Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1504
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1504, 1169 aa
1>>>pF1KE1504 1169 - 1169 aa - 1169 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2709+/-0.000419; mu= 22.5201+/- 0.026
mean_var=72.1339+/-14.387, 0's: 0 Z-trim(111.3): 188 B-trim: 104 in 1/49
Lambda= 0.151010
statistics sampled from 19621 (19821) to 19621 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.58), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 15.780
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isofo (1169) 7755 1699.8 0
NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform (1163) 7687 1685.0 0
XP_011544154 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 798) 5245 1152.9 0
NP_005344 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isoform (1161) 4979 1095.0 0
NP_001305114 (OMIM: 602453) integrin alpha-D isofo (1162) 4979 1095.0 0
XP_011544143 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1160) 4966 1092.2 0
NP_000623 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha-M i (1152) 4565 1004.8 0
NP_001139280 (OMIM: 120980,609939) integrin alpha- (1153) 4564 1004.6 0
XP_011544152 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte (1091) 4269 940.3 0
XP_011544156 (OMIM: 151510) PREDICTED: integrin al ( 614) 4081 899.2 0
XP_011544140 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1179) 4006 883.1 0
XP_011544141 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1173) 3674 810.7 0
XP_016878705 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 917) 3627 800.4 0
XP_011544145 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1028) 2701 598.7 6.1e-170
XP_016878704 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1164) 2701 598.7 6.7e-170
XP_011544138 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 2701 598.7 6.8e-170
XP_011544137 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1190) 2701 598.7 6.8e-170
XP_011544153 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 622) 2695 597.3 1e-169
XP_011544139 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1189) 2688 595.9 4.8e-169
XP_006721108 (OMIM: 120980,609939) PREDICTED: inte ( 613) 2683 594.6 6.1e-169
XP_011544144 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al (1103) 2216 493.1 4.1e-138
XP_011544148 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 790) 2058 458.5 7.3e-128
XP_011544147 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 813) 1893 422.6 4.9e-117
NP_002200 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isoform (1170) 1731 387.4 2.8e-106
XP_005255370 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1169) 1707 382.2 1e-104
XP_011544150 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 690) 1679 375.9 4.7e-103
XP_011544151 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1074) 1584 355.4 1.1e-96
NP_001107852 (OMIM: 153370) integrin alpha-L isofo (1086) 1505 338.2 1.7e-91
XP_006721107 (OMIM: 153370) PREDICTED: integrin al (1087) 1497 336.4 5.8e-91
XP_011544149 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 778) 1317 297.1 2.8e-79
XP_016858112 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1180) 1316 297.0 4.6e-79
XP_011544146 (OMIM: 602453) PREDICTED: integrin al ( 998) 1301 293.7 3.9e-78
XP_011522130 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1137) 1194 270.4 4.5e-71
XP_011522129 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1163) 1194 270.4 4.5e-71
NP_002199 (OMIM: 604682) integrin alpha-E precurso (1179) 1193 270.2 5.3e-71
XP_011522127 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1185) 1193 270.2 5.4e-71
XP_016880075 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1191) 1193 270.2 5.4e-71
XP_011522125 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al (1217) 1193 270.2 5.5e-71
XP_016880076 (OMIM: 604682) PREDICTED: integrin al ( 848) 1085 246.6 5e-64
NP_001004439 (OMIM: 604789) integrin alpha-11 prec (1188) 1084 246.5 7.6e-64
XP_005254285 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1086) 1077 244.9 2e-63
XP_011519665 (OMIM: 604789) PREDICTED: integrin al (1119) 947 216.6 7e-55
NP_002194 (OMIM: 192974,614200) integrin alpha-2 p (1181) 844 194.2 4.1e-48
XP_011508385 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1002) 830 191.1 3e-47
NP_001289970 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1024) 830 191.1 3.1e-47
NP_001289969 (OMIM: 604042) integrin alpha-10 isof (1036) 830 191.1 3.1e-47
XP_016858115 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1100) 830 191.1 3.2e-47
XP_005277493 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1105) 830 191.1 3.3e-47
XP_016858114 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 830 191.1 3.3e-47
XP_016858113 (OMIM: 604042) PREDICTED: integrin al (1143) 830 191.1 3.3e-47
>>NP_001273304 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 1 (1169 aa)
initn: 7755 init1: 7755 opt: 7755 Z-score: 9121.9 bits: 1699.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7755; 99.8% identity (100.0% similar) in 1169 aa overlap (1-1169:1-1169)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 IGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
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790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
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pF1KE1 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KE1 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
1150 1160
>>NP_000878 (OMIM: 151510) integrin alpha-X isoform 2 pr (1163 aa)
initn: 7741 init1: 7687 opt: 7687 Z-score: 9041.9 bits: 1685.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7687; 99.7% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
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490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
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pF1KE1 IGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 IGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
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730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_000 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .:
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pF1KE1 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK
:: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. .
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::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::..
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::
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::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: ::
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.::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::
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.::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :.
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: : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...:::
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:.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:.
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.::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.:.. .:::::.: :. .:::
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. .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :.
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.::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.:::
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:.:::: .:::::::: :: ::: :: . :.. :: : ::. : ::::..:...:.
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:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: ::::::::::::::
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pF1KE1 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE
::::::::::::: :::. .:.: :.:.:::.:.:::::::::.:::.:::::.:::
NP_005 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE
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pF1KE1 MMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
:.:. . : .: . : .:. :
NP_005 MLEDKPEDTATFSGDDF-SCVAPNVPLS
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pF1KE1 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL
::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .:
NP_001 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL
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:: . :::..: :::::::::.: : :.:.::::.:. ::::::::::: :::. .. .
NP_001 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ
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::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::..
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::
NP_001 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG
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pF1KE1 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWR-RWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTD
::::::::::::::::::::: : .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: :
NP_001 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLID
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pF1KE1 VVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDG
:.::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: :::::::::::::::::::
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pF1KE1 LVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYI
:.::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :
NP_001 LMDLAVGARGQVLLLRSLPVLKVGVAMRFSPVEVAKAVYRCWEEKPSALEAGDATVCLTI
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pF1KE1 DKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLL
.: : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...::
NP_001 QKSSLDQLG--DIQSSVRFDLALDPGRLTSRAIFNETKNPTLTRRKTLGLGIHCETLKLL
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pF1KE1 LPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQ
::.:::: :.:: :.:::.:: .:. . .::::.::. .: :::::::::::: : .:.
NP_001 LPDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCE
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pF1KE1 DNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQ
.::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.:.. .:::::.: :. .:::
NP_001 GDLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQ
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pF1KE1 GQLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTA
. .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :
NP_001 PHQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRA
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pF1KE1 SLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLI
::::::::::: : ...: : . .:. .:.: :::::.:::::::::::::.::::::::
NP_001 SLVLGAPRYQHIGLVAMFRQNTGMWESNANVKGTQIGAYFGASLCSVDVDSNGSTDLVLI
420 430 440 450 460 470
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pF1KE1 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWR-RWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLT
:::::::::::::::::::::: : :: ::::::::::.:::::::::::::::::::::
NP_001 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLT
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pF1KE1 DVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQD
::.::::::..::::::::::. : .::::::::::::.:: :::::::.::::::::.:
NP_001 DVAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMD
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:::::.:::.:.:::::..::: : . :.: : :. :..::: .:::. . . .::.
NP_001 GLVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLH
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pF1KE1 IDKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNL
..: ... : ..:: :: ::::: :: ::.:.:::: . ...:::: ::...:
NP_001 VQKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKL
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pF1KE1 LLPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHIC
::.:.:: :.::.:::::.::: :: :: ::::.:: :::: ::: .::::::: :.::
NP_001 QLPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNIC
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pF1KE1 QDNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQK
::.:.:.::: .: :.::. :.:. : : ::::::: : ::: : :::: :. :.
NP_001 QDDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQN
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pF1KE1 QGQLRSLHLTCDSAPVG--SQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLL
: . :: .:.:.:: : . :::: ::: :: ....:: ::::. :: ::..::
NP_001 QRSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLL
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NP_001 LKANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENT-SRVMQHQY
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::.:::::.::.:. : :::.::: ..: .:. .: : : ... : :::::...
NP_001 QVSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELR
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pF1KE1 KNPVLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFD
: ::..:::: : :..::.: :..:::.. :::::::: : . .... .::.::: :.
NP_001 KAPVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFN
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::.. :::: ::.:.:: : .: ..: :: :::::::.:::::::::::.:::.:::::
NP_001 DSVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKR
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1140 1150
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:: ..: : .:: .:. :... .: :::::.:..:. ::::.::. . :: ::. .
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:: : :.:::.:..::..::. . :::..: :::.:::::.: :: : :.:::: :: :
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.:::.:::: ::....: .::: ::::: ..:.:.:..:.::: :::::.:::::::::.
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.:::. . . .::...: ... : ..:: :: ::::: :: ::.:.:::: .
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...:::: ::...: ::.:.:: :.::.:::::.::: :: :: ::::.:: ::::
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::: .::::::: :.::::.:.:.::: .: :.::. :.:. : : ::::::: : :
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pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
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XP_011 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
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pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
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pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
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pF1KE1 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
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pF1KE1 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
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pF1KE1 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
370 380 390 400 410 420
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pF1KE1 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
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pF1KE1 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
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XP_011 IGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
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XP_011 DLAVGARGQVLLLR
610
1169 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:15:09 2016 done: Sun Nov 6 22:15:11 2016
Total Scan time: 15.780 Total Display time: 0.460
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]