Result of FASTA (omim) for
pFN21AE0999
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0999, 523 aa
1>>>pF1KE0999 523 - 523 aa - 523 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2854+/-0.00036; mu= 13.2526+/- 0.022
mean_var=106.9460+/-21.821, 0's: 0 Z-trim(115.2): 397 B-trim: 179 in 1/55
Lambda= 0.124020
statistics sampled from 25080 (25568) to 25080 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.659), E-opt: 0.2 (0.3), width: 16
Scan time: 10.340
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_016855860 (OMIM: 607718) PREDICTED: synaptotagm ( 443) 2122 390.8 4.4e-108
NP_995320 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sap ( 425) 2016 371.9 2.2e-102
NP_001257734 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo ( 425) 2016 371.9 2.2e-102
XP_011518203 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 564) 1838 340.1 1e-92
XP_011518202 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 567) 1838 340.1 1e-92
XP_011518206 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 492) 1833 339.2 1.7e-92
NP_783860 (OMIM: 613528) synaptotagmin-9 [Homo sap ( 491) 1829 338.5 2.9e-92
XP_011518204 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 535) 1775 328.8 2.5e-89
NP_001153801 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo ( 590) 1297 243.3 1.5e-63
XP_011525692 (OMIM: 600327) PREDICTED: synaptotagm ( 590) 1297 243.3 1.5e-63
NP_001153800 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo ( 590) 1297 243.3 1.5e-63
NP_115674 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo sap ( 590) 1297 243.3 1.5e-63
XP_011525693 (OMIM: 600327) PREDICTED: synaptotagm ( 590) 1297 243.3 1.5e-63
XP_011518209 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 349) 1011 192.0 2.5e-48
XP_011518208 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagm ( 351) 1011 192.0 2.5e-48
XP_005269170 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 954 181.8 3.4e-45
XP_006719639 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 419) 954 181.8 3.4e-45
NP_001278830 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 419) 954 181.8 3.4e-45
XP_016875398 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 954 181.8 3.4e-45
XP_011537012 (OMIM: 185605) PREDICTED: synaptotagm ( 422) 954 181.8 3.4e-45
NP_001129278 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 954 181.8 3.4e-45
NP_005630 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isoform 1 ( 422) 954 181.8 3.4e-45
NP_001129277 (OMIM: 185605) synaptotagmin-1 isofor ( 422) 954 181.8 3.4e-45
XP_006723403 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 385) 941 179.5 1.6e-44
XP_016855802 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 419) 941 179.5 1.7e-44
NP_796376 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 [H ( 419) 941 179.5 1.7e-44
NP_001129976 (OMIM: 600104,616040) synaptotagmin-2 ( 419) 941 179.5 1.7e-44
XP_011507494 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 941 179.5 1.7e-44
XP_016855801 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 941 179.5 1.7e-44
XP_016855800 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 422) 941 179.5 1.7e-44
XP_016855799 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 476) 941 179.6 1.9e-44
XP_016855798 (OMIM: 600104,616040) PREDICTED: syna ( 479) 941 179.6 1.9e-44
XP_016882664 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 933 178.1 4.3e-44
XP_006723402 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 933 178.1 4.3e-44
NP_003171 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isoform 1 ( 386) 933 178.1 4.3e-44
XP_016882665 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 386) 933 178.1 4.3e-44
NP_001284703 (OMIM: 600782) synaptotagmin-5 isofor ( 382) 932 177.9 4.8e-44
XP_006723404 (OMIM: 600782) PREDICTED: synaptotagm ( 383) 924 176.4 1.3e-43
XP_005274444 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 449) 854 164.0 8.7e-40
NP_004191 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isoform 2 ( 403) 853 163.8 9.1e-40
XP_011543645 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 409) 853 163.8 9.2e-40
NP_001287702 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 447) 853 163.8 9.8e-40
XP_011543643 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 453) 853 163.8 9.9e-40
NP_001238994 (OMIM: 604146) synaptotagmin-7 isofor ( 478) 853 163.8 1e-39
XP_011543642 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 484) 853 163.8 1e-39
XP_011543641 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 528) 853 163.8 1.1e-39
XP_005274442 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 611) 853 163.9 1.3e-39
XP_011543640 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 617) 853 163.9 1.3e-39
XP_005274441 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 642) 853 163.9 1.3e-39
XP_011543639 (OMIM: 604146) PREDICTED: synaptotagm ( 648) 853 163.9 1.3e-39
>>XP_016855860 (OMIM: 607718) PREDICTED: synaptotagmin-6 (443 aa)
initn: 2332 init1: 1680 opt: 2122 Z-score: 2061.5 bits: 390.8 E(85289): 4.4e-108
Smith-Waterman score: 2122; 69.8% identity (87.8% similar) in 450 aa overlap (84-523:3-443)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VSLLAVVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETEE-
:..: ..: :.: .. : :....
XP_016 MPWRNKEASS-----PSS-ANPPLEALQSPSF
10 20
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKEIKENEK-PAVKA-IEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTR
. .. .. : :.. . .: :.:::::::::::::: ..:::...:.:.::: :::.::::
XP_016 RGNMADKLKDPSTLGFLEAAVKISHTSPDIPAEVQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTR
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HSSFRRHLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVK
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XP_016 HTSFKRHLPRQMHVSSVDYGNELPPA---AEQPTSIGRIKPELYKQKSVDGEDAKSEATK
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ICGKLNFTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRK
:::.::.:.::::.: :.:.:.::.::::::: :.::::::.::::::: :.:::::::
XP_016 SCGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPDRKCKLQTRVHRK
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TLNPLFDETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATV
:::: :::.:.::: :..:..::::.::.:::::::::::::::::::::.::::::...
XP_016 TLNPTFDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEASDLSRETSI
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WKDIHCATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCE
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XP_016 WKDIQYATSESVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCD
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GRRLKKRKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTG
::::::.::: :::::::::::::::::::::.::::: :.:::::::::::.:::::.:
XP_016 GRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRVGHNEIIGVCRVG
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520
pF1KE0 LDAEGLGRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELP-------GRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
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XP_016 ITAEGLGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKKSFKEWQGRAASFDSESSCPSPKPPPTP
390 400 410 420 430 440
>>NP_995320 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sapiens (425 aa)
initn: 2212 init1: 1680 opt: 2016 Z-score: 1959.2 bits: 371.9 E(85289): 2.2e-102
Smith-Waterman score: 2016; 70.5% identity (89.1% similar) in 421 aa overlap (84-501:3-414)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VSLLAVVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETEE-
:..: ..: :.: .. : :....
NP_995 MPWRNKEASS-----PSS-ANPPLEALQSPSF
10 20
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKEIKENEK-PAVKA-IEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTR
. .. .. : :.. . .: :.:::::::::::::: ..:::...:.:.::: :::.::::
NP_995 RGNMADKLKDPSTLGFLEAAVKISHTSPDIPAEVQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTR
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HSSFRRHLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVK
:.::.:::::::.:::::.. :. .: :::::::::::::::::.: ..: .:
NP_995 HTSFKRHLPRQMHVSSVDYGNELPPA---AEQPTSIGRIKPELYKQKSVDGEDAKSEATK
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ICGKLNFTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRK
:::.::.:.::::.: :.:.:.::.::::::: :.::::::.::::::: :.:::::::
NP_995 SCGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPDRKCKLQTRVHRK
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TLNPLFDETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATV
:::: :::.:.::: :..:..::::.::.:::::::::::::::::::::.::::::...
NP_995 TLNPTFDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEASDLSRETSI
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WKDIHCATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCE
::::. ::.::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::: :::::::::.:.
NP_995 WKDIQYATSESVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCD
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GRRLKKRKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTG
::::::.::: :::::::::::::::::::::.::::: :.:::::::::::.:::::.:
NP_995 GRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRVGHNEIIGVCRVG
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520
pF1KE0 LDAEGLGRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
. ::::::::::::::: ::::.::: :.:.
NP_995 ITAEGLGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKKSFKEGNPRL
390 400 410 420
>>NP_001257734 (OMIM: 607718) synaptotagmin-6 [Homo sapi (425 aa)
initn: 2212 init1: 1680 opt: 2016 Z-score: 1959.2 bits: 371.9 E(85289): 2.2e-102
Smith-Waterman score: 2016; 70.5% identity (89.1% similar) in 421 aa overlap (84-501:3-414)
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VSLLAVVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETEE-
:..: ..: :.: .. : :....
NP_001 MPWRNKEASS-----PSS-ANPPLEALQSPSF
10 20
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KKEIKENEK-PAVKA-IEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTR
. .. .. : :.. . .: :.:::::::::::::: ..:::...:.:.::: :::.::::
NP_001 RGNMADKLKDPSTLGFLEAAVKISHTSPDIPAEVQMSVKEHIMRHTRLQRQTTEPASSTR
30 40 50 60 70 80
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HSSFRRHLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVK
:.::.:::::::.:::::.. :. .: :::::::::::::::::.: ..: .:
NP_001 HTSFKRHLPRQMHVSSVDYGNELPPA---AEQPTSIGRIKPELYKQKSVDGEDAKSEATK
90 100 110 120 130 140
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 ICGKLNFTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRK
:::.::.:.::::.: :.:.:.::.::::::: :.::::::.::::::: :.:::::::
NP_001 SCGKINFSLRYDYETETLIVRILKAFDLPAKDFCGSSDPYVKIYLLPDRKCKLQTRVHRK
150 160 170 180 190 200
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 TLNPLFDETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATV
:::: :::.:.::: :..:..::::.::.:::::::::::::::::::::.::::::...
NP_001 TLNPTFDENFHFPVPYEELADRKLHLSVFDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEASDLSRETSI
210 220 230 240 250 260
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 WKDIHCATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCE
::::. ::.::.:::::::::::::::::.::::::::::::::::: :::::::::.:.
NP_001 WKDIQYATSESVDLGEIMFSLCYLPTAGRLTLTVIKCRNLKAMDITGYSDPYVKVSLLCD
270 280 290 300 310 320
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 GRRLKKRKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTG
::::::.::: :::::::::::::::::::::.::::: :.:::::::::::.:::::.:
NP_001 GRRLKKKKTTIKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENMDQVSLLISVMDYDRVGHNEIIGVCRVG
330 340 350 360 370 380
480 490 500 510 520
pF1KE0 LDAEGLGRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
. ::::::::::::::: ::::.::: :.:.
NP_001 ITAEGLGRDHWNEMLAYPRKPIAHWHSLVEVKKSFKEGNPRL
390 400 410 420
>>XP_011518203 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagmin-9 (564 aa)
initn: 1943 init1: 1558 opt: 1838 Z-score: 1785.4 bits: 340.1 E(85289): 1e-92
Smith-Waterman score: 1996; 57.9% identity (81.4% similar) in 511 aa overlap (10-516:6-505)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFP--RDRGSQGGSSTDISVSLLA
..::..::....::: : .: ..:. .. :::. . :::::::.
XP_011 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEI
.::. :::::. ::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :...
XP_011 LVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KENEKPAVKAIEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRR
.. : . . ..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.::
XP_011 EDFLDPPTPCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLN
:...:. ::.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::
XP_011 ----QLNLSNPDFNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLF
: :.:: . : :.::: ::..::::::.::::::::.::::::: : ::.::::::::.:
XP_011 FILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHC
::.: ::: :..: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::.
XP_011 DEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKK
.:....::::.::::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.::::::
XP_011 VTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGL
:::.::.:::::::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: :
XP_011 RKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE0 GRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
:::::.:::.: ::::.::: :.:. . .. : ::
XP_011 GRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEIKEPHFPLRTHPSSPSNHVVWVEASTSSAPGMSLHL
470 480 490 500 510 520
XP_011 PRLKPNHHIQGLVRETMTMGKRTACAKDKIGQPSHKDLK
530 540 550 560
>>XP_011518202 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagmin-9 (567 aa)
initn: 1943 init1: 1558 opt: 1838 Z-score: 1785.4 bits: 340.1 E(85289): 1e-92
Smith-Waterman score: 1996; 57.9% identity (81.4% similar) in 511 aa overlap (10-516:6-505)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFP--RDRGSQGGSSTDISVSLLA
..::..::....::: : .: ..:. .. :::. . :::::::.
XP_011 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEI
.::. :::::. ::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :...
XP_011 LVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KENEKPAVKAIEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRR
.. : . . ..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.::
XP_011 EDFLDPPTPCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLN
:...:. ::.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::
XP_011 ----QLNLSNPDFNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLF
: :.:: . : :.::: ::..::::::.::::::::.::::::: : ::.::::::::.:
XP_011 FILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHC
::.: ::: :..: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::.
XP_011 DEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKK
.:....::::.::::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.::::::
XP_011 VTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKK
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGL
:::.::.:::::::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: :
XP_011 RKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE0 GRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
:::::.:::.: ::::.::: :.:. . .. : ::
XP_011 GRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEIKEPHFPLRTHPSSPSNHVVWVEASTSSAPGMSLHL
470 480 490 500 510 520
XP_011 PRLKPNHHIQGLVRGECVTQFRPRNFVGTIRKSHIFPLDLKL
530 540 550 560
>>XP_011518206 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagmin-9 (492 aa)
initn: 2060 init1: 1553 opt: 1833 Z-score: 1781.4 bits: 339.2 E(85289): 1.7e-92
Smith-Waterman score: 1991; 59.0% identity (82.3% similar) in 498 aa overlap (10-503:6-492)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFP--RDRGSQGGSSTDISVSLLA
..::..::....::: : .: ..:. .. :::. . :::::::.
XP_011 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEI
.::. :::::. ::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :...
XP_011 LVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 KENEKPAVKAIEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRR
.. : . . ..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.::
XP_011 EDFLDPPTPCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLN
:...:. ::.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::
XP_011 ----QLNLSNPDFNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLF
: :.:: . : :.::: ::..::::::.::::::::.::::::: : ::.::::::::.:
XP_011 FILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHC
::.: ::: :..: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::.
XP_011 DEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKK
.:....::::.::::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.::::::
XP_011 VTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKK
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420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGL
:::.::.:::::::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: :
XP_011 RKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE0 GRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
:::::.:::.: ::::.::: :.: :
XP_011 GRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEAHG
470 480 490
>>NP_783860 (OMIM: 613528) synaptotagmin-9 [Homo sapiens (491 aa)
initn: 2056 init1: 1549 opt: 1829 Z-score: 1777.5 bits: 338.5 E(85289): 2.9e-92
Smith-Waterman score: 1987; 59.2% identity (82.6% similar) in 495 aa overlap (10-500:6-489)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MSFHKEDGVNSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFP--RDRGSQGGSSTDISVSLLA
..::..::....::: : .: ..:. .. :::. . :::::::.
NP_783 MPGARDALCHQALQLLAELCARGALEHDSCQDFIYHLRDRARPRLRDPDISVSLLT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 VVVSFCGLALLVVSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEI
.::. :::::. ::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :...
NP_783 LVVTACGLALFGVSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENS
60 70 80 90 100 110
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pF1KE0 KENEKPAVKAIEPAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRR
.. : . . ..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.::
NP_783 EDFLDPPTPCPDSSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HLPRQMQVSSVDFSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLN
:...:. ::.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::
NP_783 ----QLNLSNPDFNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLN
180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 FTLQYDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLF
: :.:: . : :.::: ::..::::::.::::::::.::::::: : ::.::::::::.:
NP_783 FILKYDCDLEQLIVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVF
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 DETFQFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHC
::.: ::: :..: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::.
NP_783 DEVFLFPVPYNDLEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEY
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 ATTESIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKK
.:....::::.::::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.::::::
NP_783 VTNDNVDLGELMFSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKK
350 360 370 380 390 400
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pF1KE0 RKTTTKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGL
:::.::.:::::::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: :
NP_783 RKTSTKRNTLNPVYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERL
410 420 430 440 450 460
480 490 500 510 520
pF1KE0 GRDHWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
:::::.:::.: ::::.::: :.:
NP_783 GRDHWSEMLSYPRKPIAHWHSLVEKR
470 480 490
>>XP_011518204 (OMIM: 613528) PREDICTED: synaptotagmin-9 (535 aa)
initn: 1910 init1: 1558 opt: 1775 Z-score: 1724.8 bits: 328.8 E(85289): 2.5e-89
Smith-Waterman score: 1925; 59.8% identity (82.0% similar) in 478 aa overlap (41-516:9-473)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 SLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFPRDRGSQGGSSTDISVSLLAVVVSFCGLALLV
: . .:: :::::::..::. :::::.
XP_011 MLAKVVEGDLAFKGGR--DISVSLLTLVVTACGLALFG
10 20 30
80 90 100 110 120
pF1KE0 VSLFVFWKLCWPCWKSKPVTSNITTLPQSISSAPTEVFETE--EKKEIKENEKPAVKAIE
::::: ::::: :. . . :. .. .. : . ..:: :... .. : . .
XP_011 VSLFVSWKLCWVPWRERGLPSG----SKDNNQEPLNYMDTETNEQENSEDFLDPPTPCPD
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 PAIKISHTSPDIPAEVQTALKEHLIKHARVQRQITEPTSSTRHSSFRRHLPRQMQVSSVD
..:::::::::: .::...:. . .:::::.::::::.::.:.:: :...:. :
XP_011 SSMKISHTSPDIPLSTQTGIQENCAHGVRVQRQVTEPTSSARHNSIRR----QLNLSNPD
100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 FSMGTEPVLQRGETTTSIGRIKPELYKQKSVDSEGNQNEDVKICGKLNFTLQYDYENELL
:.. ::. : :.:::::::::::.:.:.. .. . : :::::: :.:: . : :
XP_011 FNIQQ---LQKQEQLTGIGRIKPELYKQRSLDNDDGRRSNSKACGKLNFILKYDCDLEQL
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 VVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLFDETFQFPVAYDQ
.::: ::..::::::.::::::::.::::::: : ::.::::::::.:::.: ::: :..
XP_011 IVKIHKAVNLPAKDFSGTSDPYVKIYLLPDRKTKHQTKVHRKTLNPVFDEVFLFPVPYND
210 220 230 240 250 260
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pF1KE0 LSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHCATTESIDLGEIM
: :::::::::::::::::.::.:..:......:. :: .::::. .:....::::.:
XP_011 LEARKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVVDHFLDLADFPRECILWKDIEYVTNDNVDLGELM
270 280 290 300 310 320
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pF1KE0 FSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKKRKTTTKKNTLNP
:::::::::::.:.:.:: ::::::::::.:::::::::::.:::::::::.::.:::::
XP_011 FSLCYLPTAGRLTITIIKARNLKAMDITGASDPYVKVSLMCDGRRLKKRKTSTKRNTLNP
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDAEGLGRDHWNEMLAYH
::::::.::.::::.::. :::::::::::::::.::::..: .:: ::::::.:::.:
XP_011 VYNEAIVFDVPPENIDQIHLSIAVMDYDRVGHNEIIGVCQVGNEAERLGRDHWSEMLSYP
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KE0 RKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
::::.::: :.:. . .. : ::
XP_011 RKPIAHWHSLVEIKEPHFPLRTHPSSPSNHVVWVEASTSSAPGMSLHLPRLKPNHHIQGL
450 460 470 480 490 500
>>NP_001153801 (OMIM: 600327) synaptotagmin-3 [Homo sapi (590 aa)
initn: 1543 init1: 1145 opt: 1297 Z-score: 1262.0 bits: 243.3 E(85289): 1.5e-63
Smith-Waterman score: 1474; 47.6% identity (68.6% similar) in 544 aa overlap (40-513:39-580)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFPRDRGSQGGSSTDISVSLLAVVVSFCGLALL
: :: : ..:::::::.:.:.:::..::
NP_001 LCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLSVIVTFCGIVLL
10 20 30 40 50 60
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pF1KE0 VVSLFVFWKLCWPCWKSK--------PVTSNITT--------------LPQSISSAP---
::::: ::::: :..: :. ... : .... :
NP_001 GVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLAAGLGGHPLLG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140
pF1KE0 --------------TEVFE--------TEEKKEIKENEKP--AVKAIEPAIKISHTSPDI
.:..: : : . . . : :. :. ..: :.:::..
NP_001 GPHHHAHAAHHPPFAELLEPGSLGGSDTPEPSYLDMDSYPEAAAAAVAAGVKPSQTSPEL
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190
pF1KE0 PAEVQTALKEHLIK-------HARVQRQITEPTSSTRHSSFRRHLPRQMQVSSVDFSMGT
:.: .. :. :. ..:.: . .::. .. : : .: .:. : :
NP_001 PSEGGAGSGLLLLPPSGGGLPSAQSHQQVTSLAPTTRYPALPRPLTQQTLTSQPDPSSEE
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240
pF1KE0 EPV-----LQRGETTTS-IGRIKPELYK------QKSVDSEGNQNEDVKI-CGKLNFTLQ
.: : :: .. ::.::::::. ..: . :. . . ::...:.:.
NP_001 RPPALPLPLPGGEEKAKLIGQIKPELYQGTGPGGRRSGGGPGSGEAGTGAPCGRISFALR
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 YDYENELLVVKIIKALDLPAKDFTGTSDPYVKMYLLPDRKKKFQTRVHRKTLNPLFDETF
: : .. :::.:..:::::::: .: ::::::.::::::::::::.::::::::.:.:::
NP_001 YLYGSDQLVVRILQALDLPAKDSNGFSDPYVKIYLLPDRKKKFQTKVHRKTLNPVFNETF
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 QFPVAYDQLSNRKLHFSVYDFDRFSRHDMIGEVILDNLFEVSDLSREATVWKDIHCATTE
:: : .:..:::::::::::::::::.::.:.::::.:... . .:.:: . .:
NP_001 QFSVPLAELAQRKLHFSVYDFDRFSRHDLIGQVVLDNLLELAEQPPDRPLWRDIVEGGSE
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SIDLGEIMFSLCYLPTAGRMTLTVIKCRNLKAMDITGSSDPYVKVSLMCEGRRLKKRKTT
. ::::. :::::::::::.:.:.:: ::::::.:: ::::::.::. ::::::::::.
NP_001 KADLGELNFSLCYLPTAGRLTVTIIKASNLKAMDLTGFSDPYVKASLISEGRRLKKRKTS
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470
pF1KE0 TKKNTLNPVYNEAIIFDIPPENVDQVSLSIAVMDYDRVGHNEVIGVCRTGLDA-EGLGRD
:::::::.::::..::. ::.:..:.:::::.::: .::::::::::.: :: . ::.
NP_001 IKKNTLNPTYNEALVFDVAPESVENVGLSIAVVDYDCIGHNEVIGVCRVGPDAADPHGRE
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520
pF1KE0 HWNEMLAYHRKPITHWHPLLELPGRATSFDSQGSCPSPKPPSTP
:: :::: :::. ::: :.: .::: ..::
NP_001 HWAEMLANPRKPVEHWHQLVE-EKTVTSF-TKGSKGLSEKENSE
550 560 570 580 590
>>XP_011525692 (OMIM: 600327) PREDICTED: synaptotagmin-3 (590 aa)
initn: 1543 init1: 1145 opt: 1297 Z-score: 1262.0 bits: 243.3 E(85289): 1.5e-63
Smith-Waterman score: 1474; 47.6% identity (68.6% similar) in 544 aa overlap (40-513:39-580)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 NSLCQKALHIVTELCFAGQVEWEKCSGIFPRDRGSQGGSSTDISVSLLAVVVSFCGLALL
: :: : ..:::::::.:.:.:::..::
XP_011 LCRRALILVSDLCARVRDADTNDRCQEFNDRIRGYPRGPDADISVSLLSVIVTFCGIVLL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100
pF1KE0 VVSLFVFWKLCWPCWKSK--------PVTSNITT--------------LPQSISSAP---
::::: ::::: :..: :. ... : .... :
XP_011 GVSLFVSWKLCWVPWRDKGGSAVGGGPLRKDLGPGVGLAGLVGGGGHHLAAGLGGHPLLG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140
pF1KE0 --------------TEVFE--------TEEKKEIKENEKP--AVKAIEPAIKISHTSPDI
.:..: : : . . . : :. :. ..: :.:::..
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