Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1350
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1350, 1187 aa
1>>>pF1KE1350 1187 - 1187 aa - 1187 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7831+/-0.0012; mu= 4.5270+/- 0.069
mean_var=267.6383+/-61.021, 0's: 0 Z-trim(108.7): 644 B-trim: 3 in 1/51
Lambda= 0.078397
statistics sampled from 9627 (10406) to 9627 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.67), E-opt: 0.2 (0.32), width: 16
Scan time: 5.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12236.1 TYK2 gene_id:7297|Hs108|chr19 (1187) 8226 945.7 0
CCDS41346.1 JAK1 gene_id:3716|Hs108|chr1 (1154) 2135 256.8 2.2e-67
CCDS12366.1 JAK3 gene_id:3718|Hs108|chr19 (1124) 1313 163.8 2.1e-39
CCDS6457.1 JAK2 gene_id:3717|Hs108|chr9 (1132) 785 104.1 2e-21
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038) 489 70.6 2.2e-11
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040) 489 70.6 2.2e-11
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086) 489 70.6 2.3e-11
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 475 69.1 7.8e-11
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 475 69.1 7.8e-11
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 468 68.0 8e-11
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 468 68.0 8.2e-11
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 467 67.9 8.8e-11
>>CCDS12236.1 TYK2 gene_id:7297|Hs108|chr19 (1187 aa)
initn: 8226 init1: 8226 opt: 8226 Z-score: 5046.3 bits: 945.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8226; 99.9% identity (100.0% similar) in 1187 aa overlap (1-1187:1-1187)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPLRHWGMARGSKPVGDGAQPMAAMGGLKVLLHWAGPGGGEPWVTFSESSLTAEEVCIHI
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CCDS12 MPLRHWGMARGSKPVGDGAQPMAAMGGLKVLLHWAGPGGGEPWVTFSESSLTAEEVCIHI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AHKVGITPPCFNLFALFDAQAQVWLPPNHILEIPRDASLMLYFRIRFYFRNWHGMNPREP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AHKVGITPPCFNLFALFDAQAQVWLPPNHILEIPRDASLMLYFRIRFYFRNWHGMNPREP
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AVYRCGPPGTEASSDQTAQGMQLLDPASFEYLFEQGKHEFVNDVASLWELSTEEEIHHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVYRCGPPGTEASSDQTAQGMQLLDPASFEYLFEQGKHEFVNDVASLWELSTEEEIHHFK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NESLGMAFLHLCHLALRHGIPLEEVAKKTSFKDCIPRSFRRHIRQHSALTRLRLRNVFRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 NESLGMAFLHLCHLALRHGIPLEEVAKKTSFKDCIPRSFRRHIRQHSALTRLRLRNVFRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FLRDFQPGRLSQQMVMVKYLATLERLAPRFGTERVPVCHLRLLAQAEGEPCYIRDSGVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 FLRDFQPGRLSQQMVMVKYLATLERLAPRFGTERVPVCHLRLLAQAEGEPCYIRDSGVAP
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TDPGPESAAGPPTHEVLVTGTGGIQWWPVEEEVNKEEGSSGSSGRNPQASLFGKKAKAHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TDPGPESAAGPPTHEVLVTGTGGIQWWPVEEEVNKEEGSSGSSGRNPQASLFGKKAKAHK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 AVGQPADRPREPLWAYFCDFRDITHVVLKEHCVSIHRQDNKCLELSLPSRAAALSFVSLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 AVGQPADRPREPLWAYFCDFRDITHVVLKEHCVSIHRQDNKCLELSLPSRAAALSFVSLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 DGYFRLTADSSHYLCHEVAPPRLVMSIRDGIHGPLLEPFVQAKLRPEDGLYLIHWSTSHP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DGYFRLTADSSHYLCHEVAPPRLVMSIRDGIHGPLLEPFVQAKLRPEDGLYLIHWSTSHP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 YRLILTVAQRSQAPDGMQSLRLRKFPIEQQDGAFVLEGWGRSFPSVRELGAALQGCLLRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YRLILTVAQRSQAPDGMQSLRLRKFPIEQQDGAFVLEGWGRSFPSVRELGAALQGCLLRA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 GDDCFSLRRCCLPQPGETSNLIIMRGARASPRTLNLSQLSFHRVDQKEITQLSHLGQGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GDDCFSLRRCCLPQPGETSNLIIMRGARASPRTLNLSQLSFHRVDQKEITQLSHLGQGTR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 TNVYEGRLRVEGSGDPEEGKMDDEDPLVPGRDRGQELRVVLKVLDPSHHDIALAFYETAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 TNVYEGRLRVEGSGDPEEGKMDDEDPLVPGRDRGQELRVVLKVLDPSHHDIALAFYETAS
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 LMSQVSHTHLAFVHGVCVRGPENIMVTEYVEHGPLDVWLRRERGHVPMAWKMVVAQQLAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LMSQVSHTHLAFVHGVCVRGPENIMVTEYVEHGPLDVWLRRERGHVPMAWKMVVAQQLAS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 ALSYLENKNLVHGNVCGRNILLARLGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGALSREERVERIPWLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALSYLENKNLVHGNVCGRNILLARLGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGALSREERVERIPWLA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 PECLPGGANSLSTAMDKWGFGATLLEICFDGEAPLQSRSPSEKEHFYQRQHRLPEPSCPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PECLPGGANSLSTAMDKWGFGATLLEICFDGEAPLQSRSPSEKEHFYQRQHRLPEPSCPQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LATLTSQCLTYEPTQRPSFRTILRDLTRLQPHNLADVLTVNPDSPASDPTVFHKRYLKKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 LATLTSQCLTYEPTQRPSFRTILRDLTRLQPHNLADVLTVNPDSPASDPTVFHKRYLKKI
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KE1 RDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDGTGEMVAVKALKADCGPQHRSGWKQEIDILRTLYHEHII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDGTGEMVAVKALKADCGPQHRSGWKQEIDILRTLYHEHII
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KE1 KYKGCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSIGLAQLLLFAQQICEGMAYLHSQHYI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS12 KYKGCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRHSIGLAQLLLFAQQICEGMAYLHAQHYI
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KE1 HRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAPECLKEYKFYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAPECLKEYKFYY
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KE1 ASDVWSFGVTLYELLTHCDSSQSPPTKFLELIGIAQGQMTVLRLTELLERGERLPRPDKC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ASDVWSFGVTLYELLTHCDSSQSPPTKFLELIGIAQGQMTVLRLTELLERGERLPRPDKC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180
pF1KE1 PCEVYHLMKNCWETEASFRPTFENLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 PCEVYHLMKNCWETEASFRPTFENLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC
1150 1160 1170 1180
>>CCDS41346.1 JAK1 gene_id:3716|Hs108|chr1 (1154 aa)
initn: 2309 init1: 1125 opt: 2135 Z-score: 1323.3 bits: 256.8 E(32554): 2.2e-67
Smith-Waterman score: 3375; 46.9% identity (72.6% similar) in 1141 aa overlap (41-1166:46-1146)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 GSKPVGDGAQPMAAMGGLKVLLHWAGPGGGEPWVTFSESSLTAEEVCIHIAHKVGITPPC
:: . .. . ::::.::. :. :.: :
CCDS41 CAKMRSSKKTEVNLEAPEPGVEVIFYLSDREP-LRLGSGEYTAEELCIRAAQACRISPLC
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KE1 FNLFALFDAQAQVWLPPNHILEIPRDASLMLYFRIRFYFRNWHGMNPREPAVYRCGPPGT
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CCDS41 HNLFALYDENTKLWYAPNRTITVDDKMSLRLHYRMRFYFTNWHGTNDNEQSVWRHSPKKQ
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180
pF1KE1 EASSDQTA--QGMQLLDPASFEYLFEQGKHEFVNDVASLWELSTEEEIHHFKNESLGMAF
. . .. .. ::: .:.:::: ::....:. .: . . .::.. : ..:: ::::
CCDS41 KNGYEKKKIPDATPLLDASSLEYLFAQGQYDLVKCLAPIRDPKTEQDGHDIENECLGMAV
140 150 160 170 180 190
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 LHLCHLALRHGIPLEEVAKKTSFKDCIPRSFRRHIRQHSALTRLRLRNVFRRFLRDFQ--
: . : :. . . : :. : :.: ::... . :::.. :::.:. :::. ::..:.
CCDS41 LAISHYAMMKKMQLPELPKDISYKRYIPETLNKSIRQRNLLTRMRINNVFKDFLKEFNNK
200 210 220 230 240 250
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ---PGRLSQQMVMVKYLATLERLAPRFGTERVPVCHLRLLAQAEGEPCYIRDSGVAPTDP
. .: . . :::::::: :. ..:.: . : : ..:.: ..... :
CCDS41 TICDSSVSTHDLKVKYLATLETLTKHYGAEIFETSML--LISSENEMNWFHSN-----DG
260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GPESAAGPPTHEVLVTGTGGIQWWPVEEEVNKEEGSSGSSGRNPQASLFGKKAKAHKAVG
: . .::.:::. :::: . :. :. . .: :: . ..
CCDS41 G-----NVLYYEVMVTGNLGIQWRHKPNVVSVEK---------EKNKLKRKKLENKHKKD
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QPADRPREPLWAYFCDFRDITHVVLKEHCVSIHRQDNKCLELSLPSRAAALSFVSLVDGY
. .. :: : : : .:::.:.:: :::..:::: .::.: :. :::::::::::
CCDS41 EEKNKIREE-WNNFSYFPEITHIVIKESVVSINKQDNKKMELKLSSHEEALSFVSLVDGY
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 FRLTADSSHYLCHEVAPPRLVMSIRDGIHGPLLEPFVQAKLRPE---DGLYLIHWSTSHP
::::::. :::: .:::: .: .:..: :::. .. ::: : .:.:...:: .
CCDS41 FRLTADAHHYLCTDVAPPLIVHNIQNGCHGPICTEYAINKLRQEGSEEGMYVLRWSCTDF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530
pF1KE1 YRLILTVA--QRSQAPDGMQSLRLRKFPIEQQDGAFVLEGWGRSFPSVRELGAALQGCLL
...::. ..:. .: :. ....: :: : : . :.: :::::. .: . :. .:
CCDS41 DNILMTVTCFEKSEQVQGAQK-QFKNFQIEVQKGRYSLHGSDRSFPSLGDLMSHLKKQIL
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 RAGDDCFSLRRCCLPQPGETSNLIIM-RGARASPRTLNLSQLSFHRVDQKEITQLSHLGQ
:. . : :.::: :.: : :::.. . :. . .::::: :. .:...: :::.
CCDS41 RTDNISFMLKRCCQPKPREISNLLVATKKAQEWQPVYPMSQLSFDRILKKDLVQGEHLGR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GTRTNVYEGRLRVEGSGDPEEGKMDDEDPLVPGRDRGQELRVVLKVLDPSHHDIALAFYE
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CCDS41 GTRTHIYSGTL------------MDYKDD--EGTSEEKKIKVILKVLDPSHRDISLAFFE
600 610 620 630
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 TASLMSQVSHTHLAFVHGVCVRGPENIMVTEYVEHGPLDVWLRRERGHVPMAWKMVVAQQ
.::.: :::: :.....::::: ::::: :.:: ::::....:. . ::. ::.:
CCDS41 AASMMRQVSHKHIVYLYGVCVRDVENIMVEEFVEGGPLDLFMHRKSDVLTTPWKFKVAKQ
640 650 660 670 680 690
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 LASALSYLENKNLVHGNVCGRNILLARLGLAEGTSPFIKLSDPGVGLGALSREERVERIP
:::::::::.:.::::::: .:.:::: :. .:::::::::. . .:::.: .::::
CCDS41 LASALSYLEDKDLVHGNVCTKNLLLAREGIDSECGPFIKLSDPGIPITVLSRQECIERIP
700 710 720 730 740 750
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 WLAPECLPGGANSLSTAMDKWGFGATLLEICFDGEAPLQSRSPSEKEHFYQRQHRLPEPS
:.::::. . : ::.: :::.::.:: :::..:: ::.... :::.::. . : ::
CCDS41 WIAPECVEDSKN-LSVAADKWSFGTTLWEICYNGEIPLKDKTLIEKERFYESRCRPVTPS
760 770 780 790 800 810
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 CPQLATLTSQCLTYEPTQRPSFRTILRDLTRLQPHNLADVLTVNPDSPASDPTVFHKRYL
: .:: : ..:..:.:.::: ::.:.::...:. .: :... . . ::: :.::.:
CCDS41 CKELADLMTRCMNYDPNQRPFFRAIMRDINKLEEQN-PDIVSEKKPATEVDPTHFEKRFL
820 830 840 850 860 870
900 910 920 930 940 950
pF1KE1 KKIRDLGEGHFGKVSLYCYDPTNDGTGEMVAVKALKADCGPQHRSGWKQEIDILRTLYHE
:.:::::::::::: : ::: .:.:::.::::.:: . : .: . :.::.:::.::::
CCDS41 KRIRDLGEGHFGKVELCRYDPEGDNTGEQVAVKSLKPESGGNHIADLKKEIEILRNLYHE
880 890 900 910 920 930
960 970 980 990 1000 1010
pF1KE1 HIIKYKGCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRHS--IGLAQLLLFAQQICEGMAYLH
.:.:::: : ..: ....:.::..: :::..:::... :.: : : .: :::.:: ::
CCDS41 NIVKYKGICTEDGGNGIKLIMEFLPSGSLKEYLPKNKNKINLKQQLKYAVQICKGMDYLG
940 950 960 970 980 990
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 SQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAPECLKE
:..:.::::::::::..... ::::::::.::. .::: :..: :::::::::::: .
CCDS41 SRQYVHRDLAARNVLVESEHQVKIGDFGLTKAIETDKEYYTVKDDRDSPVFWYAPECLMQ
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1080 1090 1100 1110 1120 1130
pF1KE1 YKFYYASDVWSFGVTLYELLTHCDSSQSPPTKFLELIGIAQGQMTVLRLTELLERGERLP
::: :::::::::::.::::.:::..:: . ::..:: ..::::: ::.. :..:.:::
CCDS41 SKFYIASDVWSFGVTLHELLTYCDSDSSPMALFLKMIGPTHGQMTVTRLVNTLKEGKRLP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1140 1150 1160 1170 1180
pF1KE1 RPDKCPCEVYHLMKNCWETEASFRPTFENLIPILKTVHEKYQGQAPSVFSVC
: .:: :::.::..::: . : : .:.:::
CCDS41 CPPNCPDEVYQLMRKCWEFQPSNRTSFQNLIEGFEALLK
1120 1130 1140 1150
>>CCDS12366.1 JAK3 gene_id:3718|Hs108|chr19 (1124 aa)
initn: 1946 init1: 641 opt: 1313 Z-score: 821.0 bits: 163.8 E(32554): 2.1e-39
Smith-Waterman score: 2475; 39.4% identity (62.6% similar) in 1200 aa overlap (26-1185:24-1111)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MPLRHWGMARGSKPVGDGAQPMAAMGGLKVLLHWAGPGGGEPWVTFSESSLTAEEVCIHI
:.:.::: ::: . ..:: .. ::..:..
CCDS12 MAPPSEETPLIPQRSCSLLSTEAGALHVLLPARGPGPPQR-LSFSFGDHLAEDLCVQA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 AHKVGITPPCFNLFALFDAQAQVWLPPNHILEIPRDASLMLYFRIRFYFRNWHGMNPREP
:. :: : .:::: . . :.::.::. . .. .: .:::::: :: :..
CCDS12 AKASGILPVYHSLFALATEDLSCWFPPSHIFSVEDASTQVLLYRIRFYFPNWFGLEK---
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AVYRCGPPGTEASSDQTAQGMQLLDPASFEYLFEQGKHEFVNDVASLWELSTEEEIHHFK
.: : ::. .:: .:.:: : . ..:. . :: .: .
CCDS12 -CHRFGLRKDLASA--------ILDLPVLEHLFAQHRSDLVSGRLPVG-LSLKE-----Q
120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 NESLGMAFLHLCHLALRHGIPLEEVAKKTSFKDCIPRSFRRHIRQHSALTRLRLRNVFRR
.: :..: : : ..: ... :. : .:.: :.: :.: :. : .:: :.: . ::
CCDS12 GECLSLAVLDLARMAREQAQRPGELLKTVSYKACLPPSLRDLIQGLSFVTRRRIRRTVRR
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 FLRDFQPGRLSQQMVMVKYLATLERLAPRFGTERVPVCHLRLLAQAEGEPCYIRDSGVAP
:: . ... .:.::. :::: : ..: :. : :
CCDS12 ALRRVAACQADRHSLMAKYIMDLERLDPAGAAETF---HVGL-----------------P
220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 TDPGPESAAGPPTHEVLVTGTGGIQWWPVEEEVNKEEGSSGSSGRNPQASLFGKKAKAHK
: ... : . :.: ::: : :.::
CCDS12 GALGGHDGLG----LLRVAGDGGIAWTQGEQEVL--------------------------
260 270 280
370 380 390 400 410
pF1KE1 AVGQPADRPREPLWAYFCDFRDITHVVLK---------EH-CVSIHRQDNKCLELSLPSR
:: :::: .:. . .: :: :.. : ::. :: .:.
CCDS12 ---QP-----------FCDFPEIVDISIKQAPRVGPAGEHRLVTVTRTDNQILEAEFPGL
290 300 310 320 330
420 430 440 450 460
pF1KE1 AAALSFVSLVDGYFRLTADSSHYLCHEVAPPRLVMSIRDGIHGPLLEPFVQAKLRP---E
:::::.:::::::::.::.:..:.:::::::. . . :::. :. ::. .
CCDS12 PEALSFVALVDGYFRLTTDSQHFFCKEVAPPRLLEEVAEQCHGPITLDFAINKLKTGGSR
340 350 360 370 380 390
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: :... : . ..::: .: .:: ... .:. : :.:.: : .: :.
CCDS12 PGSYVLRRSPQDFDSFLLTVCVQNPLGPD-YKGCLIRRSPT----GTFLLVGLSRPHSSL
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CCDS12 RELLATCWDGGLHVDGVAVTLTSCCIPRPKEKSNLIVVQRGHSPPTSSLVQPQSQYQLSQ
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..::.. . .::.:. :..:.: : : .: :. : :
CCDS12 MTFHKIPADSLEWHENLGHGSFTKIYRG-CRHE---------------VVDGEARKTE--
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CCDS12 VLLKVMDAKHKNCMESFLEAASLMSQVSYRHLVLLHGVCMAG-DSTMVQEFVHLGAIDMY
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::. ::: :: .::. :..::: ::.:::.:.: :::: .:..:::: : :.:. :::::
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CCDS12 SDPGVSPAVLSLEMLTDRIPWVAPECLRE-AQTLSLEADKWGFGATVWEV-FSGVTMPIS
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. .:..: .::. ...:: :. .:: : .::..:::.::::::...:::. :
CCDS12 ALDPAKKLQFYEDRQQLPAPKWTELALLIQQCMAYEPVQRPSFRAVIRDLNSLISSDYEL
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: :: : : . . : .:::.:..:.:: : .::.:.::.: : ::: .:.
CCDS12 LSDPTPGALAPRDGLWNGAQLYACQDPTIFEERHLKYISQLGKGNFGSVELCRYDPLGDN
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:: .:::: :. . ::... ...::.::..:. . :.::.: :..::.:::::.:
CCDS12 TGALVAVKQLQHS-GPDQQRDFQREIQILKALHSDFIVKYRGVSYGPGRQSLRLVMEYLP
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CCDS12 SGCLRDFLQRHRARLDASRLLLYSSQICKGMEYLGSRRCVHRDLAARNILVESEAHVKIA
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CCDS12 DFGLAKLLPLDKDYYVVREPGQSPIFWYAPESLSDNIFSRQSDVWSFGVVLYELFTYCDK
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CCDS12 SCSPSAEFLRMMGCERDVPALCRLLELLEEGQRLPAPPACPAEVHELMKLCWAPSPQDRP
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CCDS12 SFSALGPQLDMLWSGSRGCETHAFTAHPEGKHHSLSFS
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CCDS64 IAASKACGITPVYHNMFALMSETERIWYPPNHVFHIDESTRHNVLYRIRFYFPRWYCSGS
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CCDS64 NR--AYRHGISRGAEAP---------LLDDFVMSYLFAQWRHDFVHG----W--IKVPVT
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CCDS64 HETQEECLGMAVLDMMRIAKENDQTPLA-IYNSISYKTFLPKCIRAKIQDYHILTRKRIR
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::::...:. . . . . .::: .:: : : ::. : ::
CCDS64 YRFRRFIQQFSQCKATARNLKLKYLINLETLQSAFYTEKFEV----------KEP-----
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::..:..... . . ::. ::.::: :. .::...:.:::::..:::: : :. :
CCDS64 LDTYLKKNKNCINILWKLEVAKQLAWAMHFLEENTLIHGNVCAKNILLIREEDRKTGNPP
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::.. . ..: .::. .:.:: :. .::.: ..:. ::: :::::.:.:::. : .
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CCDS64 Y-ELLTENDMLPNMRIGALGFSGAFEDRDPTQFEERHLKFLQQLGKGNFGSVEMCRYDPL
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CCDS33 QDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIE
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CCDS77 QDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIE
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CCDS33 GSFGVVRRGEWDAPS-GKTVSVAVKCLKPDVLSQPEAMDDFIREVNAMHSLDHRNLIRLY
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pF1KE1 GCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRHS--IGLAQLLLFAQQICEGMAYLHSQHYIH
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CCDS33 GVVLTP---PMKMVTELAPLGSLLDRLRKHQGHFLLGTLSRYAVQVAEGMGYLESKRFIH
260 270 280 290 300 310
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CCDS33 QDIYNVMVQCWAHKPEDRPTFVALRDFLLEAQPTDMRALQDFEEPDKLHIQMNDVITVIE
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>>CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308 aa)
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Smith-Waterman score: 585; 35.3% identity (59.2% similar) in 306 aa overlap (864-1165:684-970)
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 PEPSCPQLATLTSQCLTYEPTQRPSFRTILRDLTRLQPHNLADVLTVNPDSPASDPT-VF
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CCDS23 KETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMA
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pF1KE1 TLYHEHIIKYKGCCEDQGEKSLQLVMEYVPLGSLRDYLPRH--SIGLAQLLLFAQQICEG
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CCDS23 SMDHPHLVRLLGVCLS---PTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKG
780 790 800 810 820 830
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KE1 MAYLHSQHYIHRDLAARNVLLDNDRLVKIGDFGLAKAVPEGHEYYRVREDGDSPVFWYAP
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CCDS23 MMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLL-EGDEKEYNADGGKMPIKWMAL
840 850 860 870 880
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KE1 ECLKEYKFYYASDVWSFGVTLYELLTHCDSSQSP-PTKFLELIGIAQGQMTVLRLTELLE
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CCDS23 ECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTR---------------EIPDLLE
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CCDS23 KGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMK
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>>CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 (612 aa)
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CCDS47 RDLAARNVLLVTQHYAKISDFGLSKALRADENYYKAQTHGKWPVKWYAPECINYYKFSSK
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CCDS47 REMYDLMNLCWTYDVENRPGFAAVELRLRNYYYDVVN
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1187 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 22:58:37 2016 done: Sun Nov 6 22:58:38 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]