Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1352
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1352, 332 aa
1>>>pF1KE1352 332 - 332 aa - 332 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4912+/-0.000924; mu= 14.1889+/- 0.055
mean_var=58.2451+/-11.718, 0's: 0 Z-trim(103.6): 20 B-trim: 2 in 1/49
Lambda= 0.168052
statistics sampled from 7490 (7501) to 7490 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.23), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6930.1 TOR1A gene_id:1861|Hs108|chr9 ( 332) 2208 543.9 6.9e-155
CCDS6929.1 TOR1B gene_id:27348|Hs108|chr9 ( 336) 1542 382.4 2.8e-106
CCDS43879.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 321) 914 230.1 1.8e-60
CCDS1329.1 TOR3A gene_id:64222|Hs108|chr1 ( 397) 844 213.2 2.9e-55
CCDS48024.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 242) 565 145.5 4.2e-35
CCDS6876.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 ( 253) 565 145.5 4.4e-35
CCDS7041.1 TOR4A gene_id:54863|Hs108|chr9 ( 423) 269 73.8 2.8e-13
>>CCDS6930.1 TOR1A gene_id:1861|Hs108|chr9 (332 aa)
initn: 2208 init1: 2208 opt: 2208 Z-score: 2894.2 bits: 543.9 E(32554): 6.9e-155
Smith-Waterman score: 2208; 99.7% identity (99.7% similar) in 332 aa overlap (1-332:1-332)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
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CCDS69 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
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CCDS69 SVSVFNNKNSGFWHSSLIDRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
250 260 270 280 290 300
310 320 330
pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS69 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
310 320 330
>>CCDS6929.1 TOR1B gene_id:27348|Hs108|chr9 (336 aa)
initn: 1564 init1: 1453 opt: 1542 Z-score: 2021.5 bits: 382.4 E(32554): 2.8e-106
Smith-Waterman score: 1542; 67.2% identity (89.1% similar) in 329 aa overlap (4-329:9-336)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLAL--AGVLTGYI-YPRLYCLFAECCGQ
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CCDS69 MLRAGWLRGAAALALLL-AARVVAAFEPITVGLAIGAASAITGYLSYNDIYCRFAECCRE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 KRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVS
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CCDS69 ERPLNASALKLDLEEKLFGQHLATEVIFKALTGFRNNKNPKKPLTLSLHGWAGTGKNFVS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEM
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CCDS69 QIVAENLHPKGLKSNFVHLFVSTLHFPHEQKIKLYQDQLQKWIRGNVSACANSVFIFDEM
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIK
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CCDS69 DKLHPGIIDAIKPFLDYYEQVDGVSYRKAIFIFLSNAGGDLITKTALDFWRAGRKREDIQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEI
:::.: .:::.:::::.::.:::.:: .::::::.:::::::.:.:::.:.::..:: :
CCDS69 LKDLEPVLSVGVFNNKHSGLWHSGLIDKNLIDYFIPFLPLEYRHVKMCVRAEMRARGSAI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330
pF1KE1 DEDIVSRVAEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
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CCDS69 DEDIVTRVAEEMTFFPRDEKIYSDKGCKTVQSRLDFH
300 310 320 330
>>CCDS43879.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 (321 aa)
initn: 952 init1: 899 opt: 914 Z-score: 1198.9 bits: 230.1 E(32554): 1.8e-60
Smith-Waterman score: 914; 43.1% identity (76.6% similar) in 304 aa overlap (26-329:18-320)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
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CCDS43 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
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CCDS43 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
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CCDS43 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
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CCDS43 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFISNTGGKQINQVALEAWRSRRDREEILLQELEPVI
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRV
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CCDS43 SRAVLDNPHHGFSNSGIMEERLLDAVVPFLPLQRHHVRHCVLNELAQLGLEPRDEVVQAV
240 250 260 270 280 290
310 320 330
pF1KE1 AEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
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CCDS43 LDSTTFFPEDEQLFSSNGCKTVASRIAFFL
300 310 320
>>CCDS1329.1 TOR3A gene_id:64222|Hs108|chr1 (397 aa)
initn: 838 init1: 456 opt: 844 Z-score: 1105.7 bits: 213.2 E(32554): 2.9e-55
Smith-Waterman score: 844; 39.4% identity (73.0% similar) in 315 aa overlap (20-329:82-395)
10 20 30 40
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAEC
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CCDS13 LRAAGALSKRYWTLFSCQVWPDDCDEDEEAATGPLGWRLPLLGQRYLDLLTTWYCSFKDC
60 70 80 90 100 110
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 C--GQKR-SLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGT
: :. : : . .:. ::. : ::::.....: .: :....:.:.: :.::.:::.::
CCDS13 CPRGDCRISNNFTGLEWDLNVRLHGQHLVQQLVLRTVRGYLETPQPEKALALSFHGWSGT
120 130 140 150 160 170
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 GKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSI
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CCDS13 GKNFVARMLVENLYRDGLMSDCVRMFIATFHFPHPKYVDLYKEQLMSQIRETQQLCHQTL
180 190 200 210 220 230
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 FIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQK--AMFIFLSNAGAERITDVALDFWRS
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CCDS13 FIFDEAEKLHPGLLEVLGPHLERRA-PEGHRAESPWTIFLFLSNLRGDIINEVVLKLLKA
240 250 260 270 280 290
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 GKQREDIKLKDIEHALSVSVFNNKNSGFWHSSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVE
: .::.: .. .: :.. . .. ..:: :: :...::::::.:::::::.:...: :
CCDS13 GWSREEITMEHLEPHLQAEIVETIDNGFGHSRLVKENLIDYFIPFLPLEYRHVRLCARDA
300 310 320 330 340 350
290 300 310 320 330
pF1KE1 MQSRGYEIDEDIVSRVAEEMTFFPKEERVFSDKGCKTVFTKLDYYYDD
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CCDS13 FLSQELLYKEETLDEIAQMMVYVPKEEQLFSSQGCKSISQRINYFLS
360 370 380 390
>>CCDS48024.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 (242 aa)
initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 743.7 bits: 145.5 E(32554): 4.2e-35
Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
CCDS48 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
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CCDS48 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::.
CCDS48 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.
CCDS48 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWLLKLGHHGRAPPRRSGALPPAPAAPRPALRAQ
180 190 200 210 220 230
>>CCDS6876.1 TOR2A gene_id:27433|Hs108|chr9 (253 aa)
initn: 570 init1: 550 opt: 565 Z-score: 743.4 bits: 145.5 E(32554): 4.4e-35
Smith-Waterman score: 565; 45.9% identity (75.1% similar) in 181 aa overlap (26-206:18-197)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MKLGRAVLGLLLLAPSVVQAVEPISLGLALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREA
:::. :.. ... : : .. : . .
CCDS68 MAAATRGCRPWGSLLGLLGLVSAAA-AAWDLASLRCTLGAFCECDFRPDLPG
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 LQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFINNPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIY
:. :: ..: :::::: ....:. .:. .: : :::.:::::::::::..::...:. ..
CCDS68 LECDLAQHLAGQHLAKALVVKALKAFVRDPAPTKPLVLSLHGWTGTGKSYVSSLLAHYLF
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYKDQLQLWIRGNVSACARSIFIFDEMDKMHAGLI
.::: : :: : .::::: :.: :: .:. :..::..::.::.:.::::::: ::.
CCDS68 QGGLRSPRVHHFSPVLHFPHPSHIERYKKDLKSWVQGNLTACGRSLFLFDEMDKMPPGLM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMFIFLSNAGAERITDVALDFWRSGKQREDIKLKDIEHAL
....::: .: :..:.::.:::.
CCDS68 EVLRPFLGSSWVVYGTNYRKAIFIFIRWGPALQWAQWGGHFSEVQLYSLSLCSQQNPVPH
180 190 200 210 220 230
>>CCDS7041.1 TOR4A gene_id:54863|Hs108|chr9 (423 aa)
initn: 202 init1: 117 opt: 269 Z-score: 351.8 bits: 73.8 E(32554): 2.8e-13
Smith-Waterman score: 269; 24.0% identity (56.5% similar) in 283 aa overlap (59-327:151-421)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 ALAGVLTGYIYPRLYCLFAECCGQKRSLSREALQKDLDDNLFGQHLAKKIILNAVFGFIN
..:.: :. .::: : . :. . ..
CCDS70 RCLLLLVAIVGFQVLNAIENLDDNAQRYDLDGLEKALQRAVFGQPAAVSRIVALMRDYLA
130 140 150 160 170 180
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 NPKPKKPLTLSLHGWTGTGKNFVSKIIAENIYEGGLNSDYVHLFVATLHFPHASNITLYK
. ..:: :.::: .:.::. :....:... .: : . : : :.: .
CCDS70 THVHSRPLLLALHGPSGVGKSHVGRLLARHFRSVLEDSALVLQYHARHHCPEARAAQDCR
190 200 210 220 230 240
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 DQLQLWIRGNVSACARS-----IFIFDEMDKMHAGLIDAIKPFLDYYDLVDGVSYQKAMF
..: . ..: : :.. ....:... : :.: .. ::. . ...:..
CCDS70 EELARRV-ADVVARAEAEEKTPLLVLDDVELMPRPLLDELHGFLQPQR---SHHFHNAIY
250 260 270 280 290
210 220 230 240 250
pF1KE1 IFLSNAGAERITDV-------ALDFWRSGKQREDIKLKDIEHALSVSVFN--NKNSGFWH
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CCDS70 VLLSGAGGAEVTRFVLQNASRALPLRPDGFRSAEAAAAQAEEDLRASLLAVLSREHPLWQ
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 SSLIHRNLIDYFVPFLPLEYKHLKMCIRVEMQSRGYEIDEDIVSRVAEEMTFFPKEERVF
.. : :::: :. . . :.: :: ..:. :. . .: ...:. : :
CCDS70 AAAI--------VPFLLLDKRDVVSCFRDEMAGEGFFPDQARAENLAAQLSFYRVAGREF
360 370 380 390 400
320 330
pF1KE1 SDKGCKTVFTKLDYYYDD
. ::: : . ..
CCDS70 AVTGCKQVVATVNLL
410 420
332 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:34:51 2016 done: Sun Nov 6 23:34:52 2016
Total Scan time: 2.500 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]