Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1509
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1509, 366 aa
1>>>pF1KE1509 366 - 366 aa - 366 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1038+/-0.000743; mu= 18.6293+/- 0.045
mean_var=85.1561+/-16.778, 0's: 0 Z-trim(110.3): 74 B-trim: 7 in 1/51
Lambda= 0.138984
statistics sampled from 11398 (11477) to 11398 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.722), E-opt: 0.2 (0.353), width: 16
Scan time: 1.480
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34393.1 C gene_id:3107|Hs108|chr6 ( 366) 2322 475.2 3.9e-134
CCDS34394.1 B gene_id:3106|Hs108|chr6 ( 362) 2191 448.9 3.2e-126
CCDS34373.1 A gene_id:3105|Hs108|chr6 ( 365) 2096 429.9 1.7e-120
CCDS4668.1 G gene_id:3135|Hs108|chr6 ( 338) 1908 392.1 3.6e-109
CCDS34379.1 E gene_id:3133|Hs108|chr6 ( 358) 1895 389.6 2.3e-108
CCDS43437.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 ( 442) 1855 381.6 6.9e-106
CCDS43438.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 ( 346) 1848 380.1 1.5e-105
CCDS43439.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 ( 254) 1074 224.8 6.5e-59
CCDS1342.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1 ( 341) 784 166.8 2.6e-41
CCDS4578.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 348) 759 161.8 8.4e-40
CCDS75412.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 337) 750 159.9 2.9e-39
CCDS47387.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 325) 711 152.1 6.3e-37
CCDS5680.1 AZGP1 gene_id:563|Hs108|chr7 ( 298) 666 143.0 3.1e-34
CCDS4580.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 260) 600 129.8 2.7e-30
CCDS53440.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1 ( 249) 530 115.7 4.4e-26
CCDS53441.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1 ( 214) 529 115.4 4.5e-26
CCDS43449.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6 ( 383) 506 111.1 1.7e-24
CCDS56412.1 MICA gene_id:100507436|Hs108|chr6 ( 332) 499 109.6 4e-24
CCDS75423.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6 ( 351) 476 105.0 1e-22
CCDS12770.1 FCGRT gene_id:2217|Hs108|chr19 ( 365) 432 96.2 4.7e-20
CCDS53442.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1 ( 296) 427 95.1 8.2e-20
CCDS4579.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 256) 412 92.1 5.9e-19
CCDS4581.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 168) 399 89.3 2.7e-18
CCDS54975.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 246) 384 86.4 2.8e-17
CCDS54974.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 334) 384 86.6 3.5e-17
CCDS47386.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 ( 242) 371 83.8 1.7e-16
CCDS75421.1 MICA gene_id:100507436|Hs108|chr6 ( 235) 360 81.6 7.7e-16
CCDS75422.1 MICB gene_id:4277|Hs108|chr6 ( 340) 327 75.1 9.8e-14
CCDS1174.1 CD1A gene_id:909|Hs108|chr1 ( 327) 298 69.3 5.4e-12
>>CCDS34393.1 C gene_id:3107|Hs108|chr6 (366 aa)
initn: 2322 init1: 2322 opt: 2322 Z-score: 2521.5 bits: 475.2 E(32554): 3.9e-134
Smith-Waterman score: 2322; 93.2% identity (97.0% similar) in 366 aa overlap (1-366:1-366)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
:::::::.:.:::::.:::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::::::::
CCDS34 MRVMAPRALLLLLSGGLALTETWACSHSMRYFDTAVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::: ::::::
CCDS34 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQADRVSLRNLRGYYNQSEDGSHTLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::
CCDS34 RMSGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKLEAARAAEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
::::::::::::::::::::::::::: :::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS34 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEPPKTHVTHHPLSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::.::::: ::::: :::
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGQEQRYTCHMQHEGLQEPLTLSWEP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
::::::::.:::::::::.:::::::::...:::::::::::::::::: ::::::::::
CCDS34 SSQPTIPIMGIVAGLAVLVVLAVLGAVVTAMMCRRKSSGGKGGSCSQAACSNSAQGSDES
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LIACKA
::.:::
CCDS34 LITCKA
>>CCDS34394.1 B gene_id:3106|Hs108|chr6 (362 aa)
initn: 2249 init1: 2008 opt: 2191 Z-score: 2379.6 bits: 448.9 E(32554): 3.2e-126
Smith-Waterman score: 2191; 89.0% identity (94.5% similar) in 363 aa overlap (1-363:1-362)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
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CCDS34 MLVMAPRTVLLLLSAALALTETWAGSHSMRYFYTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
:::::::: ::::::.::::::::::.:: :: :::::: ::::::::::::::::::::
CCDS34 DSDAASPREEPRAPWIEQEGPEYWDRNTQIYKAQAQTDRESLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
:::::.:::::::::.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.
CCDS34 SMYGCDVGPDGRLLRGHDQYAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAAREAEQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
:::::: :::::::::::::. :.::. :::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS34 RAYLEGECVEWLRRYLENGKDKLERADPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDRTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
::: :.::::::::::::::. :.:::::.:::::::::::::: :::: :.:::::: :
CCDS34 SSQSTVPIVGIVAGLAVLAVV-VIGAVVAAVMCRRKSSGGKGGSYSQAACSDSAQGSDVS
310 320 330 340 350
pF1KE1 LIACKA
: :
CCDS34 LTA
360
>>CCDS34373.1 A gene_id:3105|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1953 init1: 1927 opt: 2096 Z-score: 2276.7 bits: 429.9 E(32554): 1.7e-120
Smith-Waterman score: 2096; 84.4% identity (93.4% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-364)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
: :::::::.::::::::::.::: :::::::.:.:::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MAVMAPRTLLLLLSGALALTQTWAGSHSMRYFFTSVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
:::::: : ::::::.:::::::::.::.. : :.:::::.: .::::::::::::::.:
CCDS34 DSDAASQRMEPRAPWIEQEGPEYWDQETRNVKAQSQTDRVDLGTLRGYYNQSEAGSHTIQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
:::::.: :::.:::: :.::::::::::::::::::::: :::::.::::::. :::
CCDS34 IMYGCDVGSDGRFLRGYRQDAYDGKDYIALNEDLRSWTAADMAAQITKRKWEAAHEAEQL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
::::.::::::::::::::::::::.. ::::.::: .::::::::::::::::::::::
CCDS34 RAYLDGTCVEWLRRYLENGKETLQRTDPPKTHMTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS34 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPKPLTLRWEL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
:::::::::::.:::..:... . :::::.:: ::::: :::: .:::::.:::::: :
CCDS34 SSQPTIPIVGIIAGLVLLGAV-ITGAVVAAVMWRRKSSDRKGGSYTQAASSDSAQGSDVS
310 320 330 340 350
pF1KE1 LIACKA
: :::
CCDS34 LTACKV
360
>>CCDS4668.1 G gene_id:3135|Hs108|chr6 (338 aa)
initn: 1926 init1: 1877 opt: 1908 Z-score: 2073.4 bits: 392.1 E(32554): 3.6e-109
Smith-Waterman score: 1908; 83.1% identity (93.2% similar) in 338 aa overlap (1-338:1-337)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
: :::::::.:::::::.:::::: ::::::: .::::::::::::::.:::::::::::
CCDS46 MVVMAPRTLFLLLSGALTLTETWAGSHSMRYFSAAVSRPGRGEPRFIAMGYVDDTQFVRF
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
:::.: :: :::::::::::::::..::.. : .:::::..:..::::::::::.:::::
CCDS46 DSDSACPRMEPRAPWVEQEGPEYWEEETRNTKAHAQTDRMNLQTLRGYYNQSEASSHTLQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
:: ::::: ::::::::.: :::::::.::::::::::::::::::..:: ::: .:::.
CCDS46 WMIGCDLGSDGRLLRGYEQYAYDGKDYLALNEDLRSWTAADTAAQISKRKCEAANVAEQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
::::::::::::.:::::::: ::::. :::::::: : :.:::::::::::::::: ::
CCDS46 RAYLEGTCVEWLHRYLENGKEMLQRADPPKTHVTHHPVFDYEATLRCWALGFYPAEIILT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
:::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::.
CCDS46 WQRDGEDQTQDVELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLMLRWKQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
:: :::::.::::::.:::.. : ::.::.:. :.:::
CCDS46 SSLPTIPIMGIVAGLVVLAAV-VTGAAVAAVLWRKKSSD
310 320 330
pF1KE1 LIACKA
>>CCDS34379.1 E gene_id:3133|Hs108|chr6 (358 aa)
initn: 1799 init1: 1799 opt: 1895 Z-score: 2058.9 bits: 389.6 E(32554): 2.3e-108
Smith-Waterman score: 1895; 78.0% identity (91.5% similar) in 355 aa overlap (4-358:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
:. ::.:::: :::::.::: :::..::.:.::::::::::::.::::::::::::
CCDS34 MVDGTLLLLLSEALALTQTWAGSHSLKYFHTSVSRPGRGEPRFISVGYVDDTQFVRF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
:.:::::: :::::.:::: :::::::.. . :: ::.::.::::::::::::::::
CCDS34 DNDAASPRMVPRAPWMEQEGSEYWDRETRSARDTAQIFRVNLRTLRGYYNQSEAGSHTLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
::.::.::::::.::::.: :::::::..::::::::::.::::::...: . : ::.:
CCDS34 WMHGCELGPDGRFLRGYEQFAYDGKDYLTLNEDLRSWTAVDTAAQISEQKSNDASEAEHQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
::::: ::::::..:::.::::: . : :::::::: .::::::::::::::::::::::
CCDS34 RAYLEDTCVEWLHKYLEKGKETLLHLEPPKTHVTHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
::.::: .:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:
CCDS34 WQQDGEGHTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPVTLRWKP
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
.::::::::::.:::..:. . : :::::.:. :.::::::::: :.: :.:::::.
CCDS34 ASQPTIPIVGIIAGLVLLGSV-VSGAVVAAVIWRKKSSGGKGGSYSKAEWSDSAQGSESH
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 LIACKA
CCDS34 SL
>>CCDS43437.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 (442 aa)
initn: 1966 init1: 1805 opt: 1855 Z-score: 2014.4 bits: 381.6 E(32554): 6.9e-106
Smith-Waterman score: 1855; 78.5% identity (88.7% similar) in 354 aa overlap (4-357:1-353)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
::::.:.::::::::::.::: :::.::: ::::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43 MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
::::: :: ::: ::::::::.::. : : .::::::.:::: ::::::::::::
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
: :::.:::::::::: : ::::::::.:::::::::::::.:::::: .:: . ::.
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
:.:::: :.: :::::::::::::::. ::.::.:: .::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRADPPKAHVAHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:: ::::
CCDS43 WQRDGEEQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPPGEEQRYTCHVQHEGLPQPLILRWEQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
: :::::::::::::.::... : :::::.:: :.::: . :: ::::. . ..:.
CCDS43 SPQPTIPIVGIVAGLVVLGAV-VTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAAYSVVSGNLMI
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 LIACKA
CCDS43 TWWSSLFLLGVLFQGYLGCLRSHSVLGRRKVGDMWILFFLWLWTSFNTAFLALQSLRFGF
360 370 380 390 400 410
>>CCDS43438.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 (346 aa)
initn: 1886 init1: 1782 opt: 1848 Z-score: 2008.2 bits: 380.1 E(32554): 1.5e-105
Smith-Waterman score: 1848; 80.1% identity (89.0% similar) in 346 aa overlap (4-349:1-345)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
::::.:.::::::::::.::: :::.::: ::::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43 MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
::::: :: ::: ::::::::.::. : : .::::::.:::: ::::::::::::
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
: :::.:::::::::: : ::::::::.:::::::::::::.:::::: .:: . ::.
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITLT
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CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRADPPKAHVAHHPISDHEATLRCWALGFYPAEITLT
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 WQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWEP
::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.:: ::::
CCDS43 WQRDGEEQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPPGEEQRYTCHVQHEGLPQPLILRWEQ
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 SSQPTIPIVGIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGSDES
: :::::::::::::.::... : :::::.:: :.::: . :: ::::
CCDS43 SPQPTIPIVGIVAGLVVLGAV-VTGAVVAAVMWRKKSSDRNRGSYSQAAV
300 310 320 330 340
pF1KE1 LIACKA
>>CCDS43439.1 F gene_id:3134|Hs108|chr6 (254 aa)
initn: 1268 init1: 1072 opt: 1074 Z-score: 1171.2 bits: 224.8 E(32554): 6.5e-59
Smith-Waterman score: 1074; 66.8% identity (80.0% similar) in 250 aa overlap (4-252:1-248)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
::::.:.::::::::::.::: :::.::: ::::::::::::.::: :::::::.::
CCDS43 MAPRSLLLLLSGALALTDTWAGSHSLRYFSTAVSRPGRGEPRYIAVEYVDDTQFLRF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWVEQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTLQ
::::: :: ::: ::::::::.::. : : .::::::.:::: ::::::::::::
CCDS43 DSDAAIPRMEPREPWVEQEGPQYWEWTTGYAKANAQTDRVALRNLLRRYNQSEAGSHTLQ
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 WMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAEQQ
: :::.:::::::::: : ::::::::.:::::::::::::.:::::: .:: . ::.
CCDS43 GMNGCDMGPDGRLLRGYHQHAYDGKDYISLNEDLRSWTAADTVAQITQRFYEAEEYAEEF
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE1 RAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEH-PKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEITL
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CCDS43 RTYLEGECLELLRRYLENGKETLQRAEQSPQPTIPIVGIVAGLVVLGAVVTGAVVAAVM-
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 TWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRWE
:.. . :... .
CCDS43 -WRKKSSDRNRGSYSQAAV
240 250
>>CCDS1342.1 MR1 gene_id:3140|Hs108|chr1 (341 aa)
initn: 661 init1: 383 opt: 784 Z-score: 855.3 bits: 166.8 E(32554): 2.6e-41
Smith-Waterman score: 784; 40.9% identity (67.4% similar) in 313 aa overlap (26-335:24-326)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVRF
.::.::: .:: : .: :.::.:::::. .. .
CCDS13 MGELMAFLLPLIIVLMVKHSDSRTHSLRYFRLGVSDPIHGVPEFISVGYVDSHPITTY
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pF1KE1 DSDAASPRGEPRAPWV-EQEGPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHTL
:: .. . ::::::. :. .:..:.: :: . : .: :. :. .::.: ::::
CCDS13 DS--VTRQKEPRAPWMAENLAPDHWERYTQLLRGWQQMFKVELKRLQRHYNHS--GSHTY
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pF1KE1 QWMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARAAE-
: : ::.: :: :. : ::::.:.. .:.: :: :.:..:. .. ::: .
CCDS13 QRMIGCELLEDGSTT-GFLQYAYDGQDFLIFNKDTLSWLAVDNVAHTIKQAWEANQHELL
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 QQRAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEIT
:. .:: :. ::.:.:: ::.::::.: : ..:... . ..: : : :::: ::
CCDS13 YQKNWLEEECIAWLKRFLEYGKDTLQRTEPPLVRVNRKETFPGVTALFCKAHGFYPPEIY
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 LTWQRDGEDQTQDTELVETRPAGDGTFQKWAAVVVPSGEEQRYTCHVQHEGLPEPLTLRW
.::...::. .:. . . :.::::.: ::.. . . :.:::.: :. : .
CCDS13 MTWMKNGEEIVQEIDYGDILPSGDGTYQAWASIELDPQSSNLYSCHVEHCGVHMVLQV--
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 EPSSQPTIPIV-GIVAGLAVLAVLAVLGAVVAVVMCRRKSSGGKGGSCSQAASSNSAQGS
:. . :::.: :.: ::.. ::..: ..: ::
CCDS13 -PQESETIPLVMKAVSGSIVLVI--VLAGVGVLVWRRRPREQNGAIYLPTPDR
300 310 320 330 340
360
pF1KE1 DESLIACKA
>>CCDS4578.1 HFE gene_id:3077|Hs108|chr6 (348 aa)
initn: 531 init1: 288 opt: 759 Z-score: 828.1 bits: 161.8 E(32554): 8.4e-40
Smith-Waterman score: 759; 37.6% identity (65.9% similar) in 343 aa overlap (6-343:7-340)
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pF1KE1 MRVMAPRTLILLLSGALALTETWACSHSMRYFYTAVSRPGRGEPRFIAVGYVDDTQFVR
: :.:.: . .: :::..:.. ..:. : : :.::::: ::
CCDS45 MGPRARPALLLLMLLQTAVLQGRLLRSHSLHYLFMGASEQDLGLSLFEALGYVDDQLFVF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 FDSDAASPRGEPRAPWVEQE-GPEYWDRETQKYKRQAQTDRVSLRNLRGYYNQSEAGSHT
.: . : : :::.::: .. . ..: . .:. : . :.. .. .:.:. :::
CCDS45 YDHE--SRRVEPRTPWVSSRISSQMWLQLSQSLKGWDHMFTVDFWTIMENHNHSKE-SHT
70 80 90 100 110
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pF1KE1 LQWMYGCDLGPDGRLLRGYDQSAYDGKDYIALNEDLRSWTAADTAAQITQRKWEAARA-A
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CCDS45 LQVILGCEMQEDNST-EGYWKYGYDGQDHLEFCPDTLDWRAAEPRAWPTKLEWERHKIRA
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 EQQRAYLEGTCVEWLRRYLENGKETLQRAEHPKTHVTHHLVSDHEATLRCWALGFYPAEI
.:.::::: : :.. :: :. .:.. : ..:::: :.. .:::: ::..:: .:
CCDS45 RQNRAYLERDCPAQLQQLLELGRGVLDQQVPPLVKVTHH-VTSSVTTLRCRALNYYPQNI
180 190 200 210 220 230
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:. : .: : .:.. : . : ::::.: : ...:: ::::::::.:.: :: .::
CCDS45 TMKWLKD--KQPMDAKEFEPKDVLPNGDGTYQGWITLAVPPGEEQRYTCQVEHPGLDQPL
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. :::: . :. ..:...:.::..:. .: .. ... .:..: : :
CCDS45 IVIWEPSPSGTL-VIGVISGIAVFVVILFIG-ILFIILRKRQGSRGAMGHYVLAERE
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360
pF1KE1 QGSDESLIACKA
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]