMYLSPPSIHCLGPIKLELL
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pF1KE1 V------AAVDLLNRHATEFDAAQVLQMLPDTWSVQLLCPFLMGAMRDSIHARRTMQVAL
::...:. : ...:....:..:: . ... . :: ..... . .: ::
NP_056 EPKANLQAALQVLELHHSKLDTTKALNLLPANTQINDIRIFLEKVLEENAQKKRFNQVLK
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790 800 810 820 830 840
pF1KE1 GLARSENLIYTYDKMKLKGSSIQLSDKKLCQICQNPFCEPVFVRYPNGGLVHTHCAASRH
.: ..: : ... . . ....:.:..:.. . . .:.::::: .:: : :..
NP_056 NLLHAEFLRVQEERILHQQVKCIITEEKVCMVCKKKIGNSAFARYPNGVVVHYFC--SKE
820 830 840 850 860
850 860
pF1KE1 TNPSSSSPGTRT
.::...
NP_056 VNPADT
870
>>NP_001288067 (OMIM: 612188) vam6/Vps39-like protein is (886 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MMSIKAFTLVSAVERELLMGDKERVNIECVECCGRDLYVGTNDCFVYHFLLEERPVPAGP
.: ..:.:. . : :::.. . . ... :::
NP_001 MHDAFEPVPILEKLPLQIDCLAAWEEWLLVGTKQGHLLLYRIRKDVVPADV
10 20 30 40 50
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pF1KE1 AT--------FTATKQLQRHLGFKKPVNELRAASALNRLLVLCDNSISLVNMLNLEPVPS
:. : .: . . . .:.: .......: .. :. : .:.: . ..:... . .
NP_001 ASPESGSCNRFEVTLE-KSNKNFSKKIQQIHVVSQFKILVSLLENNIYVHDLLTFQQITT
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pF1KE1 GARIKGAATFALNENPVSGDPFCVEVCIISVKRRTIQMFLVYEDRV--QIVKEVSTAEQP
.. :::. :. . . . ...:. .::.. .:... ..:: .. . :. . :
NP_001 VSKAKGASLFTCDLQHTETGEEVLRMCV-AVKKK-LQLYF-WKDREFHELQGDFSVPDVP
120 130 140 150 160
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pF1KE1 LAVAVDGHFLCLALTTQY-IIHNYSTGVSQDLFPYCSEERPPIVKRIGRQEFLLAGPGGL
..: . .:... .: .:. . : ..::: ... :.: .. . . .: :
NP_001 KSMAWCENSICVGFKRDYYLIRVDGKGSIKELFP-TGKQLEPLVAPLADGK-VAVGQDDL
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pF1KE1 GMFATVAGI-SQRAPVHWSENVIGAAVSFPYVIALDDEFITVHSMLDQQQKQTLPFKEGH
. . :: .:. ..:.. .. . ::.::. ... .... . :.. ... .
NP_001 TVVLNEEGICTQKCALNWTDIPVAMEHQPPYIIAVLPRYVEIRTFEPRLLVQSIELQRPR
230 240 250 260 270 280
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pF1KE1 ILQDFEGRVI-VATSKGVYILVPLPLEKQIQDLLASRRVEEALVLAKGARRNIPKEKFQV
.. . . .: ::... :. :.:.:. :::.:: ... : :: ::. . . .:: :
NP_001 FITSGGSNIIYVASNHFVWRLIPVPMATQIQQLLQDKQFELALQLAE-MKDDSDSEKQQQ
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pF1KE1 MYRRILQQAGFIQFAQLQFLEAKELFRSGQLDVRELISLYPFLLPTSSSFTRSHP---PL
... : . .: : : .: :. ..: . : ....::: ::::. ..: :.
NP_001 IHH-IKNLYAFNLFCQKRFDESMQVFAKLGTDPTHVMGLYPDLLPTDYRKQLQYPNPLPV
350 360 370 380 390 400
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pF1KE1 HEYADLNQLTQGDQEKMAKCKRFLMSYLNE----------VRSTEVANGYK---EDIDTA
:.:.. . . ... . :.. ::. ...: . .. : . :::.
NP_001 LSGAELEKAHLALIDYLTQKRSQLVKKLNDSDHQSSTSPLMEGTPTIKSKKKLLQIIDTT
410 420 430 440 450 460
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pF1KE1 LLKLYAEADHDSLLDLLVTEN-FCLLTDSAAWLEKHKKYFALGLLYHYNNQDAAAVQLWV
::: : ... . :: :: : . .: :.: .:: : .::. .. :.:. :
NP_001 LLKCYLHTNVALVAPLLRLENNHCHIEESEHVLKKAHKYSELIILYEKKGLHEKALQVLV
470 480 490 500 510 520
520 530 540 550 560
pF1KE1 NIVNGDVQDSTRSDL--YEYIVDFLTYCLDEEL--VWAYADWVLQKSEEVGVQVFTKRPL
: . .. : : .: :..: . :.: ...:. :::. : :...::.
NP_001 -----DQSKKANSPLKGHERTVQYLQHLGTENLHLIFSYSVWVLRDFPEDGLKIFTE---
530 540 550 560 570
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pF1KE1 DEQQKNSFNPDDIINCLKKYPKAL-VKYLEHLVIDKRLQKEEYHTHLAVLYLEEV--LLQ
: . .:. : ... : . :.: . ::::.. . ..:. : :: :.: :..
NP_001 DLPEVESLPRDRVLGFLIENFKGLAIPYLEHIIHVWEETGSRFHNCLIQLYCEKVQGLMK
580 590 600 610 620 630
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pF1KE1 RASAS---GK-----GAEATET---QAKLRRLLQKSDLYRVHFLLERLQGAGLPMESAIL
. : :: : : : . :: .:. :. : :. . :: : :.:
NP_001 EYLLSFPAGKTPVPAGEEEGELGEYRQKLLMFLEISSYYDPGRLICDFPFDGLLEERALL
640 650 660 670 680 690
680 690 700 710 720
pF1KE1 HGKLGEHEKALHILVHELQDFAAAEDYCLWCSEGRDPPHRQQLFHTLLAIYL-----HA-
:..:.::.:: : :: :.: ::.:: . :. .... .:: .:: :
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