Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0994
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0994, 647 aa
1>>>pF1KE0994 647 - 647 aa - 647 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8804+/-0.000995; mu= 12.7584+/- 0.060
mean_var=112.7246+/-22.278, 0's: 0 Z-trim(107.4): 20 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.120799
statistics sampled from 9521 (9527) to 9521 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.652), E-opt: 0.2 (0.293), width: 16
Scan time: 2.590
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1557.1 COQ8A gene_id:56997|Hs108|chr1 ( 647) 4310 762.4 0
CCDS12562.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 ( 544) 1986 357.4 3e-98
CCDS46081.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 ( 503) 1518 275.8 1e-73
CCDS9869.1 ADCK1 gene_id:57143|Hs108|chr14 ( 523) 362 74.3 4.6e-13
>>CCDS1557.1 COQ8A gene_id:56997|Hs108|chr1 (647 aa)
initn: 4310 init1: 4310 opt: 4310 Z-score: 4065.1 bits: 762.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4310; 100.0% identity (100.0% similar) in 647 aa overlap (1-647:1-647)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAILGDTIMVAKGLVKLTQAAVETHLQHLGIGGELIMAARALQSTAVEQIGMFLGKVQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 MAAILGDTIMVAKGLVKLTQAAVETHLQHLGIGGELIMAARALQSTAVEQIGMFLGKVQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 QDKHEEYFAENFGGPEGEFHFSVPHAAGASTDFSSASAPDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 QDKHEEYFAENFGGPEGEFHFSVPHAAGASTDFSSASAPDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 ASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGFQRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 ARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 DPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 DPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 RQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 RQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQ
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACARKFRD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 YPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVLRRELALECDYQREAACARKFRD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 LLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 LLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELF
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 EFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 EFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAK
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 SIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 SIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KE0 PPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNYCKRQAQQ
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS15 PPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYSNYCKRQAQQ
610 620 630 640
>>CCDS12562.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 (544 aa)
initn: 1948 init1: 1709 opt: 1986 Z-score: 1877.3 bits: 357.4 E(32554): 3e-98
Smith-Waterman score: 1986; 58.0% identity (81.4% similar) in 522 aa overlap (129-644:11-524)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGF
: :: .. .: : : .:. :
CCDS12 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGS
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 QRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFG
. :.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.::::::
CCDS12 WAQKFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFG
50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GLAVGLGFGALAEVAKKS-----LRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGA
:::::::.:.:::.:::: :.:: :: : ::::::::::::::.::: ::::
CCDS12 GLAVGLGLGVLAEMAKKSMPGGRLQSEGGSG----LDSSPFLSEANAERIVQTLCTVRGA
100 110 120 130 140 150
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 ALKLGQMLSIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEE
:::.::::::::..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .::
CCDS12 ALKVGQMLSIQDNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEE
160 170 180 190 200 210
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEH
::::::::::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :.
CCDS12 VPFAAASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQ
220 230 240 250 260 270
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 LIDVLRRELALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPL
...:..::: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .:: ::..: ::
CCDS12 SLQALQQELAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPL
280 290 300 310 320 330
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 DQAEGLSQEIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATRE
:: .::::..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::
CCDS12 DQCQGLSQDLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASRE
340 350 360 370 380 390
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 YDRSFTDLYIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASD
. ::: ::....:::: ::. : :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::..
CCDS12 FGTEFTDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQ
400 410 420 430 440 450
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 EPFDFGTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMF
:.:::. :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:
CCDS12 GPYDFGSGETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLF
460 470 480 490 500 510
640
pF1KE0 EEAYSNY-CKRQAQQ
...: : .::
CCDS12 QDTYHRYWASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
520 530 540
>>CCDS46081.1 COQ8B gene_id:79934|Hs108|chr19 (503 aa)
initn: 1740 init1: 1505 opt: 1518 Z-score: 1437.0 bits: 275.8 E(32554): 1e-73
Smith-Waterman score: 1722; 52.2% identity (75.8% similar) in 517 aa overlap (129-644:11-483)
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 PDQSAPPSLGHAHSEGPAPAYVASGPFREAGFPGQASSPLGRANGRLFANPRDSFSAMGF
: :: .. .: : : .:. :
CCDS46 MWLKVGGLLRGTGGQLGQTVGWPCGALGPGPHRWGPCGGS
10 20 30 40
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 QRRFFHQDQSPVGGLTAEDIEKARQAKARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFG
. :.:: .: :: :::..::.:. : : . ::...::::::..::.::::::
CCDS46 WAQKFYQD-GPGRGLGEEDIRRAREARPR---KTPRPQLSDRSRERKVPASRISRLANFG
50 60 70 80 90
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 GLAVGLGFGALAEVAKKSLRSEDPSGKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLG
:::::::.:.:::.::::. :.:. : :
CCDS46 GLAVGLGLGVLAEMAKKSM----PGGR---LQS---------------------------
100 110 120
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 QMLSIQDDAFINPHLAKIFERVRQSADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAA
:..::.:.: .::::::::::::: ::...:...:: .:. :. .:: ::::
CCDS46 ------DNSFISPQLQHIFERVRQSADFMPRWQMLRVLEEELGRDWQAKVASLEEVPFAA
130 140 150 160 170
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 ASIGQVHLARMKGGREVAMKIQYPGVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEHLIDVL
::::::: . .. : :::.::::::.::::.:::.::.:::.:: :: ::: :. ...:
CCDS46 ASIGQVHQGLLRDGTEVAVKIQYPGIAQSIQSDVQNLLAVLKMSAALPAGLFAEQSLQAL
180 190 200 210 220 230
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 RRELALECDYQREAACARKFRDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEG
..::: ::::.::::::..::.:: . ::: :: .: :::. .:: ::..: :::: .:
CCDS46 QQELAWECDYRREAACAQNFRQLLANDPFFRVPAVVKELCTTRVLGMELAGGVPLDQCQG
240 250 260 270 280 290
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 LSQEIRNEICYNILVLCLRELFEFHFMQTDPNWSNFFYDPQQHKVALLDFGATREYDRSF
:::..::.::...:.:::::::::.::::::::.::.:: ..:.:.::::::.::. :
CCDS46 LSQDLRNQICFQLLTLCLRELFEFRFMQTDPNWANFLYDASSHQVTLLDFGASREFGTEF
300 310 320 330 340 350
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 TDLYIQIIRAAADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDF
:: ::....:::: ::. : :: ..:::::.:.:.. :::..:..:::: ::.. :.::
CCDS46 TDHYIEVVKAAADGDRDCVLQKSRDLKFLTGFETKAFSDAHVEAVMILGEPFATQGPYDF
360 370 380 390 400 410
580 590 600 610 620 630
pF1KE0 GTQSTTEKIHNLIPVMLRHRLVPPPEETYSLHRKMGGSFLICSKLKARFPCKAMFEEAYS
:. :...:..::::.::::: :::::::.::::..:.:: :..:.:.. :. .:...:
CCDS46 GSGETARRIQDLIPVLLRHRLCPPPEETYALHRKLAGAFLACAHLRAHIACRDLFQDTYH
420 430 440 450 460 470
640
pF1KE0 NY-CKRQAQQ
: .::
CCDS46 RYWASRQPDAATAGSLPTKGDSWVDPS
480 490 500
>>CCDS9869.1 ADCK1 gene_id:57143|Hs108|chr14 (523 aa)
initn: 229 init1: 229 opt: 362 Z-score: 348.0 bits: 74.3 E(32554): 4.6e-13
Smith-Waterman score: 365; 27.0% identity (58.5% similar) in 337 aa overlap (216-535:33-363)
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 ARPENKQHKQTLSEHARERKVPVTRIGRLANFGGLAVGLGFGALAEVAKKSLRSED--PS
.::.. :: . .. : .. : : :
CCDS98 RKALKLASWTSMALAASGIYFYSNKYLDPNDFGAVRVGRAVATTAVISYDYLTSLKSVPY
10 20 30 40 50 60
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GKKAVLGSSPFLSEANAERIVRTLCKVRGAALKLGQMLSIQDDAFINPH-LAKIFERVRQ
:.. : . .:.:. . : ::. .:.:: :. : .. :. .. .. ...
CCDS98 GSEEYLQLRSKVHLRSARRLCELCCANRGTFIKVGQHLGALD--YLLPEEYTSTLKVLHS
70 80 90 100 110 120
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 SADFMPLKQMMKTLNNDLGPNWRDKLEYFEERPFAAASIGQVHLARMKGGREVAMKIQYP
.: .... ... .::: . .: .. :.. :...::..::: : .. :: ::.:.:.:
CCDS98 QAPQSSMQEIRQVIREDLGKEIHDLFQSFDDTPLGTASLAQVHKAVLHDGRTVAVKVQHP
130 140 150 160 170 180
370 380 390 400 410
pF1KE0 GVAQSINSDVNNLMAVLNMSNMLPEGLFPEH----LIDVLRRELALECDYQREAACARKF
: . ..:. :: :: .. . :::: :.: ...: :: :. :. :.:
CCDS98 KVRAQSSKDIL-LMEVLVLA---VKQLFPEFEFMWLVDEAKKNLPLELDFLNEGRNAEKV
190 200 210 220 230
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 RDLLKGHPFFYVPEIVDELCSPHVLTTELVSGFPLDQAEGLSQEI--RNEICYNILVLCL
..:. :. ::.: .: . .:: :.:.: ... . . .. ::: .. .
CCDS98 SQMLRHFDFLKVPRIHWDLSTERVLLMEFVDGGQVNDRDYMERNKIDVNEISRHLGKMYS
240 250 260 270 280 290
480 490 500 510 520
pF1KE0 RELFEFHFMQTDPNWSNFFY--DPQQHK--VALLDFGA----TREYDRSFTDLYIQIIRA
. .: :.. ::. .: . : : ..::: : :.:. .. :. ..: .
CCDS98 EMIFVNGFVHCDPHPGNVLVRKHPGTGKAEIVLLDHGLYQMLTEEFRLNYCHLWQSLIWT
300 310 320 330 340 350
530 540 550 560 570 580
pF1KE0 AADRDRETVRAKSIEMKFLTGYEVKVMEDAHLDAILILGEAFASDEPFDFGTQSTTEKIH
: .:
CCDS98 DMKRVKEYSQRLGAGDLYPLFACMLTARSWDSVNRGISQAPVTATEDLEIRNNAANYLPQ
360 370 380 390 400 410
647 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 05:49:21 2016 done: Sun Nov 6 05:49:22 2016
Total Scan time: 2.590 Total Display time: 0.010
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]