FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1473, 381 aa
1>>>pF1KE1473 381 - 381 aa - 381 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2836+/-0.000737; mu= 13.3751+/- 0.045
mean_var=110.5525+/-21.958, 0's: 0 Z-trim(112.4): 79 B-trim: 45 in 1/54
Lambda= 0.121980
statistics sampled from 13053 (13133) to 13053 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.755), E-opt: 0.2 (0.403), width: 16
Scan time: 2.370
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 381) 2632 473.5 1.3e-133
CCDS44307.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 440) 2512 452.5 3.4e-127
CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 ( 444) 2512 452.5 3.4e-127
CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 ( 569) 549 107.1 4e-23
CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039) 552 108.1 7.4e-23
CCDS44308.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2489) 552 108.1 8.6e-23
CCDS1477.1 C4BPA gene_id:722|Hs108|chr1 ( 597) 541 105.7 1.1e-22
CCDS1478.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1033) 450 89.9 1.1e-17
CCDS31007.1 CR2 gene_id:1380|Hs108|chr1 (1092) 450 89.9 1.2e-17
CCDS48004.1 SVEP1 gene_id:79987|Hs108|chr9 (3571) 429 86.6 3.7e-16
CCDS55189.1 CSMD1 gene_id:64478|Hs108|chr8 (3564) 424 85.7 6.9e-16
CCDS1479.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 349) 402 81.1 1.7e-15
CCDS1484.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 355) 402 81.1 1.7e-15
CCDS31009.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 362) 402 81.1 1.7e-15
CCDS1481.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 369) 402 81.1 1.8e-15
CCDS31008.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 377) 402 81.1 1.8e-15
CCDS1480.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 384) 402 81.1 1.8e-15
CCDS1485.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 392) 402 81.1 1.9e-15
CCDS1482.1 CD46 gene_id:4179|Hs108|chr1 ( 399) 402 81.1 1.9e-15
CCDS11663.1 APOH gene_id:350|Hs108|chr17 ( 345) 374 76.1 5.1e-14
CCDS10659.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 910) 366 75.1 2.9e-13
CCDS45458.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 809) 362 74.3 4.2e-13
CCDS10658.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 853) 362 74.3 4.4e-13
CCDS58447.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 879) 362 74.4 4.5e-13
CCDS73865.1 SEZ6L2 gene_id:26470|Hs108|chr16 ( 923) 362 74.4 4.7e-13
CCDS380.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3487) 359 74.3 1.9e-12
CCDS60082.1 CSMD2 gene_id:114784|Hs108|chr1 (3631) 359 74.3 1.9e-12
CCDS1283.1 SELE gene_id:6401|Hs108|chr1 ( 610) 343 70.9 3.5e-12
CCDS6316.2 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3538) 331 69.4 5.8e-11
CCDS6317.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3667) 331 69.4 5.9e-11
CCDS6315.1 CSMD3 gene_id:114788|Hs108|chr8 (3707) 331 69.4 6e-11
>>CCDS31006.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 (381 aa)
initn: 2632 init1: 2632 opt: 2632 Z-score: 2512.1 bits: 473.5 E(32554): 1.3e-133
Smith-Waterman score: 2632; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (1-381:1-381)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 GHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
:::::::::::::::::::::
CCDS31 GHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
370 380
>>CCDS44307.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 (440 aa)
initn: 2505 init1: 2505 opt: 2512 Z-score: 2397.1 bits: 452.5 E(32554): 3.4e-127
Smith-Waterman score: 2512; 98.1% identity (98.6% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 GHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
: : .:.
CCDS44 GSRPVTQAGMRWCDRSSLQSRTPGFKRSFHFSLPSSWYYRAHVFHVDRFAWDASNHGLAD
370 380 390 400 410 420
>>CCDS73022.1 CD55 gene_id:1604|Hs108|chr1 (444 aa)
initn: 2505 init1: 2505 opt: 2512 Z-score: 2397.0 bits: 452.5 E(32554): 3.4e-127
Smith-Waterman score: 2512; 98.1% identity (98.6% similar) in 370 aa overlap (1-370:1-370)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 VGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGER
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 DHYGYRQSVTYACNKGFTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 TVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE1 GHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
: : .:.
CCDS73 GSRPVTQAGMRWCDRSSLQSRTPGFKRSFHFSLPSSWYYRCVPRHPAKFLKFIFCRDRIF
370 380 390 400 410 420
>>CCDS44310.1 CR1L gene_id:1379|Hs108|chr1 (569 aa)
initn: 435 init1: 304 opt: 549 Z-score: 528.6 bits: 107.1 E(32554): 4e-23
Smith-Waterman score: 555; 38.7% identity (63.0% similar) in 243 aa overlap (71-303:15-242)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 DVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKCEESFVKIPGEKDSVICLKGSQWSDIEEFCNRSCEV
..:: ... : :..:: .:.:
CCDS44 MAPPVRLERPFPSRRFPGLLLAALVLLLSSFSD-------QCNV
10 20 30
110 120 130 140 150
pF1KE1 PTRLNSASLKQPYITQNY-FPVGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCK
: : : . .:... ::.:: ..::::::: .: .. ::.: :..: . ::
CCDS44 PEWLPFA--RPTNLTDDFEFPIGTYLNYECRPGYSGRPF---SIICLKNSVWTSAKDKCK
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KKSCPNPGEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPE
.::: :: . ::. : : : . :..:: ::.:.::.:. :.:::..: :.. :
CCDS44 RKSCRNPPDPVNGMAHVIKDIQFRSQIKYSCPKGYRLIGSSSATCIISGNTVIWDNKTPV
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 CREIYCPAPPQIDNGIIQG-ERDHYGYRQSVTYACNKG------FTMIGEHSIYCTVNND
: .: : :: : :: . . :... : . ::: :: : : ..:: ::::: ..:
CCDS44 CDRIICGLPPTIANGDFTSISREYFHYGSVVTYHCNLGSRGKKVFELVGEPSIYCTSKDD
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 E-GEWSGPPPECRGKSLTSK-VPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRS
. : :::: :.: . .: .::.:.. :.
CCDS44 QVGIWSGPAPQC---IIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFGMKGPSH
220 230 240 250 260
340 350 360 370 380
pF1KE1 TPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLVTMGLLT
CCDS44 VKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQRDKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGSTY
270 280 290 300 310 320
>--
initn: 367 init1: 283 opt: 449 Z-score: 433.5 bits: 89.5 E(32554): 8e-18
Smith-Waterman score: 483; 27.4% identity (57.0% similar) in 307 aa overlap (50-353:243-535)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 RLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKCEESF-VKIPGEKDS
..:. : . :. ..:. .: .: :..
CCDS44 QVGIWSGPAPQCIIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFGMKGPSH---
220 230 240 250 260
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 VICLKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPS
: : ..: :.: :. : . : : .. : : : : :.::: . :
CCDS44 VKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVLHAERTQR--DKDNFSPGQEVFYSCEPGYDLRGS
270 280 290 300 310 320
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 LSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNP-GEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLF
: : . :: :. :. ::: . :.. ::.. : .. .:: ..: :. :..:
CCDS44 T--YLHCTPQGDWSPAAPRCEVKSCDDFLGQLPNGHVLFPLNLQLGAKVDFVCDEGFQLK
330 340 350 360 370 380
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 GSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERD-HYGYRQSVTYACNKG
::..:.:...: :.. .: :.. : .:: ::... : : : : ..:.:. :
CCDS44 GSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCERKSCETPPVPVNGMVHVITDIHVGSR--INYSCTTG
390 400 410 420 430 440
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 FTMIGEHSIYCTVNNDEGEWSGPPPECRGKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKT
.::. : : .... ..:: :: : ... ::.. . ...: .. .. .
CCDS44 HRLIGHSSAECILSGNTAHWSMKPPIC--QQIFCPNPPAILNGRHTGTPLGDIPYGKEVS
450 460 470 480 490 500
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 TTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLVT
: :. : . ....: ...:. .:.:. :
CCDS44 YTCDPHPDRGMTFNL-IGEST--IRRTSEPHGNGVWSSPAPRCELPVGAGSHDALIVGKF
510 520 530 540 550
380
pF1KE1 MGLLT
CCDS44 YEVFAEEFCHL
560
>>CCDS44309.1 CR1 gene_id:1378|Hs108|chr1 (2039 aa)
initn: 410 init1: 323 opt: 552 Z-score: 523.8 bits: 108.1 E(32554): 7.4e-23
Smith-Waterman score: 619; 36.7% identity (61.9% similar) in 289 aa overlap (36-303:421-700)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 PSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKC
: :: .::.. . . :: ...: :
CCDS44 QLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKTVNYTC
400 410 420 430 440 450
70 80 90 100 110
pF1KE1 EE------SFVKIPGEKDSVICLKGSQ----WSDIEEFCN--RSCEVPTRLNSASLKQPY
. :: : ::. .. : . : ::. :. :..: .. :.::
CCDS44 DPHPDRGTSFDLI-GES-TIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQT
460 470 480 490 500
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 ITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQ
... ::.:: ..::::: : .: ..:::.:: ::. . ::.::: .: . ::.
CCDS44 NASD-FPIGTSLKYECRPEYYGRPF---SITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGM
510 520 530 540 550 560
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 IDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDN
. : : :. :..::.::..:.: .:. :..::....:: : :..: : :: : :
CCDS44 VHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIAN
570 580 590 600 610 620
240 250 260 270 280
pF1KE1 G-IIQGERDHYGYRQSVTYACNKG------FTMIGEHSIYCTVNNDE-GEWSGPPPECRG
: .:. .:... : . ::: :: : : ..:: ::::: :.:. : :::: :.:
CCDS44 GDFISTNRENFHYGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQC--
630 640 650 660 670 680
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 KSLTSK-VPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETT
. .: .::.:.. :.
CCDS44 -IIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELP
690 700 710 720 730 740
>--
initn: 447 init1: 308 opt: 618 Z-score: 586.6 bits: 119.7 E(32554): 2.4e-26
Smith-Waterman score: 618; 36.7% identity (61.9% similar) in 289 aa overlap (36-303:871-1150)
10 20 30 40 50 60
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: :: .::.. . . :: ...: :
CCDS44 QLKGSSASYCVLAGMESLWNSSVPVCEQIFCPSPPVIPNGRHTGKPLEVFPFGKAVNYTC
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70 80 90 100 110
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. :: : ::. .. : . : ::. :. :..: .. :.::
CCDS44 DPHPDRGTSFDLI-GES-TIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQT
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pF1KE1 ITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPSLSPKLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQ
... ::.:: ..::::: : .: ..:::.:: ::. . ::.::: .: . ::.
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pF1KE1 IDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDN
. : : :. :..::.::..:.: .:. :..::....:: : :..: : :: : :
CCDS44 VHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIAN
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: .:. .:... : . ::: :: : : ..:: ::::: :.:. : :::: :.:
CCDS44 GDFISTNRENFHYGSVVTYRCNLGSRGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQC--
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. .: .::.:.. :.
CCDS44 -IIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELP
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:..: : : . .:... ::.:: ..
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::::::: .: .. ::.: :. : . :..::: :: . ::.. : :: ::. :
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..::. ::.:.::.:. :.:::..: :.. : : .: : :: : :: .:. .:... :
CCDS44 KYSCTKGYRLIGSSSATCIISGDTVIWDNETPICDRIPCGLPPTITNGDFISTNRENFHY
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. ::: :: : : ..:: ::::: :.:. : :::: :.: . .: .::.:.
CCDS44 GSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQC---IIPNKCTPPNVE
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. :.
CCDS44 NGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELPSCSRVCQPPPDVL
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: :: . :.. . ..: :.: :
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. .. ::. .. : . . ::. :. : :..: .. ::
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: :.. ::::: ..::::::: . ...::.:: ::.. . :..::: : : :
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:.. . ::.:...::: :..:.:: :. ::.::..: :. : :. : : :: :
CCDS44 GMVHINTDTQFGSTVNYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTI
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pF1KE1 DNG-IIQGERDHYGYRQSVTYACNKG------FTMIGEHSIYCTVNNDE-GEWSGPPPEC
.:: . ...: . ::: :. : : ..::.::::: ..:. : ::.:::.:
CCDS44 SNGDFYSNNRTSFHNGTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRC
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pF1KE1 --RGKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFH
.: . .: ... :
CCDS44 ISTNKCTAPEVENAIRVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPH
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:. : .: ..:. .:: . .. .: :
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...:. :.: :. : .. . .. :. : : : : :.:.: . . :
CCDS44 QTNGRWGPKLPHCSRVCQPPPEILHG--EHTLSHQDNFSPGQEVFYSCEPSYDLRGAAS-
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pF1KE1 KLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNP-GEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGST
: : . :: . : ::: . :.. .:.. .: .. .:: .:: :. :..: : .
CCDS44 -LHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDDFLGQLPHGRVLLPLNLQLGAKVSFVCDEGFRLKGRS
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.: :...: .. :.. .: :..:.:: :: : :: : .: : . ..:::.
CCDS44 ASHCVLAGMKALWNSSVPVCEQIFCPNPPAILNGRHTG--TPFGDIPYGKEISYACDTHP
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pF1KE1 -KG--FTMIGEHSIYCTVN-NDEGEWSGPPPECR-GKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEV
.: :..::: :: :: . . .: ::.: :.:. . . :: .:
CCDS44 DRGMTFNLIGESSIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLY
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pF1KE1 SPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTG
CCDS44 LPGMTISYICDPGYLLVGKGFIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKV
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10 20 30 40 50 60
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. :: : ::. .. : . : ::. :. :..: .. :.::
CCDS44 DPHPDRGTSFDLI-GES-TIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCGILGHCQAPDHFLFAKLKTQT
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CCDS44 NASD-FPIGTSLKYECRPEYYGRPF---SITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGM
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pF1KE1 IDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDN
. : : :. :..::.::..:.: .:. :..::....:: : :..: : :: : :
CCDS44 VHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNAAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIAN
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CCDS44 GDFISTNRENFHYGSVVTYRCNPGSGGRKVFELVGEPSIYCTSNDDQVGIWSGPAPQC--
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. .: .::.:.. :.
CCDS44 -IIPNKCTPPNVENGILVSDNRSLFSLNEVVEFRCQPGFVMKGPRRVKCQALNKWEPELP
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CCDS44 NASD-FPIGTSLKYECRPEYYGRPF---SITCLDNLVWSSPKDVCKRKSCKTPPDPVNGM
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CCDS44 VHVITDIQVGSRINYSCTTGHRLIGHSSAECILSGNTAHWSTKPPICQRIPCGLPPTIAN
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CCDS44 DPHPDRGMTFNLIGES-TIRCTSDPHGNGVWSSPAPRCELSVRAGHCKTPEQFPFASPTI
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CCDS44 GMVHINTDTQFGSTVNYSCNEGFRLIGSPSTTCLVSGNNVTWDKKAPICEIISCEPPPTI
1920 1930 1940 1950 1960 1970
240 250 260 270 280
pF1KE1 DNG-IIQGERDHYGYRQSVTYACNKG------FTMIGEHSIYCTVNNDE-GEWSGPPPEC
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CCDS44 SNGDFYSNNRTSFHNGTVVTYQCHTGPDGEQLFELVGERSIYCTSKDDQVGVWSSPPPRC
1980 1990 2000 2010 2020 2030
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 --RGKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEVSPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFH
.: . .: ... :
CCDS44 ISTNKCTAPEVENAIRVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSHTVQCQTNGRWGPKLPH
2040 2050 2060 2070 2080 2090
>--
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30 40 50 60 70 80
pF1KE1 LLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKCEESFVKIPGEKDSVIC
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CCDS44 GVWSSPPPRCISTNKCTAPEVENAIRVPGNRSFFTLTEIIRFRCQPGFVMVGSH--TVQC
2030 2040 2050 2060 2070 2080
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 LKGSQWSDIEEFCNRSCEVPTRLNSASLKQPYITQNYFPVGTVVEYECRPGYRREPSLSP
...:. :.: :. : .. . .. :. : : : : :.:.: . . :
CCDS44 QTNGRWGPKLPHCSRVCQPPPEILHG--EHTLSHQDNFSPGQEVFYSCEPSYDLRGAAS-
2090 2100 2110 2120 2130 2140
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pF1KE1 KLTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNP-GEIRNGQIDVPGGILFGATISFSCNTGYKLFGST
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CCDS44 -LHCTPQGDWSPEAPRCTVKSCDDFLGQLPHGRVLLPLNLQLGAKVSFVCDEGFRLKGRS
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210 220 230 240 250
pF1KE1 SSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHYG---YRQSVTYACN---
.: :...: .. :.. .: :..:.:: :: : :: : .: : . ..:::.
CCDS44 ASHCVLAGMKALWNSSVPVCEQIFCPNPPAILNGRHTG--TPFGDIPYGKEISYACDTHP
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pF1KE1 -KG--FTMIGEHSIYCTVN-NDEGEWSGPPPECR-GKSLTSKVPPTVQKPTTVNVPTTEV
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CCDS44 DRGMTFNLIGESSIRCTSDPQGNGVWSSPAPRCELSVPAACPHPPKIQNGHYIGGHVSLY
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pF1KE1 SPTSQKTTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTG
CCDS44 LPGMTISYICDPGYLLVGKGFIFCTDQGIWSQLDHYCKEVNCSFPLFMNGISKELEMKKV
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CCDS14 YTCLPGYVRSHS-TQTLTCNSDGEWVYNT-FCIYKRCRHPGELRNGQVEIKTDLSFGSQI
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pF1KE1 SFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHYGYR
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CCDS14 EFSCSEGFFLIGSTTSRCEVQDRGVGWSHPLPQCEIVKCKPPPDIRNGRHSGEENFYAYG
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CCDS14 FSVTYSCDPRFSLLGHASISCTVENETIGVWRPSPPTC--EKITCRKPDVSHGEMVSGFG
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CCDS14 PIYNYKDTIVFKCQKGFVLRGSSVIHCDADSKWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWETYP
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>--
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.::.. .::...:: . : .::: : :
CCDS14 SPPTCEKITCRKPDVSHGEMVSGFGPIYNYKDTIV-FKCQKGFV-LRG--SSVIHCDADS
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CCDS14 KWNPSPPACEPNSCINLPDIPHASWETYPRPTKEDVYVVGTVLRYRCHPGYKPTTDEPTT
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pF1KE1 LTCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNP----GEIRNGQIDVPGG---ILFGATISFSCNTGYK
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CCDS14 VICQKNLRW-TPYQGCEALCCPEPKLNNGEITQHRKSRPANHCVYFYGDEISFSCHETSR
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pF1KE1 LFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLPECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHYGYRQSVTYACNK
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CCDS14 F----SAICQGDGT---WSPRTPSCGDI-CNFPPKIAHGHYKQSSSYSFFKEEIIYECDK
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CCDS14 GYILVGQAKLSCSYSH----WSAPAPQC--KALCRK-PELVNGRLSVDKDQYVEPENVTI
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pF1KE1 TTTKTTTPNAQATRSTPVSRTTKHFHETTPNKGSGTTSGTTRLLSGHTCFTLTGLLGTLV
CCDS14 QCDSGYGVVGPQSITCSGNRTWYPEVPKCEWETPEGCEQVLTGKRLMQCLPNPEDVKMAL
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40 50 60 70
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.: : . : : ::.. ..: : . . .:. :. .: .. :.: ::
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80 90 100 110 120 130
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: ...:. . .: :. .: :.: ... ::.. : : :.
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140 150 160 170 180 190
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200 210 220 230 240
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250 260 270 280 290 300
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::.:. .: .::: .. :::.... : :::: :.:. .. . . : : . .
CCDS14 TYTCDPDPEEGVNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCPHPQILRGRM
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310 320 330 340 350 360
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:.
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10 20 30
pF1KE1 MTVARPSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPA
:: : : ... :.:: :: .. . .
CCDS31 APGVLGISCGSPPPILNGRISYYSTPIAVGTVIRYSCSGTFRLIGE-KSLLCITKDKVDG
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40 50 60 70
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CCDS31 TWDKPAPKCEYFNKYSSCPEPIVPGGYK-IRGSTPYRHGDSVTFACKTNF-SMNGNK-SV
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80 90 100 110 120 130
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: ...:. . .: :. .: :.: ... ::.. : : :.
CCDS31 WCQANNMWGPTRL---PTCVSVFPLECPAL--PMIHNGHHTSENVGSIAPGLSVTYSCES
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140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GYRREPSLSPKL-TCLQNLKWSTAVEFCKKKSCPNPGEIRNGQIDVPGGILFGATISFSC
:: .. :. .::.. :::.. :.. : . :.. ::.. : . :.: .: :
CCDS31 GYL---LVGEKIINCLSSGKWSAVPPTCEEARCKSLGRFPNGKVKEPPILRVGVTANFFC
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CCDS31 DEGYRLQGPPSSRCVIAGQGVAWTK-MPVCEEIFCPSPPPILNGRHIGNSLANVSYGSIV
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250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TYACNK------GFTMIGEHSIYCTVNNDE-GEWSGPPPECRGKSLTSKVP-PTVQKPTT
::.:. .: .::: .. :::.... : :::: :.:. .. . . : : . .
CCDS31 TYTCDPDPEEGVNFILIGESTLRCTVDSQKTGTWSGPAPRCELSTSAVQCPHPQILRGRM
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310 320 330 340 350 360
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:.
CCDS31 VSGQKDRYTYNDTVIFACMFGFTLKGSKQIRCNAQGTWEPSAPVCEKECQAPPNILNGQK
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10 20 30 40 50 60
pF1KE1 PSVPAALPLLGELPRLLLLVLLCLPAVWGDCGLPPDVPNAQPALEGRTSFPEDTVITYKC
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CCDS48 LADNSQLLCNAQGKWVPPEGQDMPRCIAHFCEKPPSVSYSILESVSKAKFAAGSVVSFKC
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CCDS48 MEGFVLNTSAK--IECMRGGQWNPSP--MSIQC-IPVRCGEPPSIMNGYASGSNYSFGAM
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CCDS48 VAYSCNKGFYIKG--EKKSTCEATGQWSSPIPTCHPVSCGEPPKVENGFLEHTTGRIFES
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pF1KE1 TISFSCNTGYKLFGSTSSFCLISGSSVQWSDPLP-ECREIYCPAPPQIDNGIIQGERDHY
. ..:: ::: :: : .. .: . : : . : :: :.::...:: .
CCDS48 EVRYQCNPGYKSVGSPVFVC---QANRHWHSESPLMCVPLDCGKPPPIQNGFMKGENFEV
2230 2240 2250 2260 2270 2280
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CCDS48 GSK--VQFFCNEGYELVGDSSWTC---QKSGKWNKKSNPKCMPAKCPE--PPLLENQLVL
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CCDS48 KELTTEVGVVTFSCKEGHVLQGPSVLKCLPSQQWNDSFPVCKIVLCTPPPLISFGVPIPS
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]