Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1348
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1348, 472 aa
1>>>pF1KE1348 472 - 472 aa - 472 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.6403+/-0.00112; mu= 15.8728+/- 0.067
mean_var=63.7362+/-12.923, 0's: 0 Z-trim(101.8): 23 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.160650
statistics sampled from 6642 (6653) to 6642 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.559), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 2.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34673.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 ( 472) 3120 732.3 2.6e-211
CCDS78251.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 ( 396) 2610 614.1 8.6e-176
CCDS78250.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 ( 412) 1797 425.6 4.7e-119
CCDS78249.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 ( 433) 1535 364.9 9.4e-101
CCDS45008.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12 ( 506) 970 234.0 2.8e-61
CCDS9259.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12 ( 509) 970 234.0 2.9e-61
CCDS3577.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4 ( 478) 957 231.0 2.2e-60
CCDS56335.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4 ( 335) 570 141.2 1.6e-33
>>CCDS34673.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 (472 aa)
initn: 3120 init1: 3120 opt: 3120 Z-score: 3907.1 bits: 732.3 E(32554): 2.6e-211
Smith-Waterman score: 3120; 100.0% identity (100.0% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-472)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLRELLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLRELLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKRNLSYWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKRNLSYWE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
430 440 450 460 470
>>CCDS78251.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 (396 aa)
initn: 2610 init1: 2610 opt: 2610 Z-score: 3269.5 bits: 614.1 E(32554): 8.6e-176
Smith-Waterman score: 2610; 100.0% identity (100.0% similar) in 396 aa overlap (77-472:1-396)
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 GTIAFKNWVKTGTEVYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQD
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQD
10 20 30
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 AEDNTVSFLQPNGAIFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 AEDNTVSFLQPNGAIFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 SSMFQVRTLRELLWGYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SSMFQVRTLRELLWGYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAI
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 IDTYKGKRNLSYWESHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IDTYKGKRNLSYWESHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 GIPVYRFVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GIPVYRFVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHF
220 230 240 250 260 270
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 LYASPDVSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 LYASPDVSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLK
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 RNYIVPILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCAC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 RNYIVPILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCAC
340 350 360 370 380 390
470
pF1KE1 RSKTIK
::::::
CCDS78 RSKTIK
>>CCDS78250.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 (412 aa)
initn: 2711 init1: 1791 opt: 1797 Z-score: 2250.9 bits: 425.6 E(32554): 4.7e-119
Smith-Waterman score: 2595; 87.3% identity (87.3% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLRELLW
:::::::::::::::::::::::
CCDS78 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVA-------------------------------------
130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKRNLSYWE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 -----------------------YNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKRNLSYWE
150 160 170 180
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 SHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
190 200 210 220 230 240
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
250 260 270 280 290 300
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470
pF1KE1 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
370 380 390 400 410
>>CCDS78249.1 CD36 gene_id:948|Hs108|chr7 (433 aa)
initn: 1532 init1: 1532 opt: 1535 Z-score: 1922.3 bits: 364.9 E(32554): 9.4e-101
Smith-Waterman score: 2754; 91.7% identity (91.7% similar) in 472 aa overlap (1-472:1-433)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 MGCDRNCGLIAGAVIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTGTE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPNGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLRELLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 IFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQFVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLRELLW
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 GYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKRNLSYWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 GYRDPFLSLVPYPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTYKGKR------
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 SHCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ---------------------------------SIYAVFESDVNLKGIPVYRFVLPSKAF
240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 ASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYASPDVSEPIDGL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 NPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNYIVPILWLNETG
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470
pF1KE1 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 TIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSKTIK
390 400 410 420 430
>>CCDS45008.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12 (506 aa)
initn: 653 init1: 232 opt: 970 Z-score: 1213.5 bits: 234.0 E(32554): 2.8e-61
Smith-Waterman score: 970; 32.7% identity (65.8% similar) in 480 aa overlap (1-469:1-467)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGCDRNCGLIAGA--VIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTG
:::. . ::: : : . ::.:.... . ::.. . :.: .. ....:. : .
CCDS45 MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIVMVPSLIKQQVLKNVRIDPSSLSFNMWKEIP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TEVYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPN
: . ..:::.::.:.. .. . ::..::::.:: .: : :.: . .: :::::.
CCDS45 IPFYLSVYFFDVMNPSEIL-KGEKPQVRERGPYVYR-EFRHKSNITFNNND-TVSFLEYR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GAIFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQ--FVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLR
:.:: : :.:.: ... :. : .:. ...:. ...:.. .. :. ::.
CCDS45 TFQFQPSKSHGSESDYIVMPNILVLGAAVMMENKPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ELLWGYRDPFLSLV----P--YPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTY
:..:::.::...:. : .: ::: ::. .:.. ::.: .:::.. ..: .
CCDS45 EIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFPFKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDKW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 KGKRNLSYWES-HCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIP
.: ....:.: .:.:::::.. .:::. . :.:.: . :::. ... . ..:::
CCDS45 NGLSKVDFWHSDQCNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGIP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 VYRFVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYA
.:::: :. ::. : : :: : :. ..: :. . :...: :::: :
CCDS45 TYRFVAPKTLFANGSIYPPNEGFCP-------CLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 SPDVSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNY
.: ..: . ::.::.: : .:::.:.::. .. . .::..: .: : ...
CCDS45 DPVLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGIGQTGKIE-PV
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 IVPILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSK
..:.::. :.:.. : . : .:.. ... ...::..: :.... .: : ::.
CCDS45 VLPLLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLALGCVLLLVPVI--CQIRSQ
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE1 TIK
CCDS45 GPEDTVSQPGLAAGPDRPPSPYTPLLPDSPSGQPPSPTA
470 480 490 500
>>CCDS9259.1 SCARB1 gene_id:949|Hs108|chr12 (509 aa)
initn: 653 init1: 232 opt: 970 Z-score: 1213.5 bits: 234.0 E(32554): 2.9e-61
Smith-Waterman score: 970; 32.7% identity (65.8% similar) in 480 aa overlap (1-469:1-467)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MGCDRNCGLIAGA--VIGAVLAVFGGILMPVGDLLIQKTIKKQVVLEEGTIAFKNWVKTG
:::. . ::: : : . ::.:.... . ::.. . :.: .. ....:. : .
CCDS92 MGCSAKARWAAGALGVAGLLCAVLGAVMIVMVPSLIKQQVLKNVRIDPSSLSFNMWKEIP
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TEVYRQFWIFDVQNPQEVMMNSSNIQVKQRGPYTYRVRFLAKENVTQDAEDNTVSFLQPN
: . ..:::.::.:.. .. . ::..::::.:: .: : :.: . .: :::::.
CCDS92 IPFYLSVYFFDVMNPSEIL-KGEKPQVRERGPYVYR-EFRHKSNITFNNND-TVSFLEYR
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GAIFEPSLSVGTEADNFTVLNLAVAAASHIYQNQ--FVQMILNSLINKSKSSMFQVRTLR
:.:: : :.:.: ... :. : .:. ...:. ...:.. .. :. ::.
CCDS92 TFQFQPSKSHGSESDYIVMPNILVLGAAVMMENKPMTLKLIMTLAFTTLGERAFMNRTVG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ELLWGYRDPFLSLV----P--YPVTTTVGLFYPYNNTADGVYKVFNGKDNISKVAIIDTY
:..:::.::...:. : .: ::: ::. .:.. ::.: .:::.. ..: .
CCDS92 EIMWGYKDPLVNLINKYFPGMFPFKDKFGLFAELNNSDSGLFTVFTGVQNISRIHLVDKW
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 KGKRNLSYWES-HCDMINGTDAASFPPFVEKSQVLQFFSSDICRSIYAVFESDVNLKGIP
.: ....:.: .:.:::::.. .:::. . :.:.: . :::. ... . ..:::
CCDS92 NGLSKVDFWHSDQCNMINGTSGQMWPPFMTPESSLEFYSPEACRSMKLMYKESGVFEGIP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 VYRFVLPSKAFASPVENPDNYCFCTEKIISKNCTSYGVLDISKCKEGRPVYISLPHFLYA
.:::: :. ::. : : :: : :. ..: :. . :...: :::: :
CCDS92 TYRFVAPKTLFANGSIYPPNEGFCP-------CLESGIQNVSTCRFSAPLFLSHPHFLNA
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KE1 SPDVSEPIDGLNPNEEEHRTYLDIEPITGFTLQFAKRLQVNLLVKPSEKIQVLKNLKRNY
.: ..: . ::.::.: : .:::.:.::. .. . .::..: .: : ...
CCDS92 DPVLAEAVTGLHPNQEAHSLFLDIHPVTGIPMNCSVKLQLSLYMKSVAGIGQTGKIE-PV
360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 IVPILWLNETGTIGDEKANMFRSQVTGKINLLGLIEMILLSVGVVMFVAFMISYCACRSK
..:.::. :.:.. : . : .:.. ... ...::..: :.... .: : ::.
CCDS92 VLPLLWFAESGAMEGETLHTFYTQLVLMPKVMHYAQYVLLALGCVLLLVPVI--CQIRSQ
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE1 TIK
CCDS92 EKCYLFWSSSKKGSKDKEAIQAYSESLMTSAPKGSVLQEAKL
470 480 490 500
>>CCDS3577.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4 (478 aa)
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CCDS35 DEGTADERAPLIRT
470
>>CCDS56335.1 SCARB2 gene_id:950|Hs108|chr4 (335 aa)
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CCDS56 EKP-----PLPVYTQ---FYFFNVTNP--EEILRGET--PRVEEVGPYT-YRSLDWWITD
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CCDS56 IDKETASRLKSMINTTL-IITNIPYIIMALGV--FFGLVFTWLACKGQGSMDEGTADERA
280 290 300 310 320 330
CCDS56 PLIRT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]