Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1369
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1369, 538 aa
1>>>pF1KE1369 538 - 538 aa - 538 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1668+/-0.000944; mu= -5.9630+/- 0.057
mean_var=348.3393+/-72.848, 0's: 0 Z-trim(117.0): 103 B-trim: 170 in 1/50
Lambda= 0.068718
statistics sampled from 17572 (17677) to 17572 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.815), E-opt: 0.2 (0.543), width: 16
Scan time: 4.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9581.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 ( 538) 3872 397.4 2.3e-110
CCDS59375.1 WTIP gene_id:126374|Hs108|chr19 ( 430) 1149 127.3 3.5e-29
CCDS2729.1 LIMD1 gene_id:8994|Hs108|chr3 ( 676) 1123 124.9 3e-28
CCDS9582.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 ( 121) 945 106.7 1.6e-23
CCDS3291.1 LPP gene_id:4026|Hs108|chr3 ( 612) 851 97.9 3.6e-20
CCDS5708.1 TRIP6 gene_id:7205|Hs108|chr7 ( 476) 812 93.9 4.4e-19
CCDS5883.1 ZYX gene_id:7791|Hs108|chr7 ( 572) 686 81.5 2.9e-15
CCDS30609.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 ( 276) 620 74.7 1.5e-13
CCDS163.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 ( 373) 616 74.4 2.6e-13
>>CCDS9581.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 (538 aa)
initn: 3872 init1: 3872 opt: 3872 Z-score: 2094.9 bits: 397.4 E(32554): 2.3e-110
Smith-Waterman score: 3872; 100.0% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MERLGEKASRLLEKFGRRKGESSRSGSDGTPGPGKGRLSGLGGPRKSGPRGATGGPGDEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MERLGEKASRLLEKFGRRKGESSRSGSDGTPGPGKGRLSGLGGPRKSGPRGATGGPGDEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LEPAREQGSLDAERNQRGSFEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLPQSLPPDFRLEPTAPALSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LEPAREQGSLDAERNQRGSFEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLPQSLPPDFRLEPTAPALSP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RSSFASSSASDASKPSSPRGSLLLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQRHGSPLPAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RSSFASSSASDASKPSSPRGSLLLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQRHGSPLPAG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 PCLFGPPLAGAPAGYSPGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PCLFGPPLAGAPAGYSPGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 LAGAGVGAAGPLERRGAQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 LAGAGVGAAGPLERRGAQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PSGIEPSGLEEPPGPFVPEAARARMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 PSGIEPSGLEEPPGPFVPEAARARMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 TQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 SYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 SYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KE1 RVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 RVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
490 500 510 520 530
>>CCDS59375.1 WTIP gene_id:126374|Hs108|chr19 (430 aa)
initn: 1252 init1: 1095 opt: 1149 Z-score: 637.3 bits: 127.3 E(32554): 3.5e-29
Smith-Waterman score: 1199; 44.2% identity (58.4% similar) in 498 aa overlap (40-535:26-422)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 RLLEKFGRRKGESSRSGSDGTPGPGKGRLSGLGGPRKSGPRGATGGPGDE--PLEPAREQ
: :.: . : :: ::::: : : .
CCDS59 MQRSRAGADEAALLLAGLALRELEPGCGSPGR-GRRGPRPGPGDEAAPALGRRGK
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 GSLDAERNQRGSFEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLPQSLPPDFRLEPTAPALSPRSSFASS
:: : . : .. : :: : .:. . :: :::.:.:.:
CCDS59 GSGGPEAGADGLSRGER-------GP---RRAAVPEL--------SAQPAGSPRASLAGS
60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SASDASKPSSPRGSLLLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQRHGSPLPAGPCLFGPP
::.:.:: : :.::::.::::::::: .: . :
CCDS59 -----------------DGGGGGG-------SARSSGISLGYDQRHGSPR-SGR---SDP
100 110 120
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LAGAPAGYSPGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGALAGAGVG
: :: : . : .: : . :: :: :
CCDS59 RPG------PG--------------------PPSVGSARSSVSSLGSRGSAGAYADFLPP
130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 AAGPLERRGAQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGEPSGIEPS
.: : :. .:. : . . : : : :::.: ::
CCDS59 GACPAPARSPEPA-----GPAPFPLPA---------LPLP---PGREGG---------PS
170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GLEEPPGPFVPEAARARMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYHTQCFVCC
. :. .. : :: : .. .:::: ::::. :::: ..::::. :::::.::.:
CCDS59 AAERRLEALTRELERA--LEARTARDYFGICIKCGLGIYGAQQACQAMGSLYHTDCFTCD
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCF
:::: :: ::::.:. .:::.::.:.::::..:.:: ::::::.: ::::.:::::::::
CCDS59 SCGRRLRGKAFYNVGEKVYCQEDFLYSGFQQTADKCSVCGHLIMEMILQALGKSYHPGCF
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 RCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDR
:: :::.::::.::::: :..::: ::: .:::::.:..::::..::: .::.::::
CCDS59 RCSVCNECLDGVPFTVDVENNIYCVRDYHTVFAPKCASCARPILPAQGCETTIRVVSMDR
320 330 340 350 360 370
490 500 510 520 530
pF1KE1 DYHFECYHCEDCRMQLSDEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
::: ::::::: .::: ::: :.:: :::::. ::..::. :.
CCDS59 DYHVACYHCEDCGLQLSGEEGRRCYPLAGHLLCRRCHLRRLQPGPLPSPTVHVTEL
380 390 400 410 420 430
>>CCDS2729.1 LIMD1 gene_id:8994|Hs108|chr3 (676 aa)
initn: 1211 init1: 1094 opt: 1123 Z-score: 620.7 bits: 124.9 E(32554): 3e-28
Smith-Waterman score: 1189; 39.8% identity (64.9% similar) in 490 aa overlap (79-531:184-665)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 PRGATGGPGDEPLEPAREQGSLDAERNQRGSFEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLPQSLPPD
:. .:.. :. : : :. .: . .. : .
CCDS27 LATSEMSAFHQPGPCEDPSCLTHGDYYDNLSLASPKW-GDKP-GVSPSIGLSVGSGWPSS
160 170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 FRLEPTAPALSPRSSFASSSASDASKPSSPRGSLLLDGAGAGGAGGSRPC----SNRTSG
.: : . . : .:. :: .::: ...: :: .. .: . ..
CCDS27 PGSDPPLPKPCGDHPLNHRQLSLSSSRSS-EGSLGGQNSGIGGRSSEKPTGLWSTASSQR
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210
pF1KE1 ISMGY---DQRHGSPLPAGPCLFGPPLAGAPAGYS-P--GGVPSAYPELHAALDRLYAQR
.: : . ..:.: .:: : ..:: . : : ::.: . : . .. ... .
CCDS27 VSPGLPSPNLENGAP-AVGPVQPRTPSVSAPLALSCPRQGGLPRSNSGLGGEVSGVMS-K
280 290 300 310 320
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PAGFGCQESRHSYPPALGSPGALAGAGVGAAGPLERRGAQPGRHSVTGYGDCAVGARYQD
: . : .. : . : .: ... .: : ..:: :: : : ..: . .
CCDS27 P-NVDPQPWFQDGPKSYLSSSAPSSSPAGLDG--SQQGAVPGLGPKPGCTDLGTGPKLSP
330 340 350 360 370 380
280 290 300 310 320
pF1KE1 E------LTALLRLTVGTGGREAGARGEPSGI---EPSG--LEEP-----PGPFV-PEAA
...: .:. : .. : ... ::. .. : ::: . : ::
CCDS27 TSLVHPVMSTLPELSCKEGPLGWSSDGSLGSVLLDSPSSPRVRLPCQPLVPGPELRPSAA
390 400 410 420 430 440
330 340 350 360 370
pF1KE1 RARM--------REPEA--REDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYHTQCFVCCSCGR
. .. :: .: . ::::.:.::.::..: ..::::. .::: ::.: .:.:
CCDS27 ELKLEALTQRLEREMDAHPKADYFGACVKCSKGVFGAGQACQAMGNLYHDTCFTCAACSR
450 460 470 480 490 500
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 TLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCFRCIV
:: :::: :::.:.::::.:.::::..:..: .:::::.. ::::.:::::::::::..
CCDS27 KLRGKAFYFVNGKVFCEEDFLYSGFQQSADRCFLCGHLIMDMILQALGKSYHPGCFRCVI
510 520 530 540 550 560
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 CNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHF
::.::::.::::: :..::: :::: :::::::: :::: :: .. .::.:::::::
CCDS27 CNECLDGVPFTVDSENKIYCVRDYHKVLAPKCAACGLPILPPEGSDETIRVVSMDRDYHV
570 580 590 600 610 620
500 510 520 530
pF1KE1 ECYHCEDCRMQLSDEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
:::::::: ..:.::.: :.::. ::.::.::..::. :
CCDS27 ECYHCEDCGLELNDEDGHRCYPLEDHLFCHSCHVKRLEKRPSSTALHQHHF
630 640 650 660 670
>>CCDS9582.1 AJUBA gene_id:84962|Hs108|chr14 (121 aa)
initn: 945 init1: 945 opt: 945 Z-score: 535.6 bits: 106.7 E(32554): 1.6e-23
Smith-Waterman score: 945; 100.0% identity (100.0% similar) in 121 aa overlap (418-538:1-121)
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 EEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 MGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSN
10 20 30
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 QVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 QVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEE
40 50 60 70 80 90
510 520 530
pF1KE1 GCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS95 GCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
100 110 120
>>CCDS3291.1 LPP gene_id:4026|Hs108|chr3 (612 aa)
initn: 804 init1: 551 opt: 851 Z-score: 475.5 bits: 97.9 E(32554): 3.6e-20
Smith-Waterman score: 884; 31.0% identity (56.6% similar) in 542 aa overlap (4-528:94-601)
10 20 30
pF1KE1 MERLGEKASRLLEKFGRRKGESSRSGSDGTPGP
: :.: .. . : . : ::. :.
CCDS32 EGDFLPPPPPPLDDSSALPSISGNFPPPPPLDEEAFKVQGNPGGKTLEERRSSLDAEIDS
70 80 90 100 110 120
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 GKGRLSGL--GGPRKS-GPRGATGGPGDEPLEPAREQGSLDAERNQRGSFEAPRYEGSFP
. :. : ..: : :...::. .. :. : . ..: . :
CCDS32 LTSILADLECSSPYKPRPPQSSTGSTASPPV-------STPVTGHKR--MVIPNQPPLTA
130 140 150 160 170
100 110 120 130 140
pF1KE1 AGPPPTRALPLPQSLPPDFRLEPTAP--ALSPRSSFASSSASDASKPSSPRGSLLLDGAG
. . : ::. : :.:: .:.:. . . .: . :: : : .. . .:
CCDS32 TKKSTLKPQPAPQAGPI-----PVAPIGTLKPQPQPVPASYTTASTSSRPTFNVQVKSAQ
180 190 200 210 220
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 AGGAGGSRPCSNRTSGIS-MGYDQRHGSPLP-AGPCLFGPPLAGAPAGYS----PGGVPS
. . : :.. : . .::. . :.: .: : :: . . :. :: :
CCDS32 PSPHYMAAPSSGQIYGSGPQGYNTQ---PVPVSGQC--PPPSTRGGMDYAYIPPPGLQPE
230 240 250 260 270 280
210 220 230 240 250
pF1KE1 -AY---PELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPG--ALAGAGVGAAGPLERRG
.: :. . :: : :.: .:.. :. :. : : . :
CCDS32 PGYGYAPNQGRYYEGYYAAGP-GYG---GRNDSDPTYGQQGHPNTWKREPGYTPPGAGNQ
290 300 310 320 330 340
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGEPSGIEPSGLEEPPGPF
:: . ::: . : ..: . : ..: : ::.. :: :
CCDS32 NPPGMYPVTGPKKTYI----TDPVSAPCAPPLQPKGGHSGQLG-PSSVAPSFRPEDELEH
350 360 370 380 390
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 VPEAARARMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYHTQCFVCCSCGRTLRCK
. . :..: : : ::: : .:.... :....: :.:...:..::.: :. :: .
CCDS32 LTKKMLYDMENPPADE-YFGRCARCGENVVGEGTGCTAMDQVFHVDCFTCIICNNKLRGQ
400 410 420 430 440 450
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 AFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCFRCIVCNKCL
::.:. ..::: :. .. :.: ::.. :.:.::.: ::.::: :: :..:.. :
CCDS32 PFYAVEKKAYCEPCYI-----NTLEQCNVCSKPIMERILRATGKAYHPHCFTCVMCHRSL
460 470 480 490 500
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 DGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHFECYHC
:::::::: .. ..:. :.::..::.:..: .::.:. : :. ::....:::.: .::.:
CCDS32 DGIPFTVDAGGLIHCIEDFHKKFAPRCSVCKEPIMPAPGQEETVRIVALDRDFHVHCYRC
510 520 530 540 550 560
500 510 520 530
pF1KE1 EDCRMQLSDEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
::: ::. .. :.:::::.::. :. :.
CCDS32 EDCGGLLSEGDNQGCYPLDGHILCKTCNSARIRVLTAKASTDL
570 580 590 600 610
>>CCDS5708.1 TRIP6 gene_id:7205|Hs108|chr7 (476 aa)
initn: 830 init1: 496 opt: 812 Z-score: 456.1 bits: 93.9 E(32554): 4.4e-19
Smith-Waterman score: 839; 35.1% identity (56.3% similar) in 510 aa overlap (51-528:3-465)
30 40 50 60 70
pF1KE1 ESSRSGSDGTPGPGKGRLSGLGGPRKSGPRGATGGPGDEPLEPARE-QGSLDAERNQRGS
: : : .: :::: :: . ::.
CCDS57 MSGPTWLPPKQP-EPARAPQG----RAIPRGT
10 20
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 FEAPRYEGSFPAGPPPTRALPLP--QSLPPDFRLEPTAPA-LSPRSSFASSSASDASKPS
: .:. : . ::: : : .:: .. .. . ... :.. .
CCDS57 PGPPPAHGAALQPHPRVNFCPLPSEQCYQAPGGPEDRGPAWVGSHGVLQHTQGLPADRGG
30 40 50 60 70 80
140 150 160 170 180
pF1KE1 SPRGSL-----LLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQ------RHGS--PLPAGPCL
::: ::... : :: : : . ..:. : :: : ::.: :
CCDS57 LRPGSLDAEIDLLSSTLAELNGGRGHASRRPD--RQAYEPPPPPAYRTGSLKPNPASP-L
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 FGPPLAG-APAGYSPGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGALA
. : .: .::.:. ...: : : . . .. . .:. :: :: :. : .
CCDS57 PASPYGGPTPASYTTASTP-AGPAFPV---QVKVAQPVR-GCG------PPRRGASQA-S
150 160 170 180 190
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 GAGVGAAGPLERRGAQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGRE--AGARGE
: : :: ::: : : : : : : : :..: ::. :
CCDS57 GPLPGPHFPL------PGRGEVWGPG-----YRSQRE--------PGPGAKEEAAGVSG-
200 210 220 230
310 320 330 340 350
pF1KE1 PSGIEPSGLEEPPGPFV--PEAARAR--------MREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSN
:.: .: . : :. :: : : .: . : ::: : :.. . :..
CCDS57 PAGRGRGGEHGPQVPLSQPPEDELDRLTKKLVHDMNHPPSGE-YFGQCGGCGEDVVGDGA
240 250 260 270 280 290
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 ACQALDSLYHTQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLI
. ::: ..:. :::: .: :: . ::.:. .::: :. . ::: .:.. :
CCDS57 GVVALDRVFHVGCFVCSTCRAQLRGQHFYAVERRAYCEGCYVAT-----LEKCATCSQPI
300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 LEKILQAMGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPI
:..::.::::.:::::: :.::.. ::::::::: ..:..:. :.:...::.:..:: :
CCDS57 LDRILRAMGKAYHPGCFTCVVCHRGLDGIPFTVDATSQIHCIEDFHRKFAPRCSVCGGAI
350 360 370 380 390 400
480 490 500 510 520
pF1KE1 LPSEGCEDIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDEEGCC--CFPLDGHLLCHGCHMQRL
.: : :. ::....::..:. ::.::.: . ::.: : : :.:::::.::..: :.
CCDS57 MPEPGQEETVRIVALDRSFHIGCYKCEECGLLLSSE-GECQGCYPLDGHILCKACSAWRI
410 420 430 440 450 460
530
pF1KE1 NARQPPANYI
CCDS57 QELSATVTTDC
470
>>CCDS5883.1 ZYX gene_id:7791|Hs108|chr7 (572 aa)
initn: 787 init1: 449 opt: 686 Z-score: 387.5 bits: 81.5 E(32554): 2.9e-15
Smith-Waterman score: 755; 31.1% identity (52.3% similar) in 572 aa overlap (13-527:24-569)
10 20 30 40
pF1KE1 MERLGEKASRLLEKFG-----RRKGESSRSG-SDGTPGPGKGRLS-GLG
.::: . : . : : :. :.:: : . :
CCDS58 MAAPRPSPAISVSVSAPAFYAPQKKFGPVVAPKPKVNPFRPGDSEPPPAPGAQRAQMGRV
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE1 GPRKSGPRGATGGPGDEPLEPAREQGSLD-AERNQRGSFEAPR--YEGSFPAGPPPTRAL
: : : : :: : :. : :: :.: : : ::: .: . .
CCDS58 GEIPPPP------PEDFPLPPPPLAGDGDDAEGALGGAFPPPPPPIEESFPPAPLEEEIF
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 PLPQSLPPDFRLEPTAPALSPRSSFASSSASDASKPSSPRGSLLLDGAGAGGAGGSR---
: : ::. . : :: : . . :. : : : ::: . .:
CCDS58 PSPPP-PPEEEGGPEAPIPPPPQPREKVSSIDLEIDSL---SSLLDDMTKNDPFKARVSS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KE1 -----PCSNRTSGISMGYDQRHGS-PLPA--GPCLFGP-PLAGAPA-GYSPGGV-PSAYP
: .. :. : :. ::: .: : : . ::: . . : :. :
CCDS58 GYVPPPVATPFSSKSSTKPAAGGTAPLPPWKSPSSSQPLPQVPAPAQSQTQFHVQPQPQP
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 ELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGALAGAGVGAAGPLERRGAQPGRHSVT
. .. : .:.... . : ::: .:: : . .:. . : . .
CCDS58 KPQVQLHVQSQTQPVSLANTQPRG--PPA-SSP-----APAPKFSPVTPK-FTPVASKFS
240 250 260 270 280
270 280 290 300 310
pF1KE1 GYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGRE------AGARGEPS------GIEPSGLEE--
. . :.. ...: :..:::. . : : .: . : . ..
CCDS58 PGAPGGSGSQPNQKLGHPEALSAGTGSPQPPSFTYAQQREKPRVQEKQHPVPPPAQNQNQ
290 300 310 320 330 340
320 330 340 350
pF1KE1 ---P--PGPF----VPEAARAR------MREPEAREDYFGT-CIKCNKGIYGQSNACQAL
: :::. : : . :..:. .. . : .:.. . . : .::
CCDS58 VRSPGAPGPLTLKEVEELEQLTQQLMQDMEHPQRQNVAVNELCGRCHQPLARAQPAVRAL
350 360 370 380 390 400
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 DSLYHTQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKIL
.:.: ::.: .:.. :. . :::..:. ::: : .. ::: .::. : ...:
CCDS58 GQLFHIACFTCHQCAQQLQGQQFYSLEGAPYCEGCYT-----DTLEKCNTCGEPITDRML
410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 QAMGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEG
.: ::.::: :: :.:: . :.: : :: .:. .:: ::::.:::.:..:..::.: :
CCDS58 RATGKAYHPHCFTCVVCARPLEGTSFIVDQANRPHCVPDYHKQYAPRCSVCSEPIMPEPG
460 470 480 490 500 510
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 CEDIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLS---DEEGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQ
.. :::...:...:..::.:::: :: :..: :::::::.::. :: :
CCDS58 RDETVRVVALDKNFHMKCYKCEDCGKPLSIEADDNG--CFPLDGHVLCRKCHTARAQT
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 PPANYI
>>CCDS30609.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 (276 aa)
initn: 474 init1: 299 opt: 620 Z-score: 356.5 bits: 74.7 E(32554): 1.5e-13
Smith-Waterman score: 620; 35.7% identity (64.7% similar) in 235 aa overlap (301-530:48-273)
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 AVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARGEPSGIEPSGLEEPPGPFVPEAARARMREPEA
: .:: :.:.. . :: : :
CCDS30 APPRRDVAVAEEVRQAVCEARRGRPWEAPAPMKTPEAGLAGRPSPWTTPG-RAAATVPAA
20 30 40 50 60 70
340 350 360 370 380
pF1KE1 REDYFG--TCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYHTQCFVCCSCGRTLRCKAFYSVNGSVYCE
. :. : :.: . . : .:. ::.:::.: .: : : ..::. .: ::
CCDS30 PMQLFNGDICAFCHKTVSPRELAVEAMKRQYHAQCFTCRTCRRQLAGQSFYQKDGRPLCE
80 90 100 110 120 130
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 EDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCFRCIVCNKCLDGIPFTVDFSNQ
: :.. :.: ::... ..:..:.:...::.:: :..: .:. :.. .:.
CCDS30 PCY-----QDTLERCGKCGEVVRDHIIRALGQAFHPSCFTCVTCARCIGDESFALGSQNE
140 150 160 170 180 190
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 VYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHFECYHCEDCRMQLSDE--
:::. :.....:: :. : .::.: .: .: .. : :..: .::.:::::. :: :
CCDS30 VYCLDDFYRKFAPVCSICENPIIPRDG-KDAFKIECMGRNFHENCYRCEDCRILLSVEPT
200 210 220 230 240 250
510 520 530
pF1KE1 -EGCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
.:: .::..::.:. ::..: :
CCDS30 DQGC--YPLNNHLFCKPCHVKRSAAGCC
260 270
>>CCDS163.1 FBLIM1 gene_id:54751|Hs108|chr1 (373 aa)
initn: 532 init1: 299 opt: 616 Z-score: 352.6 bits: 74.4 E(32554): 2.6e-13
Smith-Waterman score: 637; 31.2% identity (55.7% similar) in 368 aa overlap (170-530:36-370)
140 150 160 170 180 190
pF1KE1 GSLLLDGAGAGGAGGSRPCSNRTSGISMGYDQRHGSPLPAGPCLFGPP--LAGAPAGYS-
. :.: : : . : ::: :. ..
CCDS16 EKRVASSVFITLAPPRRDVAVAEEVRQAVCEARRGRPWEAPAPMKTPEAGLAGRPSPWTT
10 20 30 40 50 60
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 PGGVPSAYPELHAALDRLYAQRPAGFGCQESRHSYPPALGSPGALAGAGVGAAGPLERRG
:: . .. : :: .:. : :: ::.: . .: . :
CCDS16 PGRAAATVP---AAPMQLF----NG-GCPPP----PPVLDGEDVLPDLDLLPPPPPPPPV
70 80 90 100 110
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 AQPGRHSVTGYGDCAVGARYQDELTALLRLTVGTGGREAGARG---EPSGIEPSGLEEPP
:... . . .:: .: : .:. .: :.: .:. ..: : ::
CCDS16 LLPSEEEAPA----PMGASLIADLEQL-HLSPPPPPPQAPAEGPSVQPGPLRPMEEELPP
120 130 140 150 160
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GPFVPEAARARMREPEAREDYFGTCIKCNKGIYGQSNACQALDSLYHTQCFVCCSCGRTL
: : : : : : :.: . . : .:. ::.:::.: .: : :
CCDS16 PPAEPV-------EKGASTDI---CAFCHKTVSPRELAVEAMKRQYHAQCFTCRTCRRQL
170 180 190 200 210
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 RCKAFYSVNGSVYCEEDYLFSGFQEAAEKCCVCGHLILEKILQAMGKSYHPGCFRCIVCN
..::. .: :: : :.. :.: ::... ..:..:.:...::.:: :..:
CCDS16 AGQSFYQKDGRPLCEPCY-----QDTLERCGKCGEVVRDHIIRALGQAFHPSCFTCVTCA
220 230 240 250 260 270
440 450 460 470 480 490
pF1KE1 KCLDGIPFTVDFSNQVYCVTDYHKNYAPKCAACGQPILPSEGCEDIVRVISMDRDYHFEC
.:. :.. .:.:::. :.....:: :. : .::.: .: .: .. : :..: .:
CCDS16 RCIGDESFALGSQNEVYCLDDFYRKFAPVCSICENPIIPRDG-KDAFKIECMGRNFHENC
280 290 300 310 320 330
500 510 520 530
pF1KE1 YHCEDCRMQLSDEE-GCCCFPLDGHLLCHGCHMQRLNARQPPANYI
:.:::::. :: : :.::..::.:. ::..: :
CCDS16 YRCEDCRILLSVEPTDQGCYPLNNHLFCKPCHVKRSAAGCC
340 350 360 370
538 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:13:02 2016 done: Sun Nov 6 23:13:03 2016
Total Scan time: 4.330 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]