Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1088, 906 aa
1>>>pF1KE1088 906 - 906 aa - 906 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5892+/-0.00116; mu= 19.3143+/- 0.070
mean_var=65.4632+/-12.706, 0's: 0 Z-trim(101.8): 49 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.158517
statistics sampled from 6608 (6656) to 6608 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.551), E-opt: 0.2 (0.204), width: 16
Scan time: 3.710
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 6027 1388.0 0
CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 906) 5976 1376.3 0
CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 5833 1343.6 0
CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 916) 5782 1331.9 0
CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 837) 5508 1269.3 0
CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 ( 826) 4923 1135.5 0
CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 4164 961.9 0
CCDS43274.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 883) 4120 951.9 0
CCDS8333.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 902) 4061 938.4 0
CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 ( 836) 4059 937.9 0
CCDS41706.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 884) 4023 929.7 0
CCDS14605.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 3901 901.8 0
CCDS14604.1 GRIA3 gene_id:2892|Hs108|chrX ( 894) 3858 891.9 0
CCDS82656.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 934) 2062 481.2 3.8e-135
CCDS33530.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 905) 2061 481.0 4.3e-135
CCDS416.1 GRIK3 gene_id:2899|Hs108|chr1 ( 919) 2050 478.5 2.5e-134
CCDS55045.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 892) 2000 467.0 6.8e-131
CCDS5049.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 869) 1984 463.4 8.3e-130
CCDS5048.1 GRIK2 gene_id:2898|Hs108|chr6 ( 908) 1984 463.4 8.7e-130
CCDS12595.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 980) 1646 386.1 1.7e-106
CCDS77305.1 GRIK5 gene_id:2901|Hs108|chr19 ( 981) 1640 384.7 4.5e-106
CCDS42913.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 918) 1631 382.6 1.8e-105
CCDS8433.1 GRIK4 gene_id:2900|Hs108|chr11 ( 956) 1629 382.2 2.5e-105
CCDS82659.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 949) 1615 379.0 2.3e-104
CCDS82658.1 GRIK1 gene_id:2897|Hs108|chr21 ( 920) 1614 378.8 2.6e-104
CCDS41707.1 GRIA4 gene_id:2893|Hs108|chr11 ( 433) 1528 359.0 1.1e-98
CCDS62330.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 ( 873) 651 158.5 4.9e-38
CCDS32724.1 GRIN2C gene_id:2905|Hs108|chr17 (1233) 651 158.6 6.7e-38
CCDS31236.1 GRID1 gene_id:2894|Hs108|chr10 (1009) 648 157.9 9e-38
CCDS8662.1 GRIN2B gene_id:2904|Hs108|chr12 (1484) 634 154.7 1.2e-36
CCDS12719.1 GRIN2D gene_id:2906|Hs108|chr19 (1336) 630 153.8 2e-36
CCDS45407.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1281) 628 153.3 2.6e-36
CCDS10539.1 GRIN2A gene_id:2903|Hs108|chr16 (1464) 628 153.3 3e-36
CCDS68758.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 ( 912) 596 146.0 3.1e-34
CCDS3637.1 GRID2 gene_id:2895|Hs108|chr4 (1007) 596 146.0 3.4e-34
CCDS43910.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 885) 542 133.6 1.6e-30
CCDS7032.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 901) 542 133.6 1.6e-30
CCDS55355.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 906) 542 133.6 1.6e-30
CCDS7031.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 938) 542 133.6 1.7e-30
CCDS55354.1 GRIN1 gene_id:2902|Hs108|chr9 ( 943) 542 133.6 1.7e-30
CCDS6758.1 GRIN3A gene_id:116443|Hs108|chr9 (1115) 321 83.1 3.2e-15
CCDS32861.1 GRIN3B gene_id:116444|Hs108|chr19 (1043) 305 79.4 3.8e-14
>>CCDS47318.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027 Z-score: 7440.5 bits: 1388.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6027; 100.0% identity (100.0% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 WYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 WYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LGATGL
::::::
CCDS47 LGATGL
>>CCDS4322.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (906 aa)
initn: 5976 init1: 5976 opt: 5976 Z-score: 7377.5 bits: 1376.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5976; 99.1% identity (99.7% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-906)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE1 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::.::
CCDS43 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 WYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 LGATGL
::::::
CCDS43 LGATGL
>>CCDS58988.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (916 aa)
initn: 5833 init1: 5833 opt: 5833 Z-score: 7200.7 bits: 1343.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5833; 99.7% identity (99.9% similar) in 881 aa overlap (26-906:36-916)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
.. :::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLFQPLQLAGGLEWPWSNLLCFLTPVKLHPEVWGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 GMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 AYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 QTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 YLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 LKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSE
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
850 860 870 880 890 900
900
pF1KE1 SSGMPLGATGL
:::::::::::
CCDS58 SSGMPLGATGL
910
>>CCDS58987.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (916 aa)
initn: 5782 init1: 5782 opt: 5782 Z-score: 7137.7 bits: 1331.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5782; 98.8% identity (99.5% similar) in 881 aa overlap (26-906:36-916)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
.. :::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HLFQPLQLAGGLEWPWSNLLCFLTPVKLHPEVWGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAV
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGF
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYD
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KE1 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTIL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KE1 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWN
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KE1 GMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPL
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KE1 AYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSL
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KE1 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAK
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KE1 QTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYA
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KE1 YLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::
CCDS58 YLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDK
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KE1 LKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSE
::.::::::::::: . ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSE
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KE1 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSH
850 860 870 880 890 900
900
pF1KE1 SSGMPLGATGL
:::::::::::
CCDS58 SSGMPLGATGL
910
>>CCDS58989.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (837 aa)
initn: 5508 init1: 5508 opt: 5508 Z-score: 6799.6 bits: 1269.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5508; 99.0% identity (99.6% similar) in 837 aa overlap (70-906:1-837)
40 50 60 70 80 90
pF1KE1 AAFRFALSQLTEPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTS
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTS
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 FCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQ
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 KVLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KVLDTAAEKNWQVTAVNILTTTEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKL
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 EKNGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EKNGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHT
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 RVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQR
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 ALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGG
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KE1 DNSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DNSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIV
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KE1 SDGKYGARDPDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SDGKYGARDPDTKAWNGMVGELVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIK
400 410 420 430 440 450
520 530 540 550 560 570
pF1KE1 KPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTS
460 470 480 490 500 510
580 590 600 610 620 630
pF1KE1 DQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLT
520 530 540 550 560 570
640 650 660 670 680 690
pF1KE1 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRT
580 590 600 610 620 630
700 710 720 730 740 750
pF1KE1 TEEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS58 TEEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNP
640 650 660 670 680 690
760 770 780 790 800 810
pF1KE1 VNLAVLKLSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGL
::::::::.:::.:::::.::::::::::: . ::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGL
700 710 720 730 740 750
820 830 840 850 860 870
pF1KE1 AMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AMLVALIEFCYKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVV
760 770 780 790 800 810
880 890 900
pF1KE1 SHDFPKSMQSIPCMSHSSGMPLGATGL
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SHDFPKSMQSIPCMSHSSGMPLGATGL
820 830
>>CCDS58986.1 GRIA1 gene_id:2890|Hs108|chr5 (826 aa)
initn: 4923 init1: 4923 opt: 4923 Z-score: 6076.7 bits: 1135.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5247; 90.3% identity (90.8% similar) in 906 aa overlap (1-906:1-826)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQID
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 IVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQ
::::::::::::: :
CCDS58 IVNISDSFEMTYR-C---------------------------------------------
70
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 FVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ----------------------------------LSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTT
80 90 100
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TEEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDL
110 120 130 140 150 160
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 NKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVM
170 180 190 200 210 220
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 AEAFQSLRRQRIDISRRGNAGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGR
230 240 250 260 270 280
370 380 390 400 410 420
pF1KE1 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 RTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYV
290 300 310 320 330 340
430 440 450 460 470 480
pF1KE1 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MLKKNANQFEGNDRYEGYCVELAAEIAKHVGYSYRLEIVSDGKYGARDPDTKAWNGMVGE
350 360 370 380 390 400
490 500 510 520 530 540
pF1KE1 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LVYGRADVAVAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIW
410 420 430 440 450 460
550 560 570 580 590 600
pF1KE1 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQ
470 480 490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KE1 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIA
530 540 550 560 570 580
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pF1KE1 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 YGTLEAGSTKEFFRRSKIAVFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLES
590 600 610 620 630 640
730 740 750 760 770 780
pF1KE1 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::.:::.:::::.::
CCDS58 TMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRNPVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKW
650 660 670 680 690 700
790 800 810 820 830 840
pF1KE1 WYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
::::::::: . :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 WYDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKSRSESKRMK
710 720 730 740 750 760
850 860 870 880 890 900
pF1KE1 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPCMSHSSGMP
770 780 790 800 810 820
pF1KE1 LGATGL
::::::
CCDS58 LGATGL
>>CCDS3797.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 (883 aa)
initn: 3582 init1: 3498 opt: 4164 Z-score: 5138.1 bits: 961.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4164; 71.8% identity (90.4% similar) in 845 aa overlap (1-840:4-847)
10 20 30 40 50
pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPP-KLL
..:: ... . : . :.. :.:::::::: .::..::: .. :.. .:
CCDS37 MQKIMHISVLLSPVLWGLIFGVS-SNSIQIGGLFPRGADQEYSAFRVGMVQFSTSEFRLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE1 PQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVYAIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVD
:.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS37 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE1 TSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQKFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVN
.. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
CCDS37 GTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWDKFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAIN
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE1 ILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERLVVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILAN
. . . .: :: :::::: :::: :..::: ...: :. :.: . :. :::::.::
CCDS37 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 LGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSAL
::: : :: :.. .::::.:::.:.: :.. .:....:.. . ... . ::::::
CCDS37 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
240 250 260 270 280 290
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:::.:.::.:::..::.:::.:::::::::::::::::::::..:.:::.::. :::.::
CCDS37 TYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGNAGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGN
300 310 320 330 340 350
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..:...:.: :::....:.: .: ::::::.: ::.: . :. .:.:.:...:.: .::
CCDS37 IKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKIGYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVT
360 370 380 390 400 410
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CCDS37 TILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTK
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:::::::::::.::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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540 550 560 570 580 590
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::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::. .:...::::::::::
CCDS37 DPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS37 FSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
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:.::::::::::..:::::::::::::::.::::::.::::::::::: ::. :::::::
CCDS37 LSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKG
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pF1KE1 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGV
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CCDS37 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGV
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pF1KE1 LDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFCYKS
:::::.::::::::::.::::::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
CCDS37 LDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFCYKS
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pF1KE1 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
:.:.::::
CCDS37 RAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
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..:: ... . : . :.. :.:::::::: .::..::: .. :.. .:
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:.:: .....:: .: ::::::.:::::::::....:: .:::::.::: :::::::.:
CCDS43 PHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVYAIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTD
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.. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:
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CCDS43 VGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERRVILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIAN
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CCDS43 LGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYDDSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSAL
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CCDS43 TILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTK
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CCDS43 FSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAED
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CCDS43 LSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKG
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CCDS43 KYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLRNAVNLAVLKLNEQGL
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:::::.::::::::::: . ::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::::
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pF1KE1 RSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQSIPC
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CCDS43 RAEAKRMKVAKNAQNINPSSSQNSQNFATYKEGYNVYGIESVKI
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pF1KE1 MQHIFAFFCTGFLGAVVGANFPNNIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFAL------SQLT
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CCDS83 EAPFNLVPHVDNIETANSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLI
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CCDS83 TPSFPTEGESQFVLQLRPSLRGALLSLLDHYEWNCFVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNG
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:.:.:. . . .. .::.:...:....:. :.::: :::. :: ::... :. :::::
CCDS83 WHVSAICVENFNDVSYRQLLEELDRRQEKKFVIDCEIERLQNILEQIVSVGKHVKGYHYI
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pF1KE1 LANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYTDTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYT
.::::: ::.:..: ..::::::::::... . :.:..::. : :.. . ::::
CCDS83 IANLGFKDISLERFIHGGANVTGFQLVDFNTPMVIKLMDRWKKLDQREYPGSE-TPPKYT
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pF1KE1 TGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKIGYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTY
::::::.. :::.:::. :.:.: : ::.::::. ::.: :.:.....:::
CCDS83 TGNVQFDHYGRRVNYTMDVFELKSTGPRKVGYWNDMDKLVLIQDVPTLGNDTAAIENRTV
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::: :::::::::::.:..:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 DTKIWNGMVGELVYGKAEIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVF
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:: :.:.. ... :::::::
CCDS83 SFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYEWHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFGIFN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS83 SLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIES
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:::::::::::::::..::::::::::::::.:::::::.:::::::.::: ::. ::::
CCDS83 AEDLAKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVYEKMWTYMRSAEPSVFTRTTAEGVARVRK
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pF1KE1 SKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSE
::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.:: :::::::::::
CCDS83 SKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKGSSLRTPVNLAVLKLSE
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pF1KE1 QGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILIGGLGLAMLVALIEFC
:::::::.:::::::::: ::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS83 AGVLDKLKNKWWYDKGECGPKDSGSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGLAMLVALIEFC
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pF1KE1 YKSRSESKRMKGFCLIPQQSINEAIRTSTLPRNSGAGASSGGSGENGRVVSHDFPKSMQS
::::.:.:::: ...:::: :.. . .:. ::::::.. : ::....
CCDS83 YKSRAEAKRMK-------LTFSEAIR------NKARLSITGSVGENGRVLTPDCPKAVHT
840 850 860 870 880
890 900
pF1KE1 IPCMSHSSGMPLGATGL
. .:::. . :. :
CCDS83 GTAIRQSSGLAVIASDLP
890 900
>>CCDS43275.1 GRIA2 gene_id:2891|Hs108|chr4 (836 aa)
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30 40 50 60 70 80
pF1KE1 NIQIGGLFPNQQSQEHAAFRFALSQLTEPPKLLPQIDIVNISDSFEMTYRFCSQFSKGVY
.: :.:: .....:: .: ::::::.:::
CCDS43 MVQFSTSEFRLTPHIDNLEVANSFAVTNAFCSQFSRGVY
10 20 30
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pF1KE1 AIFGFYERRTVNMLTSFCGALHVCFITPSFPVDTSNQFVLQLRPELQDALISIIDHYKWQ
::::::....:: .:::::.::: :::::::.: .. ::.:.::.:. ::.:.:..:.:.
CCDS43 AIFGFYDKKSVNTITSFCGTLHVSFITPSFPTDGTHPFVIQMRPDLKGALLSLIEYYQWD
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pF1KE1 KFVYIYDADRGLSVLQKVLDTAAEKNWQVTAVNILTTT----EEGYRMLFQDLEKKKERL
::.:.::.:::::.:: :::.::::.:::::.:. . . .: :: :::::: ::::
CCDS43 KFAYLYDSDRGLSTLQAVLDSAAEKKWQVTAINVGNINNDKKDEMYRSLFQDLELKKERR
100 110 120 130 140 150
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pF1KE1 VVVDCESERLNAILGQIIKLEKNGIGYHYILANLGFMDIDLNKFKESGANVTGFQLVNYT
:..::: ...: :. :.: . :. :::::.::::: : :: :.. .::::.:::.:.:
CCDS43 VILDCERDKVNDIVDQVITIGKHVKGYHYIIANLGFTDGDLLKIQFGGANVSGFQIVDYD
160 170 180 190 200 210
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pF1KE1 DTIPAKIMQQWKNSDARDHTRVDWKRPKYTSALTYDGVKVMAEAFQSLRRQRIDISRRGN
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CCDS43 DSLVSKFIERWSTLEEKEYPGAHTTTIKYTSALTYDAVQVMTEAFRNLRKQRIEISRRGN
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 AGDCLANPAVPWGQGIDIQRALQQVRFEGLTGNVQFNEKGRRTNYTLHVIEMKHDGIRKI
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CCDS43 AGDCLANPAVPWGQGVEIERALKQVQVEGLSGNIKFDQNGKRINYTINIMELKTNGPRKI
280 290 300 310 320 330
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pF1KE1 GYWNEDDKFVPAATDAQAGGDNSSVQNRTYIVTTILEDPYVMLKKNANQFEGNDRYEGYC
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CCDS43 GYWSEVDKMVVTLTELPSGNDTSGLENKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYC
340 350 360 370 380 390
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CCDS43 VDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVR
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pF1KE1 EEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 EEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSR
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pF1KE1 FSPYEWHSEEFEEGRDQTTSDQSNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVW
:::::::.::::.::. .:...:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FSPYEWHTEEFEDGRETQSSESTNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVW
520 530 540 550 560 570
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pF1KE1 WFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLEAGSTKEFFRRSKIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::..:::::::::::::
CCDS43 WFFTLIIISSYTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIA
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pF1KE1 VFEKMWTYMKSAEPSVFVRTTEEGMIRVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGG
::.::::::.::::::::::: ::. ::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGG
640 650 660 670 680 690
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pF1KE1 NLDSKGYGIATPKGSALRGPVNLAVLKLSEQGVLDKLKSKWWYDKGECGSKDSGSKDKTS
:::::::::::::::.:: :::::::::::::::::::.::::::::::.::::::.:::
CCDS43 NLDSKGYGIATPKGSSLRTPVNLAVLKLSEQGVLDKLKNKWWYDKGECGAKDSGSKEKTS
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