Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1091
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1091, 328 aa
1>>>pF1KE1091 328 - 328 aa - 328 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.0527+/-0.000886; mu= 17.2365+/- 0.053
mean_var=113.1762+/-33.382, 0's: 0 Z-trim(107.9): 265 B-trim: 1317 in 2/48
Lambda= 0.120558
statistics sampled from 9397 (9838) to 9397 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.671), E-opt: 0.2 (0.302), width: 16
Scan time: 2.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 ( 328) 2252 402.9 1.9e-112
CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 ( 377) 773 145.7 5.5e-35
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 772 145.5 6.1e-35
CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 ( 373) 659 125.9 5.1e-29
CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX ( 370) 558 108.3 9.9e-24
CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 ( 337) 555 107.7 1.3e-23
CCDS9410.1 LPAR6 gene_id:10161|Hs108|chr13 ( 344) 523 102.2 6.4e-22
CCDS14439.1 CYSLTR1 gene_id:10800|Hs108|chrX ( 337) 515 100.8 1.7e-21
CCDS9492.1 GPR183 gene_id:1880|Hs108|chr13 ( 361) 505 99.1 5.8e-21
CCDS9412.1 CYSLTR2 gene_id:57105|Hs108|chr13 ( 346) 487 95.9 4.9e-20
CCDS3162.1 SUCNR1 gene_id:56670|Hs108|chr3 ( 334) 484 95.4 6.9e-20
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrY ( 359) 479 94.5 1.3e-19
CCDS14115.1 P2RY8 gene_id:286530|Hs108|chrX ( 359) 479 94.5 1.3e-19
CCDS14443.1 GPR174 gene_id:84636|Hs108|chrX ( 333) 455 90.3 2.3e-18
CCDS14442.1 P2RY10 gene_id:27334|Hs108|chrX ( 339) 455 90.3 2.3e-18
CCDS7950.1 APLNR gene_id:187|Hs108|chr11 ( 380) 451 89.7 4e-18
CCDS8553.1 LPAR5 gene_id:57121|Hs108|chr12 ( 372) 449 89.4 5e-18
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 441 87.9 1.3e-17
CCDS3137.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 359) 435 86.9 2.7e-17
CCDS82855.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 388) 435 86.9 2.8e-17
CCDS82854.1 AGTR1 gene_id:185|Hs108|chr3 ( 394) 435 86.9 2.8e-17
CCDS12350.1 F2RL3 gene_id:9002|Hs108|chr19 ( 385) 430 86.1 5.1e-17
CCDS12669.1 GPR4 gene_id:2828|Hs108|chr19 ( 362) 427 85.5 7e-17
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 427 85.6 7.7e-17
CCDS8927.1 GPR182 gene_id:11318|Hs108|chr12 ( 404) 424 85.0 1.1e-16
CCDS2733.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 357) 423 84.8 1.1e-16
CCDS2732.1 CCR9 gene_id:10803|Hs108|chr3 ( 369) 423 84.8 1.2e-16
CCDS4033.1 F2RL1 gene_id:2150|Hs108|chr5 ( 397) 423 84.9 1.2e-16
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 422 84.6 1.2e-16
CCDS2931.1 GPR15 gene_id:2838|Hs108|chr3 ( 360) 422 84.6 1.3e-16
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 417 83.7 2.2e-16
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 414 83.3 3.5e-16
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 414 83.3 3.5e-16
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 414 83.3 3.6e-16
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 414 83.3 3.6e-16
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 414 83.3 3.6e-16
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 414 83.3 3.6e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 414 83.3 3.7e-16
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 414 83.3 3.7e-16
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 414 83.4 3.8e-16
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 413 83.1 3.8e-16
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 414 83.4 4.1e-16
CCDS4032.1 F2R gene_id:2149|Hs108|chr5 ( 425) 413 83.2 4.2e-16
CCDS2737.1 CCR1 gene_id:1230|Hs108|chr3 ( 355) 411 82.7 4.8e-16
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 407 82.0 8e-16
CCDS14569.1 AGTR2 gene_id:186|Hs108|chrX ( 363) 406 81.9 8.8e-16
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 402 81.2 1.4e-15
CCDS77026.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 372) 400 80.8 1.9e-15
CCDS11369.1 CCR7 gene_id:1236|Hs108|chr17 ( 378) 400 80.8 1.9e-15
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 398 80.5 2.3e-15
>>CCDS8220.1 P2RY6 gene_id:5031|Hs108|chr11 (328 aa)
initn: 2252 init1: 2252 opt: 2252 Z-score: 2132.5 bits: 402.9 E(32554): 1.9e-112
Smith-Waterman score: 2252; 100.0% identity (100.0% similar) in 328 aa overlap (1-328:1-328)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICVITQICTSRRALTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICVITQICTSRRALTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 TAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFYANLHGSILFLTCI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 TAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFYANLHGSILFLTCI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SFQRYLGICHPLAPWHKRGGRRAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFAATGIQRNRTVCYDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SFQRYLGICHPLAPWHKRGGRRAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFAATGIQRNRTVCYDL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 SPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQDGPAEPVAQERRGKAARM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQDGPAEPVAQERRGKAARM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 AVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKGTRPFASANSVLDPIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKGTRPFASANSVLDPIL
250 260 270 280 290 300
310 320
pF1KE1 FYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
310 320
>>CCDS8219.1 P2RY2 gene_id:5029|Hs108|chr11 (377 aa)
initn: 644 init1: 386 opt: 773 Z-score: 741.6 bits: 145.7 E(32554): 5.5e-35
Smith-Waterman score: 773; 42.6% identity (68.1% similar) in 310 aa overlap (3-310:16-315)
10 20 30 40
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICV
:: :. :: : . :.:: .::: :..: . :: :: .
CCDS82 MAADLGPWNDTINGTWD---GDELGY---RCRFNEDFKYVLLPVSYGVVCVPGLCLNAVA
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ITQICTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFY
. . .. . ...: ..::..: ::: :::::.: ::.::::::. :.:::::::
CCDS82 LYIFLCRLKTWNASTTYMFHLAVSDALYAASLPLLVYYYARGDHWPFSTVLCKLVRFLFY
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ANLHGSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGR-RAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFA
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CCDS82 TNLYCSILFLTCISVHRCLGVLRPLRSL--RWGRARYARRVAGAVWVLVLACQAPVLYFV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 ATGIQRNRTVCYDLSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQD-GP
.:. . .:..:.: : : : .... :. .. . : .:::..:.:: :.: :: . :
CCDS82 TTSARGGRVTCHDTSAPELFSRFVAYSSVMLGLLFAVPFAVILVCYVLMARRLLKPAYGT
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 AEPVAQERRGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKG
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CCDS82 SGGLPRAKR-KSVRTIAVVLAVFALCFLPFHVTRTLYYSFRSLD-LSCHTLNAINMAYKV
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE1 TRPFASANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
:::.::::: :::.:.... ... :
CCDS82 TRPLASANSCLDPVLYFLAGQRLVRFARDAKPPTGPSPATPARRRLGLRRSDRTDMQRIE
300 310 320 330 340 350
>>CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX (365 aa)
initn: 754 init1: 406 opt: 772 Z-score: 740.8 bits: 145.5 E(32554): 6.1e-35
Smith-Waterman score: 772; 42.9% identity (65.0% similar) in 317 aa overlap (9-315:10-320)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPP--------TTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICVITQI
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CCDS14 MASTESSLLRSLGLSPGPGSSEVELDCWFDEDFKFILLPVSYAVVFVLGLGLNAPTLWLF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 CTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFYANLH
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CCDS14 IFRLRPWDATATYMFHLALSDTLYVLSLPTLIYYYAAHNHWPFGTEICKFVRFLFYWNLY
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 GSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGR-RAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFAATGI
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CCDS14 CSVLFLTCISVHRYLGICHPLRAL--RWGRPRLAGLLCLAVWLVVAGCLVPNLFFVTTSN
130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 QRNRTVCYDLSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQDGPAEPVA
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CCDS14 KGTTVLCHDTTRPEEFDHYVHFSSAVMGLLFGVPCLVTLVCYGLMARRLYQ---PLPGSA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280
pF1KE1 QER-RGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAAYKGTRPF
: : .. : .:: ..::. :.:::::.: : .: . : ::. ..:: :::.
CCDS14 QSSSRLRSLRTIAVVLTVFAVCFVPFHITRTIYYLARLLEA-DCRVLNIVNVVYKVTRPL
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE1 ASANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
::::: :::.:. .: :.::. ..:
CCDS14 ASANSCLDPVLYLLTGDKYRRQLRQLCGGGKPQPRTAASSLALVSLPEDSSCRWAATPQD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS3169.1 P2RY1 gene_id:5028|Hs108|chr3 (373 aa)
initn: 577 init1: 363 opt: 659 Z-score: 634.5 bits: 125.9 E(32554): 5.1e-29
Smith-Waterman score: 659; 36.3% identity (62.2% similar) in 331 aa overlap (3-326:25-345)
10 20 30
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPPTT--CVY-RENFKQLLLPPVYSA
: :.: . . .. :. . .:. :: ::
CCDS31 MTEVLWPAVPNGTDAAFLAGPGSSWGNSTVASTAAVSSSFKCALTKTGFQFYYLPAVYIL
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 VLAAGLPLNICVITQICTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFG
:. :. : .: .. . . .:: .::::::.::. .:: ::. : . : ::
CCDS31 VFIIGFLGNSVAIWMFVFHMKPWSGISVYMFNLALADFLYVLTLPALIFYYFNKTDWIFG
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 DFACRLVRFLFYANLHGSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGRRAAWLVCVAVWLAV
: :.: ::.:..::.:::::::::: .:: :. .:: : .. : . : ::: :
CCDS31 DAMCKLQRFIFHVNLYGSILFLTCISAHRYSGVVYPLKSLG-RLKKKNAICISVLVWLIV
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 TTQCLPTAIFAATGIQRNRTV-CYDLSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCL
.. : ....::...:.:. ::: . :. :.: :: : .:.. .:.:: :
CCDS31 VVAISPILFYSGTGVRKNKTITCYDTTSDEYLRSYFIYSMCTTVAMFCVPLVLILGCYGL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 LACRLCRQDGPAEPVAQERRGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVR---STPGV
.. : .: :. :: :. ....: ..::.:..:::. :: : .: .::..
CCDS31 IVRALIYKDLDNSPL---RR-KSIYLVIIVLTVFAVSYIPFHVMKTMNLRARLDFQTPAM
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320
pF1KE1 PCTVLEAFAAAYKGTRPFASANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
:. . :.:. :: .:: :: .::::.... :::: :.. : : .:.
CCDS31 -CAFNDRVYATYQVTRGLASLNSCVDPILYFLAGDTFRRR----LSRATRKASRRSEANL
300 310 320 330 340 350
CCDS31 QSKSEDMTLNILPEFKQNGDTSL
360 370
>>CCDS14441.1 LPAR4 gene_id:2846|Hs108|chrX (370 aa)
initn: 431 init1: 178 opt: 558 Z-score: 539.6 bits: 108.3 E(32554): 9.9e-24
Smith-Waterman score: 558; 32.1% identity (62.5% similar) in 296 aa overlap (17-310:30-320)
10 20 30 40
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICV
::. ..:: : :::.:. :: :
CCDS14 MGDRRFIDFQFQDSNSSLRPRLGNATANNTCIVDDSFKYNLNGAVYSVVFILGLITNSVS
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE1 ITQICTSRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFY
. .: . ..::.. :::..:::..:.::. :. : . :::::: :.. :
CCDS14 LFVFCFRMKMRSETAIFITNLAVSDLLFVCTLPFKIF-YNFNRHWPFGDTLCKISGTAFL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE1 ANLHGSILFLTCISFQRYLGICHPLAPWHKRGGRRAAWLVCVAVWLAVTTQCLPTAIFAA
.:..::.::::::: .:.:.: .:. : :: . .::..::. : . . ...:..
CCDS14 TNIYGSMLFLTCISVDRFLAIVYPFRSRTIRT-RRNSAIVCAGVWILVLSGGISASLFST
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE1 TGIQRNRTVCYD-LSPPALATHYMPYGMALTVIGFLLPFAALLACYCLLACRLCRQDGPA
:... :.:.. .: . :. . . :.::..:. ..: .. : :. .
CCDS14 TNVNNATTTCFEGFSKRVWKTYLSKITIFIEVVGFIIPLILNVSCSSVVL-RTLRKPATL
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KE1 EPVAQERRGKAARMAVVVAAAFAISFLPFHITKTAYLAVRSTPGVPCTVLEAFAAA-YKG
.. ... :. .: .: :.:.. :.:.. . : ::: . : :: :: :
CCDS14 SQIGTNKK-KVLKMITVHMAVFVVCFVPYNSVLFLYALVRSQAITNC-FLERFAKIMYPI
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320
pF1KE1 TRPFASANSVLDPILFYFTQKKFRRRPHELLQKLTAKWQRQGR
: .:. : .::...::: ..:..
CCDS14 TLCLATLNCCFDPFIYYFTLESFQKSFYINAHIRMESLFKTETPLTTKPSLPAIQEEVSD
300 310 320 330 340 350
>>CCDS9482.1 OXGR1 gene_id:27199|Hs108|chr13 (337 aa)
initn: 549 init1: 337 opt: 555 Z-score: 537.2 bits: 107.7 E(32554): 1.3e-23
Smith-Waterman score: 555; 32.5% identity (61.2% similar) in 289 aa overlap (24-310:31-311)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MEWDNGTGQALGLPPTTCVYRENFKQLLLPPVYSAVLAAGLPLNICVITQICT
.:. :: .:. .. .:.: : ::.
CCDS94 MNEPLDYLANASDFPDYAAAFGNCTDENIPLKMHYLPVIYGIIFLVGFPGNAVVISTYIF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 SRRALTRTAVYTLNLALADLLYACSLPLLIYNYAQGDHWPFGDFACRLVRFLFYANLHGS
. : ... :::: .:::: :::.::. ::.:..: :::: :...:: :. ::..:
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::..: ::. . :.. ::. : ::.. . :: . : . . :
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