Result of FASTA (omim) for
pFN21AE1174
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1174, 635 aa
1>>>pF1KE1174 635 - 635 aa - 635 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9629+/-0.000405; mu= 2.6600+/- 0.025
mean_var=292.0377+/-59.559, 0's: 0 Z-trim(121.2): 315 B-trim: 66 in 1/57
Lambda= 0.075051
statistics sampled from 36939 (37386) to 36939 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.746), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 12.120
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-ric ( 635) 4318 481.6 3.6e-135
NP_076941 (OMIM: 612810) leucine-rich repeat and f ( 635) 4318 481.6 3.6e-135
XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-ric ( 719) 1961 226.5 2.6e-58
NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and f ( 719) 1961 226.5 2.6e-58
NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 719) 1961 226.5 2.6e-58
XP_005259159 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1897 219.6 3.3e-56
XP_016882522 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-ric ( 771) 1897 219.6 3.3e-56
NP_065913 (OMIM: 612807) leucine-rich repeat and f ( 771) 1897 219.6 3.3e-56
NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1657 193.4 1.6e-48
NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat an ( 466) 1657 193.4 1.6e-48
XP_016866600 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 467) 1641 191.6 5.2e-48
XP_011513064 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48
XP_011513063 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48
NP_065788 (OMIM: 612808) leucine-rich repeat and f ( 789) 1642 192.0 6.9e-48
XP_016866599 (OMIM: 612808) PREDICTED: leucine-ric ( 789) 1642 192.0 6.9e-48
XP_016882791 (OMIM: 612809) PREDICTED: leucine-ric ( 628) 1500 176.5 2.5e-43
NP_078785 (OMIM: 612809) leucine-rich repeat and f ( 628) 1500 176.5 2.5e-43
XP_005271426 (OMIM: 608869,615112) PREDICTED: leuc ( 958) 406 58.2 1.5e-07
XP_011515761 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin ( 757) 396 57.1 2.7e-07
NP_653252 (OMIM: 615904) peroxidasin-like protein (1463) 396 57.4 4.3e-07
XP_016877935 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 468) 370 54.0 1.4e-06
XP_011520142 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 370 54.2 1.9e-06
NP_065902 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfamil ( 745) 370 54.2 1.9e-06
NP_001123610 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06
NP_001123608 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06
NP_001123609 (OMIM: 614179) immunoglobulin superfa ( 745) 370 54.2 1.9e-06
XP_011520143 (OMIM: 614179) PREDICTED: immunoglobu ( 745) 370 54.2 1.9e-06
XP_011515759 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 366 54.1 4e-06
NP_612449 (OMIM: 608843) vasorin precursor [Homo s ( 673) 351 52.1 7.4e-06
XP_016869792 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_016869795 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
NP_001245211 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat an ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_016869794 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_011516021 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_011516026 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_011516030 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
NP_689783 (OMIM: 609793) leucine-rich repeat and i ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_016869793 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_016869796 (OMIM: 609793) PREDICTED: leucine-ric ( 606) 348 51.8 8.7e-06
XP_011515758 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1439) 352 52.6 1.1e-05
NP_001017403 (OMIM: 606653) leucine-rich repeat-co ( 967) 326 49.6 6.2e-05
XP_016864013 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 361) 307 47.1 0.00013
XP_016864006 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 759) 313 48.1 0.00014
XP_011530477 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 760) 313 48.1 0.00014
NP_001004432 (OMIM: 609794) leucine-rich repeat an ( 593) 308 47.4 0.00017
NP_004961 (OMIM: 601489,615961) insulin-like growt ( 605) 308 47.4 0.00017
NP_001139478 (OMIM: 601489,615961) insulin-like gr ( 643) 308 47.4 0.00018
XP_011515760 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 313 48.3 0.0002
XP_016868530 (OMIM: 615904) PREDICTED: peroxidasin (1328) 313 48.3 0.0002
XP_011530478 (OMIM: 606654) PREDICTED: relaxin rec ( 733) 307 47.4 0.00021
>>XP_005274296 (OMIM: 612810) PREDICTED: leucine-rich re (635 aa)
initn: 4318 init1: 4318 opt: 4318 Z-score: 2547.8 bits: 481.6 E(85289): 3.6e-135
Smith-Waterman score: 4318; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLADNFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLADNFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLRGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLRGPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLDHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 NLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLDHNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDAEASPAPLVLSFSGNPLHCNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDAEASPAPLVLSFSGNPLHCNC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVLEGQRATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVLEGQRATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIATNPAGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIATNPAGEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGPSDIAASARTAAEGEGTLESEPAVQVTEVTATSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGPSDIAASARTAAEGEGTLESEPAVQVTEVTATSGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVPGADYDLCLLALSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVPGADYDLCLLALSPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVLVAALLVFTVALLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 AGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVLVAALLVFTVALLVR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 GRGAGNGRLPLKLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GRGAGNGRLPLKLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE1 GGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
610 620 630
>>NP_076941 (OMIM: 612810) leucine-rich repeat and fibro (635 aa)
initn: 4318 init1: 4318 opt: 4318 Z-score: 2547.8 bits: 481.6 E(85289): 3.6e-135
Smith-Waterman score: 4318; 100.0% identity (100.0% similar) in 635 aa overlap (1-635:1-635)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLADNFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLADNFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 QALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLRGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 QALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLRGPV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 NLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLDHNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 NLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLDHNL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 IDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDAEASPAPLVLSFSGNPLHCNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 IDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDAEASPAPLVLSFSGNPLHCNC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 ELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVLEGQRATL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 ELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVLEGQRATL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 RCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIATNPAGEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 RCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIATNPAGEA
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 TARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGPSDIAASARTAAEGEGTLESEPAVQVTEVTATSGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 TARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGPSDIAASARTAAEGEGTLESEPAVQVTEVTATSGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 VSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVPGADYDLCLLALSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 VSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVPGADYDLCLLALSPA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 AGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVLVAALLVFTVALLVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 AGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVLVAALLVFTVALLVR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 GRGAGNGRLPLKLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 GRGAGNGRLPLKLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRL
550 560 570 580 590 600
610 620 630
pF1KE1 GGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_076 GGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
610 620 630
>>XP_016876537 (OMIM: 612811) PREDICTED: leucine-rich re (719 aa)
initn: 1926 init1: 764 opt: 1961 Z-score: 1167.9 bits: 226.5 E(85289): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1961; 51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD
:.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.:::::::::::
XP_016 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR
::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . .
XP_016 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD
: ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.::
XP_016 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG
::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.:
XP_016 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL
:::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... ::
XP_016 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA
:::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..::::
XP_016 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE
.::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :.
XP_016 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP
. :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:.
XP_016 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL
:. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::..
XP_016 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC
::..::: . :..: . .::. . :.:.: :::::
XP_016 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
XP_016 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN
600 610 620 630 640 650
>>NP_689660 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fibro (719 aa)
initn: 1926 init1: 764 opt: 1961 Z-score: 1167.9 bits: 226.5 E(85289): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1961; 51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD
:.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.:::::::::::
NP_689 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR
::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . .
NP_689 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD
: ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.::
NP_689 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG
::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.:
NP_689 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL
:::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... ::
NP_689 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA
:::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..::::
NP_689 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE
.::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :.
NP_689 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP
. :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:.
NP_689 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL
:. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::..
NP_689 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC
::..::: . :..: . .::. . :.:.: :::::
NP_689 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
NP_689 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN
600 610 620 630 640 650
>>NP_001333102 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (719 aa)
initn: 1926 init1: 764 opt: 1961 Z-score: 1167.9 bits: 226.5 E(85289): 2.6e-58
Smith-Waterman score: 1961; 51.7% identity (78.8% similar) in 571 aa overlap (5-562:8-575)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD
:.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.:::::::::::
NP_001 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR
::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . .
NP_001 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD
: ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.::
NP_001 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG
::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.:
NP_001 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL
:::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... ::
NP_001 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA
:::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..::::
NP_001 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE
.::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :.
NP_001 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP
. :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::..: .:. ::...:.
NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRMIPPTSKTFLVNNLAA
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL
:. ::::.::. : ..:::::..:: .:.: :: .:.. ::::. . .::..
NP_001 GTMYDLCVLAIYDD-GITSLTATRVVGCIQFTTEQDYVRCHFMQSQFLGGTMIIIIGGII
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KE1 VAALLVFTVALLVRGR-GAGNGRLPL-KLSHVQSQTNGGPSPTPKAHPPRSPPPRPQRSC
::..::: . :..: . .::. . :.:.: :::::
NP_001 VASVLVFIIILMIRYKVCNNNGQHKVTKVSNVYSQTNGAQIQGCSVTLPQSVSKQAVGHE
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630
pF1KE1 SLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAERLEESVV
NP_001 ENAQCCKATSDNVIQSSETCSSQDSSTTTSALPPSWTSSTSVSQKQKRKTGTKPSTEPQN
600 610 620 630 640 650
>>XP_005259159 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-rich re (771 aa)
initn: 1349 init1: 798 opt: 1897 Z-score: 1130.1 bits: 219.6 E(85289): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 1933; 52.1% identity (74.6% similar) in 591 aa overlap (2-576:17-600)
10 20 30 40
pF1KE1 MAPPLLLLLLA--SGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVP
: :.:::: : : . :: :.:::.. .:. :::. ::::::
XP_005 MAPGPFSSALLSPPPAALPFLLLLWAGASRGQPCPGRCICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 PNVDRRTVELRLADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHL
: .:::.:::::.:::: :. :: :::.:: ::::::.: ...: ::.::..::.:::
XP_005 PAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 DGNRLVELGTGSLRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWA
:.:::.:. .::: ::.::::..::. :. .::: :: ..::::::::::. .::
XP_005 DSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 GIGAMPALHTLNLDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDA-EA
..: : :.::.::::::: . :.:.:: .: :::.::::: : :: :: :.. .
XP_005 AVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SPAPLVLSFSGNPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPL
:.::..::.::::::::::::::::.: :::::::.: :. ::::..:: :: :::::
XP_005 PPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 IARHTQ-RLWVLEGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVT
:.:.. : :.::: ..:::::.::: :..:::.:: ::.:::::.:. .:::.. .:
XP_005 ITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTIT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE1 GAGDAGGYTCIATNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGG---RPGPSDIAASARTAAE
:.: .::::.: :::::: ::. :. :: . : .:: ::::. .: .:.
XP_005 TLRDSGTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGAN
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 GEGTLESEPAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHH
. .: . ..:.:..: :. : ::. . :.:.::::: :..:.::..:..:.
XP_005 DSA---AERRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQT
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 FLLKHLVPGADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTL
::.. :. : ::::.::. : . : :::..::..:.: :. :.:: ::::.
XP_005 FLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD-GATALPATRVVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAHFLGGTM
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE1 TVAVGGVLVAALLVFTVALLVRGR--GAGNGR-------LPLKLSHVQSQTNGGPSPTPK
.:.:::.::..::: : :..: . : :..: :: ..::: ::::: . :
XP_005 IIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSRRVKGSRSLP-RVSHVCSQTNG--AGTGA
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 AHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAER
:. : :
XP_005 AQAPALPAQDHYEALREVESQAAPAVAVEAKAMEAETASAEPEVVLGRSLGGSATSLCLL
600 610 620 630 640 650
>>XP_016882522 (OMIM: 612807) PREDICTED: leucine-rich re (771 aa)
initn: 1349 init1: 798 opt: 1897 Z-score: 1130.1 bits: 219.6 E(85289): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 1933; 52.1% identity (74.6% similar) in 591 aa overlap (2-576:17-600)
10 20 30 40
pF1KE1 MAPPLLLLLLA--SGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVP
: :.:::: : : . :: :.:::.. .:. :::. ::::::
XP_016 MAPGPFSSALLSPPPAALPFLLLLWAGASRGQPCPGRCICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 PNVDRRTVELRLADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHL
: .:::.:::::.:::: :. :: :::.:: ::::::.: ...: ::.::..::.:::
XP_016 PAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 DGNRLVELGTGSLRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWA
:.:::.:. .::: ::.::::..::. :. .::: :: ..::::::::::. .::
XP_016 DSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 GIGAMPALHTLNLDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDA-EA
..: : :.::.::::::: . :.:.:: .: :::.::::: : :: :: :.. .
XP_016 AVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SPAPLVLSFSGNPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPL
:.::..::.::::::::::::::::.: :::::::.: :. ::::..:: :: :::::
XP_016 PPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 IARHTQ-RLWVLEGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVT
:.:.. : :.::: ..:::::.::: :..:::.:: ::.:::::.:. .:::.. .:
XP_016 ITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTIT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE1 GAGDAGGYTCIATNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGG---RPGPSDIAASARTAAE
:.: .::::.: :::::: ::. :. :: . : .:: ::::. .: .:.
XP_016 TLRDSGTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGAN
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 GEGTLESEPAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHH
. .: . ..:.:..: :. : ::. . :.:.::::: :..:.::..:..:.
XP_016 DSA---AERRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQT
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 FLLKHLVPGADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTL
::.. :. : ::::.::. : . : :::..::..:.: :. :.:: ::::.
XP_016 FLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD-GATALPATRVVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAHFLGGTM
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE1 TVAVGGVLVAALLVFTVALLVRGR--GAGNGR-------LPLKLSHVQSQTNGGPSPTPK
.:.:::.::..::: : :..: . : :..: :: ..::: ::::: . :
XP_016 IIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSRRVKGSRSLP-RVSHVCSQTNG--AGTGA
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 AHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAER
:. : :
XP_016 AQAPALPAQDHYEALREVESQAAPAVAVEAKAMEAETASAEPEVVLGRSLGGSATSLCLL
600 610 620 630 640 650
>>NP_065913 (OMIM: 612807) leucine-rich repeat and fibro (771 aa)
initn: 1349 init1: 798 opt: 1897 Z-score: 1130.1 bits: 219.6 E(85289): 3.3e-56
Smith-Waterman score: 1933; 52.1% identity (74.6% similar) in 591 aa overlap (2-576:17-600)
10 20 30 40
pF1KE1 MAPPLLLLLLA--SGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVP
: :.:::: : : . :: :.:::.. .:. :::. ::::::
NP_065 MAPGPFSSALLSPPPAALPFLLLLWAGASRGQPCPGRCICQNVAPTLTMLCAKTGLLFVP
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 PNVDRRTVELRLADNFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHL
: .:::.:::::.:::: :. :: :::.:: ::::::.: ...: ::.::..::.:::
NP_065 PAIDRRVVELRLTDNFIAAVRRRDFANMTSLVHLTLSRNTIGQVAAGAFADLRALRALHL
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 DGNRLVELGTGSLRGPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWA
:.:::.:. .::: ::.::::..::. :. .::: :: ..::::::::::. .::
NP_065 DSNRLAEVRGDQLRGLGNLRHLILGNNQIRRVESAAFDAFLSTVEDLDLSYNNLEALPWE
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 GIGAMPALHTLNLDHNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGRDA-EA
..: : :.::.::::::: . :.:.:: .: :::.::::: : :: :: :.. .
NP_065 AVGQMVNLNTLTLDHNLIDHIAEGTFVQLHKLVRLDMTSNRLHKLPPDGLFLRSQGTGPK
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 SPAPLVLSFSGNPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPL
:.::..::.::::::::::::::::.: :::::::.: :. ::::..:: :: :::::
NP_065 PPTPLTVSFGGNPLHCNCELLWLRRLTREDDLETCATPEHLTDRYFWSIPEEEFLCEPPL
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KE1 IARHTQ-RLWVLEGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVT
:.:.. : :.::: ..:::::.::: :..:::.:: ::.:::::.:. .:::.. .:
NP_065 ITRQAGGRALVVEGQAVSLRCRAVGDPEPVVHWVAPDGRLLGNSSRTRVRGDGTLDVTIT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390
pF1KE1 GAGDAGGYTCIATNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGG---RPGPSDIAASARTAAE
:.: .::::.: :::::: ::. :. :: . : .:: ::::. .: .:.
NP_065 TLRDSGTFTCIASNAAGEATAPVEVCVVPLPLMAPPPAAPPPLTEPGSSDIATPGRPGAN
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 GEGTLESEPAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHH
. .: . ..:.:..: :. : ::. . :.:.::::: :..:.::..:..:.
NP_065 DSA---AERRLVAAELTSNSVLIRWPAQRPVPGIRMYQVQYNSSVDDSLVYRMIPSTSQT
430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 FLLKHLVPGADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTL
::.. :. : ::::.::. : . : :::..::..:.: :. :.:: ::::.
NP_065 FLVNDLAAGRAYDLCVLAVYDD-GATALPATRVVGCVQFTTAGDPAPCRPLRAHFLGGTM
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560
pF1KE1 TVAVGGVLVAALLVFTVALLVRGR--GAGNGR-------LPLKLSHVQSQTNGGPSPTPK
.:.:::.::..::: : :..: . : :..: :: ..::: ::::: . :
NP_065 IIAIGGVIVASVLVFIVLLMIRYKVYGDGDSRRVKGSRSLP-RVSHVCSQTNG--AGTGA
540 550 560 570 580 590
570 580 590 600 610 620
pF1KE1 AHPPRSPPPRPQRSCSLDLGDAGCYGYARRLGGAWARRSHSVHGGLLGAGCRGVGGSAER
:. : :
NP_065 AQAPALPAQDHYEALREVESQAAPAVAVEAKAMEAETASAEPEVVLGRSLGGSATSLCLL
600 610 620 630 640 650
>>NP_001317035 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (466 aa)
initn: 1645 init1: 749 opt: 1657 Z-score: 992.3 bits: 193.4 E(85289): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 1657; 54.0% identity (80.1% similar) in 457 aa overlap (5-450:8-462)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD
:.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.:::::::::::
NP_001 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR
::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . .
NP_001 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD
: ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.::
NP_001 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG
::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.:
NP_001 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL
:::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... ::
NP_001 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA
:::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..::::
NP_001 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE
.::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :.
NP_001 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP
. :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::
NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRCFAD
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL
>>NP_001333104 (OMIM: 612811) leucine-rich repeat and fi (466 aa)
initn: 1645 init1: 749 opt: 1657 Z-score: 992.3 bits: 193.4 E(85289): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 1657; 54.0% identity (80.1% similar) in 457 aa overlap (5-450:8-462)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MAPPLLLLLLASGAAACPLPCVCQNLSESLSTLCAHRGLLFVPPNVDRRTVELRLAD
:.:. .: : :: :::: :: .:.::::..::::::::.:::::::::::
NP_001 MEKILFYLFLIGIAVKAQICPKRCVCQILSPNLATLCAKKGLLFVPPNIDRRTVELRLAD
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 NFIQALGPPDFRNMTGLVDLTLSRNAITRIGARAFGDLESLRSLHLDGNRLVELGTGSLR
::. . :: :::.:::::::::.:. : .::.::..::.:::..:::... . .
NP_001 NFVTNIKRKDFANMTSLVDLTLSRNTISFITPHAFADLRNLRALHLNSNRLTKITNDMFS
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GPVNLQHLILSGNQLGRIAPGAFDDFLESLEDLDLSYNNLRQVPWAGIGAMPALHTLNLD
: ::.::::..::: :. :::: . .::.::::::::. .:: .. : .::::.::
NP_001 GLSNLHHLILNNNQLTLISSTAFDDVF-ALEELDLSYNNLETIPWDAVEKMVSLHTLSLD
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 HNLIDALPPGAFAQLGQLSRLDLTSNRLATLAPDPLFSRGR----DAEASPAPLVLSFSG
::.:: .: :.:..: ...:::.:::.: : :::::.:.. .. ::. ..:::.:
NP_001 HNMIDNIPKGTFSHLHKMTRLDVTSNKLQKLPPDPLFQRAQVLATSGIISPSTFALSFGG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 NPLHCNCELLWLRRLARPDDLETCASPPGLAGRYFWAVPEGEFSCEPPLIARHTQRLWVL
:::::::::::::::.: :::::::::: :.:::::..:: :: ::::::.:::... ::
NP_001 NPLHCNCELLWLRRLSREDDLETCASPPLLTGRYFWSIPEEEFLCEPPLITRHTHEMRVL
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 EGQRATLRCRALGDPAPTMHWVGPDDRLVGNSSRARAFPNGTLEIGVTGAGDAGGYTCIA
:::::::::.: ::: :..::..:. .:..:..:. .. ::::.: .: . :.:..::::
NP_001 EGQRATLRCKARGDPEPAIHWISPEGKLISNATRSLVYDNGTLDILITTVKDTGAFTCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400
pF1KE1 TNPAGEATARVELRVLALPHGGNSSAEGGRPGP--SDIAASART-----AAEGEGTLESE
.::::::: :.:... ::: ::. . .: : :::..:... ...:. : :.
NP_001 SNPAGEATQIVDLHIIKLPHLLNSTNHIHEPDPGSSDISTSTKSGSNTSSSNGDTKL-SQ
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KE1 PAVQVTEVTATSGLVSWGPGRPADPVWMFQIQYNSSEDETLIYRIVPASSHHFLLKHLVP
. :.:.:....:.... : . :::::::.. :.::.::
NP_001 DKIVVAEATSSTALLKFNFQRNIPGIRMFQIQYNGTYDDTLVYRCFAD
420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KE1 GADYDLCLLALSPAAGPSDLTATRLLGCAHFSTLPASPLCHALQAHVLGGTLTVAVGGVL
635 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 15:08:55 2016 done: Sun Nov 6 15:08:57 2016
Total Scan time: 12.120 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]