Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1198
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1198, 918 aa
1>>>pF1KE1198 918 - 918 aa - 918 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.1619+/-0.0011; mu= -2.8107+/- 0.066
mean_var=418.0526+/-85.332, 0's: 0 Z-trim(115.2): 152 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.062728
statistics sampled from 15597 (15749) to 15597 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.765), E-opt: 0.2 (0.484), width: 16
Scan time: 5.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 920) 6294 584.5 3e-166
CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX ( 388) 2608 250.6 4.3e-66
CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 933) 1513 151.9 5.4e-36
CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 777) 1335 135.7 3.4e-31
CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 778) 1330 135.2 4.6e-31
CCDS59229.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 ( 339) 1267 129.2 1.3e-29
CCDS47298.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 ( 742) 1199 123.3 1.6e-27
CCDS3772.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 984) 872 93.9 1.6e-18
CCDS54811.1 NR3C2 gene_id:4306|Hs108|chr4 ( 867) 696 77.9 9.3e-14
>>CCDS14387.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX (920 aa)
initn: 3288 init1: 3288 opt: 6294 Z-score: 3098.1 bits: 584.5 E(32554): 3e-166
Smith-Waterman score: 6294; 99.6% identity (99.6% similar) in 921 aa overlap (1-918:1-920)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEVQLGLGRVYPRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MEVQLGLGRVYPRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYLVLDEEQQPSQP
:::::::::::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQ-ETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYLVLDEEQQPSQP
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 QSALECHPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFPGLSSCSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSALECHPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFPGLSSCSA
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 DLKDILSEASTMQLLQQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPTSSKDNYLGGTSTISDNAKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DLKDILSEASTMQLLQQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPTSSKDNYLGGTSTISDNAKEL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CKAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRGDCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CKAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRGDCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGESLGCSGSAAAGSSGTLELPSTLSLYKSGALDEAAAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GKSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGESLGCSGSAAAGSSGTLELPSTLSLYKSGALDEAAAY
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 QSRDYYNFPLALAGPPPPPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSRDYYNFPLALAGPPPPPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGA
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470
pF1KE1 AGPGSGSPSAAASSSWHTLFTAEEGQLYGPCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGG---EAGAVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS14 AGPGSGSPSAAASSSWHTLFTAEEGQLYGPCGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVA
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 PYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMR
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 LETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASR
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 NDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 NDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQK
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKW
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 AKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 AKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 RMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 RMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKEL
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEI
840 850 860 870 880 890
900 910
pF1KE1 ISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
:::::::::::::::::::::
CCDS14 ISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
900 910 920
>>CCDS43965.1 AR gene_id:367|Hs108|chrX (388 aa)
initn: 2608 init1: 2608 opt: 2608 Z-score: 1300.0 bits: 250.6 E(32554): 4.3e-66
Smith-Waterman score: 2608; 100.0% identity (100.0% similar) in 381 aa overlap (538-918:8-388)
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 SRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASG
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MILWLHSLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASG
10 20 30
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 CHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 CHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGA
40 50 60 70 80 90
630 640 650 660 670 680
pF1KE1 RKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAG
100 110 120 130 140 150
690 700 710 720 730 740
pF1KE1 HDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFA
160 170 180 190 200 210
750 760 770 780 790 800
pF1KE1 MGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMK
220 230 240 250 260 270
810 820 830 840 850 860
pF1KE1 ALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQP
280 290 300 310 320 330
870 880 890 900 910
pF1KE1 IARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
340 350 360 370 380
>>CCDS8310.1 PGR gene_id:5241|Hs108|chr11 (933 aa)
initn: 1589 init1: 980 opt: 1513 Z-score: 759.7 bits: 151.9 E(32554): 5.4e-36
Smith-Waterman score: 1598; 35.9% identity (60.6% similar) in 951 aa overlap (42-918:46-933)
20 30 40 50 60 70
pF1KE1 PRPPSKTYRGAFQNLFQSVREVIQNPGPRHPEAASAAPPGASLLLLQQQQQQQQQQQQQQ
::. :: : . . ::. . : :. ....
CCDS83 GGPPSPEVGSPLLCRPAAGPFPGSQTSDTLPEV-SAIPISLDGLLFPRPCQGQDPSDEKT
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120
pF1KE1 QQQQQQQQQQETSPRQQQQQQGEDGSPQAHRRGPTGYL--VLDEEQQPSQPQSALECHPE
:.::. .. . . : . . : :: .. . .: : ::: :: : .. .:
CCDS83 QDQQSLSDVEGAYSRAEATR-GAGGSSSSPPEKDSGLLDSVLDTLLAPSGPGQS---QPS
80 90 100 110 120 130
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 RGCVPEPGAAVAASKGL-PQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTFP------GLSSCSADL
: :. :..: : .:: :: :::.: .:.: . : :: .:
CCDS83 ----P-PACEVTSSWCLFGPELP----EDPPAAPATQRVLSPLMSRSGCKVGDSSGTAAA
140 150 160 170 180
190 200 210 220
pF1KE1 KDILSE--ASTMQLL---------------QQQQQEAVSEGSSSGRAREASGAPT-SSKD
. .: . . . ::: . : :: .: : :..: ..:
CCDS83 HKVLPRGLSPARQLLLPASESPHWSGAPVKPSPQAAAVEVEEEDGSESEESAGPLLKGKP
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KE1 NYLGGTSTISDNA---------------KELCKAVSVSMGLGVEALEHLSPGEQLRG---
:::... . : :: . . ..: :: ..::.. .
CCDS83 RALGGAAAGGGAAAVPPGAAAGGVALVPKEDSRFSAPRVAL-VEQDAPMAPGRSPLATTV
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 -DCMYAPLLGVPPAVRPTPCAPLAECKGSLLDDSAGKSTEDTAEYSPFKGGYTKGLEGES
: ...:.: . :. . : : .. : .:: .. . : .. : :.
CCDS83 MDFIHVPILPLNHALLAARTRQLLEDES--YDGGAGAASAFAPPRSSPCASSTPVAVGDF
310 320 330 340 350
330 340 350 360 370
pF1KE1 LGCSGSA-AAGSSGTLEL-----PSTLSLYKSGALDEAAAYQSRDYY---NFPLALAGPP
:. : .. . : : .:.. . ::.: . :.: : :. :
CCDS83 PDCAYPPDAEPKDDAYPLYSDFQPPALKIKEEEEGAEASARSPRSYLVAGANPAAFPDFP
360 370 380 390 400 410
380 390 400 410 420 430
pF1KE1 PPPPPPHPHARIKLENPLDYGSAWAAAAAQCRYGDLASLHGAGAAGPGSGSPSAAASSSW
:::: : : :. : :. .: .:.:.:.: :.:.::.
CCDS83 LGPPPPLP--------P---------RATPSRPGE-----AAVTAAPASASVSSASSSGS
420 430 440 450
440 450 460 470 480
pF1KE1 HT---LFTAE-----EGQLYGP-CGGGGGGG---GGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRP
:. :: .: . : : . :..: : . ..... ::: :: : :
CCDS83 TLECILYKAEGAPPQQGPFAPPPCKAPGASGCLLPRDGLPSTSASAAAAGA-APALY--P
460 470 480 490 500 510
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 PQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSR-VPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARD
:: : :.. : ...... .: : :... : .: .. .
CCDS83 ALGLNGL------PQLGYQAAVLKEGLPQVYP--------PYLN-----Y--LRPDSEAS
520 530 540 550
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 HVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTID
. .. ::: ::::::::::::::.::::::::::::: ::...::::.:::: .:
CCDS83 QSPQYSFESLPQKICLICGDEASGCHYGVLTCGSCKVFFKRAMEGQHNYLCAGRNDCIVD
560 570 580 590 600 610
610 620 630 640 650
pF1KE1 KFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSP------TEETTQK
:.::::::.:::::: .:::.::.::.::...... . .: . .: .. .:.
CCDS83 KIRRKNCPACRLRKCCQAGMVLGGRKFKKFNKVRVVRALDAVALPQPVGVPNESQALSQR
620 630 640 650 660 670
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKW
.: : . . : ..:.: .::: :. :::::..::. ..::.:::.::::::. ::::
CCDS83 FTFSPGQDIQLIPPLINLLMSIEPDVIYAGHDNTKPDTSSSLLTSLNQLGERQLLSVVKW
680 690 700 710 720 730
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 AKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKS
.:.::::::::.:::...::::::.::::..::::. .:...::::::::..:: ::..:
CCDS83 SKSLPGFRNLHIDDQITLIQYSWMSLMVFGLGWRSYKHVSGQMLYFAPDLILNEQRMKES
740 750 760 770 780 790
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 RMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKEL
.:: :. : .. ::: ::.. .::::::.:::.. ::..::..: :.:.: .::.::
CCDS83 SFYSLCLTMWQIPQEFVKLQVSQEEFLCMKVLLLLNTIPLEGLRSQTQFEEMRSSYIREL
800 810 820 830 840 850
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 DRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEI
. :. ..:. .: :.::::::::::... ....:: . .. .:.:. .::.:::::.:.
CCDS83 IKAIGLRQKGVVSSSQRFYQLTKLLDNLHDLVKQLHLYCLNTFIQSRALSVEFPEMMSEV
860 870 880 890 900 910
900 910
pF1KE1 ISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
:..:.::::.: :::. :: .
CCDS83 IAAQLPKILAGMVKPLLFHKK
920 930
>>CCDS4278.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (777 aa)
initn: 1352 init1: 751 opt: 1335 Z-score: 673.6 bits: 135.7 E(32554): 3.4e-31
Smith-Waterman score: 1338; 47.7% identity (73.4% similar) in 436 aa overlap (486-918:368-777)
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 GGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSP
:: .:... . . .:: : : ::
CCDS42 TASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQG-SGDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSP
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
. : : : : : .. :. :: : ::.:.:::::::::.:::
CCDS42 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
400 410 420 430
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGN
::::::::::.::...::::.:::: :::.::::::.:: ::: .:::.: ::: ::
CCDS42 GSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK---
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 LKLQEEGEASSTTSPTEETTQK---LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQ
:.. : ..::. ..::... :. . : ....::.::: :. ::.:..
CCDS42 -KIK--GIQQATTGVSQETSENPGNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSSV
500 510 520 530 540 550
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 PDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRS
::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.::::
CCDS42 PDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWRS
560 570 580 590 600 610
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 FTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLLF
. . .. .: :::::..:: :: ::.:: .: ..:.:. ::.. .:.::::.:::.
CCDS42 YRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLLL
620 630 640 650 660 670
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 SIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIAREL
: .: ::::.:..:::.::.::::: . :. .. : .. .:::::::::::.. ....:
CCDS42 SSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVENL
680 690 700 710 720 730
880 890 900 910
pF1KE1 HQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
.. :. .. . : :..::::.::::. :.:: .:..: . :: .
CCDS42 LNYCFQTFLDKTM-SIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK
740 750 760 770
>>CCDS34258.1 NR3C1 gene_id:2908|Hs108|chr5 (778 aa)
initn: 1151 init1: 751 opt: 1330 Z-score: 671.2 bits: 135.2 E(32554): 4.6e-31
Smith-Waterman score: 1333; 47.8% identity (73.2% similar) in 437 aa overlap (486-918:368-778)
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 GGGGGGGGGGGGGGGGEAGAVAPYGYTRPPQGLAGQESDFTAPDVWYPGGMVSRVPYPSP
:: .:... . . .:: : : ::
CCDS34 TASLSQQQDQKPIFNVIPPIPVGSENWNRCQG-SGDDNLTSLGTLNFPGRTVFSNGYSSP
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
. : : : : : .. :. :: : ::.:.:::::::::.:::
CCDS34 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
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pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQK-YLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLG
::::::::::.::.:. ::::.:::: :::.::::::.:: ::: .:::.: ::: ::
CCDS34 GSCKVFFKRAVEGRQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK--
440 450 460 470 480 490
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 NLKLQEEGEASSTTSPTEETTQK---LTVSHIEGYECQPIFLNVLEAIEPGVVCAGHDNN
:.. : ..::. ..::... :. . : ....::.::: :. ::.:..
CCDS34 --KIK--GIQQATTGVSQETSENPGNKTIVPATLPQLTPTLVSLLEVIEPEVLYAGYDSS
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pF1KE1 QPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVDDQMAVIQYSWMGLMVFAMGWR
::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.:::
CCDS34 VPDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWR
560 570 580 590 600 610
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 SFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLSQEFGWLQITPQEFLCMKALLL
:. . .. .: :::::..:: :: ::.:: .: ..:.:. ::.. .:.::::.:::
CCDS34 SYRQSSANLLCFAPDLIINEQRMTLPCMYDQCKHMLYVSSELHRLQVSYEEYLCMKTLLL
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pF1KE1 FSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTSCSRRFYQLTKLLDSVQPIARE
.: .: ::::.:..:::.::.::::: . :. .. : .. .:::::::::::.. ....
CCDS34 LSSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHEVVEN
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880 890 900 910
pF1KE1 LHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
: .. :. .. . : :..::::.::::. :.:: .:..: . :: .
CCDS34 LLNYCFQTFLDKTM-SIEFPEMLAEIITNQIPKYSNGNIKKLLFHQK
740 750 760 770
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::...::::.:::: .::.::::::.::::
CCDS59 MEGQHNYLCAGRNDCIVDKIRRKNCPACRLR
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pF1KE1 KCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSP------TEETTQKLTVSHIEGYECQP
:: .:::.::.::.::...... . .: . .: .. .:..: : . . :
CCDS59 KCCQAGMVLGGRKFKKFNKVRVVRALDAVALPQPVGVPNESQALSQRFTFSPGQDIQLIP
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pF1KE1 IFLNVLEAIEPGVVCAGHDNNQPDSFAALLSSLNELGERQLVHVVKWAKALPGFRNLHVD
..:.: .::: :. :::::..::. ..::.:::.::::::. ::::.:.::::::::.:
CCDS59 PLINLLMSIEPDVIYAGHDNTKPDTSSSLLTSLNQLGERQLLSVVKWSKSLPGFRNLHID
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pF1KE1 DQMAVIQYSWMGLMVFAMGWRSFTNVNSRMLYFAPDLVFNEYRMHKSRMYSQCVRMRHLS
::...::::::.::::..::::. .:...::::::::..:: ::..: .:: :. : ..
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pF1KE1 QEFGWLQITPQEFLCMKALLLFSIIPVDGLKNQKFFDELRMNYIKELDRIIACKRKNPTS
::: ::.. .::::::.:::.. ::..::..: :.:.: .::.:: . :. ..:. .:
CCDS59 QEFVKLQVSQEEFLCMKVLLLLNTIPLEGLRSQTQFEEMRSSYIRELIKAIGLRQKGVVS
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pF1KE1 CSRRFYQLTKLLDSVQPIARELHQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKV
:.::::::::::... ....:: . .. .:.:. .::.:::::.:.:..:.::::.: :
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pF1KE1 KPIYFHTQ
::. :: .
CCDS59 KPLLFHKK
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:: .:... . . .:: : : ::
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pF1KE1 TCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDYYFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTC
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CCDS47 S-----MRP--DVSSPPSSSSTATTG-----------PPPKLCLVCSDEASGCHYGVLTC
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pF1KE1 GSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNCPSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGN
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CCDS47 GSCKVFFKRAVEGQHNYLCAGRNDCIIDKIRRKNCPACRYRKCLQAGMNLEARKTKK---
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::: ....:: :: ::.. .::::::.:::::::.::::...::::: ::.::.::::
CCDS47 PDSTWRIMTTLNMLGGRQVIAAVKWAKAIPGFRNLHLDDQMTLLQYSWMFLMAFALGWRS
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CCDS47 SSVPKDGLKSQELFDEIRMTYIKELGKAIVKREGNSSQNWQRFYQLTKLLDSMHENVMWL
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pF1KE1 HQFTFDLLIKSHMVSVDFPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
CCDS47 KPESTSHTLI
740
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180 190 200 210 220
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230 240 250 260 270
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. . :.::. .. :.. : :: .: .: :.. . : . .:
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280 290 300 310 320
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:. : : . :.:. . . . :::.:: :: : . . . : : :
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330 340 350 360 370 380
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: . . : .: :.. . .. .::.. .. . . : ... : :
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390 400 410 420 430
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. ... ::. . :: .. . : :: : : :: . ...
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440 450 460 470 480 490
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..:. : : .. ... : ..:: . . :: . . .: . . :. :.:
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500 510 520 530 540 550
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: . : : . :: :. :. : : :. .. ..:
CCDS37 PPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVL---EYIPENVS-SSTLRSVSTGSSR--------
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560 570 580 590 600 610
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620 630 640 650
pF1KE1 PSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLK-LQEEG-----------------EASSTTSPTE
:.:::.:: .:::.::::: ::::.:: ..:: :... .:..
CCDS37 PACRLQKCLQAGMNLGARKSKKLGKLKGIHEEQPQQQQPPPPPPPPQSPEEGTTYIAPAK
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660 670 680 690 700
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: ... : .. . : . ::: ::: .: ::.:...::. :::.::.:. .
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830 840 850 860 870 880
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: :::::: .... .: . .:::::::::::.. .. .: .: : . .:: ..:.
CCDS37 RTNYIKELRKMVTKCPNNSGQSWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVE
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pF1KE1 FPEMMAEIISVQVPKILSGKVKPIYFHTQ
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CCDS37 FPAMLVEIISDQLPKVESGNAKPLYFHRK
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pF1KE1 PSQPQSALEC--HPERGCVPEPGAAVAASKGLPQQLPAPPDEDDSAAPSTLSLLGPTF--
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CCDS54 GHRP-STLSCVNTPLRSFMSDSGSSVNG--GVMRAVVKSPIMCHEKSPSVCSPLNMTSSV
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CCDS54 CSPAGINSVSSTTASFGSFPVHSPITQGTPLTCSPNVENRGSRSHSPAHASNVGSPLSSP
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230 240 250 260 270
pF1KE1 DNYLGGTSTISDNAKELCKAVS-VSMGLGVEALEHLS-PGEQLRGDC-MYAP-------L
. . :.::. .. :.. : :: .: .: :.. . : . .:
CCDS54 LSSM--KSSISSPPSH-CSVKSPVSSPNNVTLRSSVSSPANINNSRCSVSSPSNTNNRST
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280 290 300 310 320
pF1KE1 LGVPPAVR-PTPCAPLAEC-KGSLLDDSAGKST-------EDTAEYSPFKGGYTKGLEGE
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CCDS54 LSSPAASTVGSICSPVNNAFSYTASGTSAGSSTLRDVVPSPDTQEKGAQEVPFPKTEEVE
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330 340 350 360 370 380
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: . . : .: :.. . .. .::.. .. . . : ... : :
CCDS54 S-----AISNGVTGQLNIVQYIKPEPDGAFS-SSCLGGNSKINSDSSFSVPIKQESTKHS
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390 400 410 420 430
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. ... ::. . :: .. . : :: : : :: . ...
CCDS54 CSGTSFKGNPTVNPFPFMDGSYFSFMDDK----DYYSLSGILGPPVPGFDGNCEGSGFPV
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440 450 460 470 480 490
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..:. : : .. ... : ..:: . . :: . . .: . . :. :.:
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pF1KE1 ----TAPDVWYP-GGMVSRVPYPSPTCVKSEMGPWMDSYSGPYGDMRLETARDHVLPIDY
: . : : . :: :. :. : . :. .. ..:
CCDS54 PPVNTLVESWKSHGDLSSRRSDGYPVL---EYIP-ENVSSSTLRSVSTGSSR--------
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pF1KE1 YFPPQKTCLICGDEASGCHYGALTCGSCKVFFKRAAEGKQKYLCASRNDCTIDKFRRKNC
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620 630 640 650 660 670
pF1KE1 PSCRLRKCYEAGMTLGARKLKKLGNLKLQEEGEASSTTSPTEETTQKLTVSHIEGYECQP
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CCDS54 PACRLQKCLQAGMNLG--------------------------------------------
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::.:: ..
CCDS54 ----------------------------------------------------GFKNLPLE
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CCDS54 LQFVRLQLTFEEYTIMKVLLLLSTIPKDGLKSQAAFEEMRTNYIKELRKMVTKCPNNSGQ
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CCDS54 SWQRFYQLTKLLDSMHDLVSDLLEFCFYTFRESHALKVEFPAMLVEIISDQLPKVESGNA
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pF1KE1 KPIYFHTQ
::.::: .
CCDS54 KPLYFHRK
860
918 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Sun Nov 6 20:06:07 2016 done: Sun Nov 6 20:06:08 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]