Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1352
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1352, 332 aa
1>>>pF1KE1352 332 - 332 aa - 332 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.2532+/-0.000411; mu= 15.6554+/- 0.025
mean_var=59.9844+/-12.074, 0's: 0 Z-trim(110.4): 21 B-trim: 32 in 1/49
Lambda= 0.165598
statistics sampled from 18690 (18709) to 18690 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.586), E-opt: 0.2 (0.219), width: 16
Scan time: 7.420
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_000104 (OMIM: 128100,605204) torsin-1A precurso ( 332) 2208 536.3 3.5e-152
NP_055321 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 1 precu ( 336) 1542 377.1 2.8e-104
XP_005251984 (OMIM: 608050) PREDICTED: torsin-1B i ( 291) 1107 273.2 4.8e-73
NP_001078816 (OMIM: 608052) prosalusin isoform a p ( 321) 919 228.3 1.7e-59
NP_001304822 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 2 pr ( 216) 910 226.1 5.4e-59
XP_011516856 (OMIM: 608052) PREDICTED: prosalusin ( 320) 911 226.4 6.4e-59
NP_071766 (OMIM: 607555) torsin-3A precursor [Homo ( 397) 844 210.4 5.1e-54
NP_001304823 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 3 pr ( 159) 575 146.0 5.1e-35
NP_001127902 (OMIM: 608052) prosalusin isoform c p ( 242) 565 143.7 3.9e-34
NP_569726 (OMIM: 608052) prosalusin isoform b prec ( 253) 565 143.7 4e-34
NP_001238950 (OMIM: 608052) prosalusin isoform f [ ( 159) 471 121.1 1.5e-27
NP_001238947 (OMIM: 608052) prosalusin isoform f [ ( 159) 471 121.1 1.5e-27
NP_001245322 (OMIM: 616254,616271) caseinolytic pe ( 648) 144 43.3 0.0017
NP_001245323 (OMIM: 616254,616271) caseinolytic pe ( 662) 144 43.3 0.0018
NP_001245321 (OMIM: 616254,616271) caseinolytic pe ( 677) 144 43.3 0.0018
XP_005274377 (OMIM: 616254,616271) PREDICTED: case ( 678) 144 43.3 0.0018
NP_110440 (OMIM: 616254,616271) caseinolytic pepti ( 707) 144 43.3 0.0019
>>NP_000104 (OMIM: 128100,605204) torsin-1A precursor [H (332 aa)
initn: 2208 init1: 2208 opt: 2208 Z-score: 2853.1 bits: 536.3 E(85289): 3.5e-152
Smith-Waterman score: 2208; 99.7% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
:::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 SVSVFNNKNSGFWHSSLIDRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_000 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
310 320 330
>>NP_055321 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 1 precursor (336 aa)
initn: 1564 init1: 1453 opt: 1542 Z-score: 1993.1 bits: 377.1 E(85289): 2.8e-104
Smith-Waterman score: 1542; 67.2% identity (89.1% similar) in 329 aa overlap (4-329:9-336)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ
: :.:.::: : :: : :::..:::. :...:::. : .:: ::::: .
NP_055 MLRAGWLRGAAALALLL-AARVVAAFEPITVGLAIGAASAITGYLSYNDIYCRFAECCRE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVS
.: :. ::. ::...::::::: ..:..:. :: :: .::::::::::::.::::::::
NP_055 ERPLNASALKLDLEEKLFGQHLATEVIFKALTGFRNNKNPKKPLTLSLHGWAGTGKNFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEM
.:.:::.. ::.:..:::::.:::::: ..: ::.:::: :::::::::: :.::::::
NP_055 QIVAENLHPKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQKWIRGNVSACANSVFIFDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIK
::.: :.:::::::::::. ::::::.::.::::::::.. :: .::::::.:..::::.
NP_055 DKLHPGIIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLSNAGGDLITKTALDFWRAGRKREDIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEI
:::.: .:::.:::::.::.:::.:: .::::::.:::::::.:.:::.:.::..:: :
NP_055 LKDLEPVLSVGVFNNKHSGLWHSGLIDKNLIDYFIPFLPLEYRHVKMCVRAEMRARGSAI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE1 DEDIVSRVAEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
:::::.::::::::::..:...:::::::: ..::..
NP_055 DEDIVTRVAEEMTFFPRDEKIYSDKGCKTVQSRLDFH
300 310 320 330
>>XP_005251984 (OMIM: 608050) PREDICTED: torsin-1B isofo (291 aa)
initn: 1099 init1: 1018 opt: 1107 Z-score: 1432.5 bits: 273.2 E(85289): 4.8e-73
Smith-Waterman score: 1107; 66.3% identity (87.1% similar) in 249 aa overlap (4-249:9-256)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ
: :.:.::: : :: : :::..:::. :...:::. : .:: ::::: .
XP_005 MLRAGWLRGAAALALLL-AARVVAAFEPITVGLAIGAASAITGYLSYNDIYCRFAECCRE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVS
.: :. ::. ::...::::::: ..:..:. :: :: .::::::::::::.::::::::
XP_005 ERPLNASALKLDLEEKLFGQHLATEVIFKALTGFRNNKNPKKPLTLSLHGWAGTGKNFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEM
.:.:::.. ::.:..:::::.:::::: ..: ::.:::: :::::::::: :.::::::
XP_005 QIVAENLHPKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQKWIRGNVSACANSVFIFDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIK
::.: :.:::::::::::. ::::::.::.::::::::.. :: .::::::.:..::::.
XP_005 DKLHPGIIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLSNAGGDLITKTALDFWRAGRKREDIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEI
:::.: .:::.:::::.
XP_005 LKDLEPVLSVGVFNNKHKFTDLKYTQLKSGLEVQTVSDRRMWPCPPSTLDLS
240 250 260 270 280 290
>>NP_001078816 (OMIM: 608052) prosalusin isoform a precu (321 aa)
initn: 957 init1: 904 opt: 919 Z-score: 1189.0 bits: 228.3 E(85289): 1.7e-59
Smith-Waterman score: 919; 43.4% identity (76.6% similar) in 304 aa overlap (26-329:18-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
NP_001 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
:. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. ..
NP_001 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::.
NP_001 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.::.:.:.:..:::. ::: ..::.: :...: ..
NP_001 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFISNTGGEQINQVALEAWRSRRDREEILLQELEPVI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
: .:..: . :: .:..... :.: ::::::. .:.. :. :. . : : ...:. :
NP_001 SRAVLDNPHHGFSNSGIMEERLLDAVVPFLPLQRHHVRHCVLNELAQLGLEPRDEVVQAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
. ::::..:..::..::::: ... ..
NP_001 LDSTTFFPEDEQLFSSNGCKTVASRIAFFL
300 310 320
>>NP_001304822 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 2 precur (216 aa)
initn: 888 init1: 827 opt: 910 Z-score: 1180.1 bits: 226.1 E(85289): 5.4e-59
Smith-Waterman score: 910; 66.0% identity (85.9% similar) in 206 aa overlap (4-206:9-213)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ
: :.:.::: : :: : :::..:::. :...:::. : .:: ::::: .
NP_001 MLRAGWLRGAAALALLL-AARVVAAFEPITVGLAIGAASAITGYLSYNDIYCRFAECCRE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVS
.: :. ::. ::...::::::: ..:..:. :: :: .::::::::::::.::::::::
NP_001 ERPLNASALKLDLEEKLFGQHLATEVIFKALTGFRNNKNPKKPLTLSLHGWAGTGKNFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEM
.:.:::.. ::.:..:::::.:::::: ..: ::.:::: :::::::::: :.::::::
NP_001 QIVAENLHPKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQKWIRGNVSACANSVFIFDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIK
::.: :.:::::::::::. ::::::.::.::::
NP_001 DKLHPGIIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLRVH
180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEI
>>XP_011516856 (OMIM: 608052) PREDICTED: prosalusin isof (320 aa)
initn: 927 init1: 548 opt: 911 Z-score: 1178.7 bits: 226.4 E(85289): 6.4e-59
Smith-Waterman score: 911; 43.4% identity (76.6% similar) in 304 aa overlap (26-329:18-319)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
XP_011 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
:. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. ..
XP_011 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: ::: :. :..::..::.::.:.::::::: ::.
XP_011 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKD-LKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.::.:...:..:::. ::: ..::.: :...: ..
XP_011 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFISNTGGKQINQVALEAWRSRRDREEILLQELEPVI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
: .:..: . :: .:..... :.: ::::::. .:.. :. :. . : : ...:. :
XP_011 SRAVLDNPHHGFSNSGIMEERLLDAVVPFLPLQRHHVRHCVLNELAQLGLEPRDEVVQAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
. ::::..:..::..::::: ... ..
XP_011 LDSTTFFPEDEQLFSSNGCKTVASRIAFFL
300 310 320
>>NP_071766 (OMIM: 607555) torsin-3A precursor [Homo sap (397 aa)
initn: 838 init1: 456 opt: 844 Z-score: 1090.8 bits: 210.4 E(85289): 5.1e-54
Smith-Waterman score: 844; 39.4% identity (73.0% similar) in 315 aa overlap (20-329:82-395)
10 20 30 40
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAEC
:. :.. : : : . :: : .:
NP_071 LRAAGALSKRYWTLFSCQVWPDDCDEDEEAATGPLGWRLPLLGQRYLDLLTTWYCSFKDC
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 C--GQKR-SLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGT
: :. : : . .:. ::. : ::::.....: .: :....:.:.: :.::.:::.::
NP_071 CPRGDCRISNNFTGLEWDLNVRLHGQHLVQQLVLRTVRGYLETPQPEKALALSFHGWSGT
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 GKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSI
:::::.....::.:. :: :: :..:.::.:::: . . :::.::. :: . . : ...
NP_071 GKNFVARMLVENLYRDGLMSDCVRMFIATFHFPHPKYVDLYKEQLMSQIRETQQLCHQTL
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQK--AMFIFLSNAGAERITDVALDFWRS
::::: .:.: ::.... : :. .: .. ..:.:::: .. :..:.: . ..
NP_071 FIFDEAEKLHPGLLEVLGPHLERRA-PEGHRAESPWTIFLFLSNLRGDIINEVVLKLLKA
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GKQREDIKLKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVE
: .::.: .. .: :.. . .. ..:: :: :...::::::.:::::::.:...: :
NP_071 GWSREEITMEHLEPHLQAEIVETIDNGFGHSRLVKENLIDYFIPFLPLEYRHVRLCARDA
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KE1 MQSRGYEIDEDIVSRVAEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
. :. :. ....:. :.. ::::..::..:::.. ...:.
NP_071 FLSQELLYKEETLDEIAQMMVYVPKEEQLFSSQGCKSISQRINYFLS
360 370 380 390
>>NP_001304823 (OMIM: 608050) torsin-1B isoform 3 precur (159 aa)
initn: 564 init1: 486 opt: 575 Z-score: 749.7 bits: 146.0 E(85289): 5.1e-35
Smith-Waterman score: 575; 58.9% identity (83.4% similar) in 151 aa overlap (4-151:9-158)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ
: :.:.::: : :: : :::..:::. :...:::. : .:: ::::: .
NP_001 MLRAGWLRGAAALALLL-AARVVAAFEPITVGLAIGAASAITGYLSYNDIYCRFAECCRE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVS
.: :. ::. ::...::::::: ..:..:. :: :: .::::::::::::.::::::::
NP_001 ERPLNASALKLDLEEKLFGQHLATEVIFKALTGFRNNKNPKKPLTLSLHGWAGTGKNFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEM
.:.:::.. ::.:..:::::.:::::: ..: ::...:
NP_001 QIVAENLHPKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQSSLT
120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIK
>>NP_001127902 (OMIM: 608052) prosalusin isoform c precu (242 aa)
initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 733.9 bits: 143.7 E(85289): 3.9e-34
Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
NP_001 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
:. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. ..
NP_001 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::.
NP_001 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.
NP_001 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWLLKLGHHGRAPPRRSGALPPAPAAPRPALRAQ
180 190 200 210 220 230
>>NP_569726 (OMIM: 608052) prosalusin isoform b precurso (253 aa)
initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 733.6 bits: 143.7 E(85289): 4e-34
Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
NP_569 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
:. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. ..
NP_569 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::.
NP_569 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.
NP_569 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWGPALQWAQWGGHFSEVQLYSLSLCSQQNPVPH
180 190 200 210 220 230
332 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:34:52 2016 done: Sun Nov 6 23:34:53 2016
Total Scan time: 7.420 Total Display time: 0.030
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]