Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1337
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1337, 158 aa
1>>>pF1KE1337 158 - 158 aa - 158 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.8377+/-0.000589; mu= 14.5827+/- 0.036
mean_var=63.4120+/-12.552, 0's: 0 Z-trim(111.9): 66 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.161060
statistics sampled from 12685 (12753) to 12685 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.778), E-opt: 0.2 (0.392), width: 16
Scan time: 1.580
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8624.1 KLRC4 gene_id:8302|Hs108|chr12 ( 158) 1088 260.5 3.1e-70
CCDS31745.1 KLRC2 gene_id:3822|Hs108|chr12 ( 231) 823 199.1 1.4e-51
CCDS41755.1 KLRC3 gene_id:3823|Hs108|chr12 ( 240) 810 196.1 1.2e-50
CCDS31744.1 KLRC3 gene_id:3823|Hs108|chr12 ( 257) 810 196.1 1.2e-50
CCDS76531.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 ( 228) 645 157.7 3.9e-39
CCDS8625.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 ( 233) 645 157.7 4e-39
CCDS8626.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 ( 215) 364 92.4 1.7e-19
>>CCDS8624.1 KLRC4 gene_id:8302|Hs108|chr12 (158 aa)
initn: 1088 init1: 1088 opt: 1088 Z-score: 1374.5 bits: 260.5 E(32554): 3.1e-70
Smith-Waterman score: 1088; 100.0% identity (100.0% similar) in 158 aa overlap (1-158:1-158)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
70 80 90 100 110 120
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS86 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
130 140 150
>>CCDS31745.1 KLRC2 gene_id:3822|Hs108|chr12 (231 aa)
initn: 556 init1: 539 opt: 823 Z-score: 1039.4 bits: 199.1 E(32554): 1.4e-51
Smith-Waterman score: 823; 87.4% identity (90.2% similar) in 143 aa overlap (1-143:1-140)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
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CCDS31 MNKQRGTFSEVSLAQDPKRQQRKPKGNKSSISGTEQEIFQVELNLQNPSLNHQGIDKIYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::: : : :::::::::
CCDS31 CQGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIP---FLEQNNFSPNTRTQKARHCGHC
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
:::::::::::::::::::::::
CCDS31 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLLACTSKNSSLLSIDNEEEMKFLASILPSSWIGVFR
120 130 140 150 160 170
>>CCDS41755.1 KLRC3 gene_id:3823|Hs108|chr12 (240 aa)
initn: 532 init1: 532 opt: 810 Z-score: 1022.9 bits: 196.1 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 810; 79.7% identity (85.4% similar) in 158 aa overlap (1-156:1-155)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
:.:::::.:::::::::: :::: :::: :::::.:::::::::::::: .::: :: :
CCDS41 MSKQRGTFSEVSLAQDPKWQQRKPKGNKSSISGTEQEIFQVELNLQNASLNHQGIDKIYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: : : : :::::::::
CCDS41 CQGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIP---FLEQNNSSPNARTQKARHCGHC
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEE--RVCWPVLRRTLICFL
::::::::::::::::::::::: ..: .:.:
CCDS41 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLQACASKNSSSLLCIDNEEEMKFLASILPSSWIGVF
120 130 140 150 160 170
CCDS41 RNSSHHPWVTINGLAFKHEIKDSDHAERNCAMLHVRGLISDQCGSSRIIRRGFIMLTRLV
180 190 200 210 220 230
>>CCDS31744.1 KLRC3 gene_id:3823|Hs108|chr12 (257 aa)
initn: 532 init1: 532 opt: 810 Z-score: 1022.5 bits: 196.1 E(32554): 1.2e-50
Smith-Waterman score: 810; 79.7% identity (85.4% similar) in 158 aa overlap (1-156:1-155)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
:.:::::.:::::::::: :::: :::: :::::.:::::::::::::: .::: :: :
CCDS31 MSKQRGTFSEVSLAQDPKWQQRKPKGNKSSISGTEQEIFQVELNLQNASLNHQGIDKIYD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:.::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::: : : : :::::::::
CCDS31 CQGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIP---FLEQNNSSPNARTQKARHCGHC
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEE--RVCWPVLRRTLICFL
::::::::::::::::::::::: ..: .:.:
CCDS31 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLQACASKNSSSLLCIDNEEEMKFLASILPSSWIGVF
120 130 140 150 160 170
CCDS31 RNSSHHPWVTINGLAFKHEIKDSDHAERNCAMLHVRGLISDQCGSSRIIVSISFRIKALE
180 190 200 210 220 230
>>CCDS76531.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 (228 aa)
initn: 378 init1: 346 opt: 645 Z-score: 816.0 bits: 157.7 E(32554): 3.9e-39
Smith-Waterman score: 645; 67.8% identity (82.5% similar) in 143 aa overlap (1-143:1-142)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
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CCDS76 MDNQGVIYSDLNLPPNPKRQQRKPKGNKNSILATEQEITYAELNLQKASQDFQGNDKTYH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:: : :::: . .:::::..:::.:. :::.:: . ..:: ::: : :::::::::
CCDS76 CKDLPSAPEKLIVGILGIICLILMASVV-TIVVIPSTLIQRHNNSSLNTRTQKARHCGHC
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
:::::::::::::::::::::::
CCDS76 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLLACTSKNSSLLSIDNEEEMKFLSIISPSSWIGVFR
120 130 140 150 160 170
>>CCDS8625.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 (233 aa)
initn: 378 init1: 346 opt: 645 Z-score: 815.9 bits: 157.7 E(32554): 4e-39
Smith-Waterman score: 645; 67.8% identity (82.5% similar) in 143 aa overlap (1-143:1-142)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
:..: ::...: .::::::: :::: :: .:.::: .:::::.::.: ::::::::
CCDS86 MDNQGVIYSDLNLPPNPKRQQRKPKGNKNSILATEQEITYAELNLQKASQDFQGNDKTYH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:: : :::: . .:::::..:::.:. :::.:: . ..:: ::: : :::::::::
CCDS86 CKDLPSAPEKLIVGILGIICLILMASVV-TIVVIPSTLIQRHNNSSLNTRTQKARHCGHC
70 80 90 100 110
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
:::::::::::::::::::::::
CCDS86 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLLACTSKNSSLLSIDNEEEMKFLSIISPSSWIGVFR
120 130 140 150 160 170
>>CCDS8626.1 KLRC1 gene_id:3821|Hs108|chr12 (215 aa)
initn: 566 init1: 346 opt: 364 Z-score: 463.5 bits: 92.4 E(32554): 1.7e-19
Smith-Waterman score: 552; 61.5% identity (74.8% similar) in 143 aa overlap (1-143:1-124)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKQRGTYSEVSLAQDPKRQQRKLKGNKISISGTKQEIFQVELNLQNASSDHQGNDKTYH
:..: ::...: .::::::: :::: :: .:.::: .:::::.::.: ::::::::
CCDS86 MDNQGVIYSDLNLPPNPKRQQRKPKGNKNSILATEQEITYAELNLQKASQDFQGNDKTYH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 CKGLLPPPEKLTAEVLGIICIVLMATVLKTIVLIPCIGVLEQNNFSLNRRMQKARHCGHC
:: : :::: . .:::::..:::.:. :::.:: .::::::
CCDS86 CKDLPSAPEKLIVGILGIICLILMASVV-TIVVIP------------------SRHCGHC
70 80 90 100
130 140 150
pF1KE1 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEERVCWPVLRRTLICFL
:::::::::::::::::::::::
CCDS86 PEEWITYSNSCYYIGKERRTWEESLLACTSKNSSLLSIDNEEEMKFLSIISPSSWIGVFR
110 120 130 140 150 160
158 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Mon Nov 7 00:59:16 2016 done: Mon Nov 7 00:59:16 2016
Total Scan time: 1.580 Total Display time: -0.020
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]