Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1180
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1180, 697 aa
1>>>pF1KE1180 697 - 697 aa - 697 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1808+/-0.000971; mu= 7.3176+/- 0.060
mean_var=344.8897+/-68.759, 0's: 0 Z-trim(110.0): 2122 B-trim: 131 in 1/51
Lambda= 0.069061
statistics sampled from 15872 (18255) to 15872 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.509), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 8.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 697) 4963 510.4 9.6e-144
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 3955 409.9 1.6e-113
NP_066986 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zinc f ( 714) 3256 340.3 1.5e-92
NP_001191385 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zin ( 714) 3256 340.3 1.5e-92
NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 i ( 686) 2402 255.2 6.2e-67
XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2402 255.2 6.2e-67
XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2402 255.2 6.2e-67
XP_016881865 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 686) 2402 255.2 6.2e-67
XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2402 255.2 6.3e-67
XP_006723111 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2402 255.2 6.3e-67
XP_011524840 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2402 255.2 6.3e-67
XP_006723110 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 710) 2402 255.2 6.3e-67
NP_001311086 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 743) 2262 241.3 1e-62
NP_001311085 (OMIM: 314995) zinc finger protein 41 ( 745) 2262 241.3 1e-62
XP_016881867 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger ( 650) 2233 238.3 7e-62
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2155 230.9 2e-59
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 2155 230.9 2e-59
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2155 230.9 2e-59
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 2155 230.9 2e-59
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 2155 230.9 2e-59
NP_001309066 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2042 219.4 4.2e-56
NP_001309067 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2042 219.4 4.2e-56
NP_001309068 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 782) 2042 219.4 4.2e-56
NP_001309061 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309059 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309057 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309063 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309058 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
XP_016882935 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309060 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_942596 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_150630 (OMIM: 600398) zinc finger protein 160 i ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309065 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309062 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001096073 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001309064 (OMIM: 600398) zinc finger protein 16 ( 818) 2042 219.4 4.3e-56
XP_016882934 (OMIM: 600398) PREDICTED: zinc finger ( 837) 2042 219.4 4.3e-56
NP_001291967 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_001291969 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_001291965 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_001291964 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_001291966 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_001291968 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 666) 2032 218.3 7.6e-56
NP_008886 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33B i ( 778) 2032 218.4 8.3e-56
NP_001291962 (OMIM: 194522) zinc finger protein 33 ( 785) 2032 218.4 8.3e-56
NP_001311106 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 2010 216.1 3.6e-55
NP_001265103 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 2010 216.1 3.6e-55
NP_001265108 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 2010 216.1 3.6e-55
NP_001265100 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 2010 216.1 3.6e-55
NP_001311105 (OMIM: 194521) zinc finger protein 33 ( 699) 2010 216.1 3.6e-55
>>NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 isofor (697 aa)
initn: 4963 init1: 4963 opt: 4963 Z-score: 2701.7 bits: 510.4 E(85289): 9.6e-144
Smith-Waterman score: 4963; 100.0% identity (100.0% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE1 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_057 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
670 680 690
>>NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 isofor (659 aa)
initn: 3951 init1: 3951 opt: 3955 Z-score: 2159.1 bits: 409.9 E(85289): 1.6e-113
Smith-Waterman score: 4616; 94.5% identity (94.5% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-659)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEER-------
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
:::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 -------------------------------EYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
570 580 590 600 610 620
670 680 690
pF1KE1 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_008 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
630 640 650
>>NP_066986 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zinc finge (714 aa)
initn: 3510 init1: 1520 opt: 3256 Z-score: 1782.4 bits: 340.3 E(85289): 1.5e-92
Smith-Waterman score: 3350; 67.4% identity (80.8% similar) in 730 aa overlap (1-696:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
NP_066 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI--ETLIEERGNVPG
::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::. :. .
NP_066 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHI
. . .::. ::: ::.. : :: : : :.:. ::::::::: : :::. :::
NP_066 QIY-METSLVPSSIIAHN---CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK-----
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNH---
:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. :
NP_066 ----TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRA
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 -MEEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGE
. ::::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::
NP_066 YIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYE
:::::: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: ::::::::::
NP_066 KPYECNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSEC
:: :::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.::
NP_066 CSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNEC
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTF
:: . ::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: :::::::::::::
NP_066 GKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTF
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 YLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNS
::::..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: ::
NP_066 NLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK-FSQL-YLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNS
470 480 490 500 510 520
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 ALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNR
:. :. . :::: ::: .:::.:...:: : :.: :: :::: :::::::: .::.: :
NP_066 AFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFR
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 HQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMS--------
:::.::::: :::::::: ::: :::::::::::::::.::..:::.:::::
NP_066 HQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRS
590 600 610 620 630 640
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:::::::::::::::::.::::::.:.:::::::::::::
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690
pF1KE1 NMNVIDVGRLL
::::.:: :
NP_066 NMNVLDVENL
710
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10 20 30 40 50 60
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:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
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::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::. :. .
NP_001 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
70 80 90 100 110
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pF1KE1 KTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHI
. . .::. ::: ::.. : :: : : :.:. ::::::::: : :::. :::
NP_001 QIY-METSLVPSSIIAHN---CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK-----
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:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. :
NP_001 ----TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRA
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. ::::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::
NP_001 YIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGE
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:::::: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: ::::::::::
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:: :::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.::
NP_001 CSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNEC
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:: . ::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: :::::::::::::
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pF1KE1 YLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNS
::::..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: ::
NP_001 NLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK-FSQL-YLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNS
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pF1KE1 ALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNR
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NP_001 AFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFR
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NP_001 HQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRS
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pF1KE1 --------------------YLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRG
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NP_001 HSGEKPYECNECGKVFSQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRG
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690
pF1KE1 NMNVIDVGRLL
::::.:: :
NP_001 NMNVLDVENL
710
>>NP_689697 (OMIM: 613904) zinc finger protein 569 isofo (686 aa)
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pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTV--FIETLIEERGNVPG
:: ::::..: : : . . :.: .:. :..... ::. : .:: ::.::
NP_689 EQEEEPWVMEEEVLRRHWQGEIWGVDEH----QKNQDRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQ
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pF1KE1 LLHIKLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRIL--EKPFEYIECQKAFQKDTVF
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pF1KE1 VNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQ
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. ::::::::::.:::.: :: .: .::..::::::: :::::: : . : :.:.:.
NP_689 KIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMRSHT
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pF1KE1 GEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKL
:::::.:. :::.: : . : : : :.::.:: :..:::.:::.:::. :.. ::: :
NP_689 GEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKP
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pF1KE1 YKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECN
:.:.:: : : .:... :: . :: ::::::::::: : ..: :. : : :.::::: :.
NP_689 YECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICK
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pF1KE1 ECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGK
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NP_689 ECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGK
470 480 490 500 510 520
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pF1KE1 TFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQ
.: : ..: : : : ::::::: ::: ::: : :..: : :.::::: :.::::.: :
NP_689 AFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQ
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pF1KE1 NSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYL
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NP_689 RTSLIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSL
590 600 610 620 630 640
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pF1KE1 TVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
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NP_689 TLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
650 660 670 680
>>XP_016881866 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger pro (686 aa)
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTV--FIETLIEERGNVPG
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XP_016 EQEEEPWVMEEEVLRRHWQGEIWGVDEH----QKNQDRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQ
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pF1KE1 K----TFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKS
: .: .... :::. :. .: ::: .. .. :. ..: ..
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pF1KE1 LLHIKLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRIL--EKPFEYIECQKAFQKDTVF
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XP_016 VKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLD-LIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKL
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pF1KE1 VNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQ
..:.. :. :: : ::..::.: :: : ::: :.:: ::: .::..: :.
XP_016 IKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHE
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pF1KE1 RTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHS
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XP_016 KIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMRSHT
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pF1KE1 GEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKL
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XP_016 YECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICK
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pF1KE1 ECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGK
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XP_016 ECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGK
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pF1KE1 TFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQ
.: : ..: : : : ::::::: ::: ::: : :..: : :.::::: :.::::.: :
XP_016 AFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQ
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pF1KE1 NSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYL
..: :.: ::::: ::: .::: ::: : :::: : :.:::::.:..::::::..: :
XP_016 RTSLIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSL
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pF1KE1 TVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
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XP_016 TLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
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>>XP_011524841 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger pro (686 aa)
initn: 1955 init1: 1955 opt: 2402 Z-score: 1322.7 bits: 255.2 E(85289): 6.2e-67
Smith-Waterman score: 2402; 50.4% identity (72.2% similar) in 695 aa overlap (1-683:1-684)
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pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
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XP_011 MTESQGTVTFKDVAIDFTQEEWKRLDPAQRKLYRNVMLENYNNLITVGYPFTKPDVIFKL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTV--FIETLIEERGNVPG
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XP_011 EQEEEPWVMEEEVLRRHWQGEIWGVDEH----QKNQDRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQ
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pF1KE1 K----TFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKS
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XP_011 KKFANVFPLNSDFFPSRHNLYEYDLFG---KCLE--HNFDCHNNVKCLMRKEHCEY-NEP
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pF1KE1 LLHIKLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRIL--EKPFEYIECQKAFQKDTVF
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XP_011 VKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLD-LIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKL
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pF1KE1 VNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQ
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XP_011 IKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHE
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290 300 310 320 330 340
pF1KE1 RTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHS
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XP_011 KIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKPYACNECGKAFPRIASLALHMRSHT
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pF1KE1 GEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKL
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XP_011 GEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKP
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pF1KE1 YKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECN
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pF1KE1 TFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQ
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XP_011 AFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQ
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pF1KE1 NSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYL
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XP_011 TLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
650 660 670 680
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10 20 30 40 50 60
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.: : ..: : : : ::::::: ::: ::: : :..: : :.::::: :.::::.: :
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XP_016 TLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
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>>XP_006723109 (OMIM: 613904) PREDICTED: zinc finger pro (710 aa)
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10 20 30
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XP_006 HNFDCHNNVKCLMRKEHCEY-NEPVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLD-LIRHL
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pF1KE1 RIL--EKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHM
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XP_006 RIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHT
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: :::::: : . : :.:.:.:::::.:. :::.: : . : : : :.::.:: :.
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710
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10 20 30
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDV
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XP_006 DRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQKKFANVFPLNSDFFPSRHNLYEYDLFG---KCLE--
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XP_006 HNFDCHNNVKCLMRKEHCEY-NEPVKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLD-LIRHL
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pF1KE1 RIL--EKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHM
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XP_006 RIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKLIKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHT
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XP_006 GEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHEKIHTGEKPYECNECGKAFSQKQSLIAHQKVHTGEKP
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pF1KE1 YECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCH
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XP_006 YACNECGKAFPRIASLALHMRSHTGEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECN
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XP_006 ECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKPYECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGK
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XP_006 NLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQRTSLIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAFSQSSSLTIHI
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pF1KE1 RIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHR
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XP_006 RGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSLTLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHT
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XP_006 H
710
697 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 10:27:51 2016 done: Sun Nov 6 10:27:53 2016
Total Scan time: 8.880 Total Display time: 0.180
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]