Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1294
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1294, 475 aa
1>>>pF1KE1294 475 - 475 aa - 475 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4601+/-0.00117; mu= 4.2583+/- 0.069
mean_var=222.2447+/-46.158, 0's: 0 Z-trim(109.0): 143 B-trim: 78 in 1/52
Lambda= 0.086032
statistics sampled from 10461 (10604) to 10461 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.681), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 2.910
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 475) 3213 412.0 6.8e-115
CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 ( 354) 2256 293.1 3.1e-79
CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 488) 862 120.2 4.8e-27
CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 500) 835 116.9 5e-26
CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 ( 487) 779 109.9 6.1e-24
CCDS31356.1 TRIM68 gene_id:55128|Hs108|chr11 ( 485) 743 105.5 1.3e-22
CCDS6056.2 TRIM35 gene_id:23087|Hs108|chr8 ( 493) 663 95.5 1.3e-19
CCDS3808.1 TRIM60 gene_id:166655|Hs108|chr4 ( 471) 648 93.7 4.7e-19
CCDS10114.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 341) 635 91.9 1.1e-18
CCDS1571.1 TRIM17 gene_id:51127|Hs108|chr1 ( 477) 613 89.3 9.5e-18
CCDS73719.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 296) 603 87.9 1.6e-17
CCDS32437.1 TRIM72 gene_id:493829|Hs108|chr16 ( 477) 573 84.4 3e-16
CCDS78121.1 RPP21 gene_id:202658|Hs108|chr6 ( 503) 562 83.0 8e-16
CCDS76745.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 263) 544 80.5 2.3e-15
CCDS76746.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 ( 279) 544 80.5 2.4e-15
CCDS34377.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 ( 518) 538 80.0 6.4e-15
CCDS34375.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 481) 536 79.8 7.2e-15
CCDS4462.1 TRIM7 gene_id:81786|Hs108|chr5 ( 511) 534 79.5 9e-15
CCDS31390.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 488) 529 78.9 1.3e-14
CCDS31389.1 TRIM6 gene_id:117854|Hs108|chr11 ( 516) 529 78.9 1.4e-14
CCDS475.1 ERMAP gene_id:114625|Hs108|chr1 ( 475) 527 78.6 1.6e-14
CCDS4568.1 TRIM38 gene_id:10475|Hs108|chr6 ( 465) 482 73.1 7.4e-13
CCDS31393.1 TRIM5 gene_id:85363|Hs108|chr11 ( 493) 478 72.6 1.1e-12
CCDS4676.1 TRIM10 gene_id:10107|Hs108|chr6 ( 395) 476 72.2 1.1e-12
CCDS10498.1 MEFV gene_id:4210|Hs108|chr16 ( 781) 479 72.9 1.4e-12
CCDS41612.1 TRIM22 gene_id:10346|Hs108|chr11 ( 498) 473 72.0 1.7e-12
CCDS3851.1 TRIML1 gene_id:339976|Hs108|chr4 ( 468) 472 71.8 1.7e-12
CCDS44525.1 TRIM21 gene_id:6737|Hs108|chr11 ( 475) 472 71.8 1.8e-12
CCDS4654.1 TRIM27 gene_id:5987|Hs108|chr6 ( 513) 468 71.4 2.6e-12
CCDS31391.1 TRIM34 gene_id:53840|Hs108|chr11 ( 488) 466 71.1 3e-12
CCDS31388.1 TRIM34 gene_id:445372|Hs108|chr11 ( 842) 466 71.3 4.5e-12
CCDS4466.1 TRIM41 gene_id:90933|Hs108|chr5 ( 630) 463 70.8 4.7e-12
CCDS4611.1 BTN3A3 gene_id:10384|Hs108|chr6 ( 584) 438 67.7 3.8e-11
CCDS31048.1 TRIM11 gene_id:81559|Hs108|chr1 ( 468) 425 66.0 1e-10
>>CCDS376.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 (475 aa)
initn: 3213 init1: 3213 opt: 3213 Z-score: 2176.1 bits: 412.0 E(32554): 6.8e-115
Smith-Waterman score: 3213; 100.0% identity (100.0% similar) in 475 aa overlap (1-475:1-475)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRRTFAEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRRTFAEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 ALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAHDKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 ALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAHDKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 EQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 EQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 AFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 AFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 RHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 RHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 PGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 PGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 TQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KE1 DYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQPLRINTVRI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 DYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQPLRINTVRI
430 440 450 460 470
>>CCDS81297.1 TRIM62 gene_id:55223|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 2256 init1: 2256 opt: 2256 Z-score: 1535.9 bits: 293.1 E(32554): 3.1e-79
Smith-Waterman score: 2256; 97.4% identity (98.9% similar) in 350 aa overlap (126-475:5-354)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 HDKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTE
:..:. . . :::::::::::::::::::
CCDS81 MPEKTAVDQPWTQALRELKDQLQALQDSEREHTE
10 20 30
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 ALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKV
40 50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 QRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYT
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 GPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 GPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFD
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 VEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 VEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGN
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 QYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 QYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSP
280 290 300 310 320 330
460 470
pF1KE1 GQSHANGKNVQPLRINTVRI
::::::::::::::::::::
CCDS81 GQSHANGKNVQPLRINTVRI
340 350
>>CCDS34378.1 TRIM39 gene_id:56658|Hs108|chr6 (488 aa)
initn: 819 init1: 467 opt: 862 Z-score: 599.0 bits: 120.2 E(32554): 4.8e-27
Smith-Waterman score: 862; 33.5% identity (61.7% similar) in 472 aa overlap (4-470:22-481)
10 20 30 40
pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQ
.:. : ::.:: ..:: . : : ::. :::. :
CCDS34 MAETSLLEAGASAASTAAALENLQVEASCSVCLEYLKEPVIIECGHNFCKACITRWWEDL
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KE1 EAQGARD--CPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPC-QAHDKV
: :: :: ::.: .: :. .:...:: .. :.:. : : : :. .
CCDS34 E----RDFPCPVCRKTSRYRSLRPNRQLGSMVEIAKQ--LQAVKRKIRDESLCPQHHEAL
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 KLFCLTDRALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQL
.::: :. .:..: :. : :. .::: .: ...:. :. :... .: :. .
CCDS34 SLFCYEDQEAVCLICAISHTHRAHTVVPLDDATQEYKEKLQKCLEPLEQKLQEITRCKSS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 LKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYS
... .: : ..: : : . ::.::: : :.:...: .:: . : ..... . .
CCDS34 EEKKPGELKRLVESRRQQILREFEELHRRLDEEQQVLLSRLEEEEQDILQRLRENAAHLG
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 QQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTG--P
.. : . . : .. . .. .: : : :. . :.. ..: .. : . :
CCDS34 DKRRDLAHLAAEVEGKCLQSG-FEMLKDVKSTLEKCE-KVKTMEVTSVSIELEKNFSNFP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 LQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVE
:: ....... : .:::: ::: :.::.: : . . . . : :.:.::
CCDS34 RQYFALRKILKQL---IADVTLDPETAHPNLVLSEDRKSVKFVETRLRDLPDTPRRFTFY
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 VSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQY
::..:.:.:: ::::: :..::.:..:. ....:::: . : :.. . . .:..:
CCDS34 PCVLATEGFTSGRHYWEVEVGDKTHWAVGVCRDSVSRKGELTPLPETGYWRVRLWNGDKY
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 SACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQ
.: : :.: :... : .::.::::. : : :::. : : .::: . : :: : ::
CCDS34 AATTTPFTPLHIKVKPKRVGIFLDYEAGTLSFYNVTDRSHIYTFTDTFTEKLWPLFYPGI
410 420 430 440 450 460
460 470
pF1KE1 SHANGKNVQPLRINTVRI
.:. ::. :: :
CCDS34 -RAGRKNAAPLTIRPPTDWE
470 480
>>CCDS32220.1 TRIM69 gene_id:140691|Hs108|chr15 (500 aa)
initn: 751 init1: 368 opt: 835 Z-score: 580.7 bits: 116.9 E(32554): 5e-26
Smith-Waterman score: 835; 32.2% identity (60.8% similar) in 469 aa overlap (8-470:38-496)
10 20 30
pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITE
:: : .: . ..::. :.: : ::. :: .
CCDS32 SSNIDPGDYVEMNDSITHLPSKVVIQDITMELHCPLCNDWFRDPLMLSCGHNFCEACIQD
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 HWVRQEAQGARDCPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-
: : .:. . ::::. . . : ..::. ...:: .. : :
CCDS32 FW-RLQAKETF-CPECKMLCQYNNCTFNPVLDKLVEKIKKLPL------LKGHPQCPEHG
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DKVKLFCLTDRALLCFFCDEPALH--EQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHT
...::: : :.:: : . : .... :.:: . .:: : :. . .:
CCDS32 ENLKLFSKPDGKLICFQCKDARLSVGQSKEFLQISDAVHFFTEELAIQQGQLETTLKELQ
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 EALQLLKRQLAETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQK
.. :. .: : . :. .. : .::..:. ..: .: ::. . ..: .
CCDS32 TLRNMQKEAIAAHKENKLHLQQHVSMEFLKLHQFLHSKEKDILTELREEGKALNEEMELN
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 VQRYSQQLRKVQEGAQILQERLAETDRHTFLAGVASLSERL-KG-KIHET-NLTYEDFPT
... ..: ... .: . . . :: ...: . : .: :. : .: . .
CCDS32 LSQLQEQCLLAKDMLVSIQAKTEQQNSFDFLKDITTLLHSLEQGMKVLATRELISRKLNL
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 SKYTGPLQYTIWKSLFQDIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSP
..: ::.:: .:. . . . : . ::::: ::: :.:: . : : .:... . . :.:
CCDS32 GQYKGPIQYMVWREMQDTLCPGLSPLTLDPKTAHPNLVLSKSQTSVWHGDIK-KIMPDDP
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 KRFDVEVSVLGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVM
.::: :.::::..:.:: :::: ::.::.:..:...:. :::: . : .::. . .
CCDS32 ERFDSSVAVLGSRGFTSGKWYWEVEVAKKTKWTVGVVRESIIRKGSCPLTPEQGFWLLRL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 HDGNQYSACTEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCS
.. .. .: : :.. ..:::::..:::. : : :::: :. .::: . : ::
CCDS32 RNQTDLKALDLPSFSLTLTNNLDKVGIYLDYEGGQLSFYNAKTMTHIYTFSNTFMEKLYP
420 430 440 450 460 470
460 470
pF1KE1 YFSPGQSHANGKNVQPLRINTVRI
:: : . . :.: .::.:
CCDS32 YFCPCLNDG-GENKEPLHILHPQ
480 490 500
>>CCDS34654.1 TRIM50 gene_id:135892|Hs108|chr7 (487 aa)
initn: 653 init1: 286 opt: 779 Z-score: 543.3 bits: 109.9 E(32554): 6.1e-24
Smith-Waterman score: 779; 29.9% identity (60.7% similar) in 471 aa overlap (5-468:10-468)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MACSLKDELLCSICLSIYQDPVSLGCEHYFCRRCITEHWVRQEAQGARDCPECRR
:.:.: : ::: ....:. : : : .:. :.. . .:. :: ::.
CCDS34 MAWQVSLPELEDRLQCPICLEVFKEPLMLQCGHSYCKGCLVSLSCHLDAE--LRCPVCRQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 TFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDRALLCFFC
. . :...:: ..: .: : . : : . ..::: :. :.: .:
CCDS34 AVDGSSSLPNVSLARVIEALR-LPGDP------EPKVCVHHRNPLSLFCEKDQELICGLC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAETKSSTKSL
. :..: :: .. .......:: .. :.. ... : . : . .. . . .
CCDS34 GLLGSHQHHPVTPVSTVYSRMKEELAALISELKQEQKKVDELIAKLVNNRTRIVNESDVF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 RTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQEGAQILQE
.: . :..::.:. :.. :: . . : .......... .: :. :. . :
CCDS34 SWVIRREFQELHHLVDEEKARCLEGIGGHTRGLVASLDMQLEQ-AQGTRERLAQAECVLE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 RLAETDRHTFLA---GVASLSERLKGKIHETNLTYEDFPTSKYTGPLQYTIWKSLFQDIH
.... :.: :. ..:: .: ... : .. .: . . . .. :.:: ::. .
CCDS34 QFGNEDHHKFIRKFHSMASRAEMPQARPLEGAFSPISFKPGLHQADIKLTVWKRLFRKVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 PVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSSGVH
:.: : :::.::: : :: :.: : : : ..:.::: . ::.:..:: : :
CCDS34 PAPEPLKLDPATAHPLLELSKGNTVVQCG-LLAQRRASQPERFDYSTCVLASRGFSCGRH
300 310 320 330 340
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pF1KE1 YWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACTEPWTRLNVRD
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CCDS34 YWEVVVGSKSDWRLGVIKGTASRKGKLNRSPEHGVWLIGLKEGRVYEAFACPRVPLPVAG
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460
pF1KE1 KLDKVGVFLDYDQGLLIFYNAD---DMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHANGKNVQPL
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CCDS34 HPHRIGLYLHYEQGELTFFDADRPDDLRPLYTFQADFQGKLYPILDTCW-HERGSNSLPM
410 420 430 440 450 460
470
pF1KE1 RINTVRI
CCDS34 VLPPPSGPGPLSPEQPTKL
470 480
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CCDS31 ACSQSPEHEAHSVVPMEDVAWEYKWELHEALEHLK-KEQEEAWKLEVGERKRTATWKIQV
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CCDS31 ETRKQSIVWEFEKYQRLLEKKQPPH-RQLGAEVAAALASLQREAAETMQKLELNHSELIQ
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CCDS31 QSQVLWRMIAELKERSQRPVRWMLQDIQEVLNRSKSWSLQQPEPISLELKTDCRVLGLR-
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CCDS31 EILKTYAADVR-------LDPDTAYSRLIVSEDRKRVHYGDTN-QKLPDNPERFYRYNIV
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pF1KE1 LGSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSAC
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CCDS31 LGSQCISSGRHYWEVEVGDRSEWGLGVCKQNVDRKEVVYLSPHYGFWVIRLRKGNEYRAG
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pF1KE1 TEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDM-SWLYTF-REKFPGKLCSYFSPGQS
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CCDS31 TDEYPILSLPVPPRRVGIFVDYEAHDISFYNVTDCGSHIFTFPRYPFPGRLLPYFSPCYS
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460 470
pF1KE1 HANGKNVQPLRINTVRI
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CCDS31 -IGTNNTAPLAICSLDGED
470 480
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CCDS60 MERSPDVSPGPSRSFKEELLCAVCYDPFRDAVTLRCGHNFCRGCVSRCW---EVQVSPTC
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CCDS60 PVCKDR-ASPADLRTNHTLNNLVEKLLREEAEGARWTSYRFSRVCRLHRGQLSLFCLEDK
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pF1KE1 ALLCFFCDEPALHEQHQVTGIDDAFDELQRELKDQLQALQDSEREHTEALQLLKRQLAET
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CCDS60 ELLCCSCQADPRHQGHRVQPVKDTAHDFRAKCRNMEHAL----REKAKAFWAMRRSYEAI
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CCDS60 AKHNQVEAAWLEGRIRQEFDKLREFLRVEEQAILDAMAEETRQKQLLADEKMKQLTEETE
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. . . :: .. : : .:: : ..:: .. : . . :: : ::: .
CCDS60 VLAHEIERLQMEMKEDDV-SFLMKHKSRKRRLFCTMEPEPVQPGMLIDVCKYLGSLQYRV
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::... ... :: ...::.:: : .::: : :. : .: ..:.::. .:
CCDS60 WKKMLASVESVP--FSFDPNTAAGWLSVSDDLTSVTN---HGYRVQVENPERFSSAPCLL
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pF1KE1 GSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHE-----AASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQ
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CCDS60 GSRVFSQGSHAWEVALGGLQSWRVGVVRVRQDSGAEGHSHSCYHDTRSGFWYVCRTQGVE
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pF1KE1 YSAC--TEPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFS
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CCDS60 GDHCVTSDPATSPLVLAIPRRLRVELECEEGELSFYDAERHCHLYTFHARF-GEVRPYFY
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pF1KE1 PGQSHANGKNVQPLRINTVRI
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CCDS60 LGGARGAGPP-EPLRICPLHISVKEELDG
470 480 490
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CCDS38 CFPYKSFRRNPQLRNLTEIAKQLQIRRSKRKRQKENAMCEKHNQFLTLFCVKDLEILCTQ
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CCDS38 CSFSTKHQKHYICPIKKAASYHREILEGSLEPLRNNIERVEKVIILQGSKSVELKKKVEY
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: :. ::... .:...:. .:.... . :. . ...: .... .. :.
CCDS38 KREEINSEFEQIRLFLQNEQEMILRQIQDEEMNILA-------KLNENLVELSDYVSTLK
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. : :.. .. ... :.. . . . :: . : .:: . : ::. .: .
CCDS38 HLLREVEGKSVQSNLELLTQAKSMHHKYQNLKCPELFSFRLTKYGFSLPPQYS---GLDR
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pF1KE1 DIHPVPAALTLDPGTAHQRLILSDDCTIVAYGNLHPQPLQDSPKRFDVEVSVLGSEAFSS
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CCDS38 IIKPFQVDVILDLNTAHPQLLVSEDRKAVRYERKKRNICYD-PRRFYVCPAVLGSQRFSS
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: ::::: :..: .:..:. .. : . : ::: ::. : . . : : :.
CCDS38 GRHYWEVEVGNKPKWILGVCQDCLLR--NWQDQPSVLGGFWAIGRYMKSGYVASGPKTTQ
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CCDS38 LLPVVKPSKIGIFLDYELGDLSFYNMNDRSILYTFNDCFTEAVWPYFY------TGTDSE
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::.: .:
CCDS38 PLKICSVSDSER
460 470
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CCDS10 MEEELAIQQGQLETTLKELQTLRNMQKEAI
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pF1KE1 AETKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRK
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CCDS10 AAHKENKLHLQQHVSMEFLKLHQFLHSKEKDILTELREEGKALNEEMELNLSQLQEQCLL
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CCDS10 AKDMLVSIQAKTEQQNSFDFLKDITTLLHSLEQGMKVLATRELISRKLNLGQYKGPIQYM
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.:. . . . : . ::::: ::: :.:: . : : .:... . . :.:.::: :.::
CCDS10 VWREMQDTLCPGLSPLTLDPKTAHPNLVLSKSQTSVWHGDIK-KIMPDDPERFDSSVAVL
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pF1KE1 GSEAFSSGVHYWEVVVAEKTQWVIGLAHEAASRKGSIQIQPSRGFYCIVMHDGNQYSACT
::..:.:: :::: ::.::.:..:...:. :::: . : .::. . ... .. .:
CCDS10 GSRGFTSGKWYWEVEVAKKTKWTVGVVRESIIRKGSCPLTPEQGFWLLRLRNQTDLKALD
210 220 230 240 250 260
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pF1KE1 EPWTRLNVRDKLDKVGVFLDYDQGLLIFYNADDMSWLYTFREKFPGKLCSYFSPGQSHAN
: :.. ..:::::..:::. : : :::: :. .::: . : :: :: : . .
CCDS10 LPSFSLTLTNNLDKVGIYLDYEGGQLSFYNAKTMTHIYTFSNTFMEKLYPYFCPCLNDG-
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470
pF1KE1 GKNVQPLRINTVRI
:.: .::.:
CCDS10 GENKEPLHILHPQ
330 340
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CCDS15 MEAVELARKLQEEATCSICLDYFTDPVMTTCGHNFCRACIQLSWEKARGKKGRRKRKGSF
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pF1KE1 DCPECRRTFAEPALAPSLKLANIVERYSSFPLDAILNARRAARPCQAH-DKVKLFCLTDR
:::::. . : :. :....: .. : . . :: : . .:::: :.
CCDS15 PCPECREMSPQRNLLPNRLLTKVAEMAQQHP------GLQKQDLCQEHHEPLKLFCQKDQ
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CCDS15 SPICVVCRESREHRLHRVLPAEEAVQGYKLKLEEDMEYLRE-QITRTGNLQAREEQSLAE
120 130 140 150 160 170
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pF1KE1 TKSSTKSLRTTIGEAFERLHRLLRERQKAMLEELEADTARTLTDIEQKVQRYSQQLRKVQ
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CCDS15 WQGKVKERRERIVLEFEKMNLYLVEEEQRLLQALETEEEETASRLRESVACLDRQGHSLE
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CCDS15 LLLLQLEERSTQGPLQMLQDMKEPLSRKNNVSVQCPEVAPPTRPRTVCRVPGQIEVLRGF
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CCDS15 LEDVVP-------DATSAYPYLLLYESRQRRYLGSSPEGSGFCSKDRFVAYPCAVGQTAF
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CCDS15 SSGRHYWEVGMNITGDALWALGVCRDNVSRKDRVPKCPENGFWVVQLSKGTKYLSTFSAL
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CCDS15 TPVMLMEPPSHMGIFLDFEAGEVSFYSVSDGSHLHTYSQATFPGPLQPFFCLGAPKSGQM
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CCDS15 VISTVTMWVKG
470
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]