Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE1053
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE1053, 376 aa
1>>>pF1KE1053 376 - 376 aa - 376 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.3191+/-0.000921; mu= 5.7723+/- 0.055
mean_var=253.9818+/-51.577, 0's: 0 Z-trim(115.3): 928 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.080477
statistics sampled from 14857 (15851) to 14857 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.79), E-opt: 0.2 (0.487), width: 16
Scan time: 2.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs108|chr8 ( 376) 2714 327.7 1e-89
CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 ( 446) 1009 129.8 4.6e-30
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 993 128.1 2.1e-29
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 993 128.1 2.1e-29
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 993 128.1 2.2e-29
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 993 128.2 2.2e-29
CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 539) 972 125.6 1e-28
CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 555) 972 125.6 1e-28
CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 ( 560) 972 125.6 1e-28
CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 972 125.6 1e-28
CCDS74346.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 314) 966 124.7 1.1e-28
CCDS12494.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 418) 966 124.8 1.4e-28
CCDS46061.1 ZNF566 gene_id:84924|Hs108|chr19 ( 419) 966 124.8 1.4e-28
CCDS62707.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 665) 969 125.4 1.5e-28
CCDS62708.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 667) 969 125.4 1.5e-28
CCDS12639.1 ZNF180 gene_id:7733|Hs108|chr19 ( 692) 969 125.4 1.5e-28
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 966 125.0 1.9e-28
CCDS69664.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 474) 960 124.2 2.5e-28
CCDS10329.2 ZSCAN2 gene_id:54993|Hs108|chr15 ( 614) 962 124.5 2.5e-28
CCDS6871.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 498) 960 124.2 2.5e-28
CCDS12501.1 ZNF383 gene_id:163087|Hs108|chr19 ( 475) 959 124.0 2.7e-28
CCDS4645.1 ZKSCAN8 gene_id:7745|Hs108|chr6 ( 578) 957 123.9 3.6e-28
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 956 123.9 4.3e-28
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 952 123.3 5.1e-28
CCDS32991.1 ZNF599 gene_id:148103|Hs108|chr19 ( 588) 949 123.0 6.9e-28
CCDS75904.1 ZNF79 gene_id:7633|Hs108|chr9 ( 364) 945 122.3 6.9e-28
CCDS45852.1 ZNF397 gene_id:84307|Hs108|chr18 ( 534) 945 122.5 8.9e-28
CCDS233.1 ZNF436 gene_id:80818|Hs108|chr1 ( 470) 943 122.2 9.6e-28
CCDS6399.1 ZNF696 gene_id:79943|Hs108|chr8 ( 374) 940 121.7 1e-27
CCDS11067.1 ZFP3 gene_id:124961|Hs108|chr17 ( 502) 942 122.1 1.1e-27
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 941 122.0 1.2e-27
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 943 122.4 1.3e-27
CCDS44344.1 ZNF695 gene_id:57116|Hs108|chr1 ( 515) 936 121.4 1.8e-27
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 937 121.6 1.8e-27
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 937 121.6 1.9e-27
CCDS45463.1 ZNF629 gene_id:23361|Hs108|chr16 ( 869) 939 122.0 2e-27
CCDS82413.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 687) 936 121.5 2.2e-27
CCDS12973.1 ZNF544 gene_id:27300|Hs108|chr19 ( 715) 936 121.6 2.2e-27
CCDS2708.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 426) 930 120.6 2.6e-27
CCDS46807.1 ZNF662 gene_id:389114|Hs108|chr3 ( 452) 930 120.6 2.7e-27
CCDS47931.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 496) 930 120.7 2.8e-27
CCDS34957.1 ZNF623 gene_id:9831|Hs108|chr8 ( 536) 930 120.7 3e-27
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 930 120.8 3.1e-27
CCDS47944.1 ZNF251 gene_id:90987|Hs108|chr8 ( 671) 930 120.8 3.5e-27
CCDS32797.1 ZNF519 gene_id:162655|Hs108|chr18 ( 540) 927 120.4 3.8e-27
CCDS12945.1 ZNF471 gene_id:57573|Hs108|chr19 ( 626) 928 120.6 3.9e-27
CCDS6787.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 630) 927 120.5 4.2e-27
CCDS65109.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 631) 927 120.5 4.2e-27
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 927 120.5 4.3e-27
CCDS58523.1 ZNF286B gene_id:729288|Hs108|chr17 ( 522) 923 119.9 5.1e-27
>>CCDS6398.1 GLI4 gene_id:2738|Hs108|chr8 (376 aa)
initn: 2714 init1: 2714 opt: 2714 Z-score: 1724.0 bits: 327.7 E(32554): 1e-89
Smith-Waterman score: 2714; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KE1 MAALGDIQESPSVPSPVSLSSPGTPGTQHHEPQLHLHGHQHGSPGSSPKVLSQPSDLDLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 MAALGDIQESPSVPSPVSLSSPGTPGTQHHEPQLHLHGHQHGSPGSSPKVLSQPSDLDLQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE1 DVEEVEIGRDTFWPDSEPKPEQAPRSPGSQAPDEGAGGALRSLLRSLPRRARCSAGFGPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 DVEEVEIGRDTFWPDSEPKPEQAPRSPGSQAPDEGAGGALRSLLRSLPRRARCSAGFGPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE1 SSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 SSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE1 KPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 KPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE1 CGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 CGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQC
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE1 GKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS63 GKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAF
310 320 330 340 350 360
370
pF1KE1 GQSSQLIQHQRVHYRE
::::::::::::::::
CCDS63 GQSSQLIQHQRVHYRE
370
>>CCDS43619.1 ZNF3 gene_id:7551|Hs108|chr7 (446 aa)
initn: 4339 init1: 965 opt: 1009 Z-score: 653.3 bits: 129.8 E(32554): 4.6e-30
Smith-Waterman score: 1009; 47.6% identity (69.6% similar) in 332 aa overlap (53-376:69-393)
30 40 50 60 70 80
pF1KE1 GTPGTQHHEPQLHLHGHQHGSPGSSPKVLSQPSDLDL-QDVEEVEIGRDTFWPDSEPKPE
.:.. :: .:: . : ..: : : . :
CCDS43 AAALLKAKSQELVTFEDVAVYFIRKEWKRLEPAQRDLYRDVMLENYG-NVFSLDRETRTE
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 QAPRSPGSQAPDEGAGGALRS-LLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPR
. . . : . :.: . . ... . . . .. : : .:: :. :: .
CCDS43 NDQEI----SEDTRSHGVLLGRFQKDISQGLKFKEAYEREVSLKRPLGNSPGERLNRKMP
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190
pF1KE1 GAWRVTLVQQAAAGPEGA-PERAAELGVNFGR-----SRQGSARGAKPHRCEACGKSFKY
.::. .. . :.: :. ..: .: :.: : .::.:. :.:::.
CCDS43 DFGQVTVEEKLT--PRGERSEKYNDFGNSFTVNSNLISHQRLPVGDRPHKCDECSKSFNR
160 170 180 190 200 210
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 NSLLLKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHF
.: :..::::::::::: :.:::: : : .:::.:::::::::::..::..:: :: .
CCDS43 TSDLIQHQRIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLIQHQRIHTGEKPYECSDCGKTFSCSSAL
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 TQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQ
: :::.:::::.:.:::..:: ::.:..:::.:::::::::..::::: ::.::.::
CCDS43 ILHRRIHTGEKPYECNECGKTFSWSSTLTHHQRIHTGEKPYACNECGKAFSRSSTLIHHQ
280 290 300 310 320 330
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 RIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHY
:::::::::::..::::: ::...: : ::::::. : :: : :: ::::::.:
CCDS43 RIHTGEKPYECNECGKAFSQSSHLYQHQRIHTGEKPYECMECGGKFTYSSGLIQHQRIHT
340 350 360 370 380 390
pF1KE1 RE
:
CCDS43 GENPYECSECGKAFRYSSALVRHQRIHTGEKPLNGIGMSKSSLRVTTELNIREST
400 410 420 430 440
>>CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (616 aa)
initn: 9107 init1: 980 opt: 993 Z-score: 641.5 bits: 128.1 E(32554): 2.1e-29
Smith-Waterman score: 993; 54.5% identity (73.9% similar) in 253 aa overlap (129-376:254-505)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGA
.: :.. ..: .. :. .
CCDS74 GEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF-SFRSSFSQHERTHTGEK
230 240 250 260 270 280
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 PERAAELGVNFGRSRQGSAR-----GAKPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYAC
: . .: : : .: . . . : ::..: :::.:...: : :::::::::::: :
CCDS74 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
290 300 310 320 330 340
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECG
::::: : . .:::.: ::::::::::.::.:::.:. .:.: :::.::::: :.:::
CCDS74 HECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECG
350 360 370 380 390 400
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFR
..::.::.: .:.: ::::::: :::::::: :. : .:::::::::::::.::::::
CCDS74 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
410 420 430 440 450 460
340 350 360 370
pF1KE1 GRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
: . .: : ::::::. :. ::.::.: . ::::::.: :
CCDS74 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSL
470 480 490 500 510 520
CCDS74 LIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQH
530 540 550 560 570 580
>--
initn: 542 init1: 542 opt: 542 Z-score: 358.6 bits: 75.7 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 542; 64.2% identity (84.4% similar) in 109 aa overlap (265-373:506-614)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKP
:::.:..::.:::::: :..:::.:: :::
CCDS74 GEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKP
480 490 500 510 520 530
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACG
:.:..:::.: :: : .:.: ::::::::: ::::.:: .:. .: : ::::::.::
CCDS74 YGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACR
540 550 560 570 580 590
360 370
pF1KE1 ACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::: .::.: .:::.:
CCDS74 DCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
600 610
>>CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (658 aa)
initn: 9107 init1: 980 opt: 993 Z-score: 641.2 bits: 128.1 E(32554): 2.1e-29
Smith-Waterman score: 993; 54.5% identity (73.9% similar) in 253 aa overlap (129-376:296-547)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGA
.: :.. ..: .. :. .
CCDS74 GEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF-SFRSSFSQHERTHTGEK
270 280 290 300 310 320
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 PERAAELGVNFGRSRQGSAR-----GAKPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYAC
: . .: : : .: . . . : ::..: :::.:...: : :::::::::::: :
CCDS74 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
330 340 350 360 370 380
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECG
::::: : . .:::.: ::::::::::.::.:::.:. .:.: :::.::::: :.:::
CCDS74 HECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECG
390 400 410 420 430 440
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFR
..::.::.: .:.: ::::::: :::::::: :. : .:::::::::::::.::::::
CCDS74 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
450 460 470 480 490 500
340 350 360 370
pF1KE1 GRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
: . .: : ::::::. :. ::.::.: . ::::::.: :
CCDS74 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSL
510 520 530 540 550 560
CCDS74 LIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQH
570 580 590 600 610 620
>--
initn: 542 init1: 542 opt: 542 Z-score: 358.2 bits: 75.8 E(32554): 1.2e-13
Smith-Waterman score: 542; 64.2% identity (84.4% similar) in 109 aa overlap (265-373:548-656)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKP
:::.:..::.:::::: :..:::.:: :::
CCDS74 GEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKP
520 530 540 550 560 570
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACG
:.:..:::.: :: : .:.: ::::::::: ::::.:: .:. .: : ::::::.::
CCDS74 YGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACR
580 590 600 610 620 630
360 370
pF1KE1 ACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::: .::.: .:::.:
CCDS74 DCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
640 650
>>CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (670 aa)
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100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGA
.: :.. ..: .. :. .
CCDS12 GEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF-SFRSSFSQHERTHTGEK
280 290 300 310 320 330
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 PERAAELGVNFGRSRQGSAR-----GAKPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYAC
: . .: : : .: . . . : ::..: :::.:...: : :::::::::::: :
CCDS12 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
340 350 360 370 380 390
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECG
::::: : . .:::.: ::::::::::.::.:::.:. .:.: :::.::::: :.:::
CCDS12 HECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECG
400 410 420 430 440 450
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFR
..::.::.: .:.: ::::::: :::::::: :. : .:::::::::::::.::::::
CCDS12 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
460 470 480 490 500 510
340 350 360 370
pF1KE1 GRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
: . .: : ::::::. :. ::.::.: . ::::::.: :
CCDS12 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSL
520 530 540 550 560 570
CCDS12 LIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQH
580 590 600 610 620 630
>--
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240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKP
:::.:..::.:::::: :..:::.:: :::
CCDS12 GEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKP
530 540 550 560 570 580
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACG
:.:..:::.: :: : .:.: ::::::::: ::::.:: .:. .: : ::::::.::
CCDS12 YGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACR
590 600 610 620 630 640
360 370
pF1KE1 ACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::: .::.: .:::.:
CCDS12 DCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
650 660 670
>>CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 (682 aa)
initn: 9107 init1: 980 opt: 993 Z-score: 641.0 bits: 128.2 E(32554): 2.2e-29
Smith-Waterman score: 993; 54.5% identity (73.9% similar) in 253 aa overlap (129-376:320-571)
100 110 120 130 140 150
pF1KE1 ALRSLLRSLPRRARCSAGFGPESSAERPAGQPPGAVPCAQPRGAWRVTLVQQAAAGPEGA
.: :.. ..: .. :. .
CCDS54 GEKPYKCTQCGRTFNQIAPLIQHQRTHTGEKPYECSECGKSF-SFRSSFSQHERTHTGEK
290 300 310 320 330 340
160 170 180 190 200 210
pF1KE1 PERAAELGVNFGRSRQGSAR-----GAKPHRCEACGKSFKYNSLLLKHQRIHTGEKPYAC
: . .: : : .: . . . : ::..: :::.:...: : :::::::::::: :
CCDS54 PYECSECGKAFRQSIHLTQHLRIHTGEKPYQCGECGKAFSHSSSLTKHQRIHTGEKPYEC
350 360 370 380 390 400
220 230 240 250 260 270
pF1KE1 HECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECG
::::: : . .:::.: ::::::::::.::.:::.:. .:.: :::.::::: :.:::
CCDS54 HECGKAFTQITPLIQHQRTHTGEKPYECGECGKAFSQSTLLTEHRRIHTGEKPYGCNECG
410 420 430 440 450 460
280 290 300 310 320 330
pF1KE1 QAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFR
..::.::.: .:.: ::::::: :::::::: :. : .:::::::::::::.::::::
CCDS54 KTFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFS
470 480 490 500 510 520
340 350 360 370
pF1KE1 GRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
: . .: : ::::::. :. ::.::.: . ::::::.: :
CCDS54 HSSSLTKHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSL
530 540 550 560 570 580
CCDS54 LIEHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQH
590 600 610 620 630 640
>--
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Smith-Waterman score: 542; 64.2% identity (84.4% similar) in 109 aa overlap (265-373:572-680)
240 250 260 270 280 290
pF1KE1 GEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKP
:::.:..::.:::::: :..:::.:: :::
CCDS54 GEKPYECNQCGRAFSQLAPLIQHQRIHTGEKPYECNQCGRAFSQSSLLIEHQRIHTKEKP
550 560 570 580 590 600
300 310 320 330 340 350
pF1KE1 YACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACG
:.:..:::.: :: : .:.: ::::::::: ::::.:: .:. .: : ::::::.::
CCDS54 YGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRRIHTGEKPYACR
610 620 630 640 650 660
360 370
pF1KE1 ACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::: .::.: .:::.:
CCDS54 DCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
670 680
>>CCDS69562.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (539 aa)
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10 20 30
pF1KE1 MAALGDIQESPSVPSPVSLSSPGTPGTQHHEP
::: : . : .. : : ::
CCDS69 VISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETF---GEEDPQGSEP
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40 50 60 70 80
pF1KE1 QLHLHGHQHGSPGSSPKVLSQ--PSDLDLQDVEEVEIGRDTFWPDSEPKPEQAPRSPG--
.. : : :: :.. : : . : . : . . .. :.: :.: :..
CCDS69 -VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDIC
130 140 150 160 170
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 SQAPDEGAG-GALRSLLRSLPRRARCSAG--FGPESSAERPAGQPPGAV--PCAQPRGAW
:. .. . . . . :: . ..: :. . ... : : :. ..
CCDS69 EQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTF
180 190 200 210 220 230
150 160 170 180 190
pF1KE1 RVT--LVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRS-----RQGSARGAKPHRCEACGKSFKYNS
: . ::.. : : . : : :..: .. : :.::. :::.:
CCDS69 RYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRP
240 250 260 270 280 290
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LLLKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQ
:.:::::::::::: : ::::.: ..:..: :.:::::::::.:..::.::: .: . .
CCDS69 NLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIR
300 310 320 330 340 350
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 HLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRI
: : :.::::..: :::..:.:::::..:::.::::::: :..: :::: .. :.::::
CCDS69 HRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRS
360 370 380 390 400 410
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 HTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
:::::::::.::::.: .:...: : ::::::. :. ::::: .::.::.:::.:. :
CCDS69 HTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGE
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CCDS69 KPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
480 490 500 510 520 530
>>CCDS55282.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 (555 aa)
initn: 5260 init1: 971 opt: 972 Z-score: 628.9 bits: 125.6 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 972; 61.7% identity (81.1% similar) in 206 aa overlap (171-376:322-527)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 GAWRVTLVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGAKPHRCEACGKSFKYNSLLLK
::.: : :::::. :::.:. . ::.
CCDS55 HLIQHQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQ
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 HQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRI
:::::::::::.: :::: : : .:::: .:::::::::..::..::: : . .: ::
CCDS55 HQRIHTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERI
360 370 380 390 400 410
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pF1KE1 HNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGE
:. :::: : :::.:: : :.:..:::.:::::::.:..::.:: ::.:.::::::
CCDS55 HTEEKPYACYECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGE
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370
pF1KE1 KPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::..:..::::: .. .. ::::::::::. :..:::::.: : ::::::.: :
CCDS55 KPFQCTECGKAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYE
480 490 500 510 520 530
CCDS55 CGECGRAFNQHGHLIQHQKVHRKL
540 550
>--
initn: 1214 init1: 614 opt: 627 Z-score: 412.4 bits: 85.6 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 627; 58.7% identity (81.2% similar) in 138 aa overlap (229-366:184-321)
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHL
:. . .::.:: : .::. :..:::. ::
CCDS55 NETKQSFCLSPNSVDHREVQVLSQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQ
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHT
:::.::::: :. ::.:::::: : .:.:.::::::: :..::::: :: : .:..:::
CCDS55 RIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSSVLSKHRRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHT
220 230 240 250 260 270
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pF1KE1 GEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::.:: .: ::: ::...: : ::::.:..: :::::..:. :
CCDS55 GEKPHECLECRKAFTQLSHLIQHQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKP
280 290 300 310 320 330
CCDS55 HRCNECGKTFSVKRTLLQHQRIHTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECS
340 350 360 370 380 390
>>CCDS47945.1 ZNF34 gene_id:80778|Hs108|chr8 (560 aa)
initn: 1840 init1: 945 opt: 972 Z-score: 628.9 bits: 125.6 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 983; 41.5% identity (63.8% similar) in 390 aa overlap (3-376:115-500)
10 20 30
pF1KE1 MAALGDIQESPSVPSPVSLSSPGTPGTQHHEP
::: : . : .. : : ::
CCDS47 VISQLERGDEPWVLDVQGTSGKEHLRVNSPALGTRTEYKELTSQETF---GEEDPQGSEP
90 100 110 120 130 140
40 50 60 70 80
pF1KE1 QLHLHGHQHGSPGSSPKVLSQ--PSDLDLQDVEEVEIGRDTFWPDSEPKPEQAPRSPG--
.. : : :: :.. : : . : . : . . .. :.: :.: :..
CCDS47 -VEACDHISKSEGSLEKLVEQRGPRAVTLTNGESSRESGGNLRLLSRPVPDQRPHKCDIC
150 160 170 180 190 200
90 100 110 120 130 140
pF1KE1 SQAPDEGAG-GALRSLLRSLPRRARCSAG--FGPESSAERPAGQPPGAV--PCAQPRGAW
:. .. . . . . :: . ..: :. . ... : : :. ..
CCDS47 EQSFEQRSYLNNHKRVHRSKKTNTVRNSGEIFSANLVVKEDQKIPTGKKLHYCSYCGKTF
210 220 230 240 250 260
150 160 170 180 190
pF1KE1 RVT--LVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRS-----RQGSARGAKPHRCEACGKSFKYNS
: . ::.. : : . : : :..: .. : :.::. :::.:
CCDS47 RYSANLVKHQRLHTEEKPYKCDECGKAFSQSCEFINHRRMHSGEIPYRCDECGKTFTRRP
270 280 290 300 310 320
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LLLKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQ
:.:::::::::::: : ::::.: ..:..: :.:::::::::.:..::.::: .: . .
CCDS47 NLMKHQRIHTGEKPYKCGECGKHFSAYSSLIYHQRIHTGEKPYKCNDCGKAFSDGSILIR
330 340 350 360 370 380
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pF1KE1 HLRIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRI
: : :.::::..: :::..:.:::::..:::.::::::: :..: :::: .. :.::::
CCDS47 HRRTHTGEKPFECKECGKGFTQSSNLIQHQRIHTGEKPYKCNECEKAFIQKTKLVEHQRS
390 400 410 420 430 440
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 HTGEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
:::::::::.::::.: .:...: : ::::::. :. ::::: .::.::.:::.:. :
CCDS47 HTGEKPYECNDCGKVFSQSTHLIQHQRIHTGEKPYKCSECGKAFHNSSRLIHHQRLHHGE
450 460 470 480 490 500
CCDS47 KPYRCSDCKKAFSQSTYLIQHRRIHTGEKPYKCSECGKAFRHSSNMCQHQRIHLREDFSM
510 520 530 540 550 560
>>CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 (560 aa)
initn: 5260 init1: 971 opt: 972 Z-score: 628.9 bits: 125.6 E(32554): 1e-28
Smith-Waterman score: 972; 61.7% identity (81.1% similar) in 206 aa overlap (171-376:327-532)
150 160 170 180 190 200
pF1KE1 GAWRVTLVQQAAAGPEGAPERAAELGVNFGRSRQGSARGAKPHRCEACGKSFKYNSLLLK
::.: : :::::. :::.:. . ::.
CCDS34 HLIQHQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKPHRCNECGKTFSVKRTLLQ
300 310 320 330 340 350
210 220 230 240 250 260
pF1KE1 HQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHLRI
:::::::::::.: :::: : : .:::: .:::::::::..::..::: : . .: ::
CCDS34 HQRIHTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECSECGKTFSHRSTLMNHERI
360 370 380 390 400 410
270 280 290 300 310 320
pF1KE1 HNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHTGE
:. :::: : :::.:: : :.:..:::.:::::::.:..::.:: ::.:.::::::
CCDS34 HTEEKPYACYECGKAFVQHSHLIQHQRVHTGEKPYVCGECGHAFSARRSLIQHERIHTGE
420 430 440 450 460 470
330 340 350 360 370
pF1KE1 KPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::..:..::::: .. .. ::::::::::. :..:::::.: : ::::::.: :
CCDS34 KPFQCTECGKAFSLKATLIVHLRTHTGEKPYECNSCGKAFSQYSVLIQHQRIHTGEKPYE
480 490 500 510 520 530
CCDS34 CGECGRAFNQHGHLIQHQKVHRKL
540 550 560
>--
initn: 1214 init1: 614 opt: 627 Z-score: 412.4 bits: 85.6 E(32554): 1.2e-16
Smith-Waterman score: 627; 58.7% identity (81.2% similar) in 138 aa overlap (229-366:189-326)
200 210 220 230 240 250
pF1KE1 LKHQRIHTGEKPYACHECGKRFRGWSGFIQHHRIHTGEKPYECGQCGRAFSHSSHFTQHL
:. . .::.:: : .::. :..:::. ::
CCDS34 NETKQSFCLSPNSVDHREVQVLSQSMPLTPHQAVPSGERPYMCVECGKCFGRSSHLLQHQ
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE1 RIHNGEKPYKCGECGQAFSQSSNLVRHQRLHTGEKPYACSQCGKAFIWSSVLIEHQRIHT
:::.::::: :. ::.:::::: : .:.:.::::::: :..::::: :: : .:..:::
CCDS34 RIHTGEKPYVCSVCGKAFSQSSVLSKHRRIHTGEKPYECNECGKAFRVSSDLAQHHKIHT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE1 GEKPYECSDCGKAFRGRSHFFRHLRTHTGEKPFACGACGKAFGQSSQLIQHQRVHYRE
::::.:: .: ::: ::...: : ::::.:..: :::::..:. :
CCDS34 GEKPHECLECRKAFTQLSHLIQHQRIHTGERPYVCPLCGKAFNHSTVLRSHQRVHTGEKP
280 290 300 310 320 330
CCDS34 HRCNECGKTFSVKRTLLQHQRIHTGEKPYTCSECGKAFSDRSVLIQHHNVHTGEKPYECS
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