Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1180
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1180, 697 aa
1>>>pF1KE1180 697 - 697 aa - 697 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6155+/-0.00237; mu= 10.0546+/- 0.141
mean_var=284.6102+/-53.213, 0's: 0 Z-trim(103.0): 999 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.076024
statistics sampled from 6135 (7219) to 6135 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.519), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 3.030
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 697) 4963 559.7 5.3e-159
CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 3955 449.1 9.8e-126
CCDS5337.1 RBAK gene_id:57786|Hs108|chr7 ( 714) 3256 372.5 1.2e-102
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 2402 278.8 1.9e-74
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 2206 257.3 6e-68
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 2167 253.2 1.3e-66
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 2155 251.9 3.5e-66
CCDS59418.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 742) 2137 249.7 1.1e-65
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 2050 240.2 7.9e-63
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 2042 239.4 1.6e-62
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 2042 239.4 1.6e-62
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 2032 238.3 3.3e-62
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 2026 237.7 5.6e-62
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 2010 235.8 1.7e-61
CCDS31182.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 810) 2010 235.9 1.8e-61
CCDS44372.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 811) 2010 235.9 1.8e-61
CCDS60514.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 817) 2010 235.9 1.8e-61
CCDS73088.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 829) 2010 235.9 1.8e-61
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 2006 235.2 1.9e-61
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 2005 235.2 2.3e-61
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2006 235.4 2.3e-61
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 2005 235.2 2.4e-61
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 2005 235.2 2.4e-61
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 2005 235.2 2.4e-61
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1996 234.4 5.8e-61
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1983 232.9 1.4e-60
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1975 232.0 2.5e-60
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1966 231.0 5.2e-60
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1966 231.1 5.6e-60
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1960 230.4 8.5e-60
CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1957 230.1 1.1e-59
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 1957 230.2 1.1e-59
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1957 230.2 1.2e-59
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1957 230.2 1.2e-59
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1944 228.5 2.4e-59
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 1944 228.5 2.5e-59
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1943 228.5 3e-59
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1943 228.5 3e-59
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1936 227.6 4.3e-59
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1936 227.6 4.3e-59
CCDS12500.1 ZNF585B gene_id:92285|Hs108|chr19 ( 769) 1937 227.8 4.5e-59
CCDS12499.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 714) 1935 227.6 5.1e-59
CCDS74353.1 ZNF585A gene_id:199704|Hs108|chr19 ( 769) 1935 227.6 5.3e-59
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1935 227.6 5.5e-59
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1935 227.7 5.6e-59
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1925 226.4 1.1e-58
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1920 225.8 1.4e-58
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 1920 225.9 1.5e-58
CCDS12846.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 731) 1908 224.6 4e-58
CCDS82387.1 ZNF615 gene_id:284370|Hs108|chr19 ( 736) 1908 224.6 4e-58
>>CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 (697 aa)
initn: 4963 init1: 4963 opt: 4963 Z-score: 2968.1 bits: 559.7 E(32554): 5.3e-159
Smith-Waterman score: 4963; 100.0% identity (100.0% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-697)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
610 620 630 640 650 660
670 680 690
pF1KE1 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
670 680 690
>>CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 (659 aa)
initn: 3951 init1: 3951 opt: 3955 Z-score: 2370.8 bits: 449.1 E(32554): 9.8e-126
Smith-Waterman score: 4616; 94.5% identity (94.5% similar) in 697 aa overlap (1-697:1-659)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEERGNVPGKT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFIETLIEER-------
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 -------------------------------EYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKL
120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 EKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHMEEKP
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECN
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGK
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCR
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSAL
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHR
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHT
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKP
570 580 590 600 610 620
670 680 690
pF1KE1 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
630 640 650
>>CCDS5337.1 RBAK gene_id:57786|Hs108|chr7 (714 aa)
initn: 3510 init1: 1520 opt: 3256 Z-score: 1956.1 bits: 372.5 E(32554): 1.2e-102
Smith-Waterman score: 3350; 67.4% identity (80.8% similar) in 730 aa overlap (1-696:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
CCDS53 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI--ETLIEERGNVPG
::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::. :. .
CCDS53 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 KTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHI
. . .::. ::: ::.. : :: : : :.:. ::::::::: : :::. :::
CCDS53 QIY-METSLVPSSIIAHN---CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK-----
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 KLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNH---
:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. :
CCDS53 ----TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRA
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 -MEEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGE
. ::::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::
CCDS53 YIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGE
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 KPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYE
:::::: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: ::::::::::
CCDS53 KPYECNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYE
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 CSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSEC
:: :::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.::
CCDS53 CSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNEC
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 GKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTF
:: . ::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: :::::::::::::
CCDS53 GKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTF
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 YLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNS
::::..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: ::
CCDS53 NLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK-FSQL-YLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNS
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pF1KE1 ALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNR
:. :. . :::: ::: .:::.:...:: : :.: :: :::: :::::::: .::.: :
CCDS53 AFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFR
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pF1KE1 HQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMS--------
:::.::::: :::::::: ::: :::::::::::::::.::..:::.:::::
CCDS53 HQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRS
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CCDS53 HSGEKPYECNECGKVFSQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRG
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690
pF1KE1 NMNVIDVGRLL
::::.:: :
CCDS53 NMNVLDVENL
710
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CCDS12 EQEEEPWVMEEEVLRRHWQGEIWGVDEH----QKNQDRLLRQVEVKFQKTLTEEKGNECQ
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: .: .... :::. :. .: ::: .. .. :. ..: ..
CCDS12 KKFANVFPLNSDFFPSRHNLYEYDLFG---KCLE--HNFDCHNNVKCLMRKEHCEY-NEP
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. ..: .. :. :. .. . . : ...:: :::.: .:.:::.. .
CCDS12 VKSYGNSSSHFVITPFKCNHCGKGFNQTLD-LIRHLRIHTGEKPYECSNCRKAFSHKEKL
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pF1KE1 VNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQ
..:.. :. :: : ::..::.: :: : ::: :.:: ::: .::..: :.
CCDS12 IKHYKIHSREQSYKCNECGKAFIKMSNLIRHQRIHTGEKPYACKECEKSFSQKSNLIDHE
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pF1KE1 GEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKL
:::::.:. :::.: : . : : : :.::.:: :..:::.:::.:::. :.. ::: :
CCDS12 GEKPYKCDKCGKAFSQFSMLIIHVRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSALTVHMRSHTGEKP
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pF1KE1 YKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECN
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CCDS12 YECKECRKAFSHKKNFITHQKIHTREKPYECNECGKAFIQMSNLVRHQRIHTGEKPYICK
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CCDS12 ECGKAFSQKSNLIAHEKIHSGEKPYECNECGKAFSQKQNFITHQKVHTGEKPYDCNECGK
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pF1KE1 TFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQ
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CCDS12 AFSQIASLTLHLRSHTGEKPYECDKCGKAFSQCSLLNLHMRSHTGEKPYVCNECGKAFSQ
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pF1KE1 NSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYL
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CCDS12 RTSLIVHMRGHTGEKPYECNKCGKAFSQSSSLTIHIRGHTGEKPFDCSKCGKAFSQISSL
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pF1KE1 TVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMNVIDVGRLL
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CCDS12 TLHMRKHTGEKPYHCIECGKAFSQKSHLVRHQRIHTH
650 660 670 680
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CCDS33 ENNLTGKRDQHSQGDVENNHI--ENQLTSNFESRLAELQK-VQTEG-----RLYECNETE
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pF1KE1 F----VNHMEEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIH
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CCDS33 LTVHKVVHTRGKSYQCDVCGKIFRKNSYFVRHQRSHTGQKPYICNECGKSFSKSSHLAVH
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CCDS33 AGKKPYKCDVCGKAFRHRSNLVCHRRIHSGEKQYKCNECGKVFSKRSSLAVHRRIHTVEK
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CCDS33 PCKCNECGKVFSKRSSLAVHQRIHTGQKTYKCNKCGKVYSKHSHLAVHWRIHTGEKAYKC
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CCDS33 KVFSDRSAFARHRRIHTGEKPYKCKECGKVFSQCSRLTVHRRIHSGEKPYKCNECGKVYS
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CCDS33 QYSHLVGHRRVHTGEKPYKCHECGKAFNQGSTLNRHQRIHTGEKPYKCNQCGNSFSQRVH
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CCDS33 LRLHQTVHTGDRPYKCNECGKTFKRSSNLTAHQIIHAGKKPYKCDECGKVFRHSSHLVSH
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CCDS33 QRIHTGEKRYKCIECGKAFGRLFSLSKHQRIHSGKKPYKCNECGKSFICRSGLTKHRIRH
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. ::. : : . : : . .. . .:. : . . . . :. .
CCDS46 LPPIGNSNTGEKCQTVTLERH-ECYDVENFYLREIQKNLQDLEFQWKDGEINYKEVPMTY
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..:. :: . . : .. : .:.: : .. :: .... ...:. . . .: . .
CCDS46 KNNLNGKRGQHSQEDVENKCI--ENQLTLSFQSRLTELQKF-QTEGKIYECNQSEKTVNN
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.::. :.. :. :. .. ..: :. . .: .: :::. : :::. ..
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CCDS46 LINHQMVHTTEKPYKCNECGKAFHRGSLLTIHQIVHTRGKPYQCGVCGKIFRQNSDLVNH
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.:.:::::::.::.::::: :. .:..::: :::::::.::::::.: : : :: :
CCDS46 RRSHTGEKPYKCNECGKSFSQSYNLAIHQRIHTGEKPYKCNECGKTFKQGSCLTTHQIIH
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CCDS46 TGEKPYQCDICGKVFRQNSNLVNHQRIHTGEKPYKCNICGKSFSQSSNLATHQTVHSGNK
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CCDS46 NECGKVFSQTSHLVGHRRIHTGEKPYKCDKCGKAFKQGSLLTRHKIIHTREKRYQCGECG
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CCDS46 KVFSENSCLVRHLRIHTGEQPYKCNVCGKVFNYSGNLSIHKRIHTGEKPFQCNECGTVFR
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pF1KE1 QNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSY
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CCDS46 NYSCLARHLRIHTGQKPYKCNVCGKVFNDSGNLSNHKRIHTGEKPFQCNECGKVFSYYSC
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CCDS46 LARHRKIHTGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLIIHTGEKPYNCNEFGGAFIQSSKLARY
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CCDS46 HRNPTGEKPHKCSHCGRTFSHITGLTYHQRRHTGEMPYKCIECGQVFNSTSNLARHRRIH
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CCDS46 IHTGEKPYKCNDCGKAYTQRSSLTKHLIIHTGEKPYNCNEFGGAFIQSSKLARYHRNPTG
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CCDS46 EKPHKCSHCGRTFSHITGLTYHQRRHTGEMPYKCIECGQVFNSTSNLARHRRIHTGEKPY
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pF1KE1 KCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNE
::.:::: : ..:::. : ::::::: :::::: : : :. : . :.:.:::.:::
CCDS46 KCNECGKVFRHQSTLARHRSIHTGEKPYVCNECGKAFRVRSILVNHQKMHTGDKPYKCNE
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:::.: : :. ::: :::::::.: :::: :...: :. :. ::: :::.:.::::.
CCDS46 CGKAFIERSKLVYHQRNHTGEKPYKCIECGKAFGRFSCLNKHQMIHSGEKPYKCNECGKS
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pF1KE1 FYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQN
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CCDS46 FISRSGLTKHQTKHTAESLKTKFNVEKPLDVLLTSGFK
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CCDS75 ECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNSNLSKHLRIHTKEKPCDN-NGCG
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pF1KE1 TSV-SEYISSDGSYARMKADECSGC--GKSLLHIK-LEKTHPGDQAYEFNQNGEPYT-LN
: : :. . . :.:. :.: ::. :.: .. :.. :: . :. .. .
CCDS75 RSYKSPLIGHQKTDAEMEL--CGGSEYGKTS-HLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTS
480 490 500 510 520 530
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pF1KE1 EESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNHME----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTV
. .:.:. :::.: .::.:.:.. : . :.. ::::. : .: : : .
CCDS75 HLRAHQRIHTGEKPYECVECEKTFSHKTHLSVHQRVHTGEKPYECNDCGKSFTYNSALRA
540 550 560 570 580 590
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pF1KE1 HQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRT
:: : ::::::.: :.: ..: . :.: ::::::::::.::.:: . ..: .:::
CCDS75 HQRIHTGEKPYECSDCEKTFAHNSALRAHHRIHTGEKPYECNECGRSFAHISVLKAHQRI
600 610 620 630 640 650
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pF1KE1 HTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGE
:::::::::::::..: . : ::: :.:.:::::: : :.: ... : ::: :.::
CCDS75 HTGEKPYECNECGRSFTYNSALRAHQRIHTGRKPYECSDCEKTFAHNSALKIHQRIHTGE
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380 390 400 410 420 430
pF1KE1 RPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYE
.:: :..: :::...::: ::.:::: :::.:::::: : .:. :.:: : ::::::::
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pF1KE1 CNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNEC
:..::: ::. :::. : : :.:::::::: ::::: ..::. :::.::::::::::.:
CCDS75 CSKCGKTFSQKSYLSGHERIHTGEKPYECNVCGKTFVYKAALIVHQRIHTGEKPYECNQC
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pF1KE1 GKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFF
:: ::: ..: :.: :.: :::::.:::::: .:::: :.::: ::::::: ::: :
CCDS75 GKTFSQRTHLCAHQRIHTGEKPYECNECGKTFADNSALRAHHRIHTGEKPYECNDCGKTF
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pF1KE1 SQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMS
:. :.: : : .::::::::::::::: ..: .. :::.::::: ::: ::: :.. :
CCDS75 SKTSHLRAHLRTRSGEKPYECSECGKTFSEKSYVSAHQRVHTGEKPYECNVCGKPFAHNS
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pF1KE1 YLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNS
: .:.:::.::: .:::.:::.::. :.:..: : :.:::::::.:::: : ..:..
CCDS75 TLRVHQRIHTGEKSYECNDCGKTFSQKSHLSAHQRIHTGEKPYECNECGKAFAQNSTLRV
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680 690
pF1KE1 HQRIHRRGNMNVIDVGRLL
:::::
CCDS75 HQRIHTGEKPYECDECGKTFVRKAALRVHHTRMHTREKTLACNGFGKS
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>--
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:: : . :::.::.:.::.::::.: : .. ::::::::::.:.:::: : :: :::::
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10 20 30 40 50 60
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pF1KE1 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI----ETLIEERGNV
:.::::: .: ::: : :: ...: :. :.:...:: : .:: .:: .: .:
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pF1KE1 PGKTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLL
: :..: : :.::. : ::: . : .:. : :. .:.: :.. . : : :
CCDS75 LEKPFNLEIAPELSEKISCK---CDSHRMNLPVASQLIISERKYSRKKTEYMNVCEKLQL
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:: ::.: ...:: ..:.. .. .... . :.. ::. :: ... :. .. .
CCDS75 DIKHEKAHAEEKSYEHGENAKAFSYKKDQ-HWKFQTLEESFECDGSGQGLYDKTICITPQ
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pF1KE1 E----EKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHT
:: : . . : ... : :. . . : . .: : : : :. . ....:
CCDS75 SFLTGEKSCKDDEFRKNFDKIT-LFNHMRTDTRGKCSDLNEYGTS-CDKTTAVEYNKVHM
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pF1KE1 GEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKP
. ::::. : .: .:. :: ::: :: . .: :.: .:: :. : ::.:..:.:
CCDS75 AMTHYECNERGINFSRKSPLTQSQRTITGWSAFESNKCEENFSQSSAHIVHQKTQAGDKF
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pF1KE1 YECSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHD---CGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLY
: . : .. :: .: ::: :. .. :. . : :.: .:. : .::. :.: : :
CCDS75 GEHNECTDALYQKLDFTAHQRIHTEDKFYLSDEHGKCRKSFYRKAHLIQHQRPHSGEKTY
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pF1KE1 KCSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNE
. ::.: :: .: : :..: : ::::::
CCDS75 QYEECAKSFCSSSHPIQHPGTYVGFKLYECNECGKAFCQNSNLSKHLRIHTKEKPCDNNG
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pF1KE1 CGKTFYLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKT
CCDS75 CGRSYKSPLIGHQKTDAEMELCGGSEYGKTSHLKGHQRILMGEKPYECIECGKTFSKTSH
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:.::: .: :. . : :. . :: ... ::. .. .:..
CCDS59 ERGEETCTTEDEIYSRICSDSGGASGGAYAEIRKIDDPLQHHLQNQSIQKSVKQCHEQNM
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110 120 130 140 150
pF1KE1 FIETLIEERGNVPGK----TFDVETNPVPSRKIAYKNS-----LCDSCEKCLTSVSEYIS
: . . ...:. : :::.. .:. : .....:. : .: : . : . .
CCDS59 FGNIVNQNKGHFLLKQDCDTFDLHEKPLKS-NLSFENQKRSSGLKNSAEFNRDGKSLFHA
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160 170 180 190 200 210
pF1KE1 SDGS-YARMKADECSGCGKSLLHIKLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYT-LNEESLYQKIRIL
. . :..:: . .. :: ..:: ..:. .. :. . :.. .:...
CCDS59 NHKQFYTEMKFPAIAKPINKSQFIKQQRTHNIENAHVCSECGKAFLKLSQFIDHQRVHTG
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220 230 240 250 260
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::: : :::.. . ...:. : : :. . . .::. :.:..:: .:: :::
CCDS59 EKPHVCSMCGKAFSRKSRLMDHQRTHTELKHYECTECDKTFLKKSQLNIHQKTHMGGKPY
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270 280 290 300 310 320
pF1KE1 ECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNE
::.:::.: :: ..: ::::::::::. :. :::.: : .::.::.:::::::: :.:
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CCDS59 CGKGFIEKRRLTAHHRTHTGEKPFICNKCGKGFTLKNSLITHQQTHTGEKLYTCSECGKG
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::.: : ::. ::: : :::.:::: : :: : : ::::::::: :.:: : :.
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pF1KE1 IHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNRHQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSG
:.::::: :.:::: : ..:.:. ::.:::::: :.: :: : : . . : :.:.:.:
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pF1KE1 EKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRGNMN
. : :.:::: : . : .: : :.:::::.:..::: : ::..: ::: :
CCDS59 KTSFACTECGKFSLRKNDLITHQRIHTGEKPYKCSDCGKAFTTKSGLNVHQRKHTGERPY
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690
pF1KE1 VIDVGRLL
CCDS59 GCSDCGKAFAHLSILVKHRRIHR
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..: ..... . . . :.:. . .. : .:. :::..
CCDS12 --------ENQKEYFRQGMIIYDKMSIFNQHTYLSQHSRCHSTEKPYKCKECGKAFRRAS
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: . ::::: . ::.. :.:: :: : :::::.::::.: ..:.. .:::
CCDS12 HHRIHTGEKPYKCEECGKAFIRSSQLTRHQKVHTGEKPYECKECGKAFTQNSQLTLHQRL
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pF1KE1 HTGEKPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGE
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CCDS12 HTGEKLYECKECRKVFTQLSQLILHKRIHTGEKPYECKECGKAFICGSQLSQHQKIHNGE
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:::::. ::..: . . : :::: :.::.:: :..:::.: . : :..::.:::. : :.
CCDS12 KPYECKECGRAFIRGSLLMQHQRIHTGEKPYKCEECGKAFIRGSQLTQHQRIHTNEKPYE
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pF1KE1 CSECGKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNEC
:.:::: : . : :: : : :::::::.:.:::: :.: : :: : : :.:::::::.::
CCDS12 CKECGKMFSHGSQLTQHQRIHTGEKPYQCKECGKAFNRGSLLTRHQRIHTGEKPYECKEC
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CCDS12 GKTFSRGSELTQHERIHTGEKPYECKECGKSFIRGSQLTQHQRIHTGEKPYECKECRMAF
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pF1KE1 YQNSALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNS
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CCDS12 QLTQHQRIHTGEKPYECKECGKAFSHGSQLTLHQRIHTGEKPYECRECRKAFTQSSHLSR
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: : :.:::::.: :::: : . : ...:::::
CCDS12 HQRIHTGEKPYQCKECGKAFTRGSQLTQHQRIHISEKSFEYKECGIDFSHGSQVYM
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pF1KE1 AYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLH----IKLEKTHPGDQA
: .:. :::.. . . .. : :..
CCDS82 SSVQTHRSKKYHELNHFSLLTQRRKANSCGKPYKCNECGKAFTQNSNLTSHRRIHSGEKP
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:. .. :. .:. . ...: :. :::.. :: :.:.... ...: . ::::: :
CCDS82 YKCSECGKTFTVRSNLTIHQVIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHTGEKPYKCN
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250 260 270 280 290 300
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CCDS82 ECGKAFRGHSNLTTHQLIHTGEKPFKCNECGKLFTQNSHLISHWRIHTGEKPYKCNECGK
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.: ...:..:: :::::::.:::::: : . .: .:.:.:.:::::.:. :::.: .
CCDS82 AFSVRSSLAIHQTIHTGEKPYKCNECGKVFRYNSYLGRHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSM
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pF1KE1 KTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCFCRKSTL
...:. :: :.: .:. :..:.:.:.:.: : .:..:::: : :::.:::: : .:.:
CCDS82 HSNLATHQVIHTGTKPFKCNECSKVFTQNSQLANHRRIHTGEKPYKCNECGKAFSVRSSL
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CCDS82 TTHQAIHSGEKPYKCIECGKSFTQKSHLRSHRGIHSGEKPYKCNECGKVFAQTSQLARHW
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CCDS82 RVHTGEKPYKCNDCGRAFSDRSSLTFHQAIHTGEKPYKCHECGKVFRHNSYLATHRRIHT
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:::::.: ::: ::. : :: :. ::.:::::.:..:::.: ::: : :::::::::
CCDS82 GEKPYKCNECGKAFSMHSNLTTHKVIHTGEKPYKCNQCGKVFTQNSHLANHQRTHTGEKP
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pF1KE1 YECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMSYLTVHYRTHSGEKPYECT
:.: :::: :: : :: :. ::.:.::..::::::.:.. ..:. : : :.:::::.::
CCDS82 YRCNECGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNAHLANHRRIHTGEKPYRCT
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670 680 690
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:::: : .:....:. ::
CCDS82 ECGKAFRVRSSLTTHMAIHTGEKRYKCNECGKVFRQSSNLASHHRMHTGEKPYK
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697 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]