Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1504
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1504, 1169 aa
1>>>pF1KE1504 1169 - 1169 aa - 1169 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5698+/-0.00106; mu= 20.9449+/- 0.064
mean_var=74.8293+/-14.781, 0's: 0 Z-trim(104.2): 66 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.148265
statistics sampled from 7735 (7802) to 7735 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.596), E-opt: 0.2 (0.24), width: 16
Scan time: 4.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169) 7755 1669.2 0
CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163) 7687 1654.6 0
CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161) 4979 1075.4 0
CCDS45470.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1152) 4565 986.8 0
CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153) 4564 986.6 0
CCDS32433.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1170) 1731 380.6 1.2e-104
CCDS45461.1 ITGAL gene_id:3683|Hs108|chr16 (1086) 1505 332.3 3.9e-90
CCDS32531.1 ITGAE gene_id:3682|Hs108|chr17 (1179) 1193 265.6 5.1e-70
CCDS45291.1 ITGA11 gene_id:22801|Hs108|chr15 (1188) 1084 242.3 5.4e-63
CCDS3957.1 ITGA2 gene_id:3673|Hs108|chr5 (1181) 844 190.9 1.5e-47
CCDS76204.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1024) 830 187.9 1.1e-46
CCDS72869.1 ITGA10 gene_id:8515|Hs108|chr1 (1167) 830 187.9 1.2e-46
CCDS42788.1 ITGA4 gene_id:3676|Hs108|chr2 (1032) 792 179.8 3e-44
CCDS3955.1 ITGA1 gene_id:3672|Hs108|chr5 (1179) 735 167.6 1.6e-40
CCDS2669.1 ITGA9 gene_id:3680|Hs108|chr3 (1035) 661 151.7 8.3e-36
CCDS46471.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1002) 541 126.1 4.3e-28
CCDS46470.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1012) 541 126.1 4.3e-28
CCDS2292.1 ITGAV gene_id:3685|Hs108|chr2 (1048) 541 126.1 4.5e-28
CCDS8880.1 ITGA5 gene_id:3678|Hs108|chr12 (1049) 513 120.1 2.8e-26
CCDS11558.1 ITGA3 gene_id:3675|Hs108|chr17 (1051) 508 119.0 6e-26
CCDS31155.1 ITGA8 gene_id:8516|Hs108|chr10 (1063) 482 113.5 2.8e-24
CCDS8888.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1137) 447 106.0 5.4e-22
CCDS44914.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1044) 443 105.1 9.1e-22
CCDS55832.1 ITGA7 gene_id:3679|Hs108|chr12 (1141) 443 105.1 9.8e-22
CCDS82534.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 ( 954) 397 95.2 7.7e-19
CCDS2249.1 ITGA6 gene_id:3655|Hs108|chr2 (1073) 385 92.7 5e-18
CCDS34938.1 COL14A1 gene_id:7373|Hs108|chr8 (1796) 358 87.1 4.2e-16
CCDS83309.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 915) 332 81.3 1.1e-14
CCDS55265.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 937) 332 81.3 1.2e-14
CCDS55264.1 MATN2 gene_id:4147|Hs108|chr8 ( 956) 332 81.3 1.2e-14
CCDS43482.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (3063) 336 82.5 1.7e-14
CCDS43481.1 COL12A1 gene_id:1303|Hs108|chr6 (1899) 316 78.1 2.2e-13
CCDS336.1 MATN1 gene_id:4146|Hs108|chr1 ( 496) 306 75.6 3.3e-13
CCDS46607.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 540) 281 70.3 1.4e-11
CCDS13348.1 MATN4 gene_id:8785|Hs108|chr20 ( 581) 278 69.7 2.4e-11
>>CCDS67014.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1169 aa)
initn: 7755 init1: 7755 opt: 7755 Z-score: 8956.4 bits: 1669.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7755; 99.8% identity (100.0% similar) in 1169 aa overlap (1-1169:1-1169)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 IGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 IGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS67 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
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910 920 930 940 950 960
pF1KE1 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KE1 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
1150 1160
>>CCDS10711.1 ITGAX gene_id:3687|Hs108|chr16 (1163 aa)
initn: 7741 init1: 7687 opt: 7687 Z-score: 8877.8 bits: 1654.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7687; 99.7% identity (100.0% similar) in 1161 aa overlap (1-1161:1-1161)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVISQ
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190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQSL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLVLIGA
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pF1KE1 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDVV
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pF1KE1 IGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 IGAPGEEENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQDGLV
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pF1KE1 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQVVSEQTLVQSNICLYIDK
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pF1KE1 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLP
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pF1KE1 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHICQDN
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS10 LGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTITFSHPAGLSYRYVAEGQKQGQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTANV
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPVL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 DCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVYS
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEM
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160
pF1KE1 MEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
::::::::::::::::::::.
CCDS10 MEEANGQIAPENGTQTPSPPSEK
1150 1160
>>CCDS32438.1 ITGAD gene_id:3681|Hs108|chr16 (1161 aa)
initn: 4950 init1: 2496 opt: 4979 Z-score: 5747.3 bits: 1075.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4979; 65.3% identity (84.6% similar) in 1163 aa overlap (4-1165:2-1159)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTRTRAALLLFTALATSLGFNLDTEELTAFRVDSAGFGDSVVQYANSWVVVGAPQKITAA
: ...::...::. :::::.:: : :. :..:::.::::...: .::::: ...::
CCDS32 MTFGTVLLLSVLASYHGFNLDVEEPTIFQEDAGGFGQSVVQFGGSRLVVGAPLEVVAA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
:::: ::.:. .:: :.:: :.. ::::::::::.::..:. :.:::::::.:. ::.:
CCDS32 NQTGRLYDCAAATGMCQPIPLHIRPEAVNMSLGLTLAASTNGSRLLACGPTLHRVCGENS
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130 140 150 160 170
pF1KE1 YLTGLCFLLGPT-QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVIS
: : :.::: .. : .: . :::.::.::::::::::::.. .: : .::.::..
CCDS32 YSKGSCLLLGSRWEIIQTVPDATPECPHQEMDIVFLIDGSGSIDQNDFNQMKGFVQAVMG
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 QFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRL
::. .: :.:::.:: .. :::: .:: : . ::. . ::.:.:.:::.: .:: .:
CCDS32 QFEGTDTLFALMQYSNLLKIHFTFTQFRTSPSQQSLVDPIVQLKGLTFTATGILTVVTQL
180 190 200 210 220 230
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pF1KE1 FHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMADAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWK
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CCDS32 FHHKNGARKSAKKILIVITDGQKYKDPLEYSDVIPQAEKAGIIRYAIGVGHAFQGPTARQ
240 250 260 270 280 290
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pF1KE1 ELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAIEGTETTSSSSFELEMAQEGFSAV
::: :.: : :.:.:::..: :: .::.::.:::.:.:::.. .::::. ::.:::::..
CCDS32 ELNTISSAPPQDHVFKVDNFAALGSIQKQLQEKIYAVEGTQSRASSSFQHEMSQEGFSTA
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pF1KE1 FTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQS
.: :: :::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS32 LTMDGLFLGAVGSFSWSGGAFLYPPNMSPTFINMSQENVDMRDSYLGYSTELALWKGVQN
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::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 LVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRKKAEVTGTQIGSYFGASLCSVDVDSDGSTDLILIG
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pF1KE1 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGWRRWWCDAVLYGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNGDKLTDV
::::::::::::::::::::: .: ::::: ::::::::::::::::::::: ::: ::
CCDS32 APHYYEQTRGGQVSVCPLPRGRVQWQCDAVLRGEQGHPWGRFGAALTVLGDVNEDKLIDV
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.::::::.:::::::::::. .::::::::::.:::: ::::::::::::::::::::
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.::::::::::::::. ::: :::.:.: :.:. .....: :. : ....:: :.
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: : . :: :.:::: .:::::::::. :: :.:::: .:.: ..::: :::...:::
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CCDS32 PDCVEDVVSPIILHLNFSLVREPIPSPQNLRPVLAVGSQDLFTASLPFEKNCGQDGLCEG
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pF1KE1 NLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQKQG
.::...:: ::..: :::.::::. : ::: :::::::.:.. .:::::.: :. .:::
CCDS32 DLGVTLSFSGLQTLTVGSSLELNVIVTVWNAGEDSYGTVVSLYYPAGLSHRRVSGAQKQP
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pF1KE1 QLRSLHLTCDSAPVGSQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLLLTAN
. .:.:.:...:. ..: :. : .:: ::. :.. ::..::::: ::.::::.:. :.
CCDS32 HQSALRLACETVPTEDEGLRSSRCSVNHPIFHEGSNGTFIVTFDVSYKATLGDRMLMRAS
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.::::: .::.::::::::::::::..: .:. :::.::. :.::. . : :::.:::
CCDS32 ASSENNKASSSKATFQLELPVKYAVYTMISRQEESTKYFNFATSDEKKMKEAEHRYRVNN
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pF1KE1 LGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNPV
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CCDS32 LSQRDLAISINFWVPVLLNGVAVW-DVVMEAPSQ-SLPCVSERKPPQHSDFLTQISRSPM
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pF1KE1 LDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFDTSVY
:::::: ::.::::::::::::::::::::::::::::. ::::: ::::::::::::::
CCDS32 LDCSIADCLQFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRETLQKKVLVVSVAEITFDTSVY
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pF1KE1 SQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKE
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CCDS32 SQLPGQEAFMRAQMEMVLEEDEVYNAIPIIMGSSVGALLLLALITATLYKLGFFKRHYKE
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CCDS32 MLEDKPEDTATFSGDDF-SCVAPNVPLS
1140 1150 1160
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pF1KE1 NQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEAVNMSLGLSLASTTSPSQLLACGPTVHHECGRNM
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CCDS45 QKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKLQ
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CCDS45 VSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELRK
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CCDS45 APVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFND
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CCDS45 SVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKRQ
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pF1KE1 YKEMMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
::.:: :
CCDS45 YKDMMSEGGPPGAEPQ
1140 1150
>>CCDS54004.1 ITGAM gene_id:3684|Hs108|chr16 (1153 aa)
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Smith-Waterman score: 4564; 61.5% identity (81.7% similar) in 1141 aa overlap (8-1143:5-1144)
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CCDS54 NQRGSLYQCDYSTGSCEPIRLQVPVEAVNMSLGLSLAATTSPPQLLACGPTVHQTCSENT
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pF1KE1 YLTGLCFLLGPT--QLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSRNFATMMNFVRAVI
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CCDS54 YVKGLCFLFGSNLRQQPQKFPEALRGCPQEDSDIAFLIDGSGSIIPHDFRRMKEFVSTVM
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pF1KE1 SQFQRPSTQFSLMQFSNKFQTHFTFEEFRRSSNPLSLLASVHQLQGFTYTATAIQNVVHR
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CCDS54 EQLKKSKTLFSLMQYSEEFRIHFTFKEFQNNPNPRSLVKPITQLLGRTHTATGIRKVVRE
180 190 200 210 220 230
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CCDS54 LFNITNGARKNAFKILVVITDGEKFGDPLGYEDVIPEADREGVIRYVIGVGDAFRSEKSR
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CCDS54 QELNTIASKPPRDHVFQVNNFEALKTIQNQLREKIFAIEGTQTGSSSSFEHEMSQEGFSA
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CCDS54 GAPHYYEQTRGGQVSVCPLPRGQRARWQCDAVLYGEQGQPWGRFGAALTVLGDVNGDKLT
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pF1KE1 DVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQYFGQALSGGQDLTQD
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CCDS54 DVAIGAPGEEDNRGAVYLFHGTSGSGISPSHSQRIAGSKLSPRLQYFGQSLSGGQDLTMD
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CCDS54 GLVDLTVGAQGHVLLLRSQPVLRVKAIMEFNPREVARNVFECNDQVVKGKEAGEVRVCLH
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pF1KE1 IDKRSKNLLGSRDLQSSVTLDLALDPGRLSPRATFQETKNRSLSRVRVLGLKAHCENFNL
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CCDS54 VQKSTRDRLREGQIQSVVTYDLALDSGRPHSRAVFNETKNSTRRQTQVLGLTQTCETLKL
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pF1KE1 LLPSCVEDSVTPITLRLNFTLVGKPLLAFRNLRPMLAADAQRYFTASLPFEKNCGADHIC
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CCDS54 QLPNCIEDPVSPIVLRLNFSLVGTPLSAFGNLRPVLAEDAQRLFTALFPFEKNCGNDNIC
720 730 740 750 760 770
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pF1KE1 QDNLGISFSFPGLKSLLVGSNLELNAEVMVWNDGEDSYGTTVTFSHPAGLSYRYVAEGQK
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CCDS54 QDDLSITFSFMSLDCLVVGGPREFNVTVTVRNDGEDSYRTQVTFFFPLDLSYRKVSTLQN
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 QGQLRSLHLTCDSAPVG--SQGTWSTSCRINHLIFRGGAQITFLATFDVSPKAVLGDRLL
: . :: .:.:.:: : . :::: ::: :: ....:: ::::. :: ::..::
CCDS54 QRSQRSWRLACESASSTEVSGALKSTSCSINHPIFPENSEVTFNITFDVDSKASLGNKLL
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 LTANVSSENNTPRTSKTTFQLELPVKYAVYTVVSSHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRY
: :::.:::: :::.:: :::::::::::: ::.:: ::::::. ::. :.: .:.:
CCDS54 LKANVTSENNMPRTNKTEFQLELPVKYAVYMVVTSHGVSTKYLNFTASENT-SRVMQHQY
900 910 920 930 940 950
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pF1KE1 QVNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVSHPQNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQ
::.:::::.::.:. : :::.::: ..: .:. .: : : ... : :::::...
CCDS54 QVSNLGQRSLPISLVFLVPVRLNQTVIWDRPQVTFSENLSSTCHTKERLPSHSDFLAELR
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 KNPVLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFTLKGNLSFGWVRQILQKKVSVVSVAEITFD
: ::..:::: : :..::.: :..:::.. :::::::: : . .... .::.::: :.
CCDS54 KAPVVNCSIAVCQRIQCDIPFFGIQEEFNATLKGNLSFDWYIKTSHNHLLIVSTAEILFN
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 TSVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKR
::.. :::: ::.:.:: : .: ..: :: :::::::.:::::::::::.:::.:::::
CCDS54 DSVFTLLPGQGAFVRSQTETKVEPFEVPNPLPLIVGSSVGGLLLLALITAALYKLGFFKR
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1140 1150 1160
pF1KE1 QYKEMMEEANGQIAPENGTQTPSPPTPHYPQDNV
:::.:: :
CCDS54 QYKDMMSEGGPPGAEPQ
1140 1150
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..: : :.: .:::.. .: :: :: :.: .:. :.
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:::: . .:.::.:::: .:: : :. :. . .. ::..::. . ...::: :
CCDS32 VGAPGE---GNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLR-GSNYTSKYLGMTLATDPTDGSILACDP
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pF1KE1 TVHHECGRNMYLTGLCFLL-----GPTQLTQRLPVSRQECPRQEQDIVFLIDGSGSISSR
. . : .: ::.:::.:. :: . : : . ::: . . :.:::.::: :..
CCDS32 GLSRTCDQNTYLSGLCYLFRQNLQGP--MLQGRP-GFQECIKGNVDLVFLFDGSMSLQPD
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170 180 190 200 210 220
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.: ...:.. :..... : ::. .:::....:.: : .. . ..: .:: :... .
CCDS32 EFQKILDFMKDVMKKLSNTSYQFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKRKDPDALLKHVKHMLLL
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: : ::. :. ..:. ::: ::.:.::.::: :.. : .. ::: ::::
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::.: ::...: . :. .::::..: . .. :. :::. ..:..::..:::: .
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.::..:... :.:: .. :.::::. :.:: . ... :::. . ..: .
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::::. : : . .. :. ::::::: :....: : . .: . . :::::::::.
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::.::::.:: :.:.::::: .: . :::.: . : :. . : : :. :.:
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:::: :.:.: :.::: :.::..::: :.. ::::.:.: : ..::. :::: :.:.
CCDS32 GRFGEAITALTDINGDGLVDVAVGAPLEEQ--GAVYIFNGRHG-GLSPQPSQRIEGTQVL
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: .:.::... : .:: :::.:.::::..:...: .:::. . . :.: ::::: :
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: .. .. . :. .::. : . .. : : ...: : :: : :. : ..
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pF1KE1 RSLSRVRVLGLKAHCENFNLLLPSCVEDSVTPITLRLNFTLV---GKPL---LAFRNLRP
. : : .. . : .:.. .: ::.: ..::.. :::.: : : ... :
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.: . . : .::::::: :. :. :: .::: ..: . . :..:. . :
CCDS32 ILRPSLHSE-TWEIPFEKNCGEDKKCEANLRVSFSPARSRALRLTAFASLSVELSLSNLE
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::.: . . . : :::.: : . ..: . ..:. : :. . . :: .. ::
CCDS32 EDAYWVQLDLHFPPGLSFRKVEMLKPHSQ---IPVSCEELPEESRLLSRALSCNVSSPIF
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..: .... :.. .. :: . : :::. .: .. .. .:. : . ...
CCDS32 KAGHSVALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQ
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pF1KE1 SHEQFTKYLNFSESEEKESHVAMHRYQVNNLGQRDLPVSINFWVPVELNQEAVWMDVEVS
..:. : :..:. . : : . : ::: : : . .:. ::: : :
CCDS32 DQEDSTLYVSFTPKGPK-IHQVKHMYQV-----RIQPSIHDHNIPT---LEAV---VGVP
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pF1KE1 HP--QNPSLRCSSEKIAPPASDFLAHIQKNP-VLDCSIAGCLRFRCDVPSFSVQEELDFT
.: ..: . : .. ::. ... : . . . : : ::: : ..:.
CCDS32 QPPSEGPITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERLPDAAEPCLPGAL-FRCPV---VFRQEILVQ
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. :.: . : .: ... :. : :.:..: . .: :..: . ::.. .. ..
CCDS32 VIGTLEL--VGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQVVMKVDVVYEKQM
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pF1KE1 TPLIVGSSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEMMEEANG---QIAPENGTQTPSPPTP
: : :.::::::: :: ::::::::::. :: :: . : : :.. : :
CCDS32 LYLYVLSGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEA
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CCDS32 GDPGCLKPLHEKDSESGGGKD
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CCDS45 VGAPGE---GNSTGSLYQCQSGTGHCLPVTLR-GSNYTSKYLGMTLA--TDPT-------
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CCDS45 ---------------ILFAAVQFSTSYKTEFDFSDYVKRKDPDALLKHVKHMLLLTNTFG
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pF1KE1 EMAQEGFSAVFTPDGPVLGAVGSFTWSGGAFLYPPNMSP-TFINMSQENVDMRDSYLGYS
:... :.:: .. :.::::. :.:: . ... :::. . ..: .::::.
CCDS45 ELSSSGISADLSRGHAVVGAVGAKDWAGGFLDLKADLQDDTFIGNEPLTPEVRAGYLGYT
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pF1KE1 -TELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFT--QVSRQWRMKAEVTGTQIGSYFGASLCSV
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CCDS45 VTWLPSRQKTSLLASGAPRYQHMGRVLLFQEPQGGGHWSQVQTIHGTQIGSYFGGELCGV
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:::.:: :.:.::::: .: . :::.: . : :. . : : :. :.: ::::
CCDS45 DVDQDGETELLLIGAPLFYGEQRGGRVFI--YQR--RQLGFEEVSELQGDPGYPLGRFGE
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pF1KE1 ALTVLGDVNGDKLTDVVIGAPGEKENRGAVYLFHGVLGPSISPSHSQRIAGSQLSSRLQY
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pF1KE1 FGQALSGGQDLTQDGLVDLAVGARGQVLLLRTRPVLWVGVSMQFIPAEIPRSAFECREQV
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CCDS45 FGRSIHGVKDLEGDGLADVAVGAESQMIVLSSRPVVDMVTLMSFSPAEIPVHEVECSYST
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.. . :. .::. : . .. : : ...: : :: : :. : ... : :
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560 570 580 590 600 610
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.. . : .:.. .: ::.: ..::.. :::.: : : : ... :.: .
CCDS45 NIAVTTSMSCTDFSFHFPVCVQDLISPINVSLNFSLWEEEGTPRDQRAGKDIPPILRPSL
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. : .::::::: :. :. :: .::: ..: . . :..:. . : ::.: .
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. . : :::.: : . ..: . ..:. : :. . . :: .. ::..: ..
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.. :.. .. :: . : :::. .: .. .. .:. : . .....:. :
CCDS45 ALQMMFNTLVNSSWGDSVELHANVTCNNEDSDLLEDNSATTIIPILYPINILIQDQEDST
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:..:. . : : . : ::: : : . .:. ::: : : .: ..
CCDS45 LYVSFTPKGPK-IHQVKHMYQV-----RIQPSIHDHNIPT---LEAV---VGVPQPPSEG
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: . : .. ::. ... : . . . : : ::: : ..:. . :.:
CCDS45 PITHQWSVQMEPPVPCHYEDLERLPDAAEPCLPGAL-FRCPV---VFRQEILVQVIGTLE
900 910 920 930 940 950
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pF1KE1 FGWVRQILQKKV-SVVSVAEITFDTSVYSQLPGQEAFMRAQTTTVLEKYKVHNPTPLIVG
. : .: ... :. : :.:..: . .: :..: . ::.. .. .. : :
CCDS45 L--VGEIEASSMFSLCSSLSISFNSSKHFHLYGSNASL-AQVVMKVDVVYEKQMLYLYVL
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pF1KE1 SSIGGLLLLALITAVLYKVGFFKRQYKEMMEEANG---QIAPENGTQTPSPPTPHYPQDN
:.::::::: :: ::::::::::. :: :: . : : :.. : :
CCDS45 SGIGGLLLLLLIFIVLYKVGFFKRNLKEKMEAGRGVPNGIPAEDSEQLASGQEAGDPGCL
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 V
CCDS45 KPLHEKDSESGGGKD
1080
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pF1KE1 QYANSWVVVGAPQKITAANQTGGLYQCGYSTGACEPIGLQVPPEA-VNMSLGLSLASTTS
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CCDS32 RGVTVVRSHHGVLICIQVLVRRPHSLSSELTGTCSLLGPDLRPQAQANF---FDLENLLD
100 110 120 130 140
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pF1KE1 PSQLLACGPTVHHECGRNMYLTGLCFLLGPTQLTQRLPVSRQECPRQEQ---DIVFLIDG
:. . : .. : . .. . .. ..: ..:. .:....::
CCDS32 PDARVDTGDCYSNKEGGGEDDVNTARQRRALEKEEEEDKEEEEDEEEEEAGTEIAIILDG
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::::. .: .:. .. .: . . :.:.:... .::.: ... . :. .
CCDS32 SGSIDPPDFQRAKDFISNMMRNFYEKCFECNFALVQYGGVIQTEFDLRDSQDVMASLARV
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pF1KE1 ASVHQLQGFTYTATAIQNVVHRLFHASYGARRDAAKILIVITDGKKEGDSLDYKDVIPMA
.. :. . : ::.:.:.:. .: .:.:.:: :.:...:.::: : :. ::
CCDS32 QNITQVGSVTKTASAMQHVLDSIFTSSHGSRRKASKVMVVLTDGGIFEDPLNLTTVINSP
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280 290 300 310 320 330
pF1KE1 DAAGIIRYAIGVGLAFQNRNSWKELNDIASKPSQEHIFKVEDFDALKDIQNQLKEKIFAI
:. :.::::: :.. . .::: ::: :.. : ::: .. :: . ..:. .:...
CCDS32 KMQGVERFAIGVGEEFKSARTARELNLIASDPDETHAFKVTNYMALDGLLSKLRYNIISM
330 340 350 360 370 380
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 EGTETTSSSSFELEMAQEGFSAVFTPDGPVL-GAVGSFTWSGGAFLYPP-NMSPTFINMS
::: ..... ..:: :::: . . :: ::::.: :::::.:: . :.:..
CCDS32 EGT---VGDALHYQLAQIGFSAQILDERQVLLGAVGAFDWSGGALLYDTRSRRGRFLNQT
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 QENV-DMRD---SYLGYSTELALWKGVQSLVLGAPRYQHTGKAVIFTQVSRQWRMKAEVT
. : . :::::.. . : . :::::.: : . . . .:. . .
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. ::. .. . :.::::: :......: .:. . . :: : .. ::. ::.:
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. .:::.: .. :..:... . ... .: . .:..:.. :. .. :
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CCDS32 LLEEEN
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CCDS39 ATSQTSQYGGDLTNTFGAIQYARKYAYSAASGGRRSATKVMVVVTDGESHDGSM-LKAVI
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CCDS39 YLFTIKEGILGQ--HQFLEGPEGIENTRFGSAIAALSDINMDGFNDVIVGSPLENQNSGA
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CCDS39 VYIYNGHQG-TIRTKYSQKILGSDGAFRSHLQYFGRSLDGYGDLNGDSITDVSIGAFGQV
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CCDS39 IVYNITLDADGFSSRVTSRGLFKENNERCLQKNMVVNQAQSCPEHIIYIQEPS---DVVN
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CCDS39 GPKFIFSLKVTTGSVPVSMATVIIHIPQYTKEKNPLMYLTGVQTDKAGDISCNADINPLK
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CCDS39 IGQTSSSVSFKSENFRHTKELNCRTASCSNVTCWLKDVHMKGEYFVNVTTRIWNGTFASS
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CCDS39 TFQTVQLTAAAEINTYNPEIYVI---EDNTVTIPLMIMKPDEKAEVPTGVIIGSIIAGIL
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