Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1510
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1510, 715 aa
1>>>pF1KE1510 715 - 715 aa - 715 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4870+/-0.00104; mu= 18.6358+/- 0.063
mean_var=67.9488+/-13.266, 0's: 0 Z-trim(103.3): 21 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.155591
statistics sampled from 7332 (7352) to 7332 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.6), E-opt: 0.2 (0.226), width: 16
Scan time: 2.120
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47545.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 715) 4802 1087.6 0
CCDS47546.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 ( 468) 3150 716.7 2e-206
CCDS6829.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 731) 3085 702.2 7.2e-202
CCDS65118.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 739) 3085 702.2 7.3e-202
CCDS48011.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 742) 3085 702.2 7.3e-202
CCDS75891.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 748) 3085 702.2 7.4e-202
CCDS75890.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 767) 3085 702.2 7.5e-202
CCDS6828.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 ( 782) 3085 702.2 7.7e-202
CCDS8959.1 AVIL gene_id:10677|Hs108|chr12 ( 819) 2324 531.4 2.1e-150
CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 ( 827) 2293 524.4 2.6e-148
CCDS2670.2 VILL gene_id:50853|Hs108|chr3 ( 856) 1768 406.6 8.1e-113
CCDS1974.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 348) 1176 273.5 3.8e-73
CCDS58522.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1214) 516 125.6 4.4e-28
CCDS58521.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1258) 516 125.6 4.5e-28
CCDS11192.1 FLII gene_id:2314|Hs108|chr17 (1269) 516 125.6 4.5e-28
CCDS58715.1 CAPG gene_id:822|Hs108|chr2 ( 333) 506 123.1 6.9e-28
>>CCDS47545.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 (715 aa)
initn: 4802 init1: 4802 opt: 4802 Z-score: 5820.7 bits: 1087.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4802; 99.9% identity (100.0% similar) in 715 aa overlap (1-715:1-715)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRGFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRGFTY
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 RLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAG
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAG
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 GVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCGS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDII
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGKD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFY
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 GGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 HLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSLNSNDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 HLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSLNSNDV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 FVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KE1 DANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
670 680 690 700 710
>>CCDS47546.1 SCIN gene_id:85477|Hs108|chr7 (468 aa)
initn: 3150 init1: 3150 opt: 3150 Z-score: 3819.4 bits: 716.7 E(32554): 2e-206
Smith-Waterman score: 3150; 100.0% identity (100.0% similar) in 468 aa overlap (248-715:1-468)
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SELIKVLGEKPELPDGGDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAML
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAML
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LSEECFILDHGAAKQIFVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LSEECFILDHGAAKQIFVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGET
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 PIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGK
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 VEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTYPRGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLT
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 VQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VQLDRSLGGQAVQIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRR
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 NLASITRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLASITRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKT
280 290 300 310 320 330
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 LRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LRIQEGEEPEEFWNSLGGKKDYQTSPLLETQAEDHPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQ
340 350 360 370 380 390
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 DDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DDLAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQG
400 410 420 430 440 450
700 710
pF1KE1 HEPPTFTGWFLGWDSSKW
::::::::::::::::::
CCDS47 HEPPTFTGWFLGWDSSKW
460
>>CCDS6829.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (731 aa)
initn: 2072 init1: 994 opt: 3085 Z-score: 3737.6 bits: 702.2 E(32554): 7.2e-202
Smith-Waterman score: 3085; 60.3% identity (84.8% similar) in 715 aa overlap (7-715:5-717)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKTSRG-FT
: :: .:::. :::.::.::..::::: . .:::..::::..:.:.. : .
CCDS68 MVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 YRLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKA
: ::.:::.::::::: ::::::::.::::.:. ::.::.::.:: :..:::.:::::
CCDS68 YDLHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKSGLKYKK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GGVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTEIYQWCG
::::::..::. :.....::..:::::::::::::.::.:::.:::::.:::..:.::::
CCDS68 GGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDI
:. :.::::::.::. ::: :::.::... : :::.:: ...::: :: :: .: .:
CCDS68 SNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALP-AGTEDTA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 IADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQIFVWKGK
: .:::.:::: ::...:.: :..::.::::... : ::.::::::: .:::::::
CCDS68 KEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFILDHGKDGKIFVWKGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 DANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKV
.:: .:::::.::: .:. .:.: :.::..:::::::::.::::::.::: ::.::.:
CCDS68 QANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQTDGLGLS
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 YVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEF
:.. ..:.....::::. ::.: :::::.: :::.:. .:::.:..... :: .::.:
CCDS68 YLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 YGGDCYIILYTYP----RGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAVQIRVSQ
:::: :::::.: .:::::.::::..:.::...::.::.:::. ::: :: :: :
CCDS68 YGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQ
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 GKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVDVDANSL
::::.::.::: ::.::::.:::..:::. ::::::: : :. :: ::: :..:
CCDS68 GKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQTAPASTRLFQVRANSAGATRAVEVLPKAGAL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 NSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEFWNSLGG
::::.:::: : ...:.::: :::. :. ::. . ::. . ... :: ::. ::..:::
CCDS68 NSNDAFVLKTP-SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLRAQPVQVAEGSEPDGFWEALGG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 KKDYQTSPLLETQAED-HPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLLDAWEQI
: :.::: :. . : :::::..:::: :::::::.:::. :.::: :::::::.:.:.
CCDS68 KAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLLDTWDQV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 FIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSK
:.:.:::..: :: :.: ::: :.::::..::.::::...::: :::.:.:::::::..
CCDS68 FVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPITVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDY
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 W
:
CCDS68 WSVDPLDRAMAELAA
720 730
>>CCDS65118.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (739 aa)
initn: 2072 init1: 994 opt: 3085 Z-score: 3737.5 bits: 702.2 E(32554): 7.3e-202
Smith-Waterman score: 3085; 60.3% identity (84.8% similar) in 715 aa overlap (7-715:13-725)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDAYLVLHTAKT
: :: .:::. :::.::.::..::::: . .:::..::::..:.:..
CCDS65 MPLCTPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNLYGDFFTGDAYVILKTVQL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SRG-FTYRLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYESNDFVSYFKG
: . : ::.:::.::::::: ::::::::.::::.:. ::.::.::.:: :..:::.
CCDS65 RNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFESATFLGYFKS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GLKYKAGGVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPLSWDSFNKGDCFIIDLGTE
::::: ::::::..::. :.....::..:::::::::::::.::.:::.:::::.:::..
CCDS65 GLKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGDCFILDLGNN
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IYQWCGSSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVLGEKPELPDG
:.:::::. :.::::::.::. ::: :::.::... : :::.:: ...::: :: :: .
CCDS65 IHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVLGPKPALP-A
190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFILDHGAAKQI
: .: : .:::.:::: ::...:.: :..::.::::... : ::.::::::: .:
CCDS65 GTEDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFILDHGKDGKI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 FVWKGKDANPQERKAAMKTAEEFLQQMNYSKNTQIQVLPEGGETPIFKQFFKDWRDKDQS
::::::.:: .:::::.::: .:. .:.: :.::..:::::::::.::::::.::: ::.
CCDS65 FVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFFKNWRDPDQT
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 DGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVENNGRIQVDQ
::.: :.. ..:.....::::. ::.: :::::.: :::.:. .:::.:..... ::
CCDS65 DGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIEGSNKVPVDP
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE1 NSYGEFYGGDCYIILYTYP----RGQIIYTWQGANATRDELTTSAFLTVQLDRSLGGQAV
.::.::::: :::::.: .:::::.::::..:.::...::.::.:::. ::: :
CCDS65 ATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVAASAILTAQLDEELGGTPV
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 QIRVSQGKEPVHLLSLFKDKPLIIYKNGTSKKGGQAPAPPTRLFQVRRNLASITRIVEVD
: :: :::::.::.::: ::.::::.:::..:::. ::::::: : :. :: :::
CCDS65 QSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQTAPASTRLFQVRANSAGATRAVEVL
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 VDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRIQEGEEPEEF
:..:::::.:::: : ...:.::: :::. :. ::. . ::. . ... :: ::. :
CCDS65 PKAGALNSNDAFVLKTP-SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLRAQPVQVAEGSEPDGF
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KE1 WNSLGGKKDYQTSPLLETQAED-HPPRLYGCSNKTGRFVIEEIPGEFTQDDLAEDDVMLL
:..:::: :.::: :. . : :::::..:::: :::::::.:::. :.::: ::::::
CCDS65 WEALGGKAAYRTSPRLKDKKMDAHPPRLFACSNKIGRFVIEEVPGELMQEDLATDDVMLL
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KE1 DAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTGWFL
:.:.:.:.:.:::..: :: :.: ::: :.::::..::.::::...::: :::.:.::::
CCDS65 DTWDQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPITVVKQGFEPPSFVGWFL
660 670 680 690 700 710
710
pF1KE1 GWDSSKW
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10 20 30 40 50
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.. : . : ::.:::.::::::: ::::::::.::::.:. ::.::.::.:: :..:
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.:::::::.:: .:::::.::: .:. .:.: :.::..:::::::::.::::::.:::
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::.::.: :.. ..:.....::::. ::.: :::::.: :::.:. .:::.:.....
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:: .::.::::: :::::.: .:::::.::::..:.::...::.::.:::. :::
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:: :: :::::.::.::: ::.::::.:::..:::. ::::::: : :. :: :
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:: :..:::::.:::: : ...:.::: :::. :. ::. . ::. . ... :: ::
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. ::..:::: :.::: :. . : :::::..:::: :::::::.:::. :.::: :::
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pF1KE1 MLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHEPPTFTG
::::.:.:.:.:.:::..: :: :.: ::: :.::::..::.::::...::: :::.:.:
CCDS48 MLLDTWDQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPITVVKQGFEPPSFVG
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710
pF1KE1 WFLGWDSSKW
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CCDS48 WFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA
720 730 740
>>CCDS75891.1 GSN gene_id:2934|Hs108|chr9 (748 aa)
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10 20 30 40
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSAHGDFYVGDA
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pF1KE1 YLVLHTAKTSRG-FTYRLHFWLGKECSQDESTAAAIFTVQMDDYLGGKPVQNRELQGYES
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CCDS75 YVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQHREVQGFES
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CCDS75 ATFLGYFKSGLKYKKGGVASGFKHVVPNEVVVQRLFQVKGRRVVRATEVPVSWESFNNGD
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170 180 190 200 210 220
pF1KE1 CFIIDLGTEIYQWCGSSCNKYERLKANQVATGIRYNERKGRSELIVVEEGSEPSELIKVL
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CCDS75 CFILDLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGTEPEAMLQVL
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pF1KE1 GEKPELPDGGDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMAMLLSEECFI
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CCDS75 GPKPALP-AGTEDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQGALKSEDCFI
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CCDS75 LDHGKDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGGETPLFKQFF
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pF1KE1 KDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGSGKVEIWRVE
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CCDS75 KNWRDPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGTGQKQIWRIE
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pF1KE1 SITRIVEVDVDANSLNSNDVFVLKLPQNSGYIWVGKGASQEEEKGAEYVASVLKCKTLRI
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CCDS75 GATRAVEVLPKAGALNSNDAFVLKTP-SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLRVLRAQPVQV
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pF1KE1 LAEDDVMLLDAWEQIFIWIGKDANEVEKKESLKSAKMYLETDPSGRDKRTPIVIIKQGHE
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CCDS75 LATDDVMLLDTWDQVFVWVGKDSQEEEKTEALTSAKRYIETDPANRDRRTPITVVKQGFE
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700 710
pF1KE1 PPTFTGWFLGWDSSKW
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CCDS75 PPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA
720 730 740
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10 20 30
pF1KE1 MARELYHEEFARAGKQAGLQVWRIEKLELVPVPQSA
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CCDS75 PSWLPDGDMSHPQPELFLFPKAQPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNL
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40 50 60 70 80 90
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CCDS75 SWESFNNGDCFILDLGNNIHQWCGSNSNRYERLKATQVSKGIRDNERSGRARVHVSEEGT
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CCDS75 EPEAMLQVLGPKPALP-AGTEDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQG
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CCDS75 ITVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA
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10 20 30
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CCDS68 RAATASRGASQAGAPQGRVPEARPNSMVVEHPEFLKAGKEPGLQIWRVEKFDLVPVPTNL
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CCDS68 YGDFFTGDAYVILKTVQLRNGNLQYDLHYWLGNECSQDESGAAAIFTVQLDDYLNGRAVQ
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pF1KE1 NRELQGYESNDFVSYFKGGLKYKAGGVASGLNHVLTNDLTAKRLLHVKGRRVVRATEVPL
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pF1KE1 EPSELIKVLGEKPELPDGGDDDDIIADISNRKMAKLYMVSDASGSMRVTVVAEENPFSMA
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CCDS68 EPEAMLQVLGPKPALP-AGTEDTAKEDAANRKLAKLYKVSNGAGTMSVSLVADENPFAQG
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CCDS68 ALKSEDCFILDHGKDGKIFVWKGKQANTEERKAALKTASDFITKMDYPKQTQVSVLPEGG
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340 350 360 370 380 390
pF1KE1 ETPIFKQFFKDWRDKDQSDGFGKVYVTEKVAQIKQIPFDASKLHSSPQMAAQHNMVDDGS
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CCDS68 ETPLFKQFFKNWRDPDQTDGLGLSYLSSHIANVERVPFDAATLHTSTAMAAQHGMDDDGT
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pF1KE1 GKVEIWRVENNGRIQVDQNSYGEFYGGDCYIILYTYP----RGQIIYTWQGANATRDELT
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CCDS68 GQKQIWRIEGSNKVPVDPATYGQFYGGDSYIILYNYRHGGRQGQIIYNWQGAQSTQDEVA
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CCDS68 ASAILTAQLDEELGGTPVQSRVVQGKEPAHLMSLFGGKPMIIYKGGTSREGGQTAPASTR
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CCDS68 LFQVRANSAGATRAVEVLPKAGALNSNDAFVLKTP-SAAYLWVGTGASEAEKTGAQELLR
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pF1KE1 IVIIKQGHEPPTFTGWFLGWDSSKW
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CCDS68 ITVVKQGFEPPSFVGWFLGWDDDYWSVDPLDRAMAELAA
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CCDS89 GWFLAWDPNIWSAGKTYEQLKEELGDAAAIMRITADMKNATLSLNSNDSEPKYYPIAVLL
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>>CCDS2417.1 VIL1 gene_id:7429|Hs108|chr2 (827 aa)
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CCDS24 GVASGMKHVETNSYDVQRLLHVKGKRNVVAGEVEMSWKSFNRGDVFLLDLGKLIIQWNGP
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CCDS24 ESTRMERLRGMTLAKEIRDQERGGRTYVGVVDGENELASPKLMEVMNHVLGKRRELKAAV
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CCDS24 GLGKTHTVGSVAKVEQVKFDATSMHVKPQVAAQQKMVDDGSGEVQVWRIENLELVPVDSK
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]