Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1403
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1403, 374 aa
1>>>pF1KE1403 374 - 374 aa - 374 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9687+/-0.00134; mu= 12.8077+/- 0.078
mean_var=106.1321+/-28.653, 0's: 0 Z-trim(101.4): 318 B-trim: 914 in 2/45
Lambda= 0.124495
statistics sampled from 5987 (6510) to 5987 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.529), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 2.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 ( 374) 2453 452.2 3.5e-127
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 955 183.1 3.4e-46
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 955 183.1 3.4e-46
CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 ( 360) 880 169.6 3.8e-42
CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 ( 350) 877 169.1 5.4e-42
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 853 164.8 1.1e-40
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 837 161.9 8.1e-40
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 832 161.0 1.5e-39
CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 368) 750 146.3 4.1e-35
CCDS48135.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX ( 415) 750 146.3 4.5e-35
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 749 146.1 4.5e-35
CCDS2738.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 355) 742 144.8 1.1e-34
CCDS54574.1 CCR3 gene_id:1232|Hs108|chr3 ( 376) 742 144.9 1.1e-34
CCDS46813.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 360) 738 144.1 1.8e-34
CCDS2739.1 CCR5 gene_id:1234|Hs108|chr3 ( 352) 736 143.8 2.3e-34
CCDS43078.1 CCR2 gene_id:729230|Hs108|chr3 ( 374) 735 143.6 2.7e-34
CCDS2706.1 ACKR2 gene_id:1238|Hs108|chr3 ( 384) 726 142.0 8.4e-34
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 723 141.4 1.1e-33
CCDS46420.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 352) 697 136.8 2.9e-32
CCDS33295.1 CXCR4 gene_id:7852|Hs108|chr2 ( 356) 697 136.8 2.9e-32
CCDS43069.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 355) 696 136.6 3.3e-32
CCDS54571.1 CX3CR1 gene_id:1524|Hs108|chr3 ( 387) 696 136.6 3.5e-32
CCDS8402.1 CXCR5 gene_id:643|Hs108|chr11 ( 372) 666 131.2 1.4e-30
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 650 128.3 1e-29
CCDS2735.1 CXCR6 gene_id:10663|Hs108|chr3 ( 342) 636 125.8 5.6e-29
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 632 125.1 9.6e-29
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 632 125.1 1e-28
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 632 125.1 1e-28
CCDS3075.1 ACKR4 gene_id:51554|Hs108|chr3 ( 350) 611 121.3 1.3e-27
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 551 110.5 2.2e-24
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 520 105.0 1.1e-22
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 515 104.1 2.2e-22
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 508 102.8 4.9e-22
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 506 102.5 6.3e-22
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 500 101.4 1.4e-21
CCDS9942.1 BDKRB2 gene_id:624|Hs108|chr14 ( 391) 500 101.4 1.4e-21
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 498 101.0 1.7e-21
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 495 100.5 2.5e-21
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 492 100.0 4e-21
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 486 98.9 7.6e-21
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 486 98.9 7.9e-21
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 478 97.4 2.1e-20
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 478 97.5 2.2e-20
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 478 97.5 2.2e-20
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 478 97.5 2.2e-20
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 478 97.5 2.2e-20
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 478 97.5 2.2e-20
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 478 97.5 2.2e-20
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 478 97.5 2.3e-20
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 478 97.5 2.3e-20
>>CCDS5298.1 CCR6 gene_id:1235|Hs108|chr6 (374 aa)
initn: 2453 init1: 2453 opt: 2453 Z-score: 2396.9 bits: 452.2 E(32554): 3.5e-127
Smith-Waterman score: 2453; 100.0% identity (100.0% similar) in 374 aa overlap (1-374:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 STFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 STFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFIVKT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 LVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKTV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS52 TEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQT
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE1 SETADNDNASSFTM
::::::::::::::
CCDS52 SETADNDNASSFTM
370
>>CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (372 aa)
initn: 539 init1: 317 opt: 955 Z-score: 942.8 bits: 183.1 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (13-373:20-371)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFSRLFVPI
: : ... ::. :: .. ::: ..::.:. :.::
CCDS77 MKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPI
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 AYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAW
::.:: ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: : :. .:
CCDS77 MYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS-AAKSW
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 VFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVV
::. :::. .:: ..: ::::: :::.:::.:::::... : :.:.: ::. :. .
CCDS77 VFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KE1 WGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMF
: :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....::..::.
CCDS77 WILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLA
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 MIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSC
: ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::.. . .:
CCDS77 MSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTC
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 QSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSC
. : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. .. . ::
CCDS77 ELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSC
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE1 AGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
:. :..: ... .....:.
CCDS77 --RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 (378 aa)
initn: 539 init1: 317 opt: 955 Z-score: 942.7 bits: 183.1 E(32554): 3.4e-46
Smith-Waterman score: 955; 42.1% identity (73.0% similar) in 366 aa overlap (13-373:26-377)
10 20 30 40
pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEML--LCSLQEVRQFS
: : ... ::. :: .. ::: ..::.:.
CCDS11 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTT---VDYTLFESLCSKKDVRNFK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 RLFVPIAYSLICVFGLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVS
:.:: ::.:: ::::: :::.:. ..:. ..:::.::::.:.:::::.::::::: :
CCDS11 AWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYS
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 HATGAWVFSNATCKLLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSK
:. .:::. :::. .:: ..: ::::: :::.:::.:::::... : :.:.: ::
CCDS11 -AAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 IICLVVWGLSVIISSSTFVFN--QKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLELLFGF
. :. .: :....: .... :. ... . : . ..: .. . . ....::
CCDS11 LSCVGIWILATVLSIPELLYSDLQRSSSEQAMRC----SLITEHVEAFITIQVAQMVIGF
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 FIPLMFMIFCYTFIVKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLG
..::. : ::: :..::.::.: .:.:::.::::::.::.. :.:.: :.:. :.::..
CCDS11 LVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFN
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 KMNRSCQSEKLIGYTKTVTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYK
. .:. : .. . :: :: ..::.:: :::::: :::: ..:..::: :. ..
CCDS11 ITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQL
300 310 320 330 340 350
350 360 370
pF1KE1 SSGFSCAGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
. :: :. :..: ... .....:.
CCDS11 RQWSSC--RHI----RRSSMSVEAETTTTFSP
360 370
>>CCDS2656.1 CCR4 gene_id:1233|Hs108|chr3 (360 aa)
initn: 887 init1: 367 opt: 880 Z-score: 870.2 bits: 169.6 E(32554): 3.8e-42
Smith-Waterman score: 880; 41.5% identity (74.4% similar) in 328 aa overlap (6-332:1-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVNTSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVFG
:: .:. :.. : :. ..:: .: :. . .. :..::.: :::. :::
CCDS26 MNPTDIADTTLDE--SIYSNYYLYESIPKPCTKEGIKAFGELFLPPLYSLVFVFG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCKL
:::: .::... ::. ::::::::::.::.:.:::..::::. .:. :::. . ::.
CCDS26 LLGNSVVVLVLFKYKRLRSMTDVYLLNLAISDLLFVFSLPFWGY-YAADQWVFGLGLCKM
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 LKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIISS
.. .: ..: :.... .:.:::.:::.:. : ::.::: . : :..:...:. :
CCDS26 ISWMYLVGFYSGIFFVMLMSIDRYLAIVHAV--FSLRARTLTYGVITSLATWSVAVFASL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230
pF1KE1 STFVFNQKYNTQGSDVCEPKYQTVSEPIRWKLLMLGLEL-LFGFFIPLMFMIFCYTFIVK
:.:. :. .. :. ::. : ::.: .::. ..:. ::: .:.:::..:..
CCDS26 PGFLFSTCYTERNHTYCKTKYSLNSTT--WKVLS-SLEINILGLVIPLGIMLFCYSMIIR
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 TLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLVTAANLGKMNRSCQSEKLIGYTKT
:: . .: :..::...:.:::..::. :.:.::.. . .. ..: :. . :.
CCDS26 TLQHCKNEKKNKAVKMIFAVVVLFLGFWTPYNIVLFLETLVELEVLQDCTFERYLDYAIQ
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 VTEVLAFLHCCLNPVLYAFIGQKFRNYFLKILKDLWCVRRKYKSSGFSCAGRYSENISRQ
.::.:::.::::::..: :.:.:::.:.:...:
CCDS26 ATETLAFVHCCLNPIIYFFLGEKFRKYILQLFKTCRGLFVLCQYCGLLQIYSADTPSSSY
290 300 310 320 330 340
360 370
pF1KE1 TSETADNDNASSFTM
CCDS26 TQSTMDHDLHDAL
350 360
>>CCDS2409.1 CXCR1 gene_id:3577|Hs108|chr2 (350 aa)
initn: 808 init1: 232 opt: 877 Z-score: 867.5 bits: 169.1 E(32554): 5.4e-42
Smith-Waterman score: 877; 42.5% identity (75.5% similar) in 327 aa overlap (9-331:2-320)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MSGESMNFSDVFDSSEDYFVSVN-TSYYSVDSEMLLCSLQEVRQFSRLFVPIAYSLICVF
:.. : . : ..: :.. .: .. : : :.. ... : :::.:. ..
CCDS24 MSNITDPQMWDFDDLNFTGMPPADEDYSPCML-ETETLNKYVVIIAYALVFLL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 GLLGNILVVITFAFYKKARSMTDVYLLNMAIADILFVLTLPFWAVSHATGAWVFSNATCK
.:::: ::.... . . .::.:::::::.:.::.::.::::.::.:...: :.:.. ::
CCDS24 SLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIFGTFLCK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 LLKGIYAINFNCGMLLLTCISMDRYIAIVQATKSFRLRSRTLPRSKIICLVVWGLSVIIS
... . .:: :.:::.:::.:::.:::.::... . . . :..:: ::::. .:
CCDS24 VVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRHLV---KFVCLGCWGLSMNLS
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 SSTFVFNQKYNTQGSD-VCEPKYQTV-SEPIRWKLLMLGLELLFGFFIPLMFMIFCYTFI
:.: : :. ..:. :: :... .. .:.... : :::..::. :.::: :
CCDS24 LPFFLFRQAYHPNNSSPVC---YEVLGNDTAKWRMVLRILPHTFGFIVPLFVMLFCYGFT
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 VKTLVQAQNSKRHKAIRVIIAVVLVFLACQIPHNMVLLV-TAANLGKMNRSCQSEKLIGY
..:: .:. ...:.:.:::.::::.:: : .:.:.:::. : ...::. .. ::
CCDS24 LRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQESCERRNNIGR
230 240 250 260 270 280
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CCDS24 ALDATEILGFLHSCLNPIIYAFIGQNFRHGFLKILAMHGLVSKEFLARHRVTSYTSSSVN
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360 370
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CCDS24 VSSNL
350
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CCDS24 MEDFNMESDSFEDFWKGEDLSNYSYSSTLPPFLLDAAPCE-PESLEINKYFVVIIY
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CCDS24 ALVFLLSLLGNSLVMLVILYSRVGRSVTDVYLLNLALADLLFALTLPIWAASKVNG-WIF
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CCDS24 GTFLCKVVSLLKEVNFYSGILLLACISVDRYLAIVHATRTLTQKRYLV---KFICLSIWG
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CCDS24 LSLLLALPVLLFRRTVYSSNVSPAC---YEDMGNNTANWRMLLRILPQSFGFIVPLLIML
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CCDS24 FCYGFTLRTLFKAHMGQKHRAMRVIFAVVLIFLLCWLPYNLVLLADTLMRTQVIQETCER
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CCDS24 RNHIDRALDATEILGILHSCLNPLIYAFIGQKFRHGLLKILAIHGLISKDSLPKDSRPSF
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CCDS24 VGSSSGHTSTTL
350 360
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CCDS27 TIWVLAAALCIPEILYSQIKEESGIAICTMVYPS-DESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVV
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CCDS27 MACCYTIIIHTLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNC
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CCDS27 AVSTNIDICFQVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRR
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pF1KE1 AGRYSENISRQTSETADNDNASSFTM
CCDS27 EGSLKLSSMLLETTSGALSL
350 360
>>CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 (357 aa)
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10 20 30 40 50
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CCDS27 MADDYGSESTSSMEDY-VNFNFTDFY--------CEKNNVRQFASHFLPPLYWLVFIV
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CCDS27 GALGNSLVILVYWYCTRVKTMTDMFLLNLAIADLLFLVTLPFWAIA-AADQWKFQTFMCK
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CCDS27 VVNSMYKMNFYSCVLLIMCISVDRYIAIAQAMRAHTWREKRLLYSKMVCFTIWVLAAALC
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CCDS27 IPEILYSQIKEESGIAICTMVYPS-DESTKLKSAVLTLKVILGFFLPFVVMACCYTIIIH
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CCDS27 TLIQAKKSSKHKALKVTITVLTVFVLSQFPYNCILLVQTIDAYAMFISNCAVSTNIDICF
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CCDS27 QVTQTIAFFHSCLNPVLYVFVGERFRRDLVKTLKNLGCISQAQWVSFTRREGSLKLSSML
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pF1KE1 QTSETADNDNASSFTM
CCDS27 LETTSGALSL
350
>>CCDS14416.1 CXCR3 gene_id:2833|Hs108|chrX (368 aa)
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CCDS14 RAFLPALYSLLFLLGLLGNGAVAAVLLSRRTALSSTDTFLLHLAVADTLLVLTLPLWAVD
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CCDS14 AAV-QWVFGSGLCKVAGALFNINFYAGALLLACISFDRYLNIVHATQLYR---RGPPARV
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CCDS14 LPLLVMAYCYAHILAVLLVSRGQRRLRAMRLVVVVVVAFALCWTPYHLVVLVDILMDLGA
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CCDS14 LARNCGRESRVDVAKSVTSGLGYMHCCLNPLLYAFVGVKFRERMWMLLLRLGCPNQRGLQ
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CCDS14 RQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
350 360
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CCDS48 LYTAPSSPFPPSQVSDHQVLNDAEVAALLENFSSSYDYGENESDSCCTSPP--------C
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:
CCDS48 GCPNQRGLQRQPSSSRRDSSWSETSEASYSGL
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374 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:15:46 2016 done: Sun Nov 6 22:15:47 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]