FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1553, 632 aa
1>>>pF1KE1553 632 - 632 aa - 632 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0577+/-0.00095; mu= 16.1990+/- 0.057
mean_var=108.6449+/-21.572, 0's: 0 Z-trim(107.4): 130 B-trim: 64 in 1/50
Lambda= 0.123047
statistics sampled from 9424 (9567) to 9424 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.294), width: 16
Scan time: 3.750
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3492.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4 ( 632) 4241 764.3 0
CCDS47057.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4 ( 728) 4045 729.5 3.7e-210
CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13 ( 690) 1651 304.5 3.1e-82
CCDS59120.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2037) 743 143.7 2.3e-33
CCDS83342.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2070) 743 143.7 2.3e-33
CCDS617.2 PATJ gene_id:10207|Hs108|chr1 (1801) 383 79.8 3.6e-14
CCDS59119.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2008) 379 79.1 6.4e-14
CCDS47951.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2041) 379 79.1 6.5e-14
>>CCDS3492.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4 (632 aa)
initn: 4241 init1: 4241 opt: 4241 Z-score: 4075.3 bits: 764.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4241; 100.0% identity (100.0% similar) in 632 aa overlap (1-632:1-632)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKGASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAEDGQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 HLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 HLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNC
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 KDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRS
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE1 TSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
610 620 630
>>CCDS47057.1 LNX1 gene_id:84708|Hs108|chr4 (728 aa)
initn: 4039 init1: 4039 opt: 4045 Z-score: 3886.4 bits: 729.5 E(32554): 3.7e-210
Smith-Waterman score: 4045; 96.3% identity (97.9% similar) in 628 aa overlap (5-632:101-728)
10 20 30
pF1KE1 MKALLLLVLPWLSPANYIDNVGNLHFLYSELCKG
::.. :. . . . .:. .. :::
CCDS47 EKDFCPMDRKPLVLQHCKKSSILVNKLLNKLLVTCPFREHCTQVLQRCDLEHHFQTSCKG
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ASHYGLTKDRKRRSQDGCPDGCASLTATAPSPEVSAAATISLMTDEPGLDNPAYVSSAED
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 GQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGREN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GQPAISPVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGREN
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 SENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SENTTAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDG
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAP
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 DAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVL
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 AINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGER
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 SNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDG
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 RIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALEVKEYEPQEDCSSPAALDSN
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 HNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKS
620 630 640 650 660 670
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 IVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
680 690 700 710 720
>>CCDS9323.1 LNX2 gene_id:222484|Hs108|chr13 (690 aa)
initn: 1682 init1: 508 opt: 1651 Z-score: 1590.0 bits: 304.5 E(32554): 3.1e-82
Smith-Waterman score: 1651; 50.9% identity (77.7% similar) in 511 aa overlap (131-632:185-690)
110 120 130 140 150
pF1KE1 PVDSGRSNRTRARPFERSTIRSRSFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENS--ENT
:. : :. :.: . . : .: :..
CCDS93 TQAEIENENGPTLLDPAGTLSPEADCLGTGAVPVERHLTSASLSTWSEEPGLDNPAFEES
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 TAPEVFPRLYHLIPDGEITSIKINRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIAR
.. .. . : :.::::.:.:.: .: .:.: .:::.::::..:.::..::::::::
CCDS93 AGADTTQQPLSL-PEGEITTIEIHRSNPYIQLGISIVGGNETPLINIVIQEVYRDGVIAR
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 DGRLLPGDIILKVNGMDISNVPHNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYR
::::: :: ::.::...:::: :::: .: :::..: :::.::..: .: .... :.
CCDS93 DGRLLAGDQILQVNNYNISNVSHNYARAVLSQPCNTLHLTVLRERRFGNRAHNHS-DSNS
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 PRDDSFHVILNKSSPEEQLGIKLVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAING
::.. :.: :.: . :::::::::..:::::::...:.::.: . :.: :::::::::
CCDS93 PREEIFQVALHKRDSGEQLGIKLVRRTDEPGVFILDLLEGGLAAQDGRLSSNDRVLAING
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 HDLRYGSPESAAHLIQASERRVHLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSW--SPGPG-ERS
:::.::.:: ::..:::: .::.:...: . . . ..::: .:..: .: : :
CCDS93 HDLKYGTPELAAQIIQASGERVNLTIARPGKPQPGNTIREAGNHSSSSQHHTPPPYYSRP
400 410 420 430 440 450
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 NTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGR
.. : : .::.:: ....:.: :::::::::: . . .:::.: :: : : ..::::
CCDS93 SSHKDLTQCVTCQEKHITVKKEPHESLGMTVAGGRGSKSGELPIFVTSVPPHGCLARDGR
460 470 480 490 500 510
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 IKTGDILLNVDGVELTEVSRSEAVALLKRTSSS--IVLKALEVK--EYEPQEDCSSPAAL
:: ::.:::..:..::..:.:::::.:: ...: ..::::::. : :. .:...
CCDS93 IKRGDVLLNINGIDLTNLSHSEAVAMLKASAASPAVALKALEVQIVEEATQNAEEQPSTF
520 530 540 550 560 570
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 DSNHNMAPPSDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFF
. :. : .::::::::: :: :..:.::::::. :: :: ::::::: . :.:::
CCDS93 SENEYDA---SWSPSWVMWLGLPSTLHSCHDIVLRRSYLGSWGFSIVGGYEENHTNQPFF
580 590 600 610 620
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 IKSIVEGTPAYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTF
::.:: ::::: :::..:::...:::: :: :: :. :. .::: ....:::.. :::..
CCDS93 IKTIVLGTPAYYDGRLKCGDMIVAVNGLSTVGMSHSALVPMLKEQRNKVTLTVICWPGSL
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 L
.
CCDS93 V
690
>>CCDS59120.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2037 aa)
initn: 731 init1: 209 opt: 743 Z-score: 712.6 bits: 143.7 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 747; 31.9% identity (62.1% similar) in 496 aa overlap (154-626:1570-2037)
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVF---PRLYHLIPDGEITSIK
:. ...: .: : .:: : :.:.
CCDS59 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
1540 1550 1560 1570 1580 1590
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
:.. . .::: ::::.: : :::...:..:. .:::: :: ::.:::.:. ..
CCDS59 ISKGRTGLGLSI--VGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKAT
1600 1610 1620 1630 1640 1650
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
:. :. .::: : . ::..:. .:: . :.. . :.:. : . ::..
CCDS59 HDEAINVLRQTPQRVRLTLYRD---------EAPYKEEEVCDTLTIELQKK-PGKGLGLS
1660 1670 1680 1690 1700
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
.: : .. :::. ... ::.: :.: ..:..: .::.:.: .. :..: :.. : :
CCDS59 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTV
1710 1720 1730 1740 1750 1760
370 380 390 400
pF1KE1 HLVVSRQVR------QRSPDIFQEAGWNSNGSWS-PGPG-------ERSNTPKPLHPTIT
: :.: .. .: :. .... .: .:.. : : : :. . : :
CCDS59 TLEVGR-IKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQ
1770 1780 1790 1800 1810 1820
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 CHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVD
..:...: : .:::...:::.. :.::.. ..: :: .. ....:: ....
CCDS59 -GLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTIC
1830 1840 1850 1860 1870 1880
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALE-----VKEYEPQEDCSSPAALDS-NHNMAPP
:. .....:: ::: .:.:: .... : . :: :: .. . . .
CCDS59 GTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQ
1890 1900 1910 1920 1930 1940
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 SDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTP
.: .: :.: :.:.:.:. : ::: ::::: .:. :...:..
CCDS59 DDLGP--------PQC----KSITLERGPDG-LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGA
1950 1960 1970 1980 1990
590 600 610 620 630
pF1KE1 AYNDGRIRCGDILLAVNGRSTSGMIHACLARLLKELKGRITLTIVSWPGTFL
: .:::.. :: ..::::.: :. : . .::. :: .:: ..:
CCDS59 ASEDGRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS
2000 2010 2020 2030
>>CCDS83342.1 MPDZ gene_id:8777|Hs108|chr9 (2070 aa)
initn: 731 init1: 209 opt: 743 Z-score: 712.5 bits: 143.7 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 747; 31.9% identity (62.1% similar) in 496 aa overlap (154-626:1603-2070)
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFKKINRALSVLRRTKSGSAVANHADQGRENSENTTAPEVF---PRLYHLIPDGEITSIK
:. ...: .: : .:: : :.:.
CCDS83 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
1580 1590 1600 1610 1620 1630
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
:.. . .::: ::::.: : :::...:..:. .:::: :: ::.:::.:. ..
CCDS83 ISKGRTGLGLSI--VGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKAT
1640 1650 1660 1670 1680
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
:. :. .::: : . ::..:. .:: . :.. . :.:. : . ::..
CCDS83 HDEAINVLRQTPQRVRLTLYRD---------EAPYKEEEVCDTLTIELQKK-PGKGLGLS
1690 1700 1710 1720 1730
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LVRKVDEPGVFIFNVLDGGVAYRHGQLEENDRVLAINGHDLRYGSPESAAHLIQASERRV
.: : .. :::. ... ::.: :.: ..:..: .::.:.: .. :..: :.. : :
CCDS83 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKCSLGTV
1740 1750 1760 1770 1780 1790
370 380 390 400
pF1KE1 HLVVSRQVR------QRSPDIFQEAGWNSNGSWS-PGPG-------ERSNTPKPLHPTIT
: :.: .. .: :. .... .: .:.. : : : :. . : :
CCDS83 TLEVGR-IKAGPFHSERRPSQSSQVSEGSLSSFTFPLSGSSTSESLESSSKKNALASEIQ
1800 1810 1820 1830 1840 1850
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 CHEKVVNIQKDPGESLGMTVAGGASHREWDLPIYVISVEPGGVISRDGRIKTGDILLNVD
..:...: : .:::...:::.. :.::.. ..: :: .. ....:: ....
CCDS83 -GLRTVEMKKGPTDSLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTIC
1860 1870 1880 1890 1900 1910
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GVELTEVSRSEAVALLKRTSSSIVLKALE-----VKEYEPQEDCSSPAALDS-NHNMAPP
:. .....:: ::: .:.:: .... : . :: :: .. . . .
CCDS83 GTSTEGMTHTQAVNLLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQ
1920 1930 1940 1950 1960 1970
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 SDWSPSWVMWLELPRCLYNCKDIVLRRNTAGSLGFCIVGGYEEYNGNKPFFIKSIVEGTP
.: .: :.: :.:.:.:. : ::: ::::: .:. :...:..
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1980 1990 2000 2010 2020
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CCDS83 ASEDGRLKRGDQIIAVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS
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CCDS61 EENLEI----------FPVDLQKKAGR-GLGLSIVGKRNGSGVFISDIVKGGAADLDGRL
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CCDS61 GRGSPLGDIPVFIAMIQASGVAARTQKLKVGDRIVSINGQPLDGLSHADVVNLLKNAYGR
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:.:... ... : :. :. : : : :
CCDS61 IILQVVADTNISAIAAQLENMSTGYHLGSPTAEHHPEDTEEQLQMTAD
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CCDS59 -----------SSFTFPLSGSSTSESL-----ESSSKKNALASEIQ-GLRTVEMKKGPTD
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CCDS59 LLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGP--------P
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CCDS59 QC----KSITLERGPDG-LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQII
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CCDS59 AVNGQSLEGVTHEEAVAILKRTKGTVTLMVLS
1980 1990 2000
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CCDS47 AAGAASGEKKNSSQSLMVPQSGSPEPESIRNTSRSSTPAIFASDPATCPIIPGCE-TTIE
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 INRVDPSESLSIRLVGGSETPLVHIIIQHIYRDGVIARDGRLLPGDIILKVNGMDISNVP
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CCDS47 ISKGRTGLGLSI--VGGSDTLLGAIIIHEVYEEGAACKDGRLWAGDQILEVNGIDLRKAT
1640 1650 1660 1670 1680
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HNYAVRLLRQPCQVLWLTVMREQKFRSRNNGQAPDAYRPRDDSFHVILNKSSPEEQLGIK
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CCDS47 HDEAINVLRQTPQRVRLTLYRDE---------APYKEEEVCDTLTIELQKK-PGKGLGLS
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CCDS47 IVGKRNDTGVFVSDIVKGGIADADGRLMQGDQILMVNGEDVRNATQEAVAALLKVSEGSL
1740 1750 1760 1770 1780 1790
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pF1KE1 HLVVSRQVRQRSPDIFQEAGWNSNGSWSPGPGERSNTPKPLHPTITCHEKVVNIQKDPGE
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CCDS47 -----------SSFTFPLSGSSTSESL-----ESSSKKNALASEIQ-GLRTVEMKKGPTD
1800 1810 1820 1830 1840
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CCDS47 SLGISIAGGVGSPLGDVPIFIAMMHPTGVAAQTQKLRVGDRIVTICGTSTEGMTHTQAVN
1850 1860 1870 1880 1890 1900
490 500 510 520 530
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CCDS47 LLKNASGSIEMQVVAGGDVSVVTGHQQEPASSSLSFTGLTSSSIFQDDLGP--------P
1910 1920 1930 1940 1950
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CCDS47 QC----KSITLERGPDG-LGFSIVGGYGSPHGDLPIYVKTVFAKGAASEDGRLKRGDQII
1960 1970 1980 1990 2000
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2010 2020 2030 2040
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]