Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1537
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1537, 912 aa
1>>>pF1KE1537 912 - 912 aa - 912 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5312+/-0.000926; mu= 7.4033+/- 0.056
mean_var=192.2539+/-38.181, 0's: 0 Z-trim(112.8): 80 B-trim: 140 in 1/53
Lambda= 0.092499
statistics sampled from 13406 (13486) to 13406 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.744), E-opt: 0.2 (0.414), width: 16
Scan time: 5.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 912) 6086 825.2 0
CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 927) 6086 825.2 0
CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 ( 879) 5361 728.4 1.4e-209
CCDS1162.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1522) 1268 182.4 5.6e-45
CCDS1163.1 ARHGEF11 gene_id:9826|Hs108|chr1 (1562) 1268 182.4 5.7e-45
CCDS76487.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1441) 1259 181.2 1.2e-44
CCDS55794.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1525) 1259 181.2 1.3e-44
CCDS41727.1 ARHGEF12 gene_id:23365|Hs108|chr11 (1544) 1259 181.2 1.3e-44
CCDS73778.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (1434) 636 98.0 1.3e-19
CCDS32319.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2813) 636 98.2 2.2e-19
CCDS32320.1 AKAP13 gene_id:11214|Hs108|chr15 (2817) 636 98.2 2.2e-19
CCDS45946.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1173) 626 96.6 2.8e-19
CCDS12177.1 ARHGEF18 gene_id:23370|Hs108|chr19 (1015) 609 94.3 1.2e-18
CCDS58957.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1392) 547 86.1 4.8e-16
CCDS54870.1 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1705) 547 86.2 5.7e-16
CCDS47231.2 ARHGEF28 gene_id:64283|Hs108|chr5 (1731) 547 86.2 5.7e-16
CCDS1125.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 958) 539 85.0 7.5e-16
CCDS53375.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 985) 539 85.0 7.7e-16
CCDS53376.1 ARHGEF2 gene_id:9181|Hs108|chr1 ( 986) 539 85.0 7.7e-16
CCDS57967.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 ( 930) 428 70.1 2.1e-11
CCDS79.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1006) 428 70.2 2.3e-11
CCDS41241.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1062) 428 70.2 2.4e-11
CCDS57968.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1075) 428 70.2 2.4e-11
CCDS41240.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1083) 428 70.2 2.4e-11
CCDS57969.1 PLEKHG5 gene_id:57449|Hs108|chr1 (1085) 428 70.2 2.4e-11
>>CCDS12591.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (912 aa)
initn: 6086 init1: 6086 opt: 6086 Z-score: 4398.9 bits: 825.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6086; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-912)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSGDKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSGDKKS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVDAEKPGATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVDAEKPGATD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLELGDSSPQGPMSLESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLELGDSSPQGPMSLESL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 APPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 QEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILH
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 HVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 DKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVAT
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 DHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSST
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 REPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 AEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPARTQEIQENLLSLEETMKQLEELEEEFCRLRPLLSQ
850 860 870 880 890 900
910
pF1KE1 LGGNSVPQPGCT
::::::::::::
CCDS12 LGGNSVPQPGCT
910
>>CCDS12590.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (927 aa)
initn: 6086 init1: 6086 opt: 6086 Z-score: 4398.8 bits: 825.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6086; 100.0% identity (100.0% similar) in 912 aa overlap (1-912:16-927)
10 20 30 40
pF1KE1 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MASLSTWSSPAEPREMEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQ
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 FQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FQSLEQVKRRPAHLMALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLE
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 KTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KTAVLRVPVPPNVAFELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGM
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TPWEQELAQLEAWVGRDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLY
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 MRHLGVRTKSGDKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MRHLGVRTKSGDKKSGRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFR
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 HLKAEVDAEKPGATDRKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HLKAEVDAEKPGATDRKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLE
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LGDSSPQGPMSLESLAPPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LGDSSPQGPMSLESLAPPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 TLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLD
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 ELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELIEVHSLFLDRLMKRRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQ
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 LKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LKAKQRKDPRFCAFVQEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTER
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 EKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 EKVELAAECCREILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITK
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 KKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KKLVHEGPLTWRVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLR
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 PVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PVLRLTSAMTREVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVP
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 APASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAA
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 TALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPARTQEIQENLLSLEETMKQLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPARTQEIQENLLSLEETMKQLE
850 860 870 880 890 900
890 900 910
pF1KE1 ELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT
910 920
>>CCDS12592.1 ARHGEF1 gene_id:9138|Hs108|chr19 (879 aa)
initn: 5361 init1: 5361 opt: 5361 Z-score: 3876.2 bits: 728.4 E(32554): 1.4e-209
Smith-Waterman score: 5782; 96.4% identity (96.4% similar) in 912 aa overlap (1-912:1-879)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 MEDFARGAASPGPSRPGLVPVSIIGAEDEDFENELETNSEEQNSQFQSLEQVKRRPAHLM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ALLQHVALQFEPGPLLCCLHADMLGSLGPKEAKKAFLDFYHSFLEKTAVLRVPVPPNVAF
::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS12 ALLQHVALQFEPGPL---------------------------------VLRVPVPPNVAF
70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ELDRTRADLISEDVQRRFVQEVVQSQQVAVGRQLEDFRSKRLMGMTPWEQELAQLEAWVG
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSGDKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RDRASYEARERHVAERLLMHLEEMQHTISTDEEKSAAVVNAIGLYMRHLGVRTKSGDKKS
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVDAEKPGATD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GRNFFRKKVMGNRRSDEPAKTKKGLSSILDAARWNRGEPQVPDFRHLKAEVDAEKPGATD
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLELGDSSPQGPMSLESL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RKGGVGMPSRDRNIGAPGQDTPGVSLHPLSLDSPDREPGADAPLELGDSSPQGPMSLESL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 APPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 APPESTDEGAETESPEPGDEGEPGRSGLELEPEEPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEV
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 ISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ISELLVTEAAHVRMLRVLHDLFFQPMAECLFFPLEELQNIFPSLDELIEVHSLFLDRLMK
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RRQESGYLIEEIGDVLLARFDGAEGSWFQKISSRFCSRQSFALEQLKAKQRKDPRFCAFV
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 QEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 QEAESRPRCRRLQLKDMIPTEMQRLTKYPLLLQSIGQNTEEPTEREKVELAAECCREILH
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 HVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTWRVTK
570 580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 DKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTREVAT
630 640 650 660 670 680
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 DHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSST
690 700 710 720 730 740
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 REPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 REPLLSSSENGNGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFP
750 760 770 780 790 800
850 860 870 880 890 900
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910
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CCDS12 LGGNSVPQPGCT
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CCDS11 SSQSTFHIPLSPVEVKPGNVRNIIQHFENNQQYDAPEPG-TQRLSTGSFPEDLLESDSSR
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CCDS11 HEKLCRARDQCREILKYVNEAVKQTENRHRLEGYQKRLDATALERASNPLAAEFKSLDLT
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CCDS11 SPVLKLNAVLIRSVATDKRAFFIICTSKLGPPQIYELVALTSSDKNTWMELLEEAVRN-A
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CCDS11 TRHPGAAPMPVHPPPPGPREP----AQQG-------PTPSRVELDDSDVF-HGEPEPEEL
1130 1140 1150 1160
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pF1KE1 LAAT-ALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPRDGDGVPGGGPLSPARTQEIQENLLSLEETM
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CCDS11 PGGTGSQQRVQGKHQVLLEDPEQEGSAEEEELGVLPCPSTSLDGENRGIRTRNPIHLAFP
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pF1KE1 KQLEELEEEFCRLRPLLSQLGGNSVPQPGCT
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CCDS76 ASGASFSQEGGKENDTGSKQVGETSAPGDTLDGTPRTLNTVFDFPPPPLDQVQEEECEVE
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CCDS76 RVTEHGTPKPFRKFDSVAFGESQSEDEQFENDLETDPPNWQQLVSREVLLGLKPCEIKRQ
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CCDS76 QTFVQDAESNPLCRRLQLKDIIPTQMQRLTKYPLLLDNIAKYTEWPTEREKVKKAADHCR
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pF1KE1 EILHHVNQAVRDMEDLLRLKDYQRRLDLSHLRQSSDPMLSEFKNLDITKKKLVHEGPLTW
.::..:::::.. :. ::.::::::: : :. : : . :..:::.::.:..:::::.:
CCDS76 QILNYVNQAVKEAENKQRLEDYQRRLDTSSLKLSEYPNVEELRNLDLTKRKMIHEGPLVW
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pF1KE1 RVTKDKAVEVHVLLLDDLLLLLQRQDERLLLKSHSRTLTPTPDGKTMLRPVLRLTSAMTR
.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:.....:
CCDS76 KVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVR
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pF1KE1 EVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPS
.::::.::..:. :. :::::::::::::. : :: . :.:.: . : :. .
CCDS76 QVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQST
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:
CCDS76 PGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDL
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CCDS55 LEENPEKSETIQDTDTQSLVGSPSTRIAPHIIGAEDDDFGTEHEQING-QCSCFQSIELL
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CCDS55 KSRPAHLAVFLHHVVSQFDPATLLCYLYSDLYKHTNSKETRRIFLEFHQFFLDRSAHLKV
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..:.: .:: . : .:: ::... ..::. : ...:.::... .: .::.::::
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..: ..: :: : :. . ..:. .. : .:. ::: : :. :. :
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: .. . :..: . ..:. .: :. : .. : :. :. .
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: : ..: : . ..:..: : : .:... :: :. : :
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.:.: : :.: : : : ::.:..:: ..: .: ..:::
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:::.::. :: :::: :.:: ..:.: ... .. ::..:: .:......: . :..
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:: :... .:..::. ::. :.: ... .. ::: : ::::..:..:.:: ::
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.:..::......:::.:.:.:::.::.::.:. ::. :. : :.: . ::..:.....:
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:
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CCDS41 KVNRDKTIDLYTLLLEDILVLLQKQDDRLVLRCHSKILASTADSKHTFSPVIKLSTVLVR
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pF1KE1 EVATDHKAFYVLFTWDQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPS
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CCDS41 QVATDNKALFVISMSDNGAQIYELVAQTVSEKTVWQDLICRMAASVKEQSTKPIPLPQST
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:
CCDS41 PGEGDNDEEDPSKLKEEQHGISVTGLQSPDRDLGLESTLISSKPQSHSLSTSGKSEVRDL
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330 340 350 360 370 380
pF1KE1 LHPLSLDSPDREPGADAPLELGDSSPQGPMSLESLAPPESTDEGAETESPEP-GDEGEPG
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CCDS32 VSLSKSVSIQNITGVGNDENMSNTWKFLSHSTDSLNKISKVNESTESLTDEGVGTDMNEG
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pF1KE1 R--SGLELEPE--EPPGWRELVPPDTLHSLPKSQVKRQEVISELLVTEAAHVRMLRVLHD
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CCDS32 QLLGDFEIESKQLEAESWSRIIDSKFLKQQKKDVVKRQEVIYELMQTEFHHVRTLKIMSG
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CCDS32 VYSQGMMADLLFEQQMVEKLFPCLDELISIHSQFFQRILERKKESLVDKSEKNFLIKRIG
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CCDS32 DVLVNQFSGENAERLKKTYGKFCGQHNQSVNYFKDLYAKDKRFQAFVKKKMSSSVVRRLG
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CCDS32 VRLNEIYTKTDSKSIMRMKSGQM---FAKEDLKRKKLVRDGSVFLKNAAGRLKEVQAVLL
2200 2210 2220 2230 2240 2250
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CCDS32 TDILVFLQEKDQKYIFASL--------DQKST---VISLKKLIVREVAHEEKGLFLISMG
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pF1KE1 DQEAQIYELVAQTVSERKNWCALITETAGSLKVPAPASRPKPRPSPSSTREPLLSSSENG
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CCDS32 MTDPEMVEVHASSKEERNSWIQIIQDTINTLNRDEDEGIPSENEEEKKMLDTRARELKEQ
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pF1KE1 NGGRETSPADARTERILSDLLPFCRPGPEGQLAATALRKVLSLKQLLFPAEEDNGAGPPR
CCDS32 LHQKDQKILLLLEEKEMIFRDMAECSTPLPEDCSPTHSPRVLFRSNTEEALKGGPLMKSA
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912 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:21:12 2016 done: Sun Nov 6 22:21:13 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]