Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1433
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1433, 499 aa
1>>>pF1KE1433 499 - 499 aa - 499 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.8639+/-0.00104; mu= 7.5620+/- 0.061
mean_var=188.8409+/-39.642, 0's: 0 Z-trim(111.0): 124 B-trim: 492 in 1/51
Lambda= 0.093331
statistics sampled from 11863 (12008) to 11863 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.714), E-opt: 0.2 (0.369), width: 16
Scan time: 3.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1 ( 499) 3401 470.5 1.8e-132
CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 496) 1095 160.0 5.4e-39
CCDS12109.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 493) 1094 159.9 5.9e-39
CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 519) 1064 155.9 1e-37
CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 515) 1049 153.9 4e-37
CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 ( 404) 876 130.5 3.5e-30
CCDS47207.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 ( 477) 734 111.4 2.2e-24
>>CCDS484.1 CDC20 gene_id:991|Hs108|chr1 (499 aa)
initn: 3401 init1: 3401 opt: 3401 Z-score: 2491.6 bits: 470.5 E(32554): 1.8e-132
Smith-Waterman score: 3401; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAPPARWQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTP
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CCDS48 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAPPARWQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLYSQKATPGSSRKTCRYIPSLPDRILDAPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 NGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLYSQKATPGSSRKTCRYIPSLPDRILDAPE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 IRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 LAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 HVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 HVATLSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 VAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 VAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 AQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 AQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARR
430 440 450 460 470 480
490
pF1KE1 REREKASAAKSSLIHQGIR
:::::::::::::::::::
CCDS48 REREKASAAKSSLIHQGIR
490
>>CCDS45916.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 (496 aa)
initn: 1157 init1: 490 opt: 1095 Z-score: 813.6 bits: 160.0 E(32554): 5.4e-39
Smith-Waterman score: 1114; 40.5% identity (66.7% similar) in 472 aa overlap (58-487:29-487)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 WQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTPGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQ
:: .:: : ..::: : ::.:: :..:.
CCDS45 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPV-SSPSKHG-DRFIPSRAGAN
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 MEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFD-VEEAKILR--LSG----KPQNA
: .. :: ..:..... : : . :: : . . .:. : : : :.
CCDS45 WSVNFHRIN-----ENEKSPSQNRKAKD-ATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQD-
60 70 80 90 100
150 160
pF1KE1 PEGYQNRLK------------VLYSQKATPG----------------------SSRKTCR
:. . ::. : .....: : :: :
CCDS45 PQTEDRRLQPSTPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTR
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 YIPSLPDRILDAPEIRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPG
: ..: ..:::::...:.::::::::: :::.:.: . :::::: .... .: .. :
CCDS45 KISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 EYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSR
. ..::.: ..:: .:::: .. ::.::. :.: . .:.::::.:.::. ::::::
CCDS45 DSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 SGHIHHHDVRVAEHHVAT-LSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW
. : ..:.:. . :.:: ::::::.:. : . :::::::: . :: ....
CCDS45 DRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSI
:.: .:.: .::::.:: : : ..::.::::.:: ::.::. .: :. .:. ::::..
CCDS45 SPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 LWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADE
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CCDS45 AWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDE
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KE1 TLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQGIR
:::.: : . . . :..:
CCDS45 TLRFWNVFSKTRSTKVKWESVSVLNLFTRIR
470 480 490
>>CCDS12109.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 (493 aa)
initn: 1157 init1: 490 opt: 1094 Z-score: 812.9 bits: 159.9 E(32554): 5.9e-39
Smith-Waterman score: 1113; 41.3% identity (67.2% similar) in 458 aa overlap (58-473:29-473)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 WQRKAKEAAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRTPGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQ
:: .:: : ..::: : ::.:: :..:.
CCDS12 MDQDYERRLLRQIVIQNENTMPRVTEMRRTLTPASSPV-SSPSKHG-DRFIPSRAGAN
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 MEVASFLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFD-VEEAKILR--LSG----KPQNA
: .. :: ..:..... : : . :: : . . .:. : : : :.
CCDS12 WSVNFHRIN-----ENEKSPSQNRKAKD-ATSDNGKDGLAYSALLKNELLGAGIEKVQD-
60 70 80 90 100
150 160
pF1KE1 PEGYQNRLK------------VLYSQKATPG----------------------SSRKTCR
:. . ::. : .....: : :: :
CCDS12 PQTEDRRLQPSTPEKKGLFTYSLSTKRSSPDDGNDVSPYSLSPVSNKSQKLLRSPRKPTR
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 YIPSLPDRILDAPEIRNDYYLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPG
: ..: ..:::::...:.::::::::: :::.:.: . :::::: .... .: .. :
CCDS12 KISKIPFKVLDAPELQDDFYLNLVDWSSLNVLSVGLGTCVYLWSACTSQVTRLCDLSVEG
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 EYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSR
. ..::.: ..:: .:::: .. ::.::. :.: . .:.::::.:.::. ::::::
CCDS12 DSVTSVGWSERGNLVAVGTHKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSR
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 SGHIHHHDVRVAEHHVAT-LSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW
. : ..:.:. . :.:: ::::::.:. : . :::::::: . :: ....
CCDS12 DRMILQRDIRTPPLQSERRLQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSL
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGTSDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSI
:.: .:.: .::::.:: : : ..::.::::.:: ::.::. .: :. .:. ::::..
CCDS12 SPVQQYTEHLAAVKAIAWSPHQHGLLASGGGTADRCIRFWNTLTGQPLQCIDTGSQVCNL
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 LWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVAELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADE
:: : .::.: ::..:::...::::....::.: ::. ::: :.::::: .....:.::
CCDS12 AWSKHANELVSTHGYSQNQILVWKYPSLTQVAKLTGHSYRVLYLAMSPDGEAIVTGAGDE
410 420 430 440 450 460
470 480 490
pF1KE1 TLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQGIR
:::.: :
CCDS12 TLRFWNVFSKTRSTKESVSVLNLFTRIR
470 480 490
>>CCDS54852.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 (519 aa)
initn: 1065 init1: 520 opt: 1064 Z-score: 790.8 bits: 155.9 E(32554): 1e-37
Smith-Waterman score: 1070; 37.9% identity (66.0% similar) in 486 aa overlap (6-473:54-519)
10 20 30
pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAP-PARWQRKAKE
:.:.. . :. ..:. ..: .:::.
CCDS54 IMRVLSKDLKQKRSQDSANVLDSVNATYSDFKSNFAKRLSAEVPVASSPITTRWQQ----
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRT--PGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVAS
: :: . : : :. . : : :.: ..: : : . :... :
CCDS54 ------SQTRALS-SDSFGEEQSTTYLPEASGSVLKTPPEK---ETLTLGSRKEQLKTPS
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 FLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLY
.:. .. . . .. : .. . . : :. ::. . ......
CCDS54 KGISETSNSALHFCKAPHAMDRDWKESVAS---KGQKCLKQLFVTQNVVQQANGKMQLCE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 SQ----KATPGSSRKTCRYIPS---LPDRILDAPEI-------RNDYYLNLVDWSSGNVL
.. :. . : .. : . : ::. ::. :::::::..::: :..
CCDS54 QSECVWKGCKDGVRDESFHLKSSGDINDSILQ-PEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLV
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 AVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQ
:.:: ..::.:.. . . .. ... .:::::.:::::. :::::: .::::::: .
CCDS54 AIALGSAVYIWNGENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTK
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 KRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVATLSGHSQEVCGLRWA
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CCDS54 KRLRNMLGHLSVVGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVAQHHVGTLR-HKQAVCALKWS
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 PDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW-VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGT
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CCDS54 PDGRLLSSGCSDGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQ-STAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGM
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVA
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CCDS54 KDGRLHILDINAGKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSRSG
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 ELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQG
. :: .::: :..::: . : ::::: : .: :.
CCDS54 GFFGHRGRVLHLSLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY
490 500 510
pF1KE1 IR
>>CCDS3966.1 CDC20B gene_id:166979|Hs108|chr5 (515 aa)
initn: 1025 init1: 509 opt: 1049 Z-score: 779.9 bits: 153.9 E(32554): 4e-37
Smith-Waterman score: 1060; 37.9% identity (65.8% similar) in 486 aa overlap (6-473:54-515)
10 20 30
pF1KE1 MAQFAFESDLHSLLQLDAPIPNAP-PARWQRKAKE
:.:.. . :. ..:. ..: .:::.
CCDS39 IMRVLSKDLKQKRSQDSANVLDSVNATYSDFKSNFAKRLSAEVPVASSPITTRWQQ----
30 40 50 60 70
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AAGPAPSPMRAANRSHSAGRTPGRT--PGKSSSKVQTTPSKPGGDRYIPHRSAAQMEVAS
: :: . : : :. . : : :.: ..: : : . :... :
CCDS39 ------SQTRALS-SDSFGEEQSTTYLPEASGSVLKTPPEK---ETLTLGSRKEQLKTPS
80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 FLLSKENQPENSQTPTKKEHQKAWALNLNGFDVEEAKILRLSGKPQNAPEGYQNRLKVLY
.:. .. . . .. : .. . . : :. ::. . ......
CCDS39 KGISETSNSALHFCKAPHAMDRDWKESVAS---KGQKCLKQLFVTQNVVQQANGKMQLCE
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190
pF1KE1 SQ----KATPGSSRKTCRYIPS---LPDRILDAPEI-------RNDYYLNLVDWSSGNVL
.. :. . : .. : . : ::. ::. :::::::..::: :..
CCDS39 QSECVWKGCKDGVRDESFHLKSSGDINDSILQ-PEVKIHITGLRNDYYLNILDWSFQNLV
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 AVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGTSSAEVQLWDVQQQ
:.:: ..::.:.. . . .. ... .:::::.:::::. :::::: .::::::: .
CCDS39 AIALGSAVYIWNGENHNGIENIDLSLTCNYISSVSWIKEGTCLAVGTSEGEVQLWDVVTK
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 KRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVATLSGHSQEVCGLRWA
:::::: .: . ::.:::: .::::::: :...:::::::.:::.:: :.: ::.:.:.
CCDS39 KRLRNMLGHLSVVGALSWNHFILSSGSRLGRVYHHDVRVAQHHVGTLR-HKQAVCALKWS
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 PDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGW-VPLQTFTQHQGAVKAVAWCPWQSNVLATGGGT
:::: :.:: .:.:...:: :: .. ::...:: . ::::. ::::::.::: :::
CCDS39 PDGRLLSSGCSDGLLTIWPHDPGASAQGQPLKVITQ-STAVKAMDWCPWQSGVLAIGGGM
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 SDRHIRIWNVCSGACLSAVDAHSQVCSILWSPHYKELISGHGFAQNQLVIWKYPTMAKVA
.: ...: .. .: ... ...::.::..: :. ::. .:.: .:....: ::...
CCDS39 KDGRLHILDINAGKSIQTPSTNSQICSLIWLPKTKEIATGQGTPKNDVTVWTCPTVSR--
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 ELKGHTSRVLSLTMSPDGATVASAAADETLRLWRCFELDPARRREREKASAAKSSLIHQG
.:: .::: :..::: . : ::::: : .: :.
CCDS39 --SGHRGRVLHLSLSPDQTRVFSAAADGTASVWNCY
490 500 510
pF1KE1 IR
>>CCDS45917.1 FZR1 gene_id:51343|Hs108|chr19 (404 aa)
initn: 934 init1: 490 opt: 876 Z-score: 655.4 bits: 130.5 E(32554): 3.5e-30
Smith-Waterman score: 876; 47.5% identity (76.4% similar) in 259 aa overlap (216-473:130-384)
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 YLNLVDWSSGNVLAVALDNSVYLWSASSGDILQLLQMEQPGEYISSVAWIKEGNYLAVGT
. .: .. :. ..::.: ..:: .::::
CCDS45 LGAGIEKVQDPQTEDRRLQPSTPEKKGLFTVTRLCDLSVEGDSVTSVGWSERGNLVAVGT
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SSAEVQLWDVQQQKRLRNMTSHSARVGSLSWNSYILSSGSRSGHIHHHDVRVAEHHVAT-
.. ::.::. :.: . .:.::::.:.::. ::::::. : ..:.:. .
CCDS45 HKGFVQIWDAAAGKKLSMLEGHTARVGALAWNAEQLSSGSRDRMILQRDIRTPPLQSERR
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LSGHSQEVCGLRWAPDGRHLASGGNDNLVNVWPSAPGEGGWVPLQTFTQHQGAVKAVAWC
:.:: ::::::.:. : . :::::::: . :: .... :.: .:.: .::::.::
CCDS45 LQGHRQEVCGLKWSTDHQLLASGGNDNKLLVW----NHSSLSPVQQYTEHLAAVKAIAWS
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