Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1510
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1510, 715 aa
1>>>pF1KE1510 715 - 715 aa - 715 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4019+/-0.000446; mu= 18.9600+/- 0.028
mean_var=65.2914+/-13.139, 0's: 0 Z-trim(110.4): 80 B-trim: 866 in 1/48
Lambda= 0.158725
statistics sampled from 18636 (18716) to 18636 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.591), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 9.040
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001106177 (OMIM: 613416) adseverin isoform 1 [H ( 715) 4802 1109.1 0
NP_149119 (OMIM: 613416) adseverin isoform 2 [Homo ( 468) 3150 730.8 3e-210
NP_001121136 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516894 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516895 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
NP_937895 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isoform b ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
XP_005252002 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001121134 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516893 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001121137 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 731) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001244959 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 739) 3085 716.0 1.3e-205
XP_005252000 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_005252001 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516890 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_016870136 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_006717142 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516889 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001121139 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516888 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001121138 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_016870135 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516891 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_016870137 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
XP_011516892 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 742) 3085 716.0 1.3e-205
NP_001244958 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 748) 3085 716.0 1.4e-205
XP_016870134 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 752) 3085 716.0 1.4e-205
XP_011516887 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 761) 3085 716.0 1.4e-205
NP_001121135 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isofor ( 767) 3085 716.0 1.4e-205
XP_011516886 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 3085 716.0 1.4e-205
XP_016870132 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 3085 716.0 1.4e-205
XP_016870133 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 780) 3085 716.0 1.4e-205
NP_000168 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isoform a ( 782) 3085 716.0 1.4e-205
NP_006567 (OMIM: 613397) advillin [Homo sapiens] ( 819) 2324 541.7 4.2e-153
XP_016874199 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 819) 2324 541.7 4.2e-153
XP_011516896 (OMIM: 105120,137350) PREDICTED: gels ( 573) 2305 537.3 6.3e-152
NP_009058 (OMIM: 193040) villin-1 [Homo sapiens] ( 827) 2293 534.6 5.8e-151
XP_016874201 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 2271 529.6 1.9e-149
XP_016874202 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 2271 529.6 1.9e-149
XP_016874200 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 796) 2271 529.6 1.9e-149
XP_016874203 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 520) 1388 327.3 9.5e-89
XP_016874204 (OMIM: 613397) PREDICTED: advillin is ( 502) 1375 324.3 7.3e-88
NP_001307661 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
XP_011531424 (OMIM: 153615) PREDICTED: macrophage- ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
NP_001307662 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
NP_001243068 (OMIM: 153615) macrophage-capping pro ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
NP_001738 (OMIM: 153615) macrophage-capping protei ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
XP_011531425 (OMIM: 153615) PREDICTED: macrophage- ( 348) 1176 278.7 2.8e-74
NP_001243194 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1214) 516 127.8 2.5e-28
NP_001243193 (OMIM: 600362) protein flightless-1 h (1258) 516 127.8 2.6e-28
XP_005256615 (OMIM: 600362) PREDICTED: protein fli (1268) 516 127.8 2.6e-28
>>NP_001106177 (OMIM: 613416) adseverin isoform 1 [Homo (715 aa)
initn: 4802 init1: 4802 opt: 4802 Z-score: 5937.3 bits: 1109.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4802; 99.9% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (1-715:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRGFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRGFTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAG
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGKD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 HLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSLNSNDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSLNSNDV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 FVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE1 DANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
670 680 690 700 710
>>NP_149119 (OMIM: 613416) adseverin isoform 2 [Homo sap (468 aa)
initn: 3150 init1: 3150 opt: 3150 Z-score: 3895.6 bits: 730.8 E(85289): 3e-210
Smith-Waterman score: 3150; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (248-715:1-468)
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SELIKVLGEKPELPDGGDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAML
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 MAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAML
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LSEECFILDHGAAKQIFVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LSEECFILDHGAAKQIFVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGET
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 PIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 PIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 VEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 VEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLT
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 VQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 VQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRR
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 NLASITRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 NLASITRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKT
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 LRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 LRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQ
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 DDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_149 DDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQG
400 410 420 430 440 450
700 710
pF1KE1 HEPPTFTGWFLGWDSSKW
::::::::::::::::::
NP_149 HEPPTFTGWFLGWDSSKW
460
>>NP_001121136 (OMIM: 105120,137350) gelsolin isoform b (731 aa)
initn: 2072 init1: 994 opt: 3085 Z-score: 3812.2 bits: 716.0 E(85289): 1.3e-205
Smith-Waterman score: 3085; 60.3% identity (84.8% similar) in 715 aa overlap (7-715:5-717)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRG-FT
: :: .:::. :::.::.::..::::: . .:::..::::..:.:.. : .
NP_001 MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 YRLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKA
: ::.:::.::::::: ::::::::.::::.:. ::.::.::.:: :..:::.:::::
NP_001 YDLHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGLKYKK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GGVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCG
::::::..::. :.....::..:::::::::::::.::.:::.:::::.:::..:.::::
NP_001 GGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDI
:. :.::::::.::. ::: :::.::... : :::.:: ...::: :: :: .: .:
NP_001 SNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALP-AGTEDTA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 IADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGK
: .:::.:::: ::...:.: :..::.::::... : ::.::::::: .:::::::
NP_001 KEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFILDHGKDGKIFVWKGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 DANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKV
.:: .:::::.::: .:. .:.: :.::..:::::::::.::::::.::: ::.::.:
NP_001 QANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGLGLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 YVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEF
:.. ..:.....::::. ::.: :::::.: :::.:. .:::.:..... :: .::.:
NP_001 YLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 YGGDCYIILYTYP----RGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQ
:::: :::::.: .:::::.::::..:.::...::.::.:::. ::: :: :: :
NP_001 YGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 GKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSL
::::.::.::: ::.::::.:::..:::. ::::::: : :. :: ::: :..:
NP_001 GKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQTAPASTRLFQVRANSAGATRAVEVLPKAGAL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 NSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGG
::::.:::: : ...:.::: :::. :. ::. . ::. . ... :: ::. ::..:::
NP_001 NSNDAFVLKTP-SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLRAQPVQVAEGSEPDGFWEALGG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 KKDYQTSPLLETQAED-HPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQI
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]