Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1162
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1162, 567 aa
1>>>pF1KE1162 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1052+/-0.00182; mu= 11.5824+/- 0.108
mean_var=284.3053+/-57.651, 0's: 0 Z-trim(104.6): 958 B-trim: 2 in 1/50
Lambda= 0.076064
statistics sampled from 6951 (7989) to 6951 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 2.150
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 3622 412.4 7.4e-115
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 3622 412.4 7.4e-115
CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 325) 2341 271.5 1.1e-72
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 2167 253.0 1.1e-66
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 2167 253.0 1.1e-66
CCDS46170.1 ZNF845 gene_id:91664|Hs108|chr19 ( 970) 2029 238.0 4.2e-62
CCDS46172.1 ZNF813 gene_id:126017|Hs108|chr19 ( 617) 2015 236.1 9.5e-62
CCDS54310.1 ZNF578 gene_id:147660|Hs108|chr19 ( 590) 1967 230.8 3.6e-60
CCDS46784.1 ZNF860 gene_id:344787|Hs108|chr3 ( 632) 1933 227.1 4.9e-59
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1914 225.3 2.6e-58
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1912 225.1 3e-58
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 1901 223.6 5.7e-58
CCDS33093.2 ZNF28 gene_id:7576|Hs108|chr19 ( 718) 1891 222.6 1.3e-57
CCDS33094.1 ZNF468 gene_id:90333|Hs108|chr19 ( 522) 1841 216.9 4.9e-56
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1818 214.7 3.5e-55
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1799 212.5 1.3e-54
CCDS46165.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 674) 1799 212.5 1.4e-54
CCDS74437.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 458) 1793 211.6 1.7e-54
CCDS77346.1 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 492) 1793 211.6 1.8e-54
CCDS12850.2 ZNF480 gene_id:147657|Hs108|chr19 ( 535) 1793 211.7 1.9e-54
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1790 211.5 2.7e-54
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1790 211.6 2.9e-54
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1790 211.6 3e-54
CCDS46171.1 ZNF765 gene_id:91661|Hs108|chr19 ( 523) 1782 210.4 4.3e-54
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1755 207.5 3.6e-53
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1715 203.4 8.8e-52
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1669 198.0 2.3e-50
CCDS32980.1 ZNF708 gene_id:7562|Hs108|chr19 ( 563) 1651 196.1 9.6e-50
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1638 194.7 2.7e-49
CCDS59367.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 803) 1628 193.8 6.7e-49
CCDS12413.2 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 809) 1628 193.8 6.7e-49
CCDS74321.1 ZNF43 gene_id:7594|Hs108|chr19 ( 818) 1628 193.8 6.7e-49
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1624 193.7 1.2e-48
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1616 192.4 1.5e-48
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1615 192.2 1.6e-48
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1615 192.3 1.6e-48
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1615 192.3 1.6e-48
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1615 192.3 1.6e-48
CCDS46032.1 ZNF492 gene_id:57615|Hs108|chr19 ( 531) 1608 191.4 2.4e-48
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1609 191.6 2.6e-48
CCDS46031.1 ZNF98 gene_id:148198|Hs108|chr19 ( 572) 1606 191.2 3e-48
CCDS42539.1 ZNF676 gene_id:163223|Hs108|chr19 ( 588) 1606 191.2 3e-48
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1604 191.0 3.5e-48
CCDS46102.1 ZNF226 gene_id:7769|Hs108|chr19 ( 803) 1606 191.4 3.6e-48
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1601 190.8 5.1e-48
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1597 190.3 6.2e-48
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1595 190.1 7.6e-48
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1593 189.9 9.2e-48
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1591 189.6 9.4e-48
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1591 189.6 9.9e-48
>>CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 (555 aa)
initn: 3622 init1: 3622 opt: 3622 Z-score: 2175.6 bits: 412.4 E(32554): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 3622; 99.4% identity (99.8% similar) in 510 aa overlap (58-567:46-555)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 CNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 SQDEWKCLNSTQRTLYRDVMLENYRNLVSLDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 KHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::: ::
CCDS12 KHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQIISSTIKTHVSNKYGT
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 DFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 DFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQ
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 KSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCL
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 ALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 ALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQ
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 RIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 RIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHT
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 GEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 GEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKP
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 YKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS12 YKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
500 510 520 530 540 550
>>CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 (555 aa)
initn: 3622 init1: 3622 opt: 3622 Z-score: 2175.6 bits: 412.4 E(32554): 7.4e-115
Smith-Waterman score: 3622; 99.4% identity (99.8% similar) in 510 aa overlap (58-567:46-555)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 CNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SQDEWKCLNSTQRTLYRDVMLENYRNLVSLDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
20 30 40 50 60 70
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
80 90 100 110 120 130
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 KHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.::::::: ::
CCDS54 KHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQIISSTIKTHVSNKYGT
140 150 160 170 180 190
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 DFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQ
200 210 220 230 240 250
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 KSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 KSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCL
260 270 280 290 300 310
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 ALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQ
320 330 340 350 360 370
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 RIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 RIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHT
380 390 400 410 420 430
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 GEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKP
440 450 460 470 480 490
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 YKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 YKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
500 510 520 530 540 550
>>CCDS82393.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 (325 aa)
initn: 2341 init1: 2341 opt: 2341 Z-score: 1418.1 bits: 271.5 E(32554): 1.1e-72
Smith-Waterman score: 2341; 100.0% identity (100.0% similar) in 325 aa overlap (243-567:1-325)
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 SLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLA
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MTVRQVSHSGEKGYKCDLCGKVFSQKSNLA
10 20 30
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 RHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 RHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQK
40 50 60 70 80 90
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 THIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 THIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSLATHQRIHTG
100 110 120 130 140 150
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 EKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPY
160 170 180 190 200 210
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 KCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNE
220 230 240 250 260 270
520 530 540 550 560
pF1KE1 CGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 CGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKPYKRN
280 290 300 310 320
>>CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 (839 aa)
initn: 13766 init1: 2166 opt: 2167 Z-score: 1310.9 bits: 253.0 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 2167; 61.7% identity (78.2% similar) in 514 aa overlap (54-567:87-600)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 PGLECNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTV
: :: :: . :.:.: . ..: ::::.::
CCDS33 ISMLEQGKEPFTLESQVQIAGNPDGWEWIKAVITALSSEFVMKDLLHKGKSNTGEVFQTV
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 TLEQHEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIG
::..:..::: :::..:. : .. : :: : : . : . . ::: ::..:.:
CCDS33 MLERQESQDIEGCSFREVQKNTHGLEYQCRDAEGNYKGVLLTQEGNLTHGRDEHDKRDAR
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 NKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSN
:: ::.:::::. : ::: :: ::::::::.:::: :..::::::: . .::::.:.
CCDS33 NKLIKNQLGLSLQSHLPELQLFQYEGKIYECNQVEKSFNNNSSVSPPQQMPYNVKTHISK
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 KCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGK
: ::: : :::: ::. .::. : .. ..::.. .: ::. :: ::: :::
CCDS33 KYLKDFISSLLLTQGQKANNWGSPYKSNGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGK
240 250 260 270 280 290
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSR
.: .:::. : .::::: :::::: . ::::: :. :...::::::::: :: :::..
CCDS33 AFRTRSNLTTHQVIHTGEKRYKCNECGKVFSRNSQLSQHQKIHTGEKPYKCNECGKVFTQ
300 310 320 330 340 350
330 340 350 360 370 380
pF1KE1 NSCLALHQKTHIGEKPYTCKECGKAFSVRSTLTNHQVIHSGKKPYKCNECGKVFSQTSSL
:: :. :. : ::::: :.:::::: .::.:. ::. :::.::::::::::::.:.: :
CCDS33 NSHLVRHRGIHTGEKPYKCNECGKAFRARSSLAIHQATHSGEKPYKCNECGKVFTQNSHL
360 370 380 390 400 410
390 400 410 420 430 440
pF1KE1 ATHQRIHTGEKPYKCNECGKVFSQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHR
..: ::::::::::::::::.:. :::: : ::::::::::.:::::: ::::: :.
CCDS33 TNHWRIHTGEKPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPYKCHECGKVFRRNSHLARHQ
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KE1 RVHTGEKPYKCNECGKAFSVHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHT
.:::::::::::::::: .::::::::::::::::::::.::: :. .: :..:: :::
CCDS33 LIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHQRIHT
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KE1 GEKPYKCNECGKSFSVRPNLTRHQIIHTGKKPYKCSDCGKSFSVRPNLFRHQIIHTKEKP
: ::: ::::::.::: .:: ::.::::.:::::..::: :. .: ::. ::: :::
CCDS33 GVKPYMCNECGKAFSVYSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKP
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 YKRN
:: :
CCDS33 YKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCN
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>--
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290 300 310 320 330 340
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:: ::: .:: :. ::. : ::::: .:
CCDS33 CNECGKVFTQNSHLARHRGIHTGEKPYKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEY
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::::: .:.::.:::::.:.::::::::::::.:.: :: :.:.::: :::.::::::.:
CCDS33 GKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLARHRRVHTGGKPYQCNECGKAF
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pF1KE1 SQTSSLARHWRIHTGEKPYKCNECGKVFSYNSHLASHRRVHTGEKPYKCNECGKAFSVHS
::::.:::: :.:::::::.::.:::.:: : :..:. .:::.::::::::::.:. .:
CCDS33 SQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNS
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pF1KE1 NLTTHQVIHTGEKPYKCNQCGKGFSVHSSLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKSFSVRPNLTR
.:. :. :::::::::::.:::.:: :.:. :: :::::::: :::: ::. .::
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: :: :: . :.:.: . ..: ::::.::
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90 100 110 120 130 140
pF1KE1 TLEQHEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIG
::..:..::: :::..:. : .. : :: : : . : . . ::: ::..:.:
CCDS54 MLERQESQDIEGCSFREVQKNTHGLEYQCRDAEGNYKGVLLTQEGNLTHGRDEHDKRDAR
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150 160 170 180 190 200
pF1KE1 NKSIKHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSN
:: ::.:::::. : ::: :: ::::::::.:::: :..::::::: . .::::.:.
CCDS54 NKLIKNQLGLSLQSHLPELQLFQYEGKIYECNQVEKSFNNNSSVSPPQQMPYNVKTHISK
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210 220 230 240 250 260
pF1KE1 KCGTDFICSSLLTQEQKSCIREKPYRYIECDKALNHGSHMTVRQVSHSGEKGYKCDLCGK
: ::: : :::: ::. .::. : .. ..::.. .: ::. :: ::: :::
CCDS54 KYLKDFISSLLLTQGQKANNWGSPYKSNGCGMVFPQNSHLASHQRSHTKEKPYKCYECGK
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270 280 290 300 310 320
pF1KE1 VFSQKSNLARHWRVHTGEKPYKCNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSR
.: .:::. : .::::: :::::: . ::::: :. :...::::::::: :: :::..
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330 340 350 360 370 380
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:: :. :. : ::::: :.:::::: .::.:. ::. :::.::::::::::::.:.: :
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..: ::::::::::::::::.:. :::: : ::::::::::.:::::: ::::: :.
CCDS54 TNHWRIHTGEKPYKCNECGKAFGVRSSLAIHLVIHTGEKPYKCHECGKVFRRNSHLARHQ
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.:::::::::::::::: .::::::::::::::::::::.::: :. .: :..:: :::
CCDS54 LIHTGEKPYKCNECGKAFRAHSNLTTHQVIHTGEKPYKCNECGKVFTQNSHLANHQRIHT
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: ::: ::::::.::: .:: ::.::::.:::::..::: :. .: ::. ::: :::
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pF1KE1 YKRN
:: :
CCDS54 YKCNECGKVFRHNSYLSRHQRIHTGEKPYKYNEYGKAFSEHSNLTTHQVIHTGEKPYKCN
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290 300 310 320 330 340
pF1KE1 CNECDRSFSRNSCLALHRRVHTGEKPYKCYECDKVFSRNSCLALHQKTHIGEKPYTCKEC
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CCDS54 SQTSKLARHQRVHTGEKPYECNQCGKAFSVRSSLTTHQAIHTGKKPYKCNECGKVFTQNS
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CCDS54 HLARHRGIHTGEKPYKCNECGKAFSQTSKLARHQRIHTGEKPY---ECGKPFSICSSLTT
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CCDS54 HQTIHTGGKPYKCNVWKVLKSEFKPCKPSQNS
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: ::: :: : ::..::.:::: :.::::.: .: :: : .: :::.:.. :.
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.:. ::::::.:. .::: .. : ::.:..: . .:. : : : ::::.:::::.:
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: :: : : :::.::::::.: ..::.. :. :.:.::::: ::: :: :.::::: :
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..:. : ::: : :.::::.:: : :. :. .:.:.:::::.:: :.:: :.: :.
CCDS46 VIHKAIHTGEKSYKCNECGKTFSQTSYLVYHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSFKSNLERHR
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.:::::::::::::...::. :::.:: :.::::::::::.:::.:: : :. :::.::
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:::::::.:: .::: .::: :. :::::::::::.::: :: :::. :. .::::::
CCDS46 GEKPYKCEECDEAFSFKSNLERHRRIHTGEKPYKCNDCGKTFSQTSSLVYHRRLHTGEKP
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:::.:: ..:: . :: ::.:::::.: :::..:::.:: . .: :: .:: ::::. :
CCDS46 YKCEECDEAFSFKSNLERHRIIHTGEKLYKCNECGKTFSRKSSLTRHCRLHTGEKPYQCN
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CCDS46 ECGKAFRGQSALIYHQAIHGIGKLYKCNDCHQVFSNATTIANHWRIHNEERSYKCNRCGK
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: ... ::.:.:: .. .......
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:: :: :.::..: :. : . : ::::: :.:: :.:: .:.: .:. ::.:.:::::.
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: :.:.. : :: : :::::::::::::::: : ..:.:. : ::.::::::::::::.
CCDS46 CDKAFGRDSHLAQHTRIHTGEKPYKCNECGKNFRHNSALVIHKAIHSGEKPYKCNECGKT
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. :. :. :::::::::::::::.: :. :. ::::.:::::..::: :. . .:
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CCDS46 RHHRIHTGKKH
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pF1KE1 CNGAISAHCNLRLPDSNDSPASASRVAGITDLSRNCVIKELAPQQEGNPGEVFHTVTLEQ
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CCDS46 SQEEWKCLDPAQRTLYRDVMLENYRNLVSLDISSKCMMKEFSSTAQGNR-EVIHTGTLQR
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pF1KE1 HEKHDIEEFCFREIKKKIHDFDCQWRDDERNCNKVTTAPKENLTCRRDQRDRRGIGNKSI
::.: .: :.:: : ::... ::..:::: ... . ..:: :. :.: ::: :
CCDS46 HESHHTGDFRFQEIDKDIHNLEFQWQEDERNSHEAPMTEIKKLTGSADRYDQRHAGNKPI
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pF1KE1 KHQLGLSFLPHPHELQQFQAEGKIYECNHVEKSVNHGSSVSPPQILSSTVKTHVSNKCGT
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CCDS46 KDQLGSSFHSHLPELHMFQTQGKIG--NQVEKSINDASSISTSQRISCRPKTHISNNYGN
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CCDS46 NFRNSSLLTQKQEVHMREKSFQCNESGKAFNYSSLLRKHQIIHLGEKQYKCDVCGKVFNR
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CCDS46 KRNLVCHRRCHTGEKPYRCNECGKTFSQTYSLTCHRRLHTGEKPYKCEECDKAFSFKSNL
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CCDS46 KRHRRIHAGEKPYKCNECGKTFSQTSSLTCHRRLHTGEKPFKCNECGKTFSRKSSLTCHH
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CCDS46 ECGKVFNQKAHLARHHRLHTGEKPYKCNECGKVFNQKANLARHHRLHTGEKPYKFNECGK
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CCDS54 ECGKAHNHLIDSSIKPCMSS
580 590
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30 40 50 60 70 80
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CCDS46 NFFHSSLLTLKQEVHIREKSFQCNESGKAFNCSSLLRKHQIIYLGGKQYKCDVCGKVFNQ
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CCDS46 EGHESYDTENFYFREIRKNLQEVDFQWKDGEINYKEGPMTHKNNLTGQRVRHSQGDVENK
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150 160 170 180 190 200
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CCDS46 HMENQLILRFQSGLGELQKFQTAEKIYGCNQIERTVNNCFLASPLQRIFPGVQTNISRKY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]