Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1167
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1167, 598 aa
1>>>pF1KE1167 598 - 598 aa - 598 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1218+/-0.000994; mu= 10.9135+/- 0.060
mean_var=121.0832+/-23.903, 0's: 0 Z-trim(108.5): 40 B-trim: 95 in 2/48
Lambda= 0.116555
statistics sampled from 10212 (10250) to 10212 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.677), E-opt: 0.2 (0.315), width: 16
Scan time: 2.770
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 544) 3512 602.0 6.4e-172
CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 ( 412) 2694 464.4 1.3e-130
CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 540) 2288 396.2 5.8e-110
CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 540) 2288 396.2 5.8e-110
CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY ( 541) 2285 395.7 8.2e-110
CCDS35473.1 CDY2B gene_id:203611|Hs108|chrY ( 541) 2285 395.7 8.2e-110
CCDS35486.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY ( 554) 2245 388.9 8.9e-108
CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY ( 554) 2245 388.9 8.9e-108
CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 ( 506) 1327 234.6 2.4e-61
CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 364) 645 119.8 6.2e-27
CCDS43420.2 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 ( 394) 645 119.8 6.6e-27
>>CCDS4491.2 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (544 aa)
initn: 3512 init1: 3512 opt: 3512 Z-score: 3200.0 bits: 602.0 E(32554): 6.4e-172
Smith-Waterman score: 3512; 99.6% identity (100.0% similar) in 537 aa overlap (62-598:8-544)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 RNNVSAPDGPSDPSISVSSEQSGAQQPPALQVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDD
.:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MASEELYEVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSEDD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 TWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHTEKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHTEKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSPK
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 ALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDG
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 FQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPV
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 TAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLHFS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::
CCDS44 TAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFS
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 VRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVL
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 LSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIG
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 LGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 LGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTA
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 QEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANEREC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANEREC
460 470 480 490 500 510
580 590
pF1KE1 EVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
520 530 540
>>CCDS47364.1 CDYL gene_id:9425|Hs108|chr6 (412 aa)
initn: 2694 init1: 2694 opt: 2694 Z-score: 2458.4 bits: 464.4 E(32554): 1.3e-130
Smith-Waterman score: 2694; 99.8% identity (100.0% similar) in 412 aa overlap (187-598:1-412)
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSES
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVDGFQSES
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 PEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPVGALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPGPVTAAMA
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 TGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLHFSVRQTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::
CCDS47 TGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLRFSVRQTE
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 SAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKLVLLSAVG
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 SVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIGLGASI
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 LPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACG
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 KGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANERECEVLKK
340 350 360 370 380 390
580 590
pF1KE1 IWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
::::::::::::::::::::::
CCDS47 IWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
400 410
>>CCDS35487.1 CDY1B gene_id:253175|Hs108|chrY (540 aa)
initn: 2132 init1: 1564 opt: 2288 Z-score: 2087.7 bits: 396.2 E(32554): 5.8e-110
Smith-Waterman score: 2288; 64.0% identity (85.7% similar) in 539 aa overlap (61-598:6-540)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 KRNNVSAPDGPSDPSISVSSEQSGAQQPPALQVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSED
..:: :::::..:.:.:.:::::::::..:
CCDS35 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHTEKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSP
:::::::::.:::. .::::::.:::::. : : :.: ::::.. ::::..:.::.::
CCDS35 DTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTEKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSP
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVD
:. : : :.::: .:::::.. :...: ::. :::.. .: :. :.: :: .: :.
CCDS35 KTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKT-VS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KE1 GFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPG
:::. :::::. :.:::. .:. : . : ::::.. . .. .::::. :. :
CCDS35 GFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 PVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLH
:::.:::: :. :: ..: :.:::::...::: : ...:.. :: ::::: :..:
CCDS35 SVTASMATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 FSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKL
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CCDS35 FTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 VLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPA
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CCDS35 VLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRNNRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPA
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 IGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKL
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CCDS35 IGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 TAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANER
::.:::.:::::::: ::::::::..:::::: ::.:::: :::::::.:.::::::::
CCDS35 TAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANER
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE1 ECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
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CCDS35 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF
520 530 540
>>CCDS14802.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY (540 aa)
initn: 2132 init1: 1564 opt: 2288 Z-score: 2087.7 bits: 396.2 E(32554): 5.8e-110
Smith-Waterman score: 2288; 64.0% identity (85.7% similar) in 539 aa overlap (61-598:6-540)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 KRNNVSAPDGPSDPSISVSSEQSGAQQPPALQVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSED
..:: :::::..:.:.:.:::::::::..:
CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHTEKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSP
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CCDS14 DTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTEKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSP
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVD
:. : : :.::: .:::::.. :...: ::. :::.. .: :. :.: :: .: :.
CCDS14 KTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKT-VS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KE1 GFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPG
:::. :::::. :.:::. .:. : . : ::::.. . .. .::::. :. :
CCDS14 GFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 PVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLH
:::.:::: :. :: ..: :.:::::...::: : ...:.. :: ::::: :..:
CCDS14 SVTASMATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 FSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKL
:..: :::: ::::::.:.::::.:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::
CCDS14 FTIRLTESASTYRDIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEIVNALNSAAADDSKL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 VLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPA
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CCDS14 VLFSAAGSVFCCGLDFGYFVKHLRNNRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPA
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 IGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKL
::::::::::::.::::::::::::::::::::::::.. :::.:: :::::::..::::
CCDS14 IGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 TAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANER
::.:::.:::::::: ::::::::..:::::: ::.:::: :::::::.:.::::::::
CCDS14 TAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANER
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE1 ECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
:::::.:::.::::..:::::.. :::::
CCDS14 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF
520 530 540
>>CCDS14789.1 CDY2A gene_id:9426|Hs108|chrY (541 aa)
initn: 2151 init1: 1556 opt: 2285 Z-score: 2084.9 bits: 395.7 E(32554): 8.2e-110
Smith-Waterman score: 2285; 63.6% identity (85.5% similar) in 539 aa overlap (61-598:6-541)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 KRNNVSAPDGPSDPSISVSSEQSGAQQPPALQVERIVDKRKNKKGKTEYLVRWKGYDSED
..:: :::::..:.:.:.:::::::::..:
CCDS14 MASQEFEVEAIVDKRQDKNGNTQYLVRWKGYDKQD
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DTWEPEQHLVNCEEYIHDFNRRHTEKQKESTLTRTNRTSPNNARKQISRSTNSNFSKTSP
:::::::::.:::. .::::::.:::::. : : :.: ::::.. ::::..:.::.::
CCDS14 DTWEPEQHLMNCEKCVHDFNRRQTEKQKKLTWTTTSRIFSNNARRRTSRSTKANYSKNSP
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KALVIGKDHESKNSQLFAASQKFRKNTAPSLSSRKNMDLAKSGIKILVPKSPVKSRTAVD
:. : : :.::: .:::::.. :...: .::. :::.. .: :. :.: :: . .:.
CCDS14 KTPVTDKHHRSKNCKLFAASKNVRRKAASTLSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKKTVS
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260
pF1KE1 GFQSESPEKLDPVEQGQEDTVAPEVAAEKPV-GALLGPGAERARMGSRPRIHPLVPQVPG
:::. :::::. :.:::. .:. : . : ::::.. . .. ..:::. :. :
CCDS14 GFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSHPGAEQTGIQNKTQMHPLMSQMSG
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 PVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLH
:::.:::: :. :: ..: :.:::::...::: : ...:.. :: : ::: :..:
CCDS14 SVTASMATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRGQPFIKKMH
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 FSVRQTESAYRYRDIVVRKQDGFTHILLSTKSSENNSLNPEVMREVQSALSTAAADDSKL
:..: :::: ::::::.:.::::.:.:::.:.:.:.:: ::..:. .::..::::::::
CCDS14 FTIRLTESAITYRDIVVKKEDGFTQIVLSTRSTEKNALNTEVIKEMVNALNSAAADDSKL
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 VLLSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPA
::.::.:::::::::: ::.:.: .::. : .:...:.:::::::::::::.:.:::::
CCDS14 VLFSAAGSVFCCGLDFGYFVRHLRNDRNTASLEMVDTIKNFVNTFIQFKKPIVVSVNGPA
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 IGLGASILPLCDVVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSTVMFPKIMGGASANEMLLSGRKL
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CCDS14 IGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKL
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 TAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANER
::.:::.:::::::: ::::::::..:::::: : .:::: :::::::.:.::::::::
CCDS14 TAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNAIVLEECKALVRCNIKLELEQANER
460 470 480 490 500 510
570 580 590
pF1KE1 ECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
:::::.:::.::::..:::::.. :::::
CCDS14 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF
520 530 540
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CCDS35 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKYVENKIDEF
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..:: :::::..:.:.:.:::::::::..:
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100 110 120 130 140 150
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CCDS35 SVTASMATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMH
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CCDS35 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLGYKAAFPPRKTQNDQRWCP
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>>CCDS14801.1 CDY1 gene_id:9085|Hs108|chrY (554 aa)
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CCDS14 KTPVTDKHHRSKNRKLFAASKNVRRKAASILSDTKNMEIINSTIETLAPDSPFDHKT-VS
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CCDS14 GFQKL--EKLDPIAADQQDTVVFKVTEGKLLRDPLSRPGAEQTGIQNKTQIHPLMSQMSG
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pF1KE1 PVTAAMATGLAVNGKGTSPFMDALTANGTTNIQTSVTGVTASKRKFIDDRRDQPFDKRLH
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CCDS14 SVTASMATGSATR-KGIVVLIDPLAANGTTDMHTSVPRVKGGQRNITDDSRDQPFIKKMH
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CCDS14 IGLGASILPLCDLVWANEKAWFQTPYTTFGQSPDGCSSITFPKMMGKASANEMLIAGRKL
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CCDS14 TAREACAKGLVSQVFLTGTFTQEVMIQIKELASYNPIVLEECKALVRCNIKLELEQANER
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pF1KE1 ECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
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CCDS14 ECEVLRKIWSSAQGIESMLKIPLLGYKAAFPPRKTQNDQRWCP
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>>CCDS32493.1 CDYL2 gene_id:124359|Hs108|chr16 (506 aa)
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CCDS32 TWEPEHHLLHCEEFIDEFNGLHMSKDK-----RIKSGKQSSTSKLLRDSRGPSVEKLSHR
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CCDS32 PSDPGK---SKGT-----SHK-RKRINPPLAKPKKGYSGKPSSGGDRATKTVSYRTTPSG
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CCDS32 LQ------IMPLKKSQNGMENGDAGSEKDE-RHFGNGSHQPGLDLNDHVGE---QDMGEC
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. :: :: :: :. ::: :: :... : ::: .. ..: :::::..:
CCDS32 DVNHAT-LAENGLGS-----ALT-NGGLNLHSPV------KRK-LEAEKDYVFDKRLRYS
200 210 220 230
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CCDS32 VRQNESNCRFRDIVVRKEEGFTHILLSSQTSDNNALTPEIMKEVRRALCNAATDDSKLLL
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pF1KE1 LSAVGSVFCCGLDFIYFIRRLTDDRKRESTKMAEAIRNFVNTFIQFKKPIIVAVNGPAIG
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CCDS32 LSAVGSVFCSGLDYSYLIGRLSSDRRKESTRIAEAIRDFVKAFIQFKKPIVVAINGPALG
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CCDS32 LGASILPLCDIVWASEKAWFQTPYATIRLTPAGCSSYTFPQILGVALANEMLFCGRKLTA
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pF1KE1 QEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEESKALVRCNMKMELEQANEREC
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CCDS32 QEACSRGLVSQVFWPTTFSQEVMLRVKEMASCSAVVLEESKCLVRSFLKSVLEDVNEKEC
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.::..:.:..:.::...::: :: :
CCDS32 LMLKQLWSSSKGLDSLFSYLQDKIYEV
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>>CCDS4490.1 ECI2 gene_id:10455|Hs108|chr6 (364 aa)
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CCDS44 QNYVDLVSSLSPSLESSSQVEPGTDRKSTGFETLVVTSEDGITKIMFN-RPKKKNAINTE
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CCDS44 MYHEIMRALKAASKDDSIITVLTGNGDYYSSGNDLTNFTDIPPGGVEEKAKNNAVLLREF
140 150 160 170 180 190
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CCDS44 VGCFIDFPKPLIAVVNGPAVGISVTLLGLFDAVYASDRATFHTPFSHLGQSPEGCSSYTF
200 210 220 230 240 250
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pF1KE1 PKIMGGASANEMLLSGRKLTAQEACGKGLVSQVFWPGTFTQEVMVRIKELASCNPVVLEE
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CCDS44 PKIMSPAKATEMLIFGKKLTAGEACAQGLVTEVFPDSTFQKEVWTRLKAFAKLPPNALRI
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pF1KE1 SKALVRCNMKMELEQANERECEVLKKIWGSAQGMDSMLKYLQRKIDEF
:: ..: . .:. .: .::.::. : : . ......:.::
CCDS44 SKEVIRKREREKLHAVNAEECNVLQGRWLSDECTNAVVNFLSRKSKL
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598 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Tue Nov 8 02:19:51 2016 done: Tue Nov 8 02:19:52 2016
Total Scan time: 2.770 Total Display time: 0.090
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]