FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1417, 586 aa
1>>>pF1KE1417 586 - 586 aa - 586 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.8265+/-0.00125; mu= -3.0544+/- 0.075
mean_var=450.9778+/-94.433, 0's: 0 Z-trim(112.6): 102 B-trim: 130 in 1/52
Lambda= 0.060394
statistics sampled from 13214 (13302) to 13214 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.707), E-opt: 0.2 (0.409), width: 16
Scan time: 4.050
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 ( 586) 3848 350.0 4.7e-96
CCDS8343.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 583) 3048 280.3 4.5e-75
CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 604) 3048 280.4 4.6e-75
CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX ( 577) 2484 231.2 2.8e-60
CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 447) 2133 200.5 3.8e-51
CCDS13861.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 595) 1680 161.2 3.5e-39
CCDS13862.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 590) 1653 158.8 1.8e-38
CCDS13863.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 548) 1431 139.4 1.1e-32
CCDS13865.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 507) 1266 125.0 2.3e-28
CCDS13864.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 ( 549) 1262 124.7 3e-28
CCDS58171.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 257) 976 99.4 5.9e-21
CCDS58173.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 ( 200) 587 65.4 8e-11
>>CCDS5258.1 EZR gene_id:7430|Hs108|chr6 (586 aa)
initn: 3848 init1: 3848 opt: 3848 Z-score: 1837.9 bits: 350.0 E(32554): 4.7e-96
Smith-Waterman score: 3848; 100.0% identity (100.0% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-586)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ
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CCDS52 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE1 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
550 560 570 580
>>CCDS8343.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (583 aa)
initn: 3083 init1: 2643 opt: 3048 Z-score: 1461.2 bits: 280.3 E(32554): 4.5e-75
Smith-Waterman score: 3048; 76.3% identity (92.8% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:::.::. ::::
CCDS83 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
:.:::. :.:.:::::::::::::.::::.:::::.:::.::::::::.::.::::::::
CCDS83 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
:::::.:::::::.::::::.:: :::...::.::::..:::::..:::.::: :: :::
CCDS83 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
:::....:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS83 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS83 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
:::::::::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: :
CCDS83 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
:..:: :: ..::.:..:::::.::::::: .: :: .:: . .::.::.:.:::::::
CCDS83 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
:::.::::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: :
CCDS83 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ
. . .. ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.:
CCDS83 PTENEHDEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQ
490 500 510 520 530
550 560 570 580
pF1KE1 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
::::.:.:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::.
CCDS83 ARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
540 550 560 570 580
>>CCDS58174.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (604 aa)
initn: 3083 init1: 2643 opt: 3048 Z-score: 1461.1 bits: 280.4 E(32554): 4.6e-75
Smith-Waterman score: 3048; 76.3% identity (92.8% similar) in 586 aa overlap (1-586:1-583)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:::.:::.::. ::::
CCDS58 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTVGLREVWFFGLQYVDSKGYSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
:.:::. :.:.:::::::::::::.::::.:::::.:::.::::::::.::.::::::::
CCDS58 LNKKVTQQDVKKENPLQFKFRAKFFPEDVSEELIQEITQRLFFLQVKEAILNDEIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
:::::.:::::::.::::::.:: :::...::.::::..:::::..:::.::: :: :::
CCDS58 TAVLLASYAVQAKYGDYNKEIHKPGYLANDRLLPQRVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
:::....:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.::::::::::
CCDS58 GMLREDSMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS58 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
:::::::::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: :
CCDS58 EVQQMKAQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
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CCDS58 AQKELEEQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
:::.::::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: :
CCDS58 LAEFTAKIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 VSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQ
. . .. ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.:
CCDS58 PTENEHDEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQ
490 500 510 520 530
550 560 570 580
pF1KE1 ARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
::::.:.:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 ARDETKKTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAMWGPKLYALFQMRSC
540 550 560 570 580 590
CCDS58 QSSIKQM
600
>>CCDS14382.1 MSN gene_id:4478|Hs108|chrX (577 aa)
initn: 3001 init1: 2457 opt: 2484 Z-score: 1195.7 bits: 231.2 E(32554): 2.8e-60
Smith-Waterman score: 2852; 73.6% identity (90.1% similar) in 587 aa overlap (1-586:1-577)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWYFGLHYVDNKGFPTWLK
::: :.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.: :.::: ::::
CCDS14 MPKTISVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVWFFGLQYQDTKGFSTWLK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQVKEGILSDEIYCPPE
:.:::.::.::::.:: ::::::::::::.:::::::::.:::::::::::.:.::::::
CCDS14 LNKKVTAQDVRKESPLLFKFRAKFYPEDVSEELIQDITQRLFFLQVKEGILNDDIYCPPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 TAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHR
:::::.:::::.:.::.::::::::::....:.::::..::::..::::.:::::: :::
CCDS14 TAVLLASYAVQSKYGDFNKEVHKSGYLAGDKLLPQRVLEQHKLNKDQWEERIQVWHEEHR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGF
:::...:.::::::::::::::.::: ::::::..::::::::::::::..:.:::::::
CCDS14 GMLREDAVLEYLKIAQDLEMYGVNYFSIKNKKGSELWLGVDALGLNIYEQNDRLTPKIGF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS14 PWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 EVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKK
:::::::::::::::::.:: .::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.:::
CCDS14 EVQQMKAQAREEKHQKQMERAMLENEKKKREMAEKEKEKIEREKEELMERLKQIEEQTKK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AERELSEQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAE
:..:: :: .:::.::.:::::: :::.: .:. : .::: : . . :: :.::::: :
CCDS14 AQQELEEQTRRALELEQERKRAQSEAEKLAKERQEAEEAKEALLQASRDQKKTQEQLALE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 LAEYTAKIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEP
.:: ::.:. :: ::..::.:. :::..:. .:.:: ::. ::. .:..: : ::
CCDS14 MAELTARISQLEMARQKKESEAVEWQQKAQMVQEDLEKTRAELKTAMSTP-----HVAEP
430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE1 VSYHVQESLQDE-GAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELS
. . .: ::: ::: ::.: .... ::.::.: ::::::::::..: .:.:::.
CCDS14 AENEQDE--QDENGAEA---SADLRADAMAKDRSEEERTTEAEKNERVQKHLKALTSELA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580
pF1KE1 QARDENKRTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
.::::.:.: ::.:: :::: ::::::::::::::::::::::::..
CCDS14 NARDESKKTANDMIHAENMRLGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFESM
540 550 560 570
>>CCDS58172.1 RDX gene_id:5962|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 2168 init1: 1728 opt: 2133 Z-score: 1031.7 bits: 200.5 E(32554): 3.8e-51
Smith-Waterman score: 2133; 73.5% identity (90.9% similar) in 430 aa overlap (157-586:21-447)
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDN
:..:::::..:::.::: :: ::::::...
CCDS58 MLSWNLPFSPIQLANNFLTSVLEQHKLTKEQWEERIQNWHEEHRGMLRED
10 20 30 40 50
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIR
.:.:::::::::::::.:::::::::::.::::::::::::::.::::::::::::::::
CCDS58 SMMEYLKIAQDLEMYGVNYFEIKNKKGTELWLGVDALGLNIYEHDDKLTPKIGFPWSEIR
60 70 80 90 100 110
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILALCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMK
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKKAERELS
:::::::::::::: :::.:::.:: .:.:::.. ::::::: ::.. ::.: ::..::
CCDS58 AQAREEKHQKQLERAQLENEKKKREIAEKEKERIEREKEELMERLKQIEEQTIKAQKELE
180 190 200 210 220 230
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 EQIQRALQLEEERKRAQEEAERLEADRMAALRAKEELERQAVDQIKSQEQLAAELAEYTA
:: ..::.:..:::::.::::::: .: :: .:: . .::.::.:.::::::::::.::
CCDS58 EQTRKALELDQERKRAKEEAERLEKERRAAEEAKSAIAKQAADQMKNQEQLAAELAEFTA
240 250 260 270 280 290
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KIALLEEARRRKEDEVEEWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPPPVYEPVSYHVQ
::::::::...::.:. ::::.: ::.:: ::::::. ::.:::::::: : . . .
CCDS58 KIALLEEAKKKKEEEATEWQHKAFAAQEDLEKTKEELKTVMSAPPPPPPPPVIPPTENEH
300 310 320 330 340 350
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 ESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENK
. ....:: :::::.::. . :.::.:.::..:::::..:: .:::::.:::::.:
CCDS58 DEHDENNAEA---SAELSNEGVMNHRSEEERVTETQKNERVKKQLQALSSELAQARDETK
360 370 380 390 400
550 560 570 580
pF1KE1 RTHNDIIHNENMRQGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAL
.:.::..: ::.. :::::::::::::::::::::::::.
CCDS58 KTQNDVLHAENVKAGRDKYKTLRQIRQGNTKQRIDEFEAM
410 420 430 440
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10 20 30 40
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:: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.:
CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF
.:::.:. : .:::.:::: ..: ::.:. :.: ::::::.. :::.:.:::.:::
CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 LQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKL
::::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ...
CCDS13 LQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL
: ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: ::::::
CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL
::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: ::::
CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE
:.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :.
CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE
.. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : .
CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK
: :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . .
CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK
:: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :..
CCDS13 TKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKE
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 RITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIRQGN
.. ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:.... .
CCDS13 KVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKLTLQS
530 540 550 560 570 580
580
pF1KE1 TKQRIDEFEAL
.:.:. :: :
CCDS13 AKSRVAFFEEL
590
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10 20 30 40
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVW
:: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.:
CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF
.:::.:. : .:::.:::: ..: ::.:. :.: ::::::.. :::.:.:::.:::
CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPENAEEELVQEITQHLFF
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 LQVKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKL
::::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ...
CCDS13 LQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM
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170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL
: ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: ::::::
CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL
::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: ::::
CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE
:.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :.
CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE
.. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : .
CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK
: :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . .
CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK
:: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :..
CCDS13 TKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKE
480 490 500 510 520
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 RITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIR-QG
.. ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:... . ::
CCDS13 KVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQG
530 540 550 560 570 580
580
pF1KE1 NTKQRIDEFEAL
CCDS13 RRPICI
590
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CCDS13 GAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEVLDHDVSKEEPVTFHFLAKFYPEN
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CCDS13 AEEELVQEITQHLFFLQVKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLA
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pF1KE1 SERLIPQRVMDQHKLTRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEI
.:.:.:.::.. ...: ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :
CCDS13 QEELLPKRVINLYQMTPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAI
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pF1KE1 KNKKGTDLWLGVDALGLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFV
.:::::.: ::::::::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: :
CCDS13 RNKKGTELLLGVDALGLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFK
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pF1KE1 FYAPRLRINKRILQLCMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKK
: . .::.:: :::::.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::.
CCDS13 FNSSKLRVNKLILQLCIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQ
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pF1KE1 RRETVEREKEQMMREKEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE
:: .:: .... :. .. . .: ..:. . ..: ::: : ::. ::
CCDS13 MREEAERTRDELERRLLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAE
310 320 330 340 350 360
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 -RLEADRMAALRAKEELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVE
. : .:. : . : :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..
CCDS13 AEQEMQRIKATAIRTEEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAR
370 380 390 400 410 420
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pF1KE1 EWQHRAKEAQDDLVKTKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSA
: ..:::. . . :: . : : :: : .. .. .. ...: .
CCDS13 EAERRAKQKLLE-IATKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------
430 440 450 460 470
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pF1KE1 ELSSEGIRDDRNEEKRITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQ
.:: : :.... ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: :
CCDS13 RLSME------IEKEKVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRG
480 490 500 510 520
570 580
pF1KE1 GRDKYKTLRQIR-QGNTKQRIDEFEAL
: .:..:... . ::
CCDS13 GSSKHNTIKKPQAQGRRPICI
530 540
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pF1KE1 GLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFFLQ
..:. . :. . ... .. : .
CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCE
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pF1KE1 VKEGILSDEIYCPPETAVLLGSYAVQAKFGDYNKEVHKSGYLSSERLIPQRVMDQHKLTR
::. ::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ...:
CCDS13 VKKQILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQMTP
40 50 60 70 80 90
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pF1KE1 DQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDALGL
..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: ::::::::
CCDS13 EMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDALGL
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pF1KE1 NIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQLCM
.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: :::::.
CCDS13 HIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQLCI
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pF1KE1 GNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMREKE
:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :.
CCDS13 GNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERRLL
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 ELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKEEL
.. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : . :
CCDS13 QMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRTEE
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 ERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVKTK
:.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . . ::
CCDS13 EKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IATK
340 350 360 370 380 390
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pF1KE1 EELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEKRI
. : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :....
CCDS13 PTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKEKV
400 410 420 430 440
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pF1KE1 TEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIR-QGNT
::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:... . ::
CCDS13 EYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQGRR
450 460 470 480 490 500
580
pF1KE1 KQRIDEFEAL
CCDS13 PICI
>>CCDS13864.1 NF2 gene_id:4771|Hs108|chr22 (549 aa)
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10 20 30 40
pF1KE1 MPKPINVRVTTMDAELEFAIQPNTTGKQLFDQVVKTIGLREVW
:: ..::..:::::.:: . . ::.::: : .:.::::.:
CCDS13 MAGAIASRMSFSSLKRKQPKTFTVRIVTMDAEMEFNCEMKWKGKDLFDLVCRTLGLRETW
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pF1KE1 YFGLHYVDNKGFPTWLKLDKKVSAQEVRKENPLQFKFRAKFYPEDVAEELIQDITQKLFF
.:::.:. : .:::.::::. :
CCDS13 FFGLQYT-IKDTVAWLKMDKKVKKQ-----------------------------------
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::...::::::..:::.:::::::.:::. ::: :.:..:.:.:.::.. ...
CCDS13 ------ILDEKIYCPPEASVLLASYAVQAKYGDYDPSVHKRGFLAQEELLPKRVINLYQM
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pF1KE1 TRDQWEDRIQVWHAEHRGMLKDNAMLEYLKIAQDLEMYGINYFEIKNKKGTDLWLGVDAL
: ..::.:: .:.::::: .:.: .:::::::::::::.::: :.:::::.: ::::::
CCDS13 TPEMWEERITAWYAEHRGRARDEAEMEYLKIAQDLEMYGVNYFAIRNKKGTELLLGVDAL
140 150 160 170 180 190
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pF1KE1 GLNIYEKDDKLTPKIGFPWSEIRNISFNDKKFVIKPIDKKAPDFVFYAPRLRINKRILQL
::.::. ...:::::.:::.::::::..::.:.:::.::: : : . .::.:: ::::
CCDS13 GLHIYDPENRLTPKISFPWNEIRNISYSDKEFTIKPLDKKIDVFKFNSSKLRVNKLILQL
200 210 220 230 240 250
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 CMGNHELYMRRRKPDTIEVQQMKAQAREEKHQKQLERQQLETEKKRRETVEREKEQMMRE
:.:::.:.::::: :..::::::::::::: .::.:::.: ::. :: .:: .... :.
CCDS13 CIGNHDLFMRRRKADSLEVQQMKAQAREEKARKQMERQRLAREKQMREEAERTRDELERR
260 270 280 290 300 310
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pF1KE1 KEELMLRLQDYEEKTKKAERELSEQIQRALQLEEERKR-AQEEAE-RLEADRMAALRAKE
.. . .: ..:. . ..: ::: : ::. :: . : .:. : .
CCDS13 LLQMKEEATMANEALMRSEETADLLAEKAQITEEEAKLLAQKAAEAEQEMQRIKATAIRT
320 330 340 350 360 370
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pF1KE1 ELERQAVDQ-IKSQEQLAAELAEYTAKIALLEEARRRKED--EVEEWQHRAKEAQDDLVK
: :.. ..: . : :: ..:: . . : .:: . :.: :..: ..:::. . .
CCDS13 EEEKRLMEQKVLEAEVLALKMAEESERRA--KEADQLKQDLQEAREAERRAKQKLLE-IA
380 390 400 410 420 430
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pF1KE1 TKEELHLVMTAPPPPPP--PVYEPVSYHVQESLQDEGAEPTGYSAELSSEGIRDDRNEEK
:: . : : :: : .. .. .. ...: . .:: : :..
CCDS13 TKPTYPPMNPIPAPLPPDIPSFNLIGDSLSFDFKDTDMK------RLSME------IEKE
440 450 460 470 480
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pF1KE1 RITEAEKNERVQRQLLTLSSELSQARDENKRTHNDIIHNENM-RQGRDKYKTLRQIR-QG
.. ::....:.:: :..:. . ....: ::.:::: : : .:..:... . ::
CCDS13 KVEYMEKSKHLQEQLNELKTEIEALKLKERETALDILHNENSDRGGSSKHNTIKKPQAQG
490 500 510 520 530 540
580
pF1KE1 NTKQRIDEFEAL
CCDS13 RRPICI
586 residues in 1 query sequences
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