Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1502
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1502, 365 aa
1>>>pF1KE1502 365 - 365 aa - 365 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7666+/-0.000714; mu= 13.0022+/- 0.043
mean_var=160.3415+/-32.228, 0's: 0 Z-trim(116.1): 31 B-trim: 246 in 2/52
Lambda= 0.101286
statistics sampled from 16673 (16704) to 16673 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.815), E-opt: 0.2 (0.513), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 ( 365) 2636 396.3 2.2e-110
CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 ( 351) 755 121.4 1.2e-27
CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 365) 740 119.2 5.6e-27
CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 ( 355) 730 117.7 1.5e-26
CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 ( 389) 723 116.8 3.3e-26
CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 ( 360) 709 114.7 1.3e-25
CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 ( 355) 707 114.4 1.6e-25
CCDS1564.1 WNT3A gene_id:89780|Hs108|chr1 ( 352) 704 113.9 2.1e-25
CCDS76188.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 299) 697 112.8 3.8e-25
CCDS846.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 372) 697 112.9 4.4e-25
CCDS847.1 WNT2B gene_id:7482|Hs108|chr1 ( 391) 697 113.0 4.6e-25
CCDS8510.1 WNT5B gene_id:81029|Hs108|chr12 ( 359) 673 109.4 4.9e-24
CCDS58835.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 365) 670 109.0 6.7e-24
CCDS46850.1 WNT5A gene_id:7474|Hs108|chr3 ( 380) 670 109.0 6.9e-24
CCDS2616.1 WNT7A gene_id:7476|Hs108|chr3 ( 349) 668 108.7 8e-24
CCDS33667.1 WNT7B gene_id:7477|Hs108|chr22 ( 349) 666 108.4 9.8e-24
CCDS8242.1 WNT11 gene_id:7481|Hs108|chr11 ( 354) 636 104.0 2.1e-22
CCDS11506.1 WNT9B gene_id:7484|Hs108|chr17 ( 357) 510 85.6 7.2e-17
CCDS43368.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 351) 492 83.0 4.4e-16
CCDS75311.1 WNT8A gene_id:7478|Hs108|chr5 ( 369) 492 83.0 4.6e-16
CCDS7494.1 WNT8B gene_id:7479|Hs108|chr10 ( 351) 477 80.8 2e-15
CCDS8776.1 WNT1 gene_id:7471|Hs108|chr12 ( 370) 460 78.3 1.2e-14
>>CCDS2425.1 WNT6 gene_id:7475|Hs108|chr2 (365 aa)
initn: 2636 init1: 2636 opt: 2636 Z-score: 2095.1 bits: 396.3 E(32554): 2.2e-110
Smith-Waterman score: 2636; 100.0% identity (100.0% similar) in 365 aa overlap (1-365:1-365)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWAVGSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAELCQAEPE
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CCDS24 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWAVGSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAELCQAEPE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKAFGRILQQDIRETAFVFAITAAGASHAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 VVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKAFGRILQQDIRETAFVFAITAAGASHAV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSAAWEWGGCGDDVDFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 TQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSAAWEWGGCGDDVDFGD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKSRLFMDARHKRGRGDIRALVQLHNNEAGRLAVRSHTRTECKCHGLSGSCALRTCWQKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 EKSRLFMDARHKRGRGDIRALVQLHNNEAGRLAVRSHTRTECKCHGLSGSCALRTCWQKL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDGKALLPAVRTLKPPGRADLLYAADSPDFCAPNRRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 PPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDGKALLPAVRTLKPPGRADLLYAADSPDFCAPNRRT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCLCRFHWCCVVQCHRCRVRKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS24 GSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCLCRFHWCCVVQCHRCRVRKE
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LSLCL
:::::
CCDS24 LSLCL
>>CCDS223.1 WNT4 gene_id:54361|Hs108|chr1 (351 aa)
initn: 987 init1: 378 opt: 755 Z-score: 609.9 bits: 121.4 E(32554): 1.2e-27
Smith-Waterman score: 1056; 43.4% identity (69.3% similar) in 362 aa overlap (9-364:10-350)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWA-VGSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAELCQAE
: ::.. .. : . :. : ..: .. :.: . : ::...:. .
CCDS22 MSPRSCLRSLRLLVFAVFSAAASNWLYLAKLSSVGSISEEETCEKLKGLIQRQVQMCKRN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PEVVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSK--AFGRILQQDIRETAFVFAITAAGA
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CCDS22 LEVMDSVRRGAQLAIEECQYQFRNRRWNCSTLDSLPVFGKVVTQGTREAAFVYAISSAGV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 SHAVTQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSAAWEWGGCGDDV
. :::.::: ::: .:::. :. . :. ::.: ..:.::.:..
CCDS22 AFAVTRACSSGELEKCGCD----RT------VHGV--------SPQG---FQWSGCSDNI
130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DFGDEKSRLFMDARHK-RGRGDIRALVQLHNNEAGRLAVRSHTRTECKCHGLSGSCALRT
.: :. :.:.:.. .: .. :::..:::::::: :. .: :.::::::.:::: ..:
CCDS22 AYGVAFSQSFVDVRERSKGASSSRALMNLHNNEAGRKAILTHMRVECKCHGVSGSCEVKT
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 CWQKLPPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDG--KALLPAVRTLKPPGRADLLYAADSPDF
::. .::::.:: : :.: ::..: : .::.: .:: ::.: ::::
CCDS22 CWRAVPPFRQVGHALKEKFDGATEVEPRRVGSSRALVPRNAQFKPHTDEDLVYLEPSPDF
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 CAPNRRTGSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCLCRFHWCCVVQCH
: . :.: :::::.::... ..::.::::::: . .:.: : : :.::::: :.:.
CCDS22 CEQDMRSGVLGTRGRTCNKTSKAIDGCELLCCGRGFHTAQVELAERCSCKFHWCCFVKCR
280 290 300 310 320 330
360
pF1KE1 RCRVRKELSLCL
.:. :: :
CCDS22 QCQRLVELHTCR
340 350
>>CCDS5781.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 (365 aa)
initn: 876 init1: 320 opt: 740 Z-score: 597.8 bits: 119.2 E(32554): 5.6e-27
Smith-Waterman score: 863; 36.7% identity (60.0% similar) in 365 aa overlap (14-364:19-364)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWAVGSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAELC
::.: : . : : .: : .. : .:: :::
CCDS57 MDRAALLGLARLCALWAALLVLFPYGAQGNWMWLGIASFGVPEKLGCANLPLNSRQKELC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KE1 QAEPEVVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKA----------FGRILQQDIRET
. .: .. . .:::::..:: ::: .:::: . : :: :.. .::
CCDS57 KRKPYLLPSIREGARLGIQECGSQFRHERWNCMITAAATTAPMGASPLFGYELSSGTKET
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AFVFAITAAGASHAVTQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSA
::..:. ::: :.::..:: :.. .:.:. : : ..: ::
CCDS57 AFIYAVMAAGLVHSVTRSCSAGNMTECSCD---------------TTLQNGGSAS-EG--
130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 AWEWGGCGDDVDFGDEKSRLFMD--ARHKRGRGDIRAL-VQLHNNEAGRLAVRSHTRTEC
:.::::.:::..: :: :.: . :. . : ..:::::::: :: . ..:
CCDS57 -WHWGGCSDDVQYGMWFSRKFLDFPIGNTTGKENKVLLAMNLHNNEAGRQAVAKLMSVDC
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 KCHGLSGSCALRTCWQKLPPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDGKALLPAVRTLKPP-GR
.:::.:::::..:::. . :...: : ...... .. . : : : .
CCDS57 RCHGVSGSCAVKTCWKTMSSFEKIGHLLKDKYENSIQISDKTKRKMRRREKDQRKIPIHK
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 ADLLYAADSPDFCAPNRRTGSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCL
::::. ::..:. ... : :::.:: :: .. .::.:::::::. . :. : :
CCDS57 DDLLYVNKSPNYCVEDKKLGIPGTQGRECNRTSEGADGCNLLCCGRGYNTHVVRHVERCE
290 300 310 320 330 340
350 360
pF1KE1 CRFHWCCVVQCHRCRVRKELSLCL
:.: ::: :.:.::. .. :
CCDS57 CKFIWCCYVRCRRCESMTDVHTCK
350 360
>>CCDS5780.1 WNT16 gene_id:51384|Hs108|chr7 (355 aa)
initn: 897 init1: 320 opt: 730 Z-score: 590.1 bits: 117.7 E(32554): 1.5e-26
Smith-Waterman score: 853; 37.0% identity (60.5% similar) in 354 aa overlap (25-364:21-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWAVGSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAELCQAEPE
::: .: : .. : .:: :::. .:
CCDS57 MQLTTCLRETLFTGASQKTSLWW-LGIASFGVPEKLGCANLPLNSRQKELCKRKPY
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KE1 VVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKA----------FGRILQQDIRETAFVFA
.. . .:::::..:: ::: .:::: . : :: :.. .::::..:
CCDS57 LLPSIREGARLGIQECGSQFRHERWNCMITAAATTAPMGASPLFGYELSSGTKETAFIYA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ITAAGASHAVTQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSAAWEWG
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CCDS57 VMAAGLVHSVTRSCSAGNMTECSCD---------------TTLQNGGSAS-EG---WHWG
120 130 140 150
180 190 200 210 220
pF1KE1 GCGDDVDFGDEKSRLFMD--ARHKRGRGDIRAL-VQLHNNEAGRLAVRSHTRTECKCHGL
::.:::..: :: :.: . :. . : ..:::::::: :: . ..:.:::.
CCDS57 GCSDDVQYGMWFSRKFLDFPIGNTTGKENKVLLAMNLHNNEAGRQAVAKLMSVDCRCHGV
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SGSCALRTCWQKLPPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDGKALLPAVRTLKPP-GRADLLY
:::::..:::. . :...: : ...... .. . : : : . ::::
CCDS57 SGSCAVKTCWKTMSSFEKIGHLLKDKYENSIQISDKTKRKMRRREKDQRKIPIHKDDLLY
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 AADSPDFCAPNRRTGSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCLCRFHW
. ::..:. ... : :::.:: :: .. .::.:::::::. . :. : : :.: :
CCDS57 VNKSPNYCVEDKKLGIPGTQGRECNRTSEGADGCNLLCCGRGYNTHVVRHVERCECKFIW
280 290 300 310 320 330
350 360
pF1KE1 CCVVQCHRCRVRKELSLCL
:: :.:.::. .. :
CCDS57 CCYVRCRRCESMTDVHTCK
340 350
>>CCDS8775.1 WNT10B gene_id:7480|Hs108|chr12 (389 aa)
initn: 1014 init1: 326 opt: 723 Z-score: 584.0 bits: 116.8 E(32554): 3.3e-26
Smith-Waterman score: 997; 42.2% identity (63.7% similar) in 391 aa overlap (3-364:9-388)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCP----AHVGGLWWAVGSPLVMDPTSICRKARRLAGR
:: :: :. ::.: :: .. :: ::. . ..: :. :
CCDS87 MLEEPRPRPP-PSGLAGLLFLALCSRALSNEILGLKLPGEPPLTAN--TVCLTLSGLSKR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE1 QAELCQAEPEVVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKAFGR------ILQQDIRE
: :: .:.:.: .: ...:.::: :.: .:::::. .. :: ::.. .::
CCDS87 QLGLCLRNPDVTASALQGLHIAVHECQHQLRDQRWNCSAL-EGGGRLPHHSAILKRGFRE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KE1 TAFVFAITAAGASHAVTQACSMGELLQCGC------QAPRGRAP-------PRPSGLPGT
.:: :.. :::. :::. :::.:.:..::: . : :: : ...: .
CCDS87 SAFSFSMLAAGVMHAVATACSLGKLVSCGCGWKGSGEQDRLRAKLLQLQALSRGKSFPHS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE1 -PGP-PGPAGSPEGSAAWEWGGCGDDVDFGDEKSRLFMDARHKRGRGDIRALVQLHNNEA
:.: :: . :: . .::::::. :.:::.. :: :.:.:. . ::.: ...:::..
CCDS87 LPSPGPGSSPSPGPQDTWEWGGCNHDMDFGEKFSRDFLDSRE--APRDIQARMRIHNNRV
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 GRLAVRSHTRTECKCHGLSGSCALRTCWQKLPPFREVGARLLERFHGASRVMGTN-DGKA
:: .: . . .::::: :::: ..:::. : :: ::: : ::. : . : .. :
CCDS87 GRQVVTENLKRKCKCHGTSGSCQFKTCWRAAPEFRAVGAALRERLGRAIFIDTHNRNSGA
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 LLPAVRTLKPPGRADLLYAADSPDFCAPNRRTGSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRG
. : .: . : .:.: ::::: . :::::::::::... :.:: ::::::
CCDS87 FQPRLRPRRLSG--ELVYFEKSPDFCERDPTMGSPGTRGRACNKTSRLLDGCGSLCCGRG
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KE1 H---RQESVQLEENCLCRFHWCCVVQCHRCRVRKELSLCL
: :: : : : ::::::: : : .:.: . ...:
CCDS87 HNVLRQTRV---ERCHCRFHWCCYVLCDECKVTEWVNVCK
360 370 380
>>CCDS5771.1 WNT2 gene_id:7472|Hs108|chr7 (360 aa)
initn: 994 init1: 579 opt: 709 Z-score: 573.4 bits: 114.7 E(32554): 1.3e-25
Smith-Waterman score: 977; 39.9% identity (67.0% similar) in 361 aa overlap (12-364:14-348)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHVGGLWWAV----GSPLVMDPTSICRKARRLAGRQAEL
::: : : .:.. :: . :: :: : .. :.. : .:
CCDS57 MNAPLGGIWLWLPLLLTWLTP-EVNSSWWYMRATGGSSRVM-----CDNVPGLVSSQRQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CQAEPEVVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSS----HSKAFGRILQQDIRETAFVFA
:. .:.:. ...:. . ::: ::: .::::.. :: :::.: .. ::.:::.:
CCDS57 CHRHPDVMRAISQGVAEWTAECQHQFRQHRWNCNTLDRDHS-LFGRVLLRSSRESAFVYA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ITAAGASHAVTQACSMGELLQCGCQAPRGRAPPRPSGLPGTPGPPGPAGSPEGSAAWEWG
:..::. :.:.:::.::. .:.:. : : : . .: ..::
CCDS57 ISSAGVVFAITRACSQGEVKSCSCD----------------PKKMGSAKDSKG--IFDWG
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 GCGDDVDFGDEKSRLFMDARHKRGRGDIRALVQLHNNEAGRLAVRSHTRTECKCHGLSGS
::.:..:.: . .: :.::....:. : :::..::::.::: ::. . ::::::.:::
CCDS57 GCSDNIDYGIKFARAFVDAKERKGK-DARALMNLHNNRAGRKAVKRFLKQECKCHGVSGS
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 CALRTCWQKLPPFREVGARLLERFHGASRVMGTNDGKALLPAVRTLKPPGRADLLYAADS
:.::::: . ::..: : ....:: .:. ..:: .. : . .: : . ::.: .:
CCDS57 CTLRTCWLAMADFRKTGDYLWRKYNGAIQVVMNQDGTGFTVANERFKKPTKNDLVYFENS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PDFCAPNRRTGSPGTRGRACNSSAPDLSGCDLLCCGRGHRQESVQLEENCLCRFHWCCVV
::.: .:..:: :: ::.:: .. ...:...:::::. : .: :.:::::.:
CCDS57 PDYCIRDREAGSLGTAGRVCNLTSRGMDSCEVMCCGRGYDTSHVTRMTKCGCKFHWCCAV
280 290 300 310 320 330
360
pF1KE1 QCHRCRVRKELSLCL
.:. : .. :
CCDS57 RCQDCLEALDVHTCKAPKNADWTTAT
340 350 360
>>CCDS11505.1 WNT3 gene_id:7473|Hs108|chr17 (355 aa)
initn: 976 init1: 364 opt: 707 Z-score: 571.9 bits: 114.4 E(32554): 1.6e-25
Smith-Waterman score: 993; 41.2% identity (65.4% similar) in 376 aa overlap (6-364:3-354)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MLPPLPSRLGLLLLLLLCPAHV-GG--LWW--AVG---SPLVMDPTSICRKARRLAGRQA
: ::::: ::: ..: .: .:: :.: . : .: .: . :. .:
CCDS11 MEPHLLGLLLGLLLGGTRVLAGYPIWWSLALGQQYTSLGSQPL-LCGSIPGLVPKQL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KE1 ELCQAEPEVVAELARGARLGVRECQFQFRFRRWNCSSHSKA---FGRILQQDIRETAFVF
..:. :.. .:.:..::..::: ::: :::::.. . . :: .:.. ::.:::
CCDS11 RFCRNYIEIMPSVAEGVKLGIQECQHQFRGRRWNCTTIDDSLAIFGPVLDKATRESAFVH
60 70 80 90 100 110
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350 360
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CCDS11 FHWCCYVSCQECIRIYDVHTCK
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CCDS15 FCRNYVEIMPSVAEGIKIGIQECQHQFRGRRWNCTTVHDSLAIFGPVLDKATRESAFVHA
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CCDS15 HWCCYVSCQECTRVYDVHTCK
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CCDS76 ----GRHHDQRGD--FDWGGCSDNIHYGVRFAKAFVDAKEKRLK-DARALMNLHNNRCGR
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CCDS76 TAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRTGDYLRRRYDGAVQVMATQDGANFTA
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CCDS76 ARQGYRRATRTDLVYFDNSPDYCVLDKAAGSLGTAGRVCSKTSKGTDGCEIMCCGRGYDT
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CCDS76 TRVTRVTQCECKFHWCCAVRCKECRNTVDVHTCKAPKKAEWLDQT
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CCDS84 SLRTAVPGIPTQSAFNKCLQRYIGALGARVICDNIPGLVSRQRQLCQRYPDIMRSVGEGA
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CCDS84 REWIRECQHQFRHHRWNCTTLDRDHTVFGRVMLRSSREAAFVYAISSAGVVHAITRACSQ
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CCDS84 VDAKEKRLK-DARALMNLHNNRCGRTAVRRFLKLECKCHGVSGSCTLRTCWRALSDFRRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]