Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0984
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0984, 592 aa
1>>>pF1KE0984 592 - 592 aa - 592 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.1231+/-0.00133; mu= 5.6863+/- 0.077
mean_var=236.2474+/-53.392, 0's: 0 Z-trim(107.0): 727 B-trim: 258 in 1/52
Lambda= 0.083443
statistics sampled from 8486 (9315) to 8486 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.644), E-opt: 0.2 (0.286), width: 16
Scan time: 3.600
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 3936 488.0 1.5e-137
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 3020 377.6 1.9e-104
CCDS75303.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 401) 2521 317.4 2.1e-86
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 1322 173.2 7e-43
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 1322 173.3 7.7e-43
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 1038 138.9 1.1e-32
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 1012 135.7 8.8e-32
CCDS73637.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 276) 951 128.3 1.3e-29
CCDS83458.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX ( 960) 876 119.8 1.6e-26
CCDS14186.1 CDKL5 gene_id:6792|Hs108|chrX (1030) 876 119.8 1.7e-26
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 671 94.6 2e-19
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 662 93.5 4.1e-19
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 648 91.8 1.3e-18
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 632 89.9 5e-18
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 90.0 8e-18
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 631 90.0 8e-18
CCDS75627.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 423) 629 89.7 8.1e-18
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 627 89.4 8.4e-18
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 627 89.4 8.4e-18
CCDS5619.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 451) 629 89.7 8.5e-18
CCDS75626.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 469) 629 89.7 8.7e-18
CCDS14276.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 496) 627 89.5 1.1e-17
CCDS48101.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 502) 627 89.5 1.1e-17
CCDS55408.1 CDK16 gene_id:5127|Hs108|chrX ( 570) 627 89.6 1.2e-17
CCDS2350.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 384) 604 86.6 6.1e-17
CCDS58746.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 400) 604 86.7 6.3e-17
CCDS58747.1 CDK15 gene_id:65061|Hs108|chr2 ( 429) 604 86.7 6.6e-17
CCDS44043.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 770) 608 87.4 7e-17
CCDS81254.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 779) 608 87.5 7.1e-17
CCDS44042.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 780) 608 87.5 7.1e-17
CCDS81253.1 CDK11A gene_id:728642|Hs108|chr1 ( 783) 608 87.5 7.1e-17
CCDS44300.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 474) 599 86.1 1.1e-16
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 601 86.5 1.1e-16
CCDS1454.1 CDK18 gene_id:5129|Hs108|chr1 ( 504) 599 86.2 1.1e-16
CCDS72682.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 748) 596 86.0 1.9e-16
CCDS72684.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 782) 596 86.0 1.9e-16
CCDS72683.1 CDK11B gene_id:984|Hs108|chr1 ( 795) 596 86.0 2e-16
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 591 85.3 2.4e-16
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 591 85.3 2.5e-16
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 591 85.3 2.6e-16
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 572 82.9 1.1e-15
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 565 81.9 1.5e-15
CCDS9971.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 419) 565 82.0 1.7e-15
CCDS10984.2 CDK10 gene_id:8558|Hs108|chr16 ( 360) 563 81.7 1.8e-15
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 561 81.4 2.1e-15
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 557 81.0 3e-15
CCDS81854.1 MOK gene_id:5891|Hs108|chr14 ( 418) 556 80.9 3.6e-15
CCDS75628.1 CDK14 gene_id:5218|Hs108|chr7 ( 340) 551 80.2 4.7e-15
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 534 78.2 2e-14
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 534 78.2 2.1e-14
>>CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (592 aa)
initn: 3936 init1: 3936 opt: 3936 Z-score: 2583.1 bits: 488.0 E(32554): 1.5e-137
Smith-Waterman score: 3936; 100.0% identity (100.0% similar) in 592 aa overlap (1-592:1-592)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSVNKIAMREIKFLKQFHHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSVNKIAMREIKFLKQFHHE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPPNPINPSTNCNGLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPPNPINPSTNCNGLKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMPNSRQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMPNSRQE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKDTKGME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKDTKGME
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KE0 VKQIKMLKRESKKTESSKIPTLLNVDQNQEKQEGGDGHCEGKNLKRNRFFFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VKQIKMLKRESKKTESSKIPTLLNVDQNQEKQEGGDGHCEGKNLKRNRFFFW
550 560 570 580 590
>>CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (455 aa)
initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 1988.5 bits: 377.6 E(32554): 1.9e-104
Smith-Waterman score: 3020; 100.0% identity (100.0% similar) in 455 aa overlap (1-455:1-455)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSVNKIAMREIKFLKQFHHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQSVNKIAMREIKFLKQFHHE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 NLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSNN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 IIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYGK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 PVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVLP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 QVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPELK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 AKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 IKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPPNPINPSTNCNGLKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTKLVTIEPPNPINPSTNCNGLKE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMPNSRQE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVR
430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 DPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRKEFHFPELPVTIQSKDTKGME
>>CCDS75303.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 (401 aa)
initn: 2513 init1: 2513 opt: 2521 Z-score: 1664.6 bits: 317.4 E(32554): 2.1e-86
Smith-Waterman score: 2521; 98.0% identity (99.0% similar) in 397 aa overlap (190-584:1-397)
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 YVATRWYRAPELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGN
10 20 30
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 LSPHLQNIFSKSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LSPHLQNIFSKSPIFAGVVLPQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSD
40 50 60 70 80 90
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LLHHEYFTRDGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LLHHEYFTRDGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLS
100 110 120 130 140 150
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 SSVLGKEIEKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SSVLGKEIEKEKKPKEIKVRVIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANENVHPMSPDTK
160 170 180 190 200 210
400 410 420 430 440 450
pF1KE0 LVTIEPPNPINPSTNCNGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 LVTIEPPNPINPSTNCNGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTER
220 230 240 250 260 270
460 470 480 490 500 510
pF1KE0 AKKRRTSSQSIGQVMPNSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 AKKRRTSSQSIGQVMPNSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDR
280 290 300 310 320 330
520 530 540 550 560 570
pF1KE0 KEFHFPELPVTIQSKDTKGMEVKQIKMLKRESKKTESSKIPTLLNVDQNQEKQEG-GDGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::. :...
CCDS75 KEFHFPELPVTIQSKDTKGMEVKQIKMLKRESKKTESSKIPTLLNVDQNQEKQENTGNAQ
340 350 360 370 380 390
580 590
pF1KE0 CE-GKNLKRNRFFFW
: :::
CCDS75 TERKKNLPDVE
400
>>CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 (493 aa)
initn: 1289 init1: 1124 opt: 1322 Z-score: 883.4 bits: 173.2 E(32554): 7e-43
Smith-Waterman score: 1349; 45.3% identity (73.8% similar) in 488 aa overlap (1-483:1-463)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPEQS-VNKIAMREIKFLKQFHH
:: ::.:: ::::::: ::::..:.::.::::: : : ... :.::::::::.:::..:
CCDS35 MEKYENLGLVGEGSYGMVMKCRNKDTGRIVAIKKFLESDDDKMVKKIAMREIKLLKQLRH
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ENLVNLIEVFRQKKKIHLVFEFIDHTVLDELQHYCHGLESKRLRKYLFQILRAIDYLHSN
::::::.:: ..::. .:::::.:::.::.:. . .::. . ..::::::. .: . ::.
CCDS35 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 NIIHRDIKPENILVSQSGITKLCDFGFARTLAAPGDIYTDYVATRWYRAPELVLKDTSYG
::::::::::::::::::..:::::::::::::::..:::::::::::::::.. :..::
CCDS35 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 KPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVVL
: ::.::.::.. :: :.: .:..::.: :..:.. .::: :. :..:.:.:.:::: :
CCDS35 KAVDVWAIGCLVTEMFMGEPLFPGDSDIDQLYHIMMCLGNLIPRHQELFNKNPVFAGVRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PQVQHPKNARKKYPKLNGLLADIVHACLQIDPADRISSSDLLHHEYFTRDGFIEKFMPEL
:.... . ...::::. .. :... ::.::: : ..::::..: ::: :.: ::
CCDS35 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKEIEKEKKPKEIKVR
. :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. .. . . : :. :.
CCDS35 QLKVQKDARNVSLSK-KSQNRKKEKEKDDSLVEERKTLVV-----QDTNADPKIKDYKL-
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 VIKVKGGRGDISEPKKKEYEGGLGQQDANEN-VHPMSPDTKLVTIEPPNPINPST---NC
.:.::.. : . .: :.. .: . .: :.. : : ::: .:
CCDS35 -FKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSR----TSHNKIVPSTSLKDC
360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 NGLKENPHCGGSVTMPPINLTNSNLMAANLSSNLFHPSVRLTERAKKRRTSSQSIGQVMP
.... . . ::..::.. : . .: ...:.. .. . ..:.. :: : :
CCDS35 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP
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CCDS82 ENLVNLLEVCKKKKRWYLVFEFVDHTILDDLELFPNGLDYQVVQKYLFQIINGIGFCHSH
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CCDS82 NIIHRDIKPENILVSQSGVVKLCDFGFARTLAAPGEVYTDYVATRWYRAPELLVGDVKYG
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CCDS82 PEIKEREPLERRYPKLSEVVIDLAKKCLHIDPDKRPFCAELLHHDFFQMDGFAERFSQEL
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. :. ..:. :: : : .....: .::. . .::. . . . :: .
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CCDS82 LFKIKGSKIDGEKAEK-------GNRASNASCLH----DSRT----SHNKIVPSTSLKDC
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CCDS82 SNVSVDHTRNPSVAIPPLT-HNLSAVAPSINSGMGTETIPIQGYRVDEKTKKCSIPFVKP
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pF1KE0 NSRQEDPGPIQSQMEKGIFNERTGHSDQMANENKRKLNFSRSDRK--EFHFPELPVTIQS
: :. : . .. . .:.. . .:.. ..::.: . :... .:: .
CCDS82 N-RHSPSGIYNINVTTLVSSEKN-----LFWASKKRREYSRTDVRLPELNYNHLP---EL
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. :. ... .. :.::: :.::.: .:
CCDS82 RALGGI-ARNSRLTKKESKILSESRIPSLAAIDLHTPSITLHQVSGPPLSDDSGADLPQM
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CCDS82 EHQH
570
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CCDS96 --AKEHNKPTRKTLRK----SRKHHCFTETSKLQYLPQLTGSSILPALDNKKYYCDTKKL
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CCDS96 NYRFPNI
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CCDS33 PEPEDMETLEEKFSDVHPVALNFMKGCLKMNPDDRLTCSQLLESSYF--DSFQEA---QI
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CCDS33 KRKARNEGRNRRRQQVLPLKS
300 310
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CCDS73 MMEKYEKIGKIGEGSYGVVFKCRNRDTGQIVAIKKFLESEDDPVIKKIALREIRMLKQLK
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CCDS73 HPNLVNLLEVFRRKRRLHLVFEYCDHTVLHELDRYQRGVPEHLVKSITWQTLQAVNFCHK
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CCDS73 HNCIHRDVKPENILITKHSVIKLCDFGFARLLTGPSDYYTDYVATRWYRSPELLVGDTQY
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pF1KE0 GKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFSKSPIFAGVV
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CCDS73 GPPVDVWAIGCVFAELLSGVPLWPGKSDVDQLYLIRKTLGDLIPRHQQVFSTNQYFSGVK
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CCDS73 IPDPEDMEPLELKFPNISYPALGLLKGRVPIASRTE
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CCDS83 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
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..: : :. .: :.::.. ...: ::..: :... :..::::: . . :.: :
CCDS83 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
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. .... .:..:.: :: . : ..:: . . ::
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...... . .. ..: :.: . : .. . .: . :. .. :. : .. .:
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CCDS83 STSKDLTN-NNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKP--SEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFM
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CCDS83 ESSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQI
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pF1KE0 MEMYETLGKVGEGSYGTVMKCKHKNTGQIVAIKIFYERPE-QSVNKIAMRE
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CCDS14 LKMLRTLKQENIVELKEAFRRRGKLYLVFEYVEKNMLELLEEMPNGVPPEKVKSYIYQLI
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CCDS14 KAIHWCHKNDIVHRDIKPENLLISHNDVLKLCDFGFARNLSEGNNANYTEYVATRWYRSP
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pF1KE0 ELVLKDTSYGKPVDIWALGCMIIEMATGNPYLPSSSDLDLLHKIVLKVGNLSPHLQNIFS
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CCDS14 ELLL-GAPYGKSVDMWSVGCILGELSDGQPLFPGESEIDQLFTIQKVLGPLPSEQMKLFY
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CCDS14 SNPRFHGLRFPAVNHPQSLERRYLGILNSVLLDLMKNLLKLDPADRYLTEQCLNHPTFQT
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pF1KE0 DGFIEKFMPELKAKLLQEAKVNSLIKPKESSKENELRKDERKTVYTNTLLSSSVLGKE--
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CCDS14 QRLLDR-------------------SPSRSAK----RKPYH--VESSTLSNRNQAGKSTA
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CCDS14 LQSHHRSNSKDIQNLSVGLPRADEGLPANESFLNG---NLAGASLSPLHTKTYQASSQPG
340 350 360 370 380 390
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. . :: :.. . .:. . : : .:. . . . ... .. . : . ..
CCDS14 STSKDLTN-NNIPHLLSPKEAKSKTEFDFNIDPKP--SEGPGTKYLKSNSRSQQNRHSFM
400 410 420 430 440
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CCDS14 ESSQSKAGTLQPNEKQSRHSYIDTIPQSSRSPSYRTKAKSHGALSDSKSVSNLSEARAQI
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592 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]