Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1334, 377 aa
1>>>pF1KE1334 377 - 377 aa - 377 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9222+/-0.000861; mu= 13.2351+/- 0.052
mean_var=75.6349+/-14.994, 0's: 0 Z-trim(106.8): 43 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.147473
statistics sampled from 9172 (9215) to 9172 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.655), E-opt: 0.2 (0.283), width: 16
Scan time: 2.470
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 377) 2531 548.0 5.1e-156
CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 ( 321) 2168 470.7 7.9e-133
CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 376) 1860 405.2 4.8e-113
CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 434) 1843 401.6 6.7e-112
CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 447) 1843 401.6 6.9e-112
CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 ( 292) 1577 345.0 5.2e-95
CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 383) 1236 272.5 4.5e-73
CCDS8330.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 404) 1134 250.8 1.6e-66
CCDS53704.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 311) 1126 249.0 4.2e-66
CCDS8331.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 263) 695 157.3 1.5e-38
CCDS5879.1 CASP2 gene_id:835|Hs108|chr7 ( 452) 314 76.3 5.9e-14
CCDS8332.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 ( 88) 287 70.3 7.6e-13
>>CCDS8327.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 (377 aa)
initn: 2531 init1: 2531 opt: 2531 Z-score: 2914.5 bits: 548.0 E(32554): 5.1e-156
Smith-Waterman score: 2531; 100.0% identity (100.0% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-377)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 MQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 ARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 IAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMP
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE1 TIERLSMTRYFYLFPGN
:::::::::::::::::
CCDS83 TIERLSMTRYFYLFPGN
370
>>CCDS41704.1 CASP4 gene_id:837|Hs108|chr11 (321 aa)
initn: 2168 init1: 2168 opt: 2168 Z-score: 2498.2 bits: 470.7 E(32554): 7.9e-133
Smith-Waterman score: 2168; 100.0% identity (100.0% similar) in 321 aa overlap (57-377:1-321)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 DNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADSMQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNK
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 MADSMQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNK
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 KAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 KAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEF
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 DHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 DHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLV
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 LMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 LMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGEL
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 WVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 WVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQL
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370
pF1KE1 ITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS41 ITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN
280 290 300 310 320
>>CCDS44719.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (376 aa)
initn: 1645 init1: 1645 opt: 1860 Z-score: 2143.0 bits: 405.2 E(32554): 4.8e-113
Smith-Waterman score: 1860; 74.0% identity (88.9% similar) in 377 aa overlap (1-377:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS
::: ::.:: .:.:: :::: : ::.. :....::. ::::::::::.: :::. ...::
CCDS44 MAEDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDVLTLKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 MQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKE
.. :.:.: ::. ::..:.:: . : ..:::::::.:::. :::::.::::::::.
CCDS44 LR-KNRVAHQMFTQTLLNMDQKITSVKPLLQIEAGPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKK
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLT
.::::::.:..: :::::::::.::::: :::: .::.:::.::.:: :.: :.:::
CCDS44 NHDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNGAHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLT
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 ARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNN
::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::.: .:::::::::::::::::
CCDS44 ARDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNN
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDF
:::::::::::::::::::: ..:::::::::::: . ::::::::: :.: : : ::::
CCDS44 RNCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPASLALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDF
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 IAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMP
::::::::::::::: : ::::::.::::::::: :::: :.:::::.:::.:.::::::
CCDS44 IAFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYSCCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMP
300 310 320 330 340 350
370
pF1KE1 TIERLSMTRYFYLFPGN
:::: ..:: :::::::
CCDS44 TIERATLTRDFYLFPGN
360 370
>>CCDS8328.2 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (434 aa)
initn: 1700 init1: 1645 opt: 1843 Z-score: 2122.4 bits: 401.6 E(32554): 6.7e-112
Smith-Waterman score: 1843; 74.0% identity (89.0% similar) in 373 aa overlap (5-377:63-434)
10 20 30
pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNV
::.:: .:.:: :::: : ::.. :....:
CCDS83 HMLKNNVAGQTSIQTLVPNTDQKSTSVKKDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDV
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADSMQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEA
:. ::::::::::.: :::. ...::.. :.:.: ::. ::..:.:: . : ..::
CCDS83 LTLKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDSLR-KNRVAHQMFTQTLLNMDQKITSVKPLLQIEA
100 110 120 130 140 150
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 GPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNG
:::::.:::. :::::.::::::::. .::::::.:..: :::::::::.::::: :::
CCDS83 GPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNG
160 170 180 190 200 210
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILE
: .::.:::.::.:: :.: :.:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::
CCDS83 AHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLTARDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILE
220 230 240 250 260 270
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 GICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPAS
:::::.: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::::::
CCDS83 GICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPAS
280 290 300 310 320 330
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYS
: . ::::::::: :.: : : ::::::::::::::::::: : ::::::.:::::::::
CCDS83 LALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDFIAFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYS
340 350 360 370 380 390
340 350 360 370
pF1KE1 WCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN
:::: :.:::::.:::.:.:::::::::: ..:: :::::::
CCDS83 CCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMPTIERATLTRDFYLFPGN
400 410 420 430
>>CCDS44720.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (447 aa)
initn: 1681 init1: 1645 opt: 1843 Z-score: 2122.2 bits: 401.6 E(32554): 6.9e-112
Smith-Waterman score: 1843; 74.0% identity (89.0% similar) in 373 aa overlap (5-377:76-447)
10 20 30
pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNV
::.:: .:.:: :::: : ::.. :....:
CCDS44 HMLKNNVAGQTSIQTLVPNTDQKSTSVKKDNHKKKTVKMLEYLGKDVLHGVFNYLAKHDV
50 60 70 80 90 100
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 LNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADSMQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEA
:. ::::::::::.: :::. ...::.. :.:.: ::. ::..:.:: . : ..::
CCDS44 LTLKEEEKKKYYDTKIEDKALILVDSLR-KNRVAHQMFTQTLLNMDQKITSVKPLLQIEA
110 120 130 140 150 160
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 GPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNG
:::::.:::. :::::.::::::::. .::::::.:..: :::::::::.::::: :::
CCDS44 GPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKKNHDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNG
170 180 190 200 210 220
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILE
: .::.:::.::.:: :.: :.:::::::::.:::::.:::::::::::::::::::::
CCDS44 AHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLTARDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILE
230 240 250 260 270 280
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 GICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPAS
:::::.: .::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ..:::::::::::
CCDS44 GICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPAS
290 300 310 320 330 340
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYS
: . ::::::::: :.: : : ::::::::::::::::::: : ::::::.:::::::::
CCDS44 LALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDFIAFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYS
350 360 370 380 390 400
340 350 360 370
pF1KE1 WCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN
:::: :.:::::.:::.:.:::::::::: ..:: :::::::
CCDS44 CCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMPTIERATLTRDFYLFPGN
410 420 430 440
>>CCDS44718.1 CASP5 gene_id:838|Hs108|chr11 (292 aa)
initn: 1577 init1: 1577 opt: 1577 Z-score: 1819.3 bits: 345.0 E(32554): 5.2e-95
Smith-Waterman score: 1577; 81.1% identity (92.0% similar) in 286 aa overlap (92-377:7-292)
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QEKQRMAGQMLLQTFFNIDQISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKER
.:::::::.:::. :::::.::::::::.
CCDS44 MAALLQIEAGPPESAESTNILKLCPREEFLRLCKKN
10 20 30
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 AEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTA
.::::::.:..: :::::::::.::::: :::: .::.:::.::.:: :.: :.::::
CCDS44 HDEIYPIKKREDRRRLALIICNTKFDHLPARNGAHYDIVGMKRLLQGLGYTVVDEKNLTA
40 50 60 70 80 90
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 RDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDTIFQIFNNR
:::::.:::::.::::::::::::::::::::::::::.: .::::::::::::::::::
CCDS44 RDMESVLRAFAARPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTAHKKKKPDVLLYDTIFQIFNNR
100 110 120 130 140 150
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYKTHVEKDFI
::::::::::::::::::: ..:::::::::::: . ::::::::: :.: : : :::::
CCDS44 NCLSLKDKPKVIIVQACRGEKHGELWVRDSPASLALISSQSSENLEADSVCKIHEEKDFI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETPRAKAQMPT
:::::::::::::: : ::::::.::::::::: :::: :.:::::.:::.:.:::::::
CCDS44 AFCSSTPHNVSWRDRTRGSIFITELITCFQKYSCCCHLMEIFRKVQKSFEVPQAKAQMPT
220 230 240 250 260 270
370
pF1KE1 IERLSMTRYFYLFPGN
::: ..:: :::::::
CCDS44 IERATLTRDFYLFPGN
280 290
>>CCDS8329.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 (383 aa)
initn: 1228 init1: 1109 opt: 1236 Z-score: 1425.3 bits: 272.5 E(32554): 4.5e-73
Smith-Waterman score: 1236; 51.0% identity (73.4% similar) in 384 aa overlap (1-377:1-383)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAEGNHRKKPLKVLESLGKDFLTGVLDNLVEQNVLNWKEEEKKKYYDAKTEDKVRVMADS
::. ..: ..:.:. ..:.::.:.. ::: .: :: : .: . ::.:.. ::
CCDS83 MADKVLKEKRKLFIRSMGEGTINGLLDELLQTRVLNKEEMEKVKRENATVMDKTRALIDS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 MQEKQRMAGQMLLQTFFNIDQ-------ISPNKKAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEE
. : .: :. . . . :. .: .: . : : :: : .::: ::
CCDS83 VIPKGAQACQICITYICEEDSYLAGTLGLSAAPQAVQDNPAMPTSSG-SEGNVKLCSLEE
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 FLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEFDHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSV
:. :... ::::: ....:::::::::: ::: .: :.::. ::::: ::..: :::
CCDS83 AQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEFDSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSV
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 DVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLVLMSHGILEGICGTVHDEKKPDVLLYDT
::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::.::::: ::::: :.:. ::.: ..
CCDS83 DVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLVFMSHGIREGICGKKHSEQVPDILQLNA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 IFQIFNNRNCLSLKDKPKVIIVQACRGANRGELWVRDSPASLEVASSQSSENLEEDAVYK
::...:..:: ::::::::::.::::: . : .: .:: . : ..:..:.::. :
CCDS83 IFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRGDSPGVVWFKDSVGVSGNLSLPTTEEFEDDAIKK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 THVEKDFIAFCSSTPHNVSWRDSTMGSIFITQLITCFQKYSWCCHLEEVFRKVQQSFETP
.:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:: .:.:. : .::.::::. ::: :
CCDS83 AHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRLIEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQP
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KE1 RAKAQMPTIERLSMTRYFYLFPGN
..::::: ::...:: ::::::.
CCDS83 DGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
360 370 380
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280 290 300 310 320 330
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CCDS83 YACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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:::.. ...: ....... . : .
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: .: :.::. ::::: ::..: :::::..:::: :: . :.::: :::::.:::::::
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: .:: . : ..:..:.::. :.:.:::::::::::: ::::: ::::.:: .:
CCDS53 WFKDSVGVSGNLSLPTTEEFEDDAIKKAHIEKDFIAFCSSTPDNVSWRHPTMGSVFIGRL
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370
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CCDS53 IEHMQEYACSCDVEEIFRKVRFSFEQPDGRAQMPTTERVTLTRCFYLFPGH
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>>CCDS8331.1 CASP1 gene_id:834|Hs108|chr11 (263 aa)
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CCDS83 MADKVLKEKR---KLFIRSMGEAPQAVQD-
10 20
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 KAHPNMEAGPPESGESTDALKLCPHEEFLRLCKERAEEIYPIKERNNRTRLALIICNTEF
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CCDS83 --NPAM----PTSSGSEGNVKLCSLEEAQRIWKQKSAEIYPIMDKSSRTRLALIICNEEF
30 40 50 60 70 80
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pF1KE1 DHLPPRNGADFDITGMKELLEGLDYSVDVEENLTARDMESALRAFATRPEHKSSDSTFLV
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CCDS83 DSIPRRTGAEVDITGMTMLLQNLGYSVDVKKNLTASDMTTELEAFAHRPEHKTSDSTFLV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
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CCDS83 FMSHGIREGICGKKHSEQVPDILQLNAIFNMLNTKNCPSLKDKPKVIIIQACRG------
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]