Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1563
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1563, 458 aa
1>>>pF1KE1563 458 - 458 aa - 458 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4526+/-0.000785; mu= 17.0612+/- 0.047
mean_var=67.1130+/-13.274, 0's: 0 Z-trim(107.3): 32 B-trim: 3 in 1/53
Lambda= 0.156556
statistics sampled from 9456 (9484) to 9456 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.674), E-opt: 0.2 (0.291), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 ( 458) 3154 721.3 5.2e-208
CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 ( 476) 1411 327.6 1.7e-89
CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 515) 1315 305.9 6.2e-83
CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 641) 1315 306.0 7.5e-83
CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 ( 652) 1315 306.0 7.6e-83
CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 ( 734) 834 197.4 4.2e-50
CCDS7637.1 CPXM2 gene_id:119587|Hs108|chr10 ( 756) 774 183.8 5.2e-46
CCDS5476.1 AEBP1 gene_id:165|Hs108|chr7 (1158) 685 163.8 8.5e-40
CCDS8987.1 CPM gene_id:1368|Hs108|chr12 ( 443) 678 162.0 1.1e-39
CCDS56025.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1133) 572 138.3 4e-32
CCDS11257.1 CPD gene_id:1362|Hs108|chr17 (1380) 572 138.3 4.7e-32
>>CCDS7486.1 CPN1 gene_id:1369|Hs108|chr10 (458 aa)
initn: 3154 init1: 3154 opt: 3154 Z-score: 3848.0 bits: 721.3 E(32554): 5.2e-208
Smith-Waterman score: 3154; 100.0% identity (100.0% similar) in 458 aa overlap (1-458:1-458)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYSIGRSVEGRHL
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CCDS74 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYSIGRSVEGRHL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 YVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRNQRIVQLIQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 YVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRNQRIVQLIQD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIYYNEKYGGPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYIYYNEKYGGPN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 HHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVRRT
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CCDS74 HHLPLPDNWKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDKSFEHRVRGVRRT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDYFPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYLHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDYFPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYLHT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 NCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVIS
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CCDS74 NCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVIS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFHLKRSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 VSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFHLKRSIP
370 380 390 400 410 420
430 440 450
pF1KE1 QVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
430 440 450
>>CCDS3810.1 CPE gene_id:1363|Hs108|chr4 (476 aa)
initn: 1441 init1: 694 opt: 1411 Z-score: 1720.1 bits: 327.6 E(32554): 1.7e-89
Smith-Waterman score: 1411; 53.1% identity (77.5% similar) in 409 aa overlap (21-416:49-450)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
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CCDS38 CGWLLGAEAQEPGAPAAGMRRRRRLQQEDGISFEYHRYPELREALVSVWLQCTAISRIYT
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
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CCDS38 VGRSFEGRELLVIELSDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEAVGRELLIFLAQYLCNEYQKG
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTYI
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CCDS38 NETIVNLIHSTRIHIMPSLNPDGFEKAASQPGELKDWFVGRSNAQGIDLNRNFPDLDRIV
140 150 160 170 180 190
180 190 200 210 220
pF1KE1 YYNEKYGGPNHHLPLPDNWK-----SQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYP
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CCDS38 YVNEKEGGPNNHL-LKNMKKIVDQNTKLAPETKAVIHWIMDIPFVLSANLHGGDLVANYP
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270
pF1KE1 YDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQG------WNCGDY-FPDG
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CCDS38 YD---ETRSGSAHEYSSS--PDDAIFQSLARAYSSFNPAMSDPNRPPCRKNDDDSSFVDG
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 ITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQV
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CCDS38 TTNGGAWYSVPGGMQDFNYLSSNCFEITVELSCEKFPPEETLKTYWEDNKNSLISYLEQI
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 HQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPET
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CCDS38 HRGVKGFVRDLQGNPIANATISVEGIDHDVTSAKDGDYWRLLIPGNYKLTASAPGYLAIT
380 390 400 410 420 430
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 VTVTVGPAEPTL-VNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGP
:.: : :. :.:.:.
CCDS38 KKVAV-PYSPAAGVDFELESFSERKEEEKEELMEWWKMMSETLNF
440 450 460 470
>>CCDS43212.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (515 aa)
initn: 1179 init1: 605 opt: 1315 Z-score: 1602.4 bits: 305.9 E(32554): 6.2e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:46-432)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
. : :: : ..::.: .. ..: ..:.::
CCDS43 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
20 30 40 50 60 70
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
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CCDS43 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
80 90 100 110 120 130
120 130 140 150 160
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
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CCDS43 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
: :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.:
CCDS43 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
200 210 220 230 240 250
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
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CCDS43 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
260 270 280 290 300 310
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
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CCDS43 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
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CCDS43 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
::
CCDS43 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
440 450 460 470 480 490
>>CCDS3404.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (641 aa)
initn: 1179 init1: 605 opt: 1315 Z-score: 1600.9 bits: 306.0 E(32554): 7.5e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:172-558)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
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CCDS34 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
150 160 170 180 190 200
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
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CCDS34 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
210 220 230 240 250 260
120 130 140 150 160
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
: :: .:.. ::::.::::::::::::::.: . :. ::.::...:::::::::.. :
CCDS34 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
270 280 290 300 310 320
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
: :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.:
CCDS34 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
330 340 350 360 370 380
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
: .: .. .::::.:.:. :...:. .: :. .. : :: ... : : :::.
CCDS34 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
390 400 410 420 430
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
:::.. ::.:::::::::::::.::.: :::::: : : :.:.:..:.: ::.::::
CCDS34 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
440 450 460 470 480 490
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
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CCDS34 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
500 510 520 530 540 550
410 420 430 440 450
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
::
CCDS34 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
560 570 580 590 600 610
>>CCDS33953.1 CPZ gene_id:8532|Hs108|chr4 (652 aa)
initn: 1179 init1: 605 opt: 1315 Z-score: 1600.8 bits: 306.0 E(32554): 7.6e-83
Smith-Waterman score: 1315; 50.3% identity (77.0% similar) in 392 aa overlap (21-406:183-569)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVYS
. : :: : ..::.: .. ..: ..:.::
CCDS33 EDEGCYDPLEKLRGGLEADEALPSGLPPTFIRFSHHSYAQMVRVLRRTASRCAHVARTYS
160 170 180 190 200 210
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 IGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNR
:::: .::.: :.:::..:: :: .::::: .::.::::. :::... :...:: :.
CCDS33 IGRSFDGRELLVIEFSSRPGQHELMEPEVKLIGNIHGNEVAGREMLIYLAQYLCSEYLLG
220 230 240 250 260 270
120 130 140 150 160
pF1KE1 NQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNT-Y
: :: .:.. ::::.::::::::::::::.: . :. ::.::...:::::::::.. :
CCDS33 NPRIQRLLNTTRIHLLPSMNPDGYEVAAAEGAGYNGWTSGRQNAQNLDLNRNFPDLTSEY
280 290 300 310 320 330
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IYYNEKYGGPNHHLPLPDN-WKSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVANYPYDK
: :. . :.:.:.. : ..: :::.:...::... :::::.:::: .:..::.:
CCDS33 YRLAETRGARSDHIPIPQHYWWGKVAPETKAIMKWMQTIPFVLSASLHGGDLVVSYPFDF
340 350 360 370 380 390
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMF-QGWN-CG-DYFPDG-ITNGAS
: .: .. .::::.:.:. :...:. .: :. .. : :: ... : : :::.
CCDS33 S-KH---PQEEKMFSPTPDEKMFKLLSRAYADVHPMMMDRSENRCGGNFLKRGSIINGAD
400 410 420 430 440
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 WYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKG
:::.. ::.:::::::::::::.::.: :::::: : : :.:.:..:.: ::.::::
CCDS33 WYSFTGGMSDFNYLHTNCFEITVELGCVKFPPEEALYILWQHNKESLLNFVETVHRGIKG
450 460 470 480 490 500
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 MVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVG
.: :. . . :: :::.:: ::.:.. :::.::: :::. : : :::: ... ..
CCDS33 VVTDKFGKPVKNARISVKGIRHDITTAPDGDYWRLLPPGIHIVIAQAPGY-AKVIKKVII
510 520 530 540 550 560
410 420 430 440 450
pF1KE1 PAEPTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
::
CCDS33 PARMKRAGRVDFILQPLGMGPKNFIHGLRRTGPHDPLGGASSLGEATEPDPLRARRQPSA
570 580 590 600 610 620
>>CCDS13033.1 CPXM1 gene_id:56265|Hs108|chr20 (734 aa)
initn: 1269 init1: 599 opt: 834 Z-score: 1012.9 bits: 197.4 E(32554): 4.2e-50
Smith-Waterman score: 1299; 48.2% identity (71.7% similar) in 448 aa overlap (20-451:294-730)
10 20 30 40
pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPGITRVY
:. :.:: : . . . .::..::.:::.:
CCDS13 APCLRAEILACPVSDPNDLFLEAPASGSSDPLDFQHHNYKAMRKLMKQVQEQCPNITRIY
270 280 290 300 310 320
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 SIGRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRN
:::.: .: .:::.:.::.:: :: ::::.::..:::::::::::.: : .:::.::
CCDS13 SIGKSYQGLKLYVMEMSDKPGEHELGEPEVRYVAGMHGNEALGRELLLLLMQFLCHEFLR
330 340 350 360 370 380
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 RNQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFPDLNTY
: :...:... :::.::::::::::.: .: . :. :: : ...:::.:: ::::
CCDS13 GNPRVTRLLSEMRIHLLPSMNPDGYEIAYHRGSELVGWAEGRWNNQSIDLNHNFADLNTP
390 400 410 420 430 440
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IYYNEKYGG-----PNHHLPLPDNW---KSQVEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVV
.. . : :::::::: . .. : :::::::.::. . :::::::::: .:
CCDS13 LWEAQDDGKVPHIVPNHHLPLPTYYTLPNATVAPETRAVIKWMKRIPFVLSANLHGGELV
450 460 470 480 490 500
230 240 250 260 270
pF1KE1 ANYPYDKSFEHRVRGVRRTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWN---CG--DYFP
..::.: . :. . : :::::: .:. :. ::. .. : : . : :.
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pF1KE1 DG-ITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFL
: : :::.:... .:.::.::::::::.:.:::::::: :.:: .:: .:..::. .:
CCDS13 HGNIINGADWHTVPGSMNDFSYLHTNCFEVTVELSCDKFPHENELPQEWENNKDALLTYL
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pF1KE1 EQVHQGIKGMVLDENYN-NLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGY
:::..:: :.: :.. . ..:.:::.:.:::::::.. :::.::: :: : :.:.: ::
CCDS13 EQVRMGIAGVVRDKDTELGIADAVIAVDGINHDVTTAWGGDYWRLLTPGDYMVTASAEGY
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pF1KE1 DPETVTVTVGPAE-PTLVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQL
: . : : : :: : .. : .: . .. ::: :. :.. ..:
CCDS13 HSVTRNCRVTFEEGPFPCNFVLTKT-----PKQRL-RELLAAGAKVPPDLRRRLERLRGQ
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CCDS13 KD
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: . :::.. .:. . :. : :::::: ::... :::..::.:: .:.
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:::: ::. .: ::::::..:. :: :. .: : .. : :. .
CCDS76 YPYD-----LVRSPWKTQEHTPTPDDHVFRWLAYSYASTHRLMTDARRRVCHTEDFQKEE
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pF1KE1 GITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQ
: .:::::.... ...::.::::::::... ..:::.: : .: .:: .:::.:: :.::
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pF1KE1 VHQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPE
::.::::.: : . ... ::.::: :::::. ... :::.::: :: :.:.: : :.
CCDS76 VHRGIKGLVRDSHGKGIPNAIISVEGINHDIRTANDGDYWRLLNPGEYVVTAKAEGFTAS
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: . :: : .: :... ... .:. .. : . : : : ... :::
CCDS76 TKNCMVGYDMGATRCDFTLSKT--NMARIREI-MEKFGKQPVSLPARRLKLRGQKRRQRG
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pF1KE1 PA
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pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNE-CPGITRVYSI
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CCDS54 CMRLEVLGCSVAPVYSYYAQNEVVATDDLDFRHHSYKDM-RQLMKVVNEECPTITRTYSL
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pF1KE1 GRSVEGRHLYVLEFSDHPGIHEPLEPEVKYVGNMHGNEALGRELMLQLSEFLCEEFRNRN
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CCDS54 GKSSRGLKIYAMEISDNPGEHELGEPEFRYTAGIHGNEVLGRELLLLLMQYLCREYRDGN
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CCDS54 PRVRSLVQDTRIHLVPSLNPDGYEVAAQMGSEFGNWALGLWTEEGFDIFEDFPDLNSVLW
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pF1KE1 YNEK-----YGGPNHHLPLPDNWKSQ---VEPETRAVIRWMHSFNFVLSANLHGGAVVAN
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CCDS54 GAEERKWVPYRVPNNNLPIPERYLSPDATVSTEVRAIIAWMEKNPFVLGANLNGGERLVS
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pF1KE1 YPYDKSFEHR-----------VRGVRR---TASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGW
:::: . .:: . . . ::: .:. :: .. :: . . .
CCDS54 YPYDMARTPTQEQLLAAAMAAARGEDEDEVSEAQETPDHAIFRWLAISFASAHLTLTEPY
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pF1KE1 NCG----DYFPD-GITNGASWYSLSKGMQDFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREW
: :: ::.:::.: . ..::.::::::.:... :.::::: : :: :::
CCDS54 RGGCQAQDYTGGMGIVNGAKWNPRTGTINDFSYLHTNCLELSFYLGCDKFPHESELPREW
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pF1KE1 LGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAVISVSGINHDVTSGDHGDYFRLLLPGI
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CCDS54 ENNKEALLTFMEQVHRGIKGVVTDEQGIPIANATISVSGINHGVKTASGGDYWRILNPGE
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pF1KE1 YTVSATAPGYDPETVTVTVG-PAEPTLVNFHLKRS----------------IPQVSPVR-
: :.: : :: : . : .: : :: : :: ::...: :
CCDS54 YRVTAHAEGYTPSAKTCNVDYDIGATQCNFILARSNWKRIREIMAMNGNRPIPHIDPSRP
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pF1KE1 RAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
.:..:. . ..: . :
CCDS54 MTPQQRRLQQRRLQHRLRLRAQMRLRRLNATTTLGPHTVPPTLPPAPATTLSTTIEPWGL
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CCDS89 WVLVVGRFPKEHRIGIPEFKYVANMHGDETVGRELLLHLIDYLVTS-DGKDPEITNLINS
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CCDS89 TRIHIMPSMNPDGFE--AVKKPDCY-YSIGRENYNQYDLNRNFPDAFEY-----------
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CCDS89 ------NNVSRQ--PETVAVMKWLKTETFVLSANLHGGALVASYPFDNGVQ--ATGALYS
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pF1KE1 ASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGWNCGDY--FPDGITNGASWYSLSKGMQDFNYL
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CCDS89 RSL-TPDDDVFQYLAHTYASRNPNMKKGDECKNKMNFPNGVTNGYSWYPLQGGMQDYNYI
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pF1KE1 HTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDENYNNLANAV
..:::::::::: :.: ::.: : .:. .::....::: :.::.:.:.: : : :..
CCDS89 WAQCFEITLELSCCKYPREEKLPSFWNNNKASLIEYIKQVHLGVKGQVFDQNGNPLPNVI
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pF1KE1 ISVSGINH--DVTSGDHGDYFRLLLPGIYTVSATAPGYDPETVTVTVGPAEPTLVNFH-L
. :. .: .. .:.:. ::::: : ...:.::.::. .: .. : . :: :
CCDS89 VEVQDRKHICPYRTNKYGEYYLLLLPGSYIINVTVPGHDPH-ITKVIIPEKSQ--NFSAL
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pF1KE1 KRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
:..:
CCDS89 KKDILLPFQGQLDSIPVSNPSCPMIPLYRNLPDHSAATKPSLFLFLVSLLHIFFK
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pF1KE1 RTASTPTPDDKLFQKLAKVYSYAHGWMFQGW-NC-GDY---FPDGITNGASWYSLSKGMQ
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CCDS56 ----SKTSDDEVFKYLAKAYASNHPIMKTGEPHCPGDEDETFKDGITNGAHWYDVEGGMQ
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pF1KE1 DFNYLHTNCFEITLELSCDKFPPEEELQREWLGNREALIQFLEQVHQGIKGMVLDE-NYN
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CCDS56 DYNYVWANCFEITLELSCCKYPPASQLRQEWENNRESLITLIEKVHIGVKGFVKDSITGS
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CCDS56 GLENATISVAGINHNITTGRFGDFYRLLVPGTYNLTVVLTGYMPLTVTNVVVKEGPA--T
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pF1KE1 LVNFHLKRSIPQVSPVRRAPSRRHGVRAKVQPQARKKEMEMRQLQRGPA
:.: :. .. .: :
CCDS56 EVDFSLRPTVTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFL
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pF1KE1 MSDLLSVFLHLLLLFKLVAPVTFRHHRYDDLVRTLYKVQNECPG
.. . : :.::.. :. : . :: :.
CCDS56 VTSVIPDTTEAVSTASTVAIPNILSGTSSSYQPIQPKDFHHHHFPDMEIFLRRFANEYPN
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CCDS56 ITRLYSLGKSVESRELYVMEISDNPGVHEPGEPEFKYIGNMHGNEVVGRELLLNLIEYLC
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pF1KE1 EEFRNRNQRIVQLIQDTRIHILPSMNPDGYEVAAAQGPNKPGYLVGRNNANGVDLNRNFP
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CCDS56 KNF-GTDPEVTDLVHNTRIHLMPSMNPDGYE-KSQEGDSIS--VIGRNNSNNFDLNRNFP
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CCDS56 D---------------QFVQITD----PTQPETIAVMSWMKSYPFVLSANLHGGSLVVNY
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CCDS56 PFDDDEQ----GL--ATYSKSPDDAVFQQIALSYSKENSQMFQGRPCKNMYPNEYFPHGI
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CCDS56 TNGASWYNVPGGMQDWNYLQTNCFEVTIELGCVKYPLEKELPNFWEQNRRSLIQFMKQVH
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CCDS56 QGVRGFVLDATDGRGILNATISVAEINHPVTTYKTGDYWRLLVPGTYKITASARGYNPVT
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CCDS56 KNVTVKSEGAIQVNFTLVRSSTDSNNESKKGKGASSSTNDASDPTTKEFETLIKDLSAEN
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CCDS56 DPTTKEFETLIKDLSAENGLESLMLRSSSNLALALYRYHSYKDLSEFLRGLVMNYPHITN
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. ..:.:.: ::.. ::.:..:.. :: ::....:...::: .: ::.: :.:::: ..
CCDS56 LTNLGQSTEYRHIWSLEISNKPNVSEPEEPKIRFVAGIHGNAPVGTELLLALAEFLCLNY
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CCDS56 K-KNPAVTQLVDRTRIVIVPSLNPDGRERAQEKDCTSK---IGQTNARGKDLDTDFT---
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CCDS56 --------------------NNASQ--PETKAIIENLIQKQDFSLSVALDGGSMLVTYPY
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CCDS56 DKP----VQTVE--------NKETLKHLASLYANNHPSMHMGQPSCPNKSDENIPGGVMR
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CCDS56 GAEWHSHLGSMKDYSVTYGHCPEITVYTSCCYFPSAARLPSLWADNKRSLLSMLVEVHKG
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pF1KE1 IKGMVLDENYNNLANAVISVS-GINHDVTSGDHGDYFRLLL-PGIYTVSATAPGYDPETV
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CCDS56 VHGFVKDKTGKPISKAVIVLNEGIK---VQTKEGGYFHVLLAPGVHNIIAIADGYQQQHS
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: :
CCDS56 QVFVHHDAASSVVIVFDTDNRIFGLPRELVVTVSGATMSALILTACIIWCICSIKSNRHK
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458 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]