Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1406
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1406, 572 aa
1>>>pF1KE1406 572 - 572 aa - 572 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.3529+/-0.000858; mu= 14.9749+/- 0.052
mean_var=95.9652+/-19.826, 0's: 0 Z-trim(109.1): 15 B-trim: 397 in 2/51
Lambda= 0.130923
statistics sampled from 10652 (10665) to 10652 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.683), E-opt: 0.2 (0.328), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 572) 3807 729.4 2.9e-210
CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 570) 3720 713.0 2.5e-205
CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 ( 686) 3720 713.0 3e-205
CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 572) 3063 588.9 5.8e-168
CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 677) 2999 576.8 2.9e-164
CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 ( 570) 2931 563.9 1.8e-160
CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 ( 684) 2863 551.1 1.6e-156
CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 ( 536) 2852 549.0 5.4e-156
CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10 ( 572) 2780 535.4 7.1e-152
CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8 ( 519) 2098 406.6 3.9e-113
CCDS1730.1 DPYSL5 gene_id:56896|Hs108|chr2 ( 564) 1973 383.0 5.4e-106
>>CCDS43207.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (572 aa)
initn: 3807 init1: 3807 opt: 3807 Z-score: 3888.4 bits: 729.4 E(32554): 2.9e-210
Smith-Waterman score: 3807; 100.0% identity (100.0% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
550 560 570
>>CCDS75102.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (570 aa)
initn: 3720 init1: 3720 opt: 3720 Z-score: 3799.7 bits: 713.0 E(32554): 2.5e-205
Smith-Waterman score: 3720; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (14-572:12-570)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MQKMNNEVVDKSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
480 490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
540 550 560 570
>>CCDS33950.1 CRMP1 gene_id:1400|Hs108|chr4 (686 aa)
initn: 3720 init1: 3720 opt: 3720 Z-score: 3798.5 bits: 713.0 E(32554): 3e-205
Smith-Waterman score: 3720; 100.0% identity (100.0% similar) in 559 aa overlap (14-572:128-686)
10 20 30 40
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SPGERDERPPTLRIRRPAPRDLPLGRDNGQSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIK
100 110 120 130 140 150
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 QIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 QIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTM
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 IIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 IIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNS
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 FQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGH
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 ALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASL
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAV
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 GKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAV
460 470 480 490 500 510
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 GSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNK
520 530 540 550 560 570
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 GMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSP
580 590 600 610 620 630
530 540 550 560 570
pF1KE1 SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
640 650 660 670 680
>>CCDS6051.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (572 aa)
initn: 3063 init1: 3063 opt: 3063 Z-score: 3129.0 bits: 588.9 E(32554): 5.8e-168
Smith-Waterman score: 3063; 76.2% identity (94.4% similar) in 572 aa overlap (1-572:1-572)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
:::::::.::.:::::::::::.:.:::::.:::.:.:::::::::::::::::::::::
CCDS60 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGKIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
..::::::::::.: .: :.::::.::::::::.:::.:::::::::::::::.:::..:
CCDS60 HSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
..:.: ::.::::::::::::. :. :..::.:.::.:.::::: ::::.:: .:..: :
CCDS60 DQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
.::... .. .::. :::::::.::.::.:::..::::::::.::::::.::::: :::
CCDS60 IYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:::::::::.:..:: ::::: .:.::::.:::::::.::::::::::::
CCDS60 TIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
:::::::::::::::.:.:::.:::::::::.:: ..:::::::::::::::::.:: ::
CCDS60 FVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
::.:.:::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::..:::
CCDS60 RMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
.::.:.:..::::::::::.:::::::::::::.:::...:..: ::.:::: ::. .:.
CCDS60 SAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
:.: :... :.:: ::.::::: :: .::: .::: :::.::.:.: ::.::::::.::
CCDS60 RIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
::::::::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS60 LSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
550 560 570
>>CCDS83268.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (677 aa)
initn: 2990 init1: 2990 opt: 2999 Z-score: 3062.5 bits: 576.8 E(32554): 2.9e-164
Smith-Waterman score: 2999; 75.1% identity (93.9% similar) in 570 aa overlap (5-572:108-677)
10 20 30
pF1KE1 MSYQGKKSIPHIT--SDRLLIKGGRIINDDQSLY
::... .:. :::::::::.:.:::::.:
CCDS83 PQPPYSRQGRRAGGEPSVESGRKVEIRRASGKEALQNINDQSDRLLIKGGKIVNDDQSFY
80 90 100 110 120 130
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 ADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQG
::.:.:::::::::::::::::::::::..::::::::::.: .: :.::::.:::::::
CCDS83 ADIYMEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVIPGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQG
140 150 160 170 180 190
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 TRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREEL
:.:::.:::::::::::::::.:::..:..:.: ::.::::::::::::. :. :..::.
CCDS83 TKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREWADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEM
200 210 220 230 240 250
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 EVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRI
:.::.:.::::: ::::.:: .:..: :.::... .. .::. :::::::.::.::.::
CCDS83 EALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLSVIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRI
260 270 280 290 300 310
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 LEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGP
:..::::::::.::::::.::::: ::::::.. :::.:::::::::.:..:: :::::
CCDS83 LDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQTNCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGT
320 330 340 350 360 370
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSG
.:.::::.:::::::.:::::::::::::::::::::::::::.:.:::.:::::::::.
CCDS83 VVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSA
380 390 400 410 420 430
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 HCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIF
:: ..:::::::::::::::::.:: ::::.:.:::::.:::::::::::::::::::.:
CCDS83 HCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIWDKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVF
440 450 460 470 480 490
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 NLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKI
::::::::::::::::.::::::..:::.::.:.:..::::::::::.::::::::::::
CCDS83 NLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHNSSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKI
500 510 520 530 540 550
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 VFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKY
:.:::...:..: ::.:::: ::. .:.:.: :... :.:: ::.::::: :: .:::
CCDS83 VLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARSRLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKT
560 570 580 590 600 610
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 ATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
.::: :::.::.:.: ::.::::::.::::::::::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS83 VTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQIDDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
620 630 640 650 660 670
>>CCDS43381.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 (570 aa)
initn: 2861 init1: 2758 opt: 2931 Z-score: 2994.2 bits: 563.9 E(32554): 1.8e-160
Smith-Waterman score: 2931; 74.4% identity (92.1% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-569)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
:::::::.::.:::::::::::::.:::::.:::.:.:::::::::.:::::::::::::
CCDS43 MSYQGKKNIPRITSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMEDGLIKQIGDNLIVPGGVKTIEA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
::.:::::::::.:..: : .:::..:::::::.:::.:::::::::::::: ::: ..
CCDS43 NGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPESSLTEAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
:::.: :: ::::::.:::::: : :.:..:.. :..:::::::.:::::::.::.:...
CCDS43 EKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDKGVNSFMVYMAYKDLYQVSNTE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
::: :: : :::. :::::::.::::: :.:::::::::::.::::::::::::::::
CCDS43 LYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITGPEGHVLSRPEELEAEAVFRAI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
:::.. :::.:.::::::::::.:. ::::: .::::::.:::: :::::::::::::::
CCDS43 TIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPITASLGIDGTHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
::::::::::::::::..:::: ::::..::.:: .::::::.:::::: ::::.::.::
CCDS43 FVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTAQKAIGKDNFTAIPEGTNGVEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::::: .: .
CCDS43 RMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRISVGSDSDLVIWDPDAVKIV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
.::.:.::.::::::::: .:.::::: ::::..::::..:..: ::::: . : ...:.
CCDS43 SAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNLHVTQGAGRFIPCSPFSDYVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
:.: : :. :..: ::::::::... .::: .::: ::..::.. .:: .::::::.::
CCDS43 RIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSARGSPTRPNPP-VRNLHQSGFS
490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
:::.:.:.. : ...:::::::::::::::
CCDS43 LSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
540 550 560 570
>>CCDS56387.1 DPYSL3 gene_id:1809|Hs108|chr5 (684 aa)
initn: 2788 init1: 2685 opt: 2863 Z-score: 2923.6 bits: 551.1 E(32554): 1.6e-156
Smith-Waterman score: 2863; 73.8% identity (91.6% similar) in 562 aa overlap (10-571:124-683)
10 20 30
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLED
:. :::::::::::.:::::.:::.:.::
CCDS56 ESREPAPASPAPAGVEIRSATGKEVLQNLGPKDKSDRLLIKGGRIVNDDQSFYADIYMED
100 110 120 130 140 150
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GLIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVG
:::::::.:::::::::::::::.:::::::::.:..: : .:::..:::::::.:::.:
CCDS56 GLIKQIGDNLIVPGGVKTIEANGKMVIPGGIDVHTHFQMPYKGMTTVDDFFQGTKAALAG
160 170 180 190 200 210
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 GTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDK
::::::::::::: ::: ..:::.: :: ::::::.:::::: : :.:..:.. :..::
CCDS56 GTTMIIDHVVPEPESSLTEAYEKWREWADGKSCCDYALHVDITHWNDSVKQEVQNLIKDK
220 230 240 250 260 270
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 GVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITG
:::::.:::::::.::.:...::: :: : :::. :::::::.::::: :.:::::::
CCDS56 GVNSFMVYMAYKDLYQVSNTELYEIFTCLGELGAIAQVHAENGDIIAQEQTRMLEMGITG
280 290 300 310 320 330
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PEGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPI
::::.:::::::::::::::::::.. :::.:.::::::::::.:. ::::: .::::::
CCDS56 PEGHVLSRPEELEAEAVFRAITIASQTNCPLYVTKVMSKSAADLISQARKKGNVVFGEPI
340 350 360 370 380 390
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 AASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTA
.:::: :::::::::::::::::::::::::::::::..:::: ::::..::.:: .:::
CCDS56 TASLGIDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPPLSPDPTTPDYINSLLASGDLQLSGSAHCTFSTA
400 410 420 430 440 450
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 QKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKG
:::.:::::: ::::.::.::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS56 QKAIGKDNFTAIPEGTNGVEERMSVIWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKG
460 470 480 490 500 510
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 RIAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNI
::.::::.:.:::::: .: ..::.:.::.::::::::: .:.::::: ::::..::::.
CCDS56 RISVGSDSDLVIWDPDAVKIVSAKNHQSAAEYNIFEGMELRGAPLVVICQGKIMLEDGNL
520 530 540 550 560 570
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 NVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSA
.:..: ::::: . : ...:.:.: : :. :..: ::::::::... .::: .::: ::
CCDS56 HVTQGAGRFIPCSPFSDYVYKRIKARRKMADLHAVPRGMYDGPVFDLTTTPKGGTPAGSA
580 590 600 610 620 630
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 KSSPSKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
..::.. .:: .::::::.:::::.:.:.. : ...:::::::::::::::
CCDS56 RGSPTRPNPP-VRNLHQSGFSLSGTQVDEGV-RSASKRIVAPPGGRSNITSLS
640 650 660 670 680
>>CCDS59096.1 DPYSL2 gene_id:1808|Hs108|chr8 (536 aa)
initn: 2852 init1: 2852 opt: 2852 Z-score: 2914.0 bits: 549.0 E(32554): 5.4e-156
Smith-Waterman score: 2852; 75.7% identity (94.0% similar) in 536 aa overlap (37-572:1-536)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 KSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEANGRMVI
.:::::::::::::::::::::::..::::
CCDS59 MEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEAHSRMVI
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 PGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSFEKWHEA
::::::.: .: :.::::.::::::::.:::.:::::::::::::::.:::..:..:.:
CCDS59 PGGIDVHTRFQMPDQGMTSADDFFQGTKAALAGGTTMIIDHVVPEPGTSLLAAFDQWREW
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 ADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQLYEAFT
::.::::::::::::. :. :..::.:.::.:.::::: ::::.:: .:..: :.::...
CCDS59 ADSKSCCDYSLHVDISEWHKGIQEEMEALVKDHGVNSFLVYMAFKDRFQLTDCQIYEVLS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAITIAGRI
.. .::. :::::::.::.::.:::..::::::::.::::::.::::: ::::::..
CCDS59 VIRDIGAIAQVHAENGDIIAEEQQRILDLGITGPEGHVLSRPEEVEAEAVNRAITIANQT
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAAFVTSPP
:::.:::::::::.:..:: ::::: .:.::::.:::::::.::::::::::::::::::
CCDS59 NCPLYITKVMSKSSAEVIAQARKKGTVVYGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAAFVTSPP
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 LSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEERMTVVW
:::::::::.:.:::.:::::::::.:: ..:::::::::::::::::.:: ::::.:.:
CCDS59 LSPDPTTPDFLNSLLSCGDLQVTGSAHCTFNTAQKAVGKDNFTLIPEGTNGTEERMSVIW
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 DKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTITAKSHK
::::.:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::.::::::..:::.::.:.
CCDS59 DKAVVTGKMDENQFVAVTSTNAAKVFNLYPRKGRIAVGSDADLVIWDPDSVKTISAKTHN
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQRVKIRN
:..::::::::::.:::::::::::::.:::...:..: ::.:::: ::. .:.:.: :.
CCDS59 SSLEYNIFEGMECRGSPLVVISQGKIVLEDGTLHVTEGSGRYIPRKPFPDFVYKRIKARS
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 KVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFSLSGAQI
.. :.:: ::.::::: :: .::: .::: :::.::.:.: ::.::::::.::::::::
CCDS59 RLAELRGVPRGLYDGPVCEVSVTPKTVTPASSAKTSPAKQQAPPVRNLHQSGFSLSGAQI
460 470 480 490 500 510
550 560 570
pF1KE1 DDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
::: :::: .:::::::::.::::::
CCDS59 DDNIPRRTTQRIVAPPGGRANITSLG
520 530
>>CCDS7665.1 DPYSL4 gene_id:10570|Hs108|chr10 (572 aa)
initn: 2780 init1: 2780 opt: 2780 Z-score: 2840.1 bits: 535.4 E(32554): 7.1e-152
Smith-Waterman score: 2780; 69.2% identity (89.5% similar) in 571 aa overlap (1-571:1-571)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGGVKTIEA
::.:::::::.::::::::.::::.:::::.::::..:::::::::::::::::.:::.:
CCDS76 MSFQGKKSIPRITSDRLLIRGGRIVNDDQSFYADVHVEDGLIKQIGENLIVPGGIKTIDA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 NGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSLLTSF
.: ::.:::.::.: :: : ::: :::: :::.:::.::::::.::: :. : :::...
CCDS76 HGLMVLPGGVDVHTRLQMPVLGMTPADDFCQGTKAALAGGTTMILDHVFPDTGVSLLAAY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQMSDSQ
:.:.: ::. .::::::::::: :.....::::.::..:::::: :.::::: : ::::
CCDS76 EQWRERADSAACCDYSLHVDITRWHESIKEELEALVKEKGVNSFLVFMAYKDRCQCSDSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAVFRAI
.:: :.... :::. :::::::.. .::::.::.::::::::.::.:::.:::::.::.
CCDS76 MYEIFSIIRDLGALAQVHAENGDIVEEEQKRLLELGITGPEGHVLSHPEEVEAEAVYRAV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 TIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWAKAAA
::: . :::.:.::::::.::: :: :...: .::::::.:::::::.::::::::::::
CCDS76 TIAKQANCPLYVTKVMSKGAADAIAQAKRRGVVVFGEPITASLGTDGSHYWSKNWAKAAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 FVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVNGIEE
::::::..::::: :.:: ::. ::::::::.:: ..:::::::::::.:::::.:::::
CCDS76 FVTSPPVNPDPTTADHLTCLLSSGDLQVTGSAHCTFTTAQKAVGKDNFALIPEGTNGIEE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDKLKTI
::..::.: ::.::::::.::::::::::::::.::::::.:::::::.:::.: : :
CCDS76 RMSMVWEKCVASGKMDENEFVAVTSTNAAKIFNFYPRKGRVAVGSDADLVIWNPKATKII
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 TAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPEHLYQ
.::.:. ::::::::.::.:.: ::::::....:::.. :. : :::.:::.::. .:.
CCDS76 SAKTHNLNVEYNIFEGVECRGAPAVVISQGRVALEDGKMFVTPGAGRFVPRKTFPDFVYK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 RVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPATPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNLHQSNFS
:.: ::.. ..:: ::.:::::.:: . : .. ::. : :.: . ::.::::::.::
CCDS76 RIKARNRLAEIHGVPRGLYDGPVHEVMVPAKPGSGAPARASCPGKISVPPVRNLHQSGFS
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KE1 LSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
:::.: ::. :::...:.::::::::::::
CCDS76 LSGSQADDHIARRTAQKIMAPPGGRSNITSLS
550 560 570
>>CCDS6302.1 DPYS gene_id:1807|Hs108|chr8 (519 aa)
initn: 2101 init1: 1898 opt: 2098 Z-score: 2144.5 bits: 406.6 E(32554): 3.9e-113
Smith-Waterman score: 2098; 58.8% identity (81.7% similar) in 514 aa overlap (16-523:6-519)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSYQGKKSIPHITSDRLLIKGGRIINDDQSLYADVYLEDGLIKQIGENLIVPGG----VK
::::.:::..::: : ::: .:::... .:..:. ::: ..
CCDS63 MAAPSRLLIRGGRVVNDDFSEVADVLVEDGVVRALGHDLLPPGGAPAGLR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TIEANGRMVIPGGIDVNTYLQKPSQGMTAADDFFQGTRAALVGGTTMIIDHVVPEPGSSL
...: :..:.:::::..:..: : .: . ::: :::.::: :::::::: ..:. :.::
CCDS63 VLDAAGKLVLPGGIDTHTHMQFPFMGSRSIDDFHQGTKAALSGGTTMIIDFAIPQKGGSL
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LTSFEKWHEAADTKSCCDYSLHVDITSWYDGVREELEVLVQDKGVNSFQVYMAYKDVYQM
. .:: :. :: : :::::::: .: : : :.::...::::::::::...:::::.:..
CCDS63 IEAFETWRSWADPKVCCDYSLHVAVTWWSDQVKEEMKILVQDKGVNSFKMFMAYKDLYMV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SDSQLYEAFTFLKGLGAVILVHAENGDLIAQEQKRILEMGITGPEGHALSRPEELEAEAV
.: .:::::. : .::. ::::::::::. :..: .:::::::: : ::: .::::.
CCDS63 TDLELYEAFSRCKEIGAIAQVHAENGDLIAEGAKKMLALGITGPEGHELCRPEAVEAEAT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 FRAITIAGRINCPVYITKVMSKSAADIIALARKKGPLVFGEPIAASLGTDGTHYWSKNWA
.::::::. .:::.::..::::::: .:: ::. : .:.::::::::::::::::.:.:
CCDS63 LRAITIASAVNCPLYIVHVMSKSAAKVIADARRDGKVVYGEPIAASLGTDGTHYWNKEWH
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KAAAFVTSPPLSPDPTTPDYLTSLLACGDLQVTGSGHCPYSTAQKAVGKDNFTLIPEGVN
.:: : .::: :::.:::.: .::: :: .::. .: ..: :::.:::.:: ::.:::
CCDS63 HAAHHVMGPPLRPDPSTPDFLMNLLANDDLTTTGTDNCTFNTCQKALGKDDFTKIPNGVN
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 GIEERMTVVWDKAVATGKMDENQFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADVVIWDPDK
:.:.::.:.:.:.: .::::::.:::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS63 GVEDRMSVIWEKGVHSGKMDENRFVAVTSTNAAKIFNLYPRKGRIAVGSDADIVIWDPKG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LKTITAKSHKSAVEYNIFEGMECHGSPLVVISQGKIVFEDGNINVNKGMGRFIPRKAFPE
.::.::.:..::..:::::: ::: :::.::.::.:.: : ..:. : :.::::: : :
CCDS63 TRTISAKTHHQAVNFNIFEGMVCHGVPLVTISRGKVVYEAGVFSVTAGDGKFIPRKPFAE
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 HLYQRVKIRNKVFGLQGVSRGMYDGPVYEVPA--TPKYATPAPSAKSSPSKHQPPPIRNL
..:.:.: :... : :. : : : . . : . :: . .. :
CCDS63 YIYKRIKQRDRTCTPTPVERAPYKGEVATLKSRVTKEDATAGTRKQAHP
480 490 500 510
540 550 560 570
pF1KE1 HQSNFSLSGAQIDDNNPRRTGHRIVAPPGGRSNITSLG
572 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 15:41:45 2016 done: Mon Nov 7 15:41:45 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]