Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1453
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1453, 1062 aa
1>>>pF1KE1453 1062 - 1062 aa - 1062 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7822+/-0.000461; mu= 19.6303+/- 0.029
mean_var=84.6633+/-16.410, 0's: 0 Z-trim(111.2): 221 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.139388
statistics sampled from 19519 (19753) to 19519 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.577), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 14.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001167552 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1062) 7164 1451.6 0
NP_060322 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domain (1062) 7164 1451.6 0
NP_001167554 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1039) 6730 1364.4 0
NP_001167553 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD dom (1040) 6183 1254.4 0
NP_996611 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD ( 980) 2637 541.3 1e-152
XP_011524903 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1008) 2637 541.3 1.1e-152
NP_001120727 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and (1037) 2637 541.3 1.1e-152
XP_011524901 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 2637 541.3 1.1e-152
XP_006723139 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 2637 541.3 1.1e-152
XP_006723138 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1037) 2637 541.3 1.1e-152
XP_011524898 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACH (1065) 2637 541.3 1.1e-152
NP_631915 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD (1009) 2635 540.9 1.4e-152
XP_011518346 (OMIM: 609665) PREDICTED: NACHT, LRR (1052) 1886 390.3 3.2e-107
NP_789780 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD domain (1043) 1719 356.7 4e-97
NP_001307986 (OMIM: 609660) NACHT, LRR and PYD dom (1036) 1717 356.3 5.3e-97
NP_604393 (OMIM: 609645) NACHT, LRR and PYD domain ( 994) 1706 354.0 2.4e-96
XP_016881833 (OMIM: 609645) PREDICTED: NACHT, LRR ( 938) 1587 330.1 3.6e-89
XP_016881834 (OMIM: 609645) PREDICTED: NACHT, LRR ( 937) 1537 320.0 3.8e-86
NP_789781 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD domain (1048) 1534 319.5 6.4e-86
NP_789790 (OMIM: 609663) NACHT, LRR and PYD domain ( 991) 1216 255.5 1.1e-66
NP_001303929 (OMIM: 609659) NACHT, LRR and PYD dom (1029) 1175 247.3 3.4e-64
NP_659444 (OMIM: 609664) NACHT, LRR and PYD domain (1033) 1158 243.9 3.7e-63
NP_001284672 (OMIM: 609664) NACHT, LRR and PYD dom ( 934) 1137 239.6 6.3e-62
NP_703148 (OMIM: 609658) NACHT, LRR and PYD domain (1200) 1062 224.6 2.7e-57
NP_653288 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and PYD (1061) 957 203.4 5.5e-51
XP_016882952 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 876 187.1 3.9e-46
XP_016882956 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 876 187.1 3.9e-46
XP_016882955 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 876 187.1 3.9e-46
XP_016882953 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 876 187.1 3.9e-46
XP_016882954 (OMIM: 609648,611762) PREDICTED: NACH ( 923) 876 187.1 3.9e-46
NP_001264055 (OMIM: 609648,611762) NACHT, LRR and (1062) 876 187.2 4.4e-46
XP_011542355 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 922) 832 178.3 1.8e-43
XP_011542357 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 865) 826 177.0 4e-43
NP_899632 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) NACH ( 922) 826 177.1 4.2e-43
XP_016855673 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P ( 922) 826 177.1 4.2e-43
NP_001028225 (OMIM: 606579,606636,615225) NACHT, L (1375) 790 169.9 8.7e-41
NP_127500 (OMIM: 606579,606636,615225) NACHT, LRR (1399) 790 169.9 8.8e-41
NP_055737 (OMIM: 606579,606636,615225) NACHT, LRR (1429) 790 169.9 9e-41
NP_127499 (OMIM: 606579,606636,615225) NACHT, LRR (1443) 790 169.9 9e-41
NP_127497 (OMIM: 606579,606636,615225) NACHT, LRR (1473) 790 170.0 9.2e-41
NP_789792 (OMIM: 609665) NACHT, LRR and PYD domain (1093) 779 167.7 3.4e-40
XP_011518233 (OMIM: 609650) PREDICTED: NACHT, LRR ( 703) 752 162.1 1e-38
XP_016872742 (OMIM: 609650) PREDICTED: NACHT, LRR ( 730) 752 162.1 1e-38
XP_016872741 (OMIM: 609650) PREDICTED: NACHT, LRR ( 771) 752 162.1 1.1e-38
NP_001263629 (OMIM: 609650) NACHT, LRR and PYD dom ( 891) 752 162.2 1.2e-38
NP_612202 (OMIM: 609650) NACHT, LRR and PYD domain ( 892) 752 162.2 1.2e-38
XP_011518345 (OMIM: 609662) PREDICTED: NACHT, LRR ( 655) 694 150.4 3.1e-35
NP_789791 (OMIM: 609662) NACHT, LRR and PYD domain ( 655) 694 150.4 3.1e-35
NP_001230062 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) N (1034) 682 148.1 2.4e-34
XP_011542350 (OMIM: 120100,191900,606416,607115) P (1036) 682 148.1 2.4e-34
>>NP_001167552 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domains (1062 aa)
initn: 7164 init1: 7164 opt: 7164 Z-score: 7782.2 bits: 1451.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7164; 99.9% identity (99.9% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 GVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KE1 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWEERPSSHDFMI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_001 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
1030 1040 1050 1060
>>NP_060322 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domains-co (1062 aa)
initn: 7164 init1: 7164 opt: 7164 Z-score: 7782.2 bits: 1451.6 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 7164; 99.9% identity (99.9% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1062)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
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pF1KE1 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
490 500 510 520 530 540
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pF1KE1 GVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 GVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGGHSTVT
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610 620 630 640 650 660
pF1KE1 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
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pF1KE1 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
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pF1KE1 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
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pF1KE1 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
790 800 810 820 830 840
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pF1KE1 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_060 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060
pF1KE1 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWEERPSSHDFMI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_060 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
1030 1040 1050 1060
>>NP_001167554 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domains (1039 aa)
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Smith-Waterman score: 6949; 97.7% identity (97.7% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1039)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKE--------------
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ---------MASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
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pF1KE1 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE1 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
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pF1KE1 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
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pF1KE1 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
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pF1KE1 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
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pF1KE1 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
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pF1KE1 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
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1030 1040 1050 1060
pF1KE1 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWEERPSSHDFMI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_001 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
1000 1010 1020 1030
>>NP_001167553 (OMIM: 609364) NACHT, LRR and PYD domains (1040 aa)
initn: 6183 init1: 6183 opt: 6183 Z-score: 6716.1 bits: 1254.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6963; 97.8% identity (97.8% similar) in 1062 aa overlap (1-1062:1-1040)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPLDV
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pF1KE1 DEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
:::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DEMLERFKTEAQ----------------------DKDNRCRYILKTKFREMWKSWPGDSK
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pF1KE1 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVQVMAERYKMLIPFSNPRVLPGPFSYTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNLIHKFK
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pF1KE1 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGAAPGAL
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310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIRVEGFL
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pF1KE1 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVP
340 350 360 370 380 390
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pF1KE1 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGVQESDL
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pF1KE1 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDVQKLLS
460 470 480 490 500 510
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KE1 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHLNAVDVVPSSFCVKHCRNLQKMSLQVIKE
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pF1KE1 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NLPENVTASESDAEVERSQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILC
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pF1KE1 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQGNDQDDMFPALCEVLRH
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pF1KE1 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKC
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pF1KE1 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQ
820 830 840 850 860 870
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGMKFLCEALRKPLCNLRCLW
880 890 900 910 920 930
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKMLFETLTCSSGTLRTLRLKI
940 950 960 970 980 990
1030 1040 1050 1060
pF1KE1 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWEERPSSHDFMI
::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::
NP_001 DDFNDELNKLLEEIEEKNPQLIIDTEKHHPWAERPSSHDFMI
1000 1010 1020 1030 1040
>>NP_996611 (OMIM: 231090,609661) NACHT, LRR and PYD dom (980 aa)
initn: 3876 init1: 2343 opt: 2637 Z-score: 2862.7 bits: 541.3 E(85289): 1e-152
Smith-Waterman score: 3814; 62.6% identity (80.2% similar) in 978 aa overlap (2-961:1-938)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTFSLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILT
..: :. ..::.:::::..:::..:: :. .: : ::: : .::..::::.:.:::.
NP_996 MTSPQLEWTLQTLLEQLNEDELKSFKSLLWAFPLEDVLQKTPWSEVEEADGKKLAEILV
10 20 30 40 50
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pF1KE1 THCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVREAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPL-D
. . :.. :.....:.:. .: . :: :. : . . . . : : :
NP_996 NTSSENWIRNATVNILEEMNLTELCKMAKAEMMEDGQ------------VQEIDNPELGD
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pF1KE1 VDEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGKKPDKDNRCRYILKTKFREMWKS--WPG
..: : :.: :.: : . : .::. : :
NP_996 AEEDSE------------------LAKP---GEKEGWRNSME-----KQSLVWKNTFWQG
110 120 130 140
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pF1KE1 DSKEVQV-MAERYKMLIPFSNPRVLPGPFS-YTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNL
: . . .. : . .::: :::. : .. :::::.::::.::::::.: ::::.. ::
NP_996 DIDNFHDDVTLRNQRFIPFLNPRT-PRKLTPYTVVLHGPAGVGKTTLAKKCMLDWTDCNL
150 160 170 180 190 200
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pF1KE1 IHKFKYAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGA
..:::::::.::::.::::::::. .:::::::::: :::::..::::.::.::: .
NP_996 SPTLRYAFYLSCKELSRMGPCSFAELISKDWPELQDDIPSILAQAQRILFVVDGLDELKV
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 APGALIEDICGDWEKKKPVPVLLGSLLNRVMLPKAALLVTTRPRALRDLRILAEEPIYIR
:::::.::::::::::::::::::::.: :::.:::::::::::::::..::..:::.:
NP_996 PPGALIQDICGDWEKKKPVPVLLGSLLKRKMLPRAALLVTTRPRALRDLQLLAQQPIYVR
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pF1KE1 VEGFLEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_996 VEGFLEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKG
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 EDPVPTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQTSVLHREDLERLGV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::::::::::
NP_996 EDPVPTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALRTLSLLAAQGLWAQMSVFHREDLERLGV
390 400 410 420 430 440
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pF1KE1 QESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYTLEKEEEEDRDGHTWDIGDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::: ::::::.::::::
NP_996 QESDLRLFLDGDILRQDRVSKGCYSFIHLSFQQFLTALFYALEKEEGEDRDGHAWDIGDV
450 460 470 480 490 500
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 QKLLSGVERLRNPDLIQAGYYSFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLRCDISCKGG
:::::: :::.::::::.:.. :::::::::::::::::::::::::::::.: ...
NP_996 QKLLSGEERLKNPDLIQVGHFLFGLANEKRAKELEATFGCRMSPDIKQELLQCKAHLHAN
510 520 530 540 550 560
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 HS-TVTDLQELLGCLYESQEEELVKEVMAQFKEISLHL-NAVDVVPSSFCVKHCRNLQKM
. .::::.:.::::::::::::.: :.: :::::.:: :. .:. :: .:::..:::.
NP_996 KPLSVTDLKEVLGCLYESQEEELAKVVVAPFKEISIHLTNTSEVMHCSFSLKHCQDLQKL
570 580 590 600 610 620
660 670 680 690 700
pF1KE1 SLQVIKENLPENVTASESDAEVER---------SQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGL
:::: : . :: : : : :: ...: . : .:::.::.:.::..: :
NP_996 SLQVAKGVFLENYMDFELDIEFERCTYLTIPNWARQDLRSLRLWTDFCSLFSSNSNLKFL
630 640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KE1 AINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKNISPADAHRNLCLALRGHKTVTYLTLQG
...:::: : :::::.... .:::::.: .::..: :.:..:::. :.::.:.::: :
NP_996 EVKQSFLSDSSVRILCDHVTRSTCHLQKVEIKNVTPDTAYRDFCLAFIGKKTLTHLTLAG
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 NDQDD--MFPALCEVLRHPECNLRYLGLVSCSATTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNE
. . . :. ::..::. .:::.:: : . :: .:::.. .:..:::: . :: :
NP_996 HIEWERTMMLMLCDLLRNHKCNLQYLRLGGHCATPEQWAEFFYVLKANQSLKHLRLSANV
750 760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KE1 LLDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEANCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGN
:::::: ::: :. .:: ::: ::::::.::::.:::::::::::..::::::::::::.
NP_996 LLDEGAMLLYKTMTRPKHFLQMLSLENCRLTEASCKDLAAVLVVSKKLTHLCLAKNPIGD
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KE1 TGVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCCDLTKLLQEKSSLLCLDLGLNHIGVKGM
:::::::::: ::.:::::::: .:.::. :: :.. ::: :: :::..:.:. .:.
NP_996 TGVKFLCEGLSYPDCKLQTLVLQQCSITKLGCRYLSEALQEACSLTNLDLSINQIA-RGL
870 880 890 900 910
950 960 970 980 990 1000
pF1KE1 KFLCEALRKPLCNLRCLWLWGCSIPPFSCEDLCSALSCNQSLVTLDLGQNPLGSSGVKML
.::.::..: :::. : :
NP_996 WILCQALENPNCNLKHLRLKTYETNLEIKKLLEEVKEKNPKLTIDCNASGATAPPCCDFF
920 930 940 950 960 970
>>XP_011524903 (OMIM: 231090,609661) PREDICTED: NACHT, L (1008 aa)
initn: 4161 init1: 2343 opt: 2637 Z-score: 2862.5 bits: 541.3 E(85289): 1.1e-152
Smith-Waterman score: 3814; 62.6% identity (80.2% similar) in 978 aa overlap (2-961:29-966)
10 20 30
pF1KE1 MVSSAQMGFNLQALLEQLSQDELSKFKYLITTF
..: :. ..::.:::::..:::..:: :. .:
XP_011 MSRKHRLEARPDLREFFSLNLRSHTRSTMTSPQLEWTLQTLLEQLNEDELKSFKSLLWAF
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40 50 60 70 80 90
pF1KE1 SLAHELQKIPHKEVDKADGKQLVEILTTHCDSYWVEMASLQVFEKMHRMDLSERAKDEVR
: ::: : .::..::::.:.:::.. . :.. :.....:.:. .: . :: :.
XP_011 PLEDVLQKTPWSEVEEADGKKLAEILVNTSSENWIRNATVNILEEMNLTELCKMAKAEMM
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pF1KE1 EAALKSFNKRKPLSLGITRKERPPL-DVDEMLERFKTEAQAFTETKGNVICLGKEVFKGK
: . . . . : : :..: : :.: :.
XP_011 EDGQ------------VQEIDNPELGDAEEDSE------------------LAKP---GE
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: : . : .::. : :: . . .. : . .::: :::. : .. ::
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150 160 170 180 190 200
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:::.::::.::::::.: ::::.. :: ..:::::::.::::.::::::::. .::::
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210 220 230 240 250 260
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:::::: :::::..::::.::.::: . :::::.::::::::::::::::::::.: :::
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.:::::::::::::::..::..:::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKGEDPVPTCLTRTGLFLRFLCSRFPQGAQLRGALR
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::::::::::::: ::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::.::::: ::::::.:::::::::::: :::.::::::.:.. :::::::::::
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::::::::::::::::::.: .... .::::.:.::::::::::::.: :.: :::
XP_011 LEATFGCRMSPDIKQELLQCKAHLHANKPLSVTDLKEVLGCLYESQEEELAKVVVAPFKE
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::.:: :. .:. :: .:::..:::.:::: : . :: : : : ::
XP_011 ISIHLTNTSEVMHCSFSLKHCQDLQKLSLQVAKGVFLENYMDFELDIEFERCTYLTIPNW
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pF1KE1 SQDDQHMLPFWTDLCSIFGSNKDLMGLAINDSFLSASLVRILCEQIASDTCHLQRVVFKN
...: . : .:::.::.:.::..: : ...:::: : :::::.... .:::::.: .::
XP_011 ARQDLRSLRLWTDFCSLFSSNSNLKFLEVKQSFLSDSSVRILCDHVTRSTCHLQKVEIKN
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..: :.:..:::. :.::.:.::: :. . . :. ::..::. .:::.:: : . :
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pF1KE1 TTQQWADLSLALEVNQSLTCVNLSDNELLDEGAKLLYTTLRHPKCFLQRLSLENCHLTEA
: .:::.. .:..:::: . :: : :::::: ::: :. .:: ::: ::::::.::::
XP_011 TPEQWAEFFYVLKANQSLKHLRLSANVLLDEGAMLLYKTMTRPKHFLQMLSLENCRLTEA
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pF1KE1 NCKDLAAVLVVSRELTHLCLAKNPIGNTGVKFLCEGLRYPECKLQTLVLWNCDITSDGCC
.:::::::::::..::::::::::::.:::::::::: ::.:::::::: .:.::. ::
XP_011 SCKDLAAVLVVSKKLTHLCLAKNPIGDTGVKFLCEGLSYPDCKLQTLVLQQCSITKLGCR
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pF1KE1 DSKEVQV-MAERYKMLIPFSNPRVLPGPFS-YTVVLYGPAGLGKTTLAQKLMLDWAEDNL
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XP_011 DIDNFHDDVTLRNQRFIPFLNPRT-PRKLTPYTVVLHGPAGVGKTTLAKKCMLDWTDCNL
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pF1KE1 IHKFKYAFYLSCRELSRLGPCSFAELVFRDWPELQDDIPHILAQARKILFVIDGFDELGA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 VEGFLEEDRRAYFLRHFGDEDQAMRAFELMRSNAALFQLGSAPAVCWIVCTTLKLQMEKG
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60827320 residues in 85289 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]