Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1467
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1467, 570 aa
1>>>pF1KE1467 570 - 570 aa - 570 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8944+/-0.000456; mu= 20.6153+/- 0.028
mean_var=65.1458+/-13.081, 0's: 0 Z-trim(108.5): 36 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.158903
statistics sampled from 16558 (16594) to 16558 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.549), E-opt: 0.2 (0.195), width: 16
Scan time: 9.450
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000388 (OMIM: 300481,300645,306400) cytochrome ( 570) 3911 906.2 0
NP_056533 (OMIM: 607105) NADPH oxidase 3 [Homo sap ( 568) 2392 558.0 2.9e-158
NP_008983 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isoform 1 ( 564) 2259 527.5 4.3e-149
NP_001258744 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isofor ( 527) 1898 444.7 3.4e-124
XP_016884896 (OMIM: 300225) PREDICTED: NADPH oxida ( 458) 1795 421.1 3.9e-117
NP_039249 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isoform 2 ( 515) 1727 405.5 2.1e-112
NP_001278855 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 504) 808 194.9 5.4e-49
NP_001278858 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 553) 808 194.9 5.8e-49
NP_001137309 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 554) 808 194.9 5.8e-49
XP_016873333 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 412) 805 194.1 7.5e-49
XP_016873334 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 412) 805 194.1 7.5e-49
XP_016873331 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 421) 805 194.1 7.6e-49
XP_011541159 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 554) 805 194.2 9.4e-49
NP_054799 (OMIM: 606759,607200) dual oxidase 2 pre (1548) 604 148.4 1.6e-34
XP_005254478 (OMIM: 606759,607200) PREDICTED: dual (1548) 604 148.4 1.6e-34
XP_011519984 (OMIM: 606758) PREDICTED: dual oxidas (1197) 582 143.3 4.2e-33
XP_011519983 (OMIM: 606758) PREDICTED: dual oxidas (1512) 582 143.4 5e-33
NP_059130 (OMIM: 606758) dual oxidase 1 precursor (1551) 582 143.4 5.1e-33
NP_787954 (OMIM: 606758) dual oxidase 1 precursor (1551) 582 143.4 5.1e-33
NP_001287924 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 514) 383 97.4 1.2e-19
NP_001137308 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 538) 373 95.1 6e-19
NP_058627 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isoform a ( 578) 373 95.2 6.3e-19
XP_016873332 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 420) 339 87.3 1.1e-16
XP_006718912 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 559) 339 87.4 1.4e-16
XP_016873330 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxida ( 572) 339 87.4 1.4e-16
NP_001278856 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isofor ( 599) 339 87.4 1.4e-16
NP_001171709 (OMIM: 606572) NADPH oxidase 5 isofor ( 730) 175 49.9 3.5e-05
NP_001171708 (OMIM: 606572) NADPH oxidase 5 isofor ( 737) 175 49.9 3.5e-05
NP_078781 (OMIM: 606572) NADPH oxidase 5 isoform 1 ( 765) 175 49.9 3.6e-05
>>NP_000388 (OMIM: 300481,300645,306400) cytochrome b-24 (570 aa)
initn: 3911 init1: 3911 opt: 3911 Z-score: 4844.3 bits: 906.2 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 3911; 100.0% identity (100.0% similar) in 570 aa overlap (1-570:1-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 FNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 VITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVHN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ITVCEQKISEWGKIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ITVCEQKISEWGKIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 VTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 VTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 WTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 WTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASIL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 KSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 TGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 TGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPE
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 ALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 ALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
550 560 570
>>NP_056533 (OMIM: 607105) NADPH oxidase 3 [Homo sapiens (568 aa)
initn: 2399 init1: 1849 opt: 2392 Z-score: 2962.4 bits: 558.0 E(85289): 2.9e-158
Smith-Waterman score: 2392; 59.0% identity (82.1% similar) in 571 aa overlap (1-570:2-568)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAAC
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NP_056 MMGCWILNEGLSTILVLSWLGINFYLFIDTFYWYEEEESFHYTRVILGSTLAWARASALC
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAH
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NP_056 LNFNCMLILIPVSRNLISFIRGTSICCRGPWRRQLDKNLRFHKLVAYGIAVNATIHIVAH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LFNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITG
.::.: .. .... .:::.::. :::::: .: : : . .::.::
NP_056 FFNLERYHWSQSEEAQGLLAALSKLGNTPNESYLNPVRTFPTNTTTEL---LRTIAGVTG
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 VVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVH
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NP_056 LVISLALVLIMTSSTEFIRQASYELFWYTHHVFIVFFLSLAIHGTGRIVRGQTQDSLSLH
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NITVCEQKISEWGKIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITK
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NP_056 NITFCRDRYAEWQTVAQCPVPQFSGKEPSAWKWILGPVVLYACERIIRFWRFQQEVVITK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVG
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NP_056 VVSHPSGVLELHMKKRGFKMAPGQYILVQCPAISSLEWHPFTLTSAPQEDFFSVHIRAAG
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 DWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASI
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NP_056 DWTAALLEAFGAEGQALQEPWSLPRLAVDGPFGTALTDVFHYPVCVCVAAGIGVTPFAAL
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LKSVWYKYCNNA-TNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNI
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NP_056 LKSIWYK-CSEAQTPLKLSKVYFYWICRDARAFEWFADLLLSLETRMSEQGKTHFLSYHI
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 YLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCG
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NP_056 FLTGWDENQALHIALHWDENTDVITGLKQKTFYGRPNWNNEFKQIAYNHPSSSIGVFFCG
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KE1 PEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
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NP_056 PKALSRTLQKMCHLYSSADPRGVHFYYNKESF
540 550 560
>>NP_008983 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isoform 1 [Ho (564 aa)
initn: 1887 init1: 1078 opt: 2259 Z-score: 2797.6 bits: 527.5 E(85289): 4.3e-149
Smith-Waterman score: 2259; 58.2% identity (80.0% similar) in 574 aa overlap (1-570:1-564)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
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NP_008 MGNWVVNHWFSVLFLVVWLGLNVFLFVDAFLKYEKADKYYYTRKILGSTLACARASALCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
::: ::::::::::::::::. . :: .:.:::.::::::.::.:: ::.::: ::::
NP_008 NFNSTLILLPVCRNLLSFLRGTCSFCSRTLRKQLDHNLTFHKLVAYMICLHTAIHIIAHL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170
pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSD-PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGI
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NP_008 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA
:::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::.
NP_008 TGVIMTIALILMVTSATEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VHNITVCEQKISEWG-KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVV
. : ... : . ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.:::::::
NP_008 ESHPRKCAESFEMWDDRDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
::::: :: :..::::.:.::.:::::::::.::..: ::::::::::::::::::::::
NP_008 ITKVVMHPSKVLELQMNKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPF
.:::::.:. : .:... .:.: :::::::::::::.:::..:::::::::::
NP_008 AAGDWTENLIRAF---EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPF
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSY
::::::.:::. ::: :::::::.::.: :: :: .:: ::..:.: ...:::.:
NP_008 ASILKSIWYKFQCADHNLKTKKIYFYWICRETGAFSWFNNLLTSLEQEMEELGKVGFLNY
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 NIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFL
..::::: . ..: :.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .::::
NP_008 RLFLTGWDSNIVGHAALNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570
pF1KE1 CGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
:::..::..: : : :: :.: ::::::
NP_008 CGPRTLAKSLRKCCHRYSSLDPRKVQFYFNKENF
540 550 560
>>NP_001258744 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isoform 3 (527 aa)
initn: 1698 init1: 823 opt: 1898 Z-score: 2350.8 bits: 444.7 E(85289): 3.4e-124
Smith-Waterman score: 1998; 53.5% identity (74.7% similar) in 574 aa overlap (1-570:1-527)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
::::.::. .:.. ..::::::::::: . :. :..::::.::
NP_001 MGNWVVNHWFSVLFLVVWLGLNVFLFVDAFLKYEKADKYYYTRKILG-------------
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
: :: .:.:::.::::::.::.:: ::.::: ::::
NP_001 -F-----------------------CSRTLRKQLDHNLTFHKLVAYMICLHTAIHIIAHL
50 60 70 80
130 140 150 160 170
pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSD-PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGI
:: . : . . .: . :: :. .... :.:: ..: . : :.. : .::.
NP_001 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL
90 100 110 120 130
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA
:::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::.
NP_001 TGVIMTIALILMVTSATEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMN
140 150 160 170 180 190
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VHNITVCEQKISEWG-KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVV
. : ... : . ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.:::::::
NP_001 ESHPRKCAESFEMWDDRDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVV
200 210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 ITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
::::: :: :..::::.:.::.:::::::::.::..: ::::::::::::::::::::::
NP_001 ITKVVMHPSKVLELQMNKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
260 270 280 290 300 310
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 IVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPF
.:::::.:. : .:... .:.: :::::::::::::.:::..:::::::::::
NP_001 AAGDWTENLIRAF---EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPF
320 330 340 350 360 370
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 ASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSY
::::::.:::. ::: :::::::.::.: :: :: .:: ::..:.: ...:::.:
NP_001 ASILKSIWYKFQCADHNLKTKKIYFYWICRETGAFSWFNNLLTSLEQEMEELGKVGFLNY
380 390 400 410 420 430
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 NIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFL
..::::: . ..: :.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .::::
NP_001 RLFLTGWDSNIVGHAALNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFL
440 450 460 470 480 490
540 550 560 570
pF1KE1 CGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
:::..::..: : : :: :.: ::::::
NP_001 CGPRTLAKSLRKCCHRYSSLDPRKVQFYFNKENF
500 510 520
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80 90 100 110 120 130
pF1KE1 SFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSD-
:: ::.::: :::::: . : . . .:
XP_016 MICLHTAIHIIAHLFNFD-CYSRSRQATDG
10 20
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSS
. :: :. .... :.:: ..: . : :.. : .::.:::..:. :::..::.
XP_016 SLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGLTGVIMTIALILMVTSA
30 40 50 60 70 80
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 TKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLAVHNITVCEQKISEWG-
:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::. . : ... :
XP_016 TEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMNESHPRKCAESFEMWDD
90 100 110 120 130 140
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQM
. ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.:::::::::::: :: :..::::
XP_016 RDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVVITKVVMHPSKVLELQM
150 160 170 180 190 200
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pF1KE1 KKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRIVGDWTEGLFNACGCD
.:.::.:::::::::.::..: :::::::::::::::::::::: .:::::.:. :
XP_016 NKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIRAAGDWTENLIRAF---
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 KQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSVWYKYCNNAT
.:... .:.: :::::::::::::.:::..:::::::::::::::::.:::.
XP_016 EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPFASILKSIWYKFQCADH
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pF1KE1 NLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFA
::: :::::::.::.: :: :: .:: ::..:.: ...:::.: ..::::: . ..: :
XP_016 NLKTKKIYFYWICRETGAFSWFNNLLTSLEQEMEELGKVGFLNYRLFLTGWDSNIVGHAA
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 VHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSIS
.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .:::::::..::..: :
XP_016 LNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFLCGPRTLAKSLRKCCHR
390 400 410 420 430 440
560 570
pF1KE1 NSESGPRGVHFIFNKENF
: :: :.: ::::::
XP_016 YSSLDPRKVQFYFNKENF
450
>>NP_039249 (OMIM: 300225) NADPH oxidase 1 isoform 2 [Ho (515 aa)
initn: 1667 init1: 1078 opt: 1727 Z-score: 2139.0 bits: 405.5 E(85289): 2.1e-112
Smith-Waterman score: 1944; 53.5% identity (73.0% similar) in 574 aa overlap (1-570:1-515)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
::::.::. .:.. ..::::::::::: . :. :..::::.:::.:: ::: : ::
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pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
::: ::::::::::::::::. . :: .:.:::.::::::.::.:: ::.::: ::::
NP_039 NFNSTLILLPVCRNLLSFLRGTCSFCSRTLRKQLDHNLTFHKLVAYMICLHTAIHIIAHL
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pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSD-PYSVALSELG--DRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGI
:: . : . . .: . :: :. .... :.:: ..: . : :.. : .::.
NP_039 FNFD-CYSRSRQATDGSLASILSSLSHDEKKGGSWLNPIQSRNTTVE---YVTFTSIAGL
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pF1KE1 TGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTAESLA
:::..:. :::..::.:. ::::::::::::::::.....::.::: :::::: ::.
NP_039 TGVIMTIALILMVTSATEFIRRSYFEVFWYTHHLFIFYILGLGIHGIGGIVRGQTEESMN
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pF1KE1 VHNITVCEQKISEWG-KIKECPIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVV
. : ... : . ..: :.: :.:: .::::..:..::.:::..::.:::::::
NP_039 ESHPRKCAESFEMWDDRDSHCRRPKFEGHPPESWKWILAPVILYICERILRFYRSQQKVV
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pF1KE1 ITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
::::: :: :..::::.:.::.:::::::::.::..: ::::::::::::::::::::::
NP_039 ITKVVMHPSKVLELQMNKRGFSMEVGQYIFVNCPSISLLEWHPFTLTSAPEEDFFSIHIR
300 310 320 330 340 350
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pF1KE1 IVGDWTEGLFNACGCDKQEFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPF
.:::::.:. : .:... .:.: :::::::::::::.:::..:::::::::::
NP_039 AAGDWTENLIRAF---EQQYSP---IPRIEVDGPFGTASEDVFQYEVAVLVGAGIGVTPF
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 ASILKSVWYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSY
::::::.:::. ::: ::.
NP_039 ASILKSIWYKFQCADHNLKTKKV-------------------------------------
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pF1KE1 NIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFL
.: :.. :. :..::::::: .::: :::::.:::..::.. .::::
NP_039 ------------GHAALNFDKATDIVTGLKQKTSFGRPMWDNEFSTIATSHPKSVVGVFL
440 450 460 470 480
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pF1KE1 CGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
:::..::..: : : :: :.: ::::::
NP_039 CGPRTLAKSLRKCCHRYSSLDPRKVQFYFNKENF
490 500 510
>>NP_001278855 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isoform d (504 aa)
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50 60 70 80 90 100
pF1KE1 YTRKLLGSALALARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTF
.::.::..::::. : :.:: ::.. ::
NP_001 MCRTLLAYLRGSQKVPSRRTRRLLDKSRTF
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 HKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRI
: . : . :..:. ::: :. .: :: :. . :: :: :
NP_001 HITCGVTICIFSGVHVAAHLVNA---LNFSVNYSEDFV-------------ELNAARYRD
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170 180 190 200 210 220
pF1KE1 KNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLA
..:. :. : . :.::: ... :.:.::.:: .:: : ...:::::.:: .:.. :.
NP_001 EDPRKLLF---TTVPGLTGVCMVVVLFLMITASTYAIRVSNYDIFWYTHNLFFVFYMLLT
80 90 100 110 120 130
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pF1KE1 IHGAERIVRGQTA-----------ESLAVHNITVCE--------------QKISEWGK--
.: . ... :: . . .::.. : .: .:. .
NP_001 LHVSGGLLKYQTNLDTHPPGCISLNRTSSQNISLPEYFSEHFHEPFPEGFSKPAEFTQHK
140 150 160 170 180 190
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 -IKEC-PIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQ
.: : :.: .: :.:: :: ::. :: ::: :. ::.. :.: .:..:: ..:..
NP_001 FVKICMEEPRFQANFPQTWLWISGPLCLYCAERLYRYIRSNKPVTIISVISHPSDVMEIR
200 210 220 230 240 250
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pF1KE1 MKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEED--FFSIHIRIVGDWTEG----L
: :..:: . :::: ..::.:: :: :::::: : : :..:..::::::: :
NP_001 MVKENFKARPGQYITLHCPSVSALENHPFTLTMCPTETKATFGVHLKIVGDWTERFRDLL
260 270 280 290 300 310
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pF1KE1 FNACGCDKQ--EFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSV
. . :.. : .. . ::. .:::::. :. ..::: . :..:::::::::::...
NP_001 LPPSSQDSEILPFIQSRNYPKLYIDGPFGSPFEESLNYEVSLCVAGGIGVTPFASILNTL
320 330 340 350 360 370
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pF1KE1 ---WYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYL
: : ::...:: :.::: ..:.:::::: .:.... ..: ... ..::
NP_001 LDDWKPY-------KLRRLYFIWVCRDIQSFRWFADLLCMLHNKFWQENRPDYVNIQLYL
380 390 400 410 420
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pF1KE1 TGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPE
. : : .: .:... . ::: : : ::. . . .::: :::.
NP_001 SQTDGIQKIIGEKYH--------ALNSRLFIGRPRWKLLFDEIAKYNRGKTVGVFCCGPN
430 440 450 460 470
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pF1KE1 ALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
.:..:: : : .:. : : : .:::.:
NP_001 SLSKTLHKLSNQNNSYGTR---FEYNKESFS
480 490 500
>>NP_001278858 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isoform f (553 aa)
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20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACLNFNCMLILLPVCRNLLSFL
: :.:: :. ::.:: :::::.::.::..:
NP_001 MLSAVTDLGSIESTVSKNLPVVSIHQLGLCLSRASASVLNLNCSLILLPMCRTLLAYL
10 20 30 40 50
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pF1KE1 RGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHLFNVEWCVNARVNNSDPYSV
:::. : :.:: ::.. ::: . : . :..:. ::: :. .: :: :. .
NP_001 RGSQKVPSRRTRRLLDKSRTFHITCGVTICIFSGVHVAAHLVNA---LNFSVNYSEDFV-
60 70 80 90 100 110
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pF1KE1 ALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRR
:: :: : ..:. :. : . :.::: ... :.:.::.:: .::
NP_001 ------------ELNAARYRDEDPRKLLF---TTVPGLTGVCMVVVLFLMITASTYAIRV
120 130 140 150
200 210 220 230 240
pF1KE1 SYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTA-----------ESLAVHNITVCE---
: ...:::::.:: .:.. :..: . ... :: . . .::.. :
NP_001 SNYDIFWYTHNLFFVFYMLLTLHVSGGLLKYQTNLDTHPPGCISLNRTSSQNISLPEYFS
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 -----------QKISEWGK---IKEC-PIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWR
.: .:. . .: : :.: .: :.:: :: ::. :: ::: :. :
NP_001 EHFHEPFPEGFSKPAEFTQHKFVKICMEEPRFQANFPQTWLWISGPLCLYCAERLYRYIR
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KE1 SQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPKVSKLEWHPFTLTSAPEED-
:.. :.: .:..:: ..:..: :..:: . :::: ..::.:: :: :::::: : :
NP_001 SNKPVTIISVISHPSDVMEIRMVKENFKARPGQYITLHCPSVSALENHPFTLTMCPTETK
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 -FFSIHIRIVGDWTEG----LFNACGCDKQ--EFQDAWKLPKIAVDGPFGTASEDVFSYE
:..:..::::::: :. . :.. : .. . ::. .:::::. :. ..::
NP_001 ATFGVHLKIVGDWTERFRDLLLPPSSQDSEILPFIQSRNYPKLYIDGPFGSPFEESLNYE
340 350 360 370 380 390
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pF1KE1 VVMLVGAGIGVTPFASILKSV---WYKYCNNATNLKLKKIYFYWLCRDTHAFEWFADLLQ
: . :..:::::::::::... : : ::...:: :.::: ..:.::::::
NP_001 VSLCVAGGIGVTPFASILNTLLDDWKPY-------KLRRLYFIWVCRDIQSFRWFADLLC
400 410 420 430 440 450
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pF1KE1 LLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKDVITGLKQKTLYGRPNWDNE
.:.... ..: ... ..::. : : .: .:... . ::: :
NP_001 MLHNKFWQENRPDYVNIQLYLSQTDGIQKIIGEKYH--------ALNSRLFIGRPRWKLL
460 470 480 490 500
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pF1KE1 FKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRGVHFIFNKENF
: ::. . . .::: :::..:..:: : : .:. : : : .:::.:
NP_001 FDEIAKYNRGKTVGVFCCGPNSLSKTLHKLSNQNNSYGTR---FEYNKESFS
510 520 530 540 550
>>NP_001137309 (OMIM: 605261) NADPH oxidase 4 isoform c (554 aa)
initn: 1276 init1: 322 opt: 808 Z-score: 1000.0 bits: 194.9 E(85289): 5.8e-49
Smith-Waterman score: 1228; 37.8% identity (63.1% similar) in 590 aa overlap (21-570:1-553)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGNWAVNEGLSIFVILVWLGLNVFLFVWYYRVYDIPPKFFYTRKLLGSALALARAPAACL
.::.:: . .:. :.. : ...:: .: :.:: :. :
NP_001 MNVLLFWKTFLLYNQGPEYHYLHQMLGLGLCLSRASASVL
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NFNCMLILLPVCRNLLSFLRGSSACCSTRVRRQLDRNLTFHKMVAWMIALHSAIHTIAHL
:.:: :::::.::.::..::::. : :.:: ::.. ::: . : . :..:. :::
NP_001 NLNCSLILLPMCRTLLAYLRGSQKVPSRRTRRLLDKSRTFHITCGVTICIFSGVHVAAHL
50 60 70 80 90 100
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pF1KE1 FNVEWCVNARVNNSDPYSVALSELGDRQNESYLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGV
:. .: :: :. . :: :: : ..:. :. : . :.:::
NP_001 VNA---LNFSVNYSEDFV-------------ELNAARYRDEDPRKLLF---TTVPGLTGV
110 120 130 140
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pF1KE1 VITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHLFVIFFIGLAIHGAERIVRGQTA-------
... :.:.::.:: .:: : ...:::::.:: .:.. :..: . ... ::
NP_001 CMVVVLFLMITASTYAIRVSNYDIFWYTHNLFFVFYMLLTLHVSGGLLKYQTNLDTHPPG
150 160 170 180 190 200
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pF1KE1 ----ESLAVHNITVCE--------------QKISEWGK---IKEC-PIPQFAGNPPMTWK
. . .::.. : .: .:. . .: : :.: .: :.::
NP_001 CISLNRTSSQNISLPEYFSEHFHEPFPEGFSKPAEFTQHKFVKICMEEPRFQANFPQTWL
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 WIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVTHPFKTIELQMKKKGFKMEVGQYIFVKCPK
:: ::. :: ::: :. ::.. :.: .:..:: ..:..: :..:: . :::: ..::.
NP_001 WISGPLCLYCAERLYRYIRSNKPVTIISVISHPSDVMEIRMVKENFKARPGQYITLHCPS
270 280 290 300 310 320
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pF1KE1 VSKLEWHPFTLTSAPEED--FFSIHIRIVGDWTEG----LFNACGCDKQ--EFQDAWKLP
:: :: :::::: : : :..:..::::::: :. . :.. : .. . :
NP_001 VSALENHPFTLTMCPTETKATFGVHLKIVGDWTERFRDLLLPPSSQDSEILPFIQSRNYP
330 340 350 360 370 380
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 KIAVDGPFGTASEDVFSYEVVMLVGAGIGVTPFASILKSV---WYKYCNNATNLKLKKIY
:. .:::::. :. ..::: . :..:::::::::::... : : ::...:
NP_001 KLYIDGPFGSPFEESLNYEVSLCVAGGIGVTPFASILNTLLDDWKPY-------KLRRLY
390 400 410 420 430
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pF1KE1 FYWLCRDTHAFEWFADLLQLLESQMQERNNAGFLSYNIYLTGWDESQANHFAVHHDEEKD
: :.::: ..:.:::::: .:.... ..: ... ..::. : : .:
NP_001 FIWVCRDIQSFRWFADLLCMLHNKFWQENRPDYVNIQLYLSQTDGIQKIIGEKYH-----
440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 VITGLKQKTLYGRPNWDNEFKTIASQHPNTRIGVFLCGPEALAETLSKQSISNSESGPRG
.:... . ::: : : ::. . . .::: :::..:..:: : : .:. : :
NP_001 ---ALNSRLFIGRPRWKLLFDEIAKYNRGKTVGVFCCGPNSLSKTLHKLSNQNNSYGTR-
490 500 510 520 530 540
570
pF1KE1 VHFIFNKENF
: .:::.:
NP_001 --FEYNKESFS
550
>>XP_016873333 (OMIM: 605261) PREDICTED: NADPH oxidase 4 (412 aa)
initn: 948 init1: 319 opt: 805 Z-score: 998.1 bits: 194.1 E(85289): 7.5e-49
Smith-Waterman score: 898; 37.3% identity (63.4% similar) in 429 aa overlap (182-570:1-411)
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 YLNFARKRIKNPEGGLYLAVTLLAGITGVVITLCLILIITSSTKTIRRSYFEVFWYTHHL
... :.:.::.:: .:: : ...:::::.:
XP_016 MVVVLFLMITASTYAIRVSNYDIFWYTHNL
10 20 30
220 230 240
pF1KE1 FVIFFIGLAIHGAERIVRGQTA-----------ESLAVHNITVCE--------------Q
: .:.. :..: . ... :: . . .::.. : .
XP_016 FFVFYMLLTLHVSGGLLKYQTNLDTHPPGCISLNRTSSQNISLPEYFSEHFHEPFPEGFS
40 50 60 70 80 90
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 KISEWGK---IKEC-PIPQFAGNPPMTWKWIVGPMFLYLCERLVRFWRSQQKVVITKVVT
: .:. . .: : :.: .: :.:: :: ::. :: ::: :. ::.. :.: .:..
XP_016 KPAEFTQHKFVKICMEEPRFQANFPQTWLWISGPLCLYCAERLYRYIRSNKPVTIISVMS
100 110 120 130 140 150
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