Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1562
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1562, 482 aa
1>>>pF1KE1562 482 - 482 aa - 482 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1654+/-0.000908; mu= 14.2962+/- 0.055
mean_var=96.6141+/-18.801, 0's: 0 Z-trim(108.4): 55 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.130483
statistics sampled from 10108 (10163) to 10108 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.312), width: 16
Scan time: 3.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 ( 482) 3192 611.4 6.9e-175
CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 394) 582 120.0 4.7e-27
CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 ( 367) 532 110.5 3e-24
CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 ( 314) 514 107.1 2.8e-23
CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 ( 419) 484 101.5 1.8e-21
CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 ( 381) 479 100.6 3.2e-21
CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX ( 384) 473 99.5 6.9e-21
CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 ( 384) 460 97.0 3.8e-20
CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 ( 303) 424 90.2 3.4e-18
CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 ( 665) 422 90.0 8.4e-18
CCDS7724.1 DUSP8 gene_id:1850|Hs108|chr11 ( 625) 405 86.8 7.3e-17
CCDS2289.1 DUSP19 gene_id:142679|Hs108|chr2 ( 217) 344 75.0 9e-14
CCDS4468.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 184) 321 70.6 1.6e-12
CCDS69035.1 DUSP22 gene_id:56940|Hs108|chr6 ( 205) 321 70.7 1.7e-12
CCDS55882.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 692) 324 71.6 3.1e-12
CCDS53825.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 ( 703) 324 71.6 3.1e-12
CCDS9121.1 SSH1 gene_id:54434|Hs108|chr12 (1049) 324 71.7 4.3e-12
CCDS13193.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 235) 311 68.8 7.1e-12
CCDS11253.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1423) 322 71.4 7.2e-12
CCDS74024.1 SSH2 gene_id:85464|Hs108|chr17 (1450) 322 71.4 7.3e-12
CCDS11320.1 DUSP14 gene_id:11072|Hs108|chr17 ( 198) 304 67.5 1.5e-11
CCDS82607.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 232) 304 67.5 1.7e-11
CCDS82606.1 DUSP15 gene_id:128853|Hs108|chr20 ( 295) 304 67.6 2.1e-11
CCDS8157.1 SSH3 gene_id:54961|Hs108|chr11 ( 659) 298 66.7 8.9e-11
CCDS14264.1 DUSP21 gene_id:63904|Hs108|chrX ( 190) 290 64.8 9.2e-11
>>CCDS1528.1 DUSP10 gene_id:11221|Hs108|chr1 (482 aa)
initn: 3192 init1: 3192 opt: 3192 Z-score: 3253.2 bits: 611.4 E(32554): 6.9e-175
Smith-Waterman score: 3192; 100.0% identity (100.0% similar) in 482 aa overlap (1-482:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPPSPLDDRVVVALSRPVRPQDLNLCLDSSYLGSANPGSNSHPPVIATTVVSLKAANLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MPPSPLDDRVVVALSRPVRPQDLNLCLDSSYLGSANPGSNSHPPVIATTVVSLKAANLTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MPSSSGSARSLNCGCSSASCCTVATYDKDNQAQTQAIAAGTTTTAIGTSTTCPANQMVNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MPSSSGSARSLNCGCSSASCCTVATYDKDNQAQTQAIAAGTTTTAIGTSTTCPANQMVNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NENTGSLSPSSGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NENTGSLSPSSGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 MEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NEPSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 NEPSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SAASSLLPQPIPTTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SAASSLLPQPIPTTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 AYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVET
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VV
::
CCDS15 VV
>>CCDS6072.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (394 aa)
initn: 544 init1: 338 opt: 582 Z-score: 599.2 bits: 120.0 E(32554): 4.7e-27
Smith-Waterman score: 582; 33.7% identity (67.0% similar) in 297 aa overlap (167-459:39-331)
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 VSGTPKQLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGP-VIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHIN
::: : ...:::::. .. ..: :.:..
CCDS60 EMDCSVLKRLMNRDENGGGAGGSGSHGTLGLPSGGKCLLLDCRPFLAHSAGYILGSVNVR
10 20 30 40 50 60
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 CADKISRRRLQQGKITVLDLISCREG-KDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHI
: . : ::: .:.... ... .: . .. . . .::::: . . . .. . .
CCDS60 C-NTIVRRR-AKGSVSLEQILPAEEEVRARLRSGLYSAVIVYDERSPRAESLREDSTVSL
70 80 90 100 110 120
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 VLESLKREGKEPLV--LKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPIP
:...:.:.... . :::: :.... ..:... : ... :
CCDS60 VVQALRRNAERTDICLLKGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPPSATEPLDLGCSSC
130 140 150 160 170 180
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 TTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKR
:: ... . :::::.::. : : .. :.: ..::.. : :.: : ..::
CCDS60 GTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCP-NHFE-GHYQYKC
190 200 210 220 230 240
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 LPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMT
.:. :..: .. ..: ::.:.:. ...: .:.:::::.:::::: .:::: . :. .
CCDS60 IPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMMKKRVRLE
250 260 270 280 290 300
440 450 460 470 480
pF1KE1 DAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
.:..::: .: :::::..::::::.::
CCDS60 EAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLRERGKTPATPTSQF
310 320 330 340 350 360
>>CCDS4380.1 DUSP1 gene_id:1843|Hs108|chr5 (367 aa)
initn: 445 init1: 339 opt: 532 Z-score: 548.7 bits: 110.5 E(32554): 3e-24
Smith-Waterman score: 532; 33.7% identity (63.9% similar) in 294 aa overlap (173-459:25-309)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
...::: :. .: .:: :.:.. . : :
CCDS43 MVMEVGTLDAGGLRALLGERAAQCLLLDCRSFFAFNAGHIAGSVNVRFST-IVR
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKRE
:: .: . . .. : . . . ... :: . . . . : .. .: ::
CCDS43 RR-AKGAMGLEHIVPNAELRGRLLAGAYHAVVLLDERSAALDGAKRDGTLALAAGALCRE
60 70 80 90 100 110
270 280 290 300 310
pF1KE1 GKEPLV--LKGGLSSFKQNHENLCDNS-----LQLQECREVGGGASAASSLLPQPIPTTP
.. : :::: .:. . .::... :.: : .: .. : .::
CCDS43 ARAAQVFFLKGGYEAFSASCPELCSKQSTPMGLSLPLSTSVPDSAESGCSSC-----STP
120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 DIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPA
... . :::::.::. :. : .. :.: .:::... : :.: : ..:: .:.
CCDS43 LYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASRKDMLDALGITALINVSANCP-NHFE-GHYQYKSIPV
170 180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 TDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAY
:..: .. ..:.::..::. .. : ...:::::.:::::: .::::. .:. . .:.
CCDS43 EDNHKADISSWFNEAIDFIDSIKNAGGRVFVHCQAGISRSATICLAYLMRTNRVKLDEAF
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480
pF1KE1 KFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
.::: .: :::::..::::::.::
CCDS43 EFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLAPHCSAEAGSPAMAVLDRGTSTTTVFNFPVSI
290 300 310 320 330 340
>>CCDS2016.1 DUSP2 gene_id:1844|Hs108|chr2 (314 aa)
initn: 501 init1: 331 opt: 514 Z-score: 531.4 bits: 107.1 E(32554): 2.8e-23
Smith-Waterman score: 546; 34.6% identity (63.7% similar) in 292 aa overlap (173-459:28-308)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
...:::::. . . :...: . . . :
CCDS20 MGLEAARELECAALGTLLRDPREAERTLLLDCRPFLAFCRRHVRAARPVP-WNALLR
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 RRLQQGKITVLD-LISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKR
:: . .:: :. : . . : . .: ::.. ... :..: :..: .: .
CCDS20 RRARGPPAAVLACLLPDRALRTRLVRGELARAVVLDEGSASVAELRPDSPAHVLLAALLH
60 70 80 90 100 110
270 280 290 300 310
pF1KE1 EGKE-PLV---LKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPIPTTPDI
: . : . :.::...:. .::... .: .: ..: : : .
CCDS20 ETRAGPTAVYFLRGGFDGFQGCCPDLCSEA-PAPALPPTGDKTSRSDSRAPVYDQGGP-V
120 130 140 150 160 170
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 ENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPATD
: :::.::::. . ..::. .: .: :.::.. : :.: ::: :: .:. :
CCDS20 E------ILPYLFLGSCSHSSDLQGLQACGITAVLNVSASCP-NHFE-GLFRYKSIPVED
180 190 200 210 220
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAYKF
.. .. .:.::. ::. ... : .:.:::::.:::::: .::::. :. . .:. :
CCDS20 NQMVEISAWFQEAIGFIDWVKNSGGRVLVHCQAGISRSATICLAYLMQSRRVRLDEAFDF
230 240 250 260 270 280
440 450 460 470 480
pF1KE1 VKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
:: .: .::::..::::::.::
CCDS20 VKQRRGVISPNFSFMGQLLQFETQVLCH
290 300 310
>>CCDS33766.2 DUSP7 gene_id:1849|Hs108|chr3 (419 aa)
initn: 540 init1: 476 opt: 484 Z-score: 499.1 bits: 101.5 E(32554): 1.8e-21
Smith-Waterman score: 629; 33.0% identity (62.4% similar) in 364 aa overlap (129-462:31-385)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 AGTTTTAIGTSTTCPANQMVNNNENTGSLSPSSGVGSPVSGTPKQLASIKIIYPNDLAKK
:..: :: .:: :. .: :.
CCDS33 MKNQLRGPPARAHMSTSGAAAAGGTRAGSEPGAGSGSG-AGTGAGAATGAGAMPCKSAEW
10 20 30 40 50
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 MTKCSKSHLPSQGP---VIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISRRRLQQGKITVLDL
. . .: ..: ...:::: ...:::. :... . :::..:.. . ..
CCDS33 L----QEELEARGGASLLLLDCRPHELFESSHIETAINLA-IPGLMLRRLRKGNLPIRSI
60 70 80 90 100 110
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 ISCREGKDSFK-RIFSKEIIVYDENTNE--PSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGG
: . :. : : . ...::: : : : :.. : ..:..:. .: . :.::
CCDS33 IPNHADKERFATRCKAATVLLYDEATAEWQPEPGAPASVLGLLLQKLRDDGCQAYYLQGG
120 130 140 150 160 170
280 290 300
pF1KE1 LSSFKQNHENLCDNSLQLQECRE-------VG-GGASAASSL--------LPQ-------
...:. .. . :..... . .: :: .:. ::.
CCDS33 FNKFQTEYSEHCETNVDSSSSPSSSPPTSVLGLGGLRISSDCSDGESDRELPSSATESDG
180 190 200 210 220 230
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 -PIPTTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLF
:.:.. . : . :::.:.:: .:. .::.. . .: :..::: .:: . : :
CCDS33 SPVPSS---QPAFPVQILPYLYLGCAKDSTNLDVLGKYGIKYILNVTPNLPNAFEHGGEF
240 250 260 270 280 290
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTR
.::..: .: .::: :.: ::. ::.::.. :.:.:: ::.:::.:...::::..
CCDS33 TYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARSKKCGVLVHCLAGISRSVTVTVAYLMQKMN
300 310 320 330 340 350
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
....::: ::: :. ::::.:::::::.::. :
CCDS33 LSLNDAYDFVKRKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNHASSEQLYFSTPTNHNLF
360 370 380 390 400 410
CCDS33 PLNTLEST
>>CCDS9033.1 DUSP6 gene_id:1848|Hs108|chr12 (381 aa)
initn: 638 init1: 477 opt: 479 Z-score: 494.6 bits: 100.6 E(32554): 3.2e-21
Smith-Waterman score: 646; 37.1% identity (67.3% similar) in 315 aa overlap (173-462:35-347)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
...:::: :..:::..:... :
CCDS90 LRPVPFASEMAISKTVAWLNEQLELGNERLLLMDCRPQELYESSHIESAINVA-IPGIML
10 20 30 40 50 60
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSF-KRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQP-LHIVLESLK
::::.:.. : :.. : .: : .: . ...:::.... .. .. : ..:..::
CCDS90 RRLQKGNLPVRALFTRGEDRDRFTRRCGTDTVVLYDESSSDWNENTGGESVLGLLLKKLK
70 80 90 100 110 120
270 280 290 300
pF1KE1 REGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECRE-------VG-GG---ASAASSLLPQ
:: . . :.::.:.:. . :...:. : .: :: .: .:: . .
CCDS90 DEGCRAFYLEGGFSKFQAEFSLHCETNLD-GSCSSSSPPLPVLGLGGLRISSDSSSDIES
130 140 150 160 170 180
310 320 330 340 350
pF1KE1 PIPTTP----DIENAELT---P-----ILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTH
. : : ... :. : :::::.:: .:. .::......: :..::: .
CCDS90 DLDRDPNSATDSDGSPLSNSQPSFPVEILPFLYLGCAKDSTNLDVLEEFGIKYILNVTPN
190 200 210 220 230 240
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSAT
:: . : :.::..: .: .::: :.: ::. ::.::. . :.:.:: ::.:::.:
CCDS90 LPNLFENAGEFKYKQIPISDHWSQNLSQFFPEAISFIDEARGKNCGVLVHCLAGISRSVT
250 260 270 280 290 300
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 IVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMG
...::::.. ..:.::: .:: :. ::::.:::::::.::. :
CCDS90 VTVAYLMQKLNLSMNDAYDIVKMKKSNISPNFNFMGQLLDFERTLGLSSPCDNRVPAQQL
310 320 330 340 350 360
480
pF1KE1 VETVV
CCDS90 YFTTPSNQNVYQVDSLQST
370 380
>>CCDS14724.1 DUSP9 gene_id:1852|Hs108|chrX (384 aa)
initn: 590 init1: 473 opt: 473 Z-score: 488.4 bits: 99.5 E(32554): 6.9e-21
Smith-Waterman score: 535; 32.6% identity (59.4% similar) in 340 aa overlap (168-462:18-344)
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 SGTPKQLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCA
: ...::: :....: ::. .
CCDS14 MEGLGRSCLWLRRELSPPRPRLLLLDCRSRELYESARIGGALSVALP
10 20 30 40
200 210 220 230 240
pF1KE1 DKISRRRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYD---------ENTNEPSRVMP
. :::..:...: :. : .. ...:: : : .
CCDS14 -ALLLRRLRRGSLSVRALLP---GPP-LQPPPPAPVLLYDQGGGRRRRGEAEAEAEEWEA
50 60 70 80 90 100
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLP
. : .:..:..:: :.::.: :. . .::..:: .: :... . .:
CCDS14 ESVLGTLLQKLREEGYLAYYLQGGFSRFQAECPHLCETSL--------AGRAGSSMAPVP
110 120 130 140 150
310 320 330
pF1KE1 QPIPTT--------PDIENAE----------------LTP------------ILPFLFLG
:.:.. : .:: :: ::: :.::
CCDS14 GPVPVVGLGSLCLGSDCSDAESEADRDSMSCGLDSEGATPPPVGLRASFPVQILPNLYLG
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 NEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFE
. .:. .:... .:.: :..::: .:: . ..: :.::..: .: .::: ..: ::.:
CCDS14 SARDSANLESLAKLGIRYILNVTPNLPNFFEKNGDFHYKQIPISDHWSQNLSRFFPEAIE
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 FIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFM
::.:: . . :.:.:: ::::::.:...::::.. .....::: .:: :. ::::.:::
CCDS14 FIDEALSQNCGVLVHCLAGVSRSVTVTVAYLMQKLHLSLNDAYDLVKRKKSNISPNFNFM
280 290 300 310 320 330
460 470 480
pF1KE1 GQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
::::.::..:
CCDS14 GQLLDFERSLRLEERHSQEQGSGGQASAASNPPSFFTTPTSDGAFELAPT
340 350 360 370 380
>>CCDS7566.1 DUSP5 gene_id:1847|Hs108|chr10 (384 aa)
initn: 473 init1: 301 opt: 460 Z-score: 475.2 bits: 97.0 E(32554): 3.8e-20
Smith-Waterman score: 460; 27.7% identity (61.3% similar) in 318 aa overlap (173-477:24-331)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
:..::::.. . :...:....: ...
CCDS75 MKVTSLDGRQLRKMLRKEAAARCVVLDCRPYLAFAASNVRGSLNVNL-NSVVL
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250
pF1KE1 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSK------EIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVL
:: . : ... .. . .. :.... ..: :... . ... . ..::
CCDS75 RRARGGAVSARYVLPDEAAR---ARLLQEGGGGVAAVVVLDQGSRHWQKLREESAARVVL
60 70 80 90 100
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 ESLKR---EGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLC-DNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPIP
:: : . :::: .: ... . : : . :: : . : : .:.
CCDS75 TSLLACLPAGPRVYFLKGGYETFYSEYPECCVDVKPISQEKIE---SERALISQCGKPVV
110 120 130 140 150 160
320 330 340 350 360
pF1KE1 TT---PDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFN
.. : ... . :::::.::. :. . . :.: ..::. . . ..
CCDS75 NVSYRPAYDQGGPVEILPFLYLGSAYHASKCEFLANLHITALLNVSRRTS--EACATHLH
170 180 190 200 210 220
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 YKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRM
:: .:. ::. .. ..:.::..::. ... : .:.::.::.::: :: .::::: ..
CCDS75 YKWIPVEDSHTADISSHFQEAIDFIDCVREKGGKVLVHCEAGISRSPTICMAYLMKTKQF
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
. .:. ..: .: ..:::..::::::..: .. . :: :. .:
CCDS75 RLKEAFDYIKQRRSMVSPNFGFMGQLLQYESEILPS-TPNPQPPSCQGEAAGSSLIGHLQ
290 300 310 320 330 340
CCDS75 TLSPDMQGAYCTFPASVLAPVPTHSTVSELSRSPVATATSC
350 360 370 380
>>CCDS6073.1 DUSP4 gene_id:1846|Hs108|chr8 (303 aa)
initn: 440 init1: 338 opt: 424 Z-score: 440.1 bits: 90.2 E(32554): 3.4e-18
Smith-Waterman score: 424; 37.4% identity (67.4% similar) in 190 aa overlap (270-459:53-240)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TNEPSRVMPSQPLHIVLESLKREGKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGG
.:: :.... ..:... :
CCDS60 GRDCKPVRAPSMALGVSQLAGRSRCLCSESQGGYERFSSEYPEFCSKTKALAAIPPPVPP
30 40 50 60 70 80
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ASAASSLLPQPIPTTPDIENAELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLP
... : :: ... . :::::.::. : : .. :.: ..::.. :
CCDS60 SATEPLDLGCSSCGTPLHDQGGPVEILPFLYLGSAYHAARRDMLDALGITALLNVSSDCP
90 100 110 120 130 140
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 LYHYEKGLFNYKRLPATDSNKQNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIV
:.: : ..:: .:. :..: .. ..: ::.:.:. ...: .:.:::::.::::::
CCDS60 -NHFE-GHYQYKCIPVEDNHKADISSWFMEAIEYIDAVKDCRGRVLVHCQAGISRSATIC
150 160 170 180 190 200
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 IAYLMKHTRMTMTDAYKFVKGKRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVE
.:::: . :. . .:..::: .: :::::..::::::.::
CCDS60 LAYLMMKKRVRLEEAFEFVKQRRSIISPNFSFMGQLLQFESQVLATSCAAEAASPSGPLR
210 220 230 240 250 260
480
pF1KE1 TVV
CCDS60 ERGKTPATPTSQFVFSFPVSVGVHSAPSSLPYLHSPITTSPSC
270 280 290 300
>>CCDS8650.1 DUSP16 gene_id:80824|Hs108|chr12 (665 aa)
initn: 573 init1: 321 opt: 422 Z-score: 433.1 bits: 90.0 E(32554): 8.4e-18
Smith-Waterman score: 602; 36.1% identity (67.3% similar) in 294 aa overlap (173-464:27-300)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 QLASIKIIYPNDLAKKMTKCSKSHLPSQGPVIIDCRPFMEYNKSHIQGAVHINCADKISR
..:: :::.::: ::: :..:::. :. .
CCDS86 MAHEMIGTQIVTERLVALLESGTEKVLLIDSRPFVEYNTSHILEAININCS-KLMK
10 20 30 40 50
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 RRLQQGKITVLDLISCREGKDSFKRIFSKEIIVYDENTNEPSRVMPSQPLHIVLESLKRE
::::: :. . .::. . .: . :....:::..... . . . : ..: .:..
CCDS86 RRLQQDKVLITELIQ-HSAKHKVDIDCSQKVVVYDQSSQDVASLSSDCFLTVLLGKLEKS
60 70 80 90 100 110
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 GKEPLVLKGGLSSFKQNHENLCDNSLQLQECREVGGGASAASSLLPQPI--PTTPDIENA
. .: ::.. :.. .::... :.:.: : : : . :
CCDS86 FNSVHLLAGGFAEFSRCFPGLCEGK----------------STLVPTCISQPCLP-VANI
120 130 140 150
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 ELTPILPFLFLGNEQDAQDLDTMQRLNIGYVINVTTHLPLYHYEKGLFNYKRLPATDSNK
: ::: :.:: ..:. . . ::. .::::.:... : . .. :.:..::
CCDS86 GPTRILPNLYLGCQRDVLNKELMQQNGIGYVLNASNTCPKPDFIPES-HFLRVPVNDSFC
160 170 180 190 200 210
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 QNLRQYFEEAFEFIEEAHQCGKGLLIHCQAGVSRSATIVIAYLMKHTRMTMTDAYKFVKG
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CCDS86 EKILPWLDKSVDFIEKAKASNGCVLVHCLAGISRSATIAIAYIMKRMDMSLDEAYRFVKE
220 230 240 250 260 270
450 460 470 480
pF1KE1 KRPIISPNLNFMGQLLEFEEDLNNGVTPRILTPKLMGVETVV
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CCDS86 KRPTISPNFNFLGQLLDYEKKIKNQTGASGPKSKLKLLHLEKPNEPVPAVSEGGQKSETP
280 290 300 310 320 330
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 22:27:35 2016 done: Sun Nov 6 22:27:35 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]