FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0982, 587 aa
1>>>pF1KE0982 587 - 587 aa - 587 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4027+/-0.00111; mu= 0.0421+/- 0.065
mean_var=332.8226+/-74.328, 0's: 0 Z-trim(110.6): 483 B-trim: 0 in 0/53
Lambda= 0.070302
statistics sampled from 11113 (11716) to 11113 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.708), E-opt: 0.2 (0.36), width: 16
Scan time: 3.330
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 3971 417.4 2.6e-116
CCDS77189.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 376) 2598 277.9 1.6e-74
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 1791 196.4 1.1e-49
CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 233) 1512 167.5 1.7e-41
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 899 105.6 1.2e-22
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 894 105.1 1.7e-22
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 847 100.3 4.4e-21
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 755 91.4 4.9e-18
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 697 85.3 2.2e-16
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 692 84.5 2.3e-16
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 683 83.7 4.6e-16
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 629 78.4 2.6e-14
CCDS5462.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1452) 606 76.5 2.6e-13
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 593 74.5 2.6e-13
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 598 75.3 2.7e-13
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 587 73.8 3.5e-13
CCDS5461.1 CDK13 gene_id:8621|Hs108|chr7 (1512) 589 74.8 8.7e-13
CCDS45666.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1481) 580 73.9 1.6e-12
CCDS11337.1 CDK12 gene_id:51755|Hs108|chr17 (1490) 580 73.9 1.6e-12
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 567 71.9 1.6e-12
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 567 72.0 1.8e-12
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 563 71.5 2.1e-12
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 561 71.3 2.4e-12
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 560 71.2 2.7e-12
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 560 71.3 2.9e-12
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 555 70.7 3.7e-12
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 552 70.4 5e-12
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 552 70.4 5.1e-12
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 552 70.5 5.4e-12
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 539 69.1 1.2e-11
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 539 69.1 1.3e-11
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 534 68.6 1.7e-11
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 534 68.6 1.8e-11
CCDS6879.1 CDK9 gene_id:1025|Hs108|chr9 ( 372) 522 67.3 3.8e-11
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 512 66.3 7.1e-11
>>CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (587 aa)
initn: 3971 init1: 3971 opt: 3971 Z-score: 2201.8 bits: 417.4 E(32554): 2.6e-116
Smith-Waterman score: 3971; 100.0% identity (100.0% similar) in 587 aa overlap (1-587:1-587)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLEQGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLEQGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQHYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQHYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 LSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQSHSSMERAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQSHSSMERAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 EADYGRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDLSHWKQAAGAPPTATGLADTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EADYGRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDLSHWKQAAGAPPTATGLADTG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 AREDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSASPPGRPAPVDGGASPQFDLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AREDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSASPPGRPAPVDGGASPQFDLD
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580
pF1KE0 VFISRALKLCTKPEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQTEAFSKERW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VFISRALKLCTKPEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQTEAFSKERW
550 560 570 580
>>CCDS77189.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (376 aa)
initn: 2598 init1: 2598 opt: 2598 Z-score: 1451.5 bits: 277.9 E(32554): 1.6e-74
Smith-Waterman score: 2598; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (212-587:1-376)
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 KGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQLI
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQLI
10 20 30
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 LETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDRL
40 50 60 70 80 90
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVSL
100 110 120 130 140 150
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQSHSSMERAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQSHSSMERAFE
160 170 180 190 200 210
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 ADYGRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDLSHWKQAAGAPPTATGLADTGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ADYGRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDLSHWKQAAGAPPTATGLADTGA
220 230 240 250 260 270
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 REDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSASPPGRPAPVDGGASPQFDLDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 REDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSASPPGRPAPVDGGASPQFDLDV
280 290 300 310 320 330
550 560 570 580
pF1KE0 FISRALKLCTKPEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQTEAFSKERW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FISRALKLCTKPEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQTEAFSKERW
340 350 360 370
>>CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 (721 aa)
initn: 1542 init1: 968 opt: 1791 Z-score: 1005.8 bits: 196.4 E(32554): 1.1e-49
Smith-Waterman score: 1947; 53.9% identity (74.7% similar) in 608 aa overlap (1-586:1-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
:::: . . ...:.:::.:..:..::: : ::::.::::. ..::.:::.:.: .:.:
CCDS10 MAEKFESLMNIHGFDLGSRYMDLKPLGCGGNGLVFSAVDNDCDKRVAIKKIVLTDPQSVK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KE0 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQ---GELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLE
::::::::::::::::::::.:.:::.:..: : : ... .:::::::::::: .::
CCDS10 HALREIKIIRRLDHDNIVKVFEILGPSGSQLTDDVGSLTELNSVYIVQEYMETDLANVLE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 QGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQ
:: : ::::.:::::::::::::::::::::::::::.::.::::::::::::::::.:
CCDS10 QGPLLEEHARLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANLFINTEDLVLKIGDFGLARIMDP
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 HYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQ
::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::. ::::::::::
CCDS10 HYSHKGHLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIFAEMLTGKTLFAGAHELEQ
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 MQLILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTW-EVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFN
::::::.:::..:::..::: :.: .. . : ..:: .::: .. ::.::::.::::.
CCDS10 MQLILESIPVVHEEDRQELLSVIPVYIRNDMTEPHKPLTQLLPGISREALDFLEQILTFS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 PMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSR
:::::::: .:.::::: :: : ::: :.:::.::::.:::.:: ..:.. ::. :
CCDS10 PMDRLTAEEALSHPYMSIYSFPMDEPISSHPFHIEDEVDDILLMDETHSHIYNWE----R
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 YPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGS-APLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLEQ----
: :. .: : .::: :::: : . :.::::::: .. :..::.
CCDS10 YHDCQFSEHDWPVHNNFDIDEVQLDPRALSDVTDEEEVQVDPRKYLDGDREKYLEDPAFD
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460
pF1KE0 SHSSMERAFE-ADY----------GRSCDYKVGSPSYLDKLLWRDNKPHHYSEPKLILDL
.. : : .. .:. ...:.::. : ::::.:.::... .:: :::::.::
CCDS10 TNYSTEPCWQYSDHHENKYCDLECSHTCNYKTRSSSYLDNLVWRESEVNHYYEPKLIIDL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KE0 SHWKQAAGAPPTATGLADTGAREDEPASLFLEIAQWVKSTQGGPEHASPPADDPERRLSA
:.::. .. . :. .. : ::. : . :.:: ::. .
CCDS10 SNWKE------------QSKEKSDKKGKSKCERNGLVKA-QIALEEASQQLAGKEREKNQ
480 490 500 510 520
530 540 550 560 570
pF1KE0 SPPGRPAPVDGGASPQFDLDVFISRALKLCTK--PEDLPDNKLGDLNGACIPEHPGDLVQ
. ::.: ::. ...: .. : :. : ::.:::.. . .:.
CCDS10 G---------------FDFDSFIAGTIQLSSQHEPTDVVD-KLNDLNSSVSQLELKSLI-
530 540 550 560
580
pF1KE0 TEAFSKERW
... :.:.
CCDS10 SKSVSQEKQEKGMANLAQLEALYQSSWDSQFVSGGEDCFFINQFCEVRKDEQVEKENTYT
570 580 590 600 610 620
>>CCDS77188.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 (233 aa)
initn: 1512 init1: 1512 opt: 1512 Z-score: 858.6 bits: 167.5 E(32554): 1.7e-41
Smith-Waterman score: 1512; 100.0% identity (100.0% similar) in 231 aa overlap (1-231:1-231)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSDARSMK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLEQGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLLEQGT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQHYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIVDQHYS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAHELEQMQL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGTL
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDR
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 819 init1: 322 opt: 899 Z-score: 520.4 bits: 105.6 E(32554): 1.2e-22
Smith-Waterman score: 899; 42.6% identity (74.2% similar) in 329 aa overlap (14-337:19-338)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKIALSD
.:.: :..... .: :. :.: :: :. .::.:::. .
CCDS13 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNVNKVRVAIKKISPFE
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 ARSM-KHALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVL-GPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLA
... ...::::::. :. :.::. . ... .: ... .::::. :::::
CCDS13 HQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKD-------VYIVQDLMETDLY
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 RLLEQGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTE-DLVLKIGDFGLA
.::. :...: :.::.:::::::::::::::::::.:....: :: :: :::::
CCDS13 KLLKTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDL--KICDFGLA
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RIVDQHYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGA
:..: ..: :.:.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..::::::::..: .: :
CCDS13 RVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRPIFPGK
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 HELEQMQLILETIPVIREEDKDEL--LRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEVNSEAIDFLE
: :.:.. :: . .:: . . :.. ..: . : : .:.:...:.:.:.:.
CCDS13 HYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 KILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQLSNW
:.::::: :. .:..: :::. : : ::: .. ::... :.::.
CCDS13 KMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEET
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 DTCSSRYPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQVDPRKDSHSSSERFLE
CCDS13 ARFQPGYRS
360
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
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Smith-Waterman score: 894; 42.8% identity (73.7% similar) in 334 aa overlap (14-337:36-355)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRAC
.:.: :....: .: :. :.: :: :
CCDS10 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RKVAVKKIALSDARSM-KHALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAY
.::.:::. . ... ...::::.:. :. :.:.. . ..: ... :.. . .:
CCDS10 TRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDIL--RASTLEA----MRDVY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 IVQEYMETDLARLLEQGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTE-D
:::. ::::: .::.. :...: :.::.:::::::::::::::::::.:..:.: :
CCDS10 IVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
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: :: :::::::.: ...: :.:.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..::::::
CCDS10 L--KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE0 MLTGRMLFAGAHELEQMQLILETIPVIREEDKDEL--------LRVMPSFVSSTWEVKRP
::..: .: : : :.:.. :: . .:: . . :. .:: .. .:
CCDS10 MLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWA----
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDE
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CCDS10 --KLFPKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAME
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 IDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDV
.::.
CCDS10 LDDLPKERLKELIFQETARFQPGVLEAP
360 370
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
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Smith-Waterman score: 847; 42.9% identity (73.1% similar) in 324 aa overlap (14-327:36-344)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRAC
.:.: :....: .: :. :.: :: :
CCDS42 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RKVAVKKIALSDARSM-KHALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAY
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CCDS42 TRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDIL--RASTLEA----MRDVY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 IVQEYMETDLARLLEQGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTE-D
:::. ::::: .::.. :...: :.::.:::::::::::::::::::.:..:.: :
CCDS42 IVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCD
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170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LVLKIGDFGLARIVDQHYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAE
: :: :::::::.: ...: :.:.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..::::::
CCDS42 L--KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
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::..: .: : : :.:.. :: . .:: . . :. .:: .. .:
CCDS42 MLSNRPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWA----
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 LRKLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDE
::.:. .:.:.:.:...::::: :.:.: .: :::. : : :: ..: :
CCDS42 --KLFPKSDSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDE-VGQSPAAVGLG
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 IDDIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDV
CCDS42 AGEQGGT
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
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Smith-Waterman score: 755; 38.1% identity (71.8% similar) in 323 aa overlap (14-328:49-363)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRAC
.:.: .. .. .: :. :.: :: .
CCDS11 GPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSFDVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTG
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RKVAVKKI--ALSDARSMKHALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVA
..::.::: :.. . . :..:::.::.... ::::. . ..: : : :: :. .
CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRP--TVPYGE---FKSV
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 YIVQEYMETDLARLLEQGT-LAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTE
:.: . ::.:: ...... :. ::.. :.:::::::::.:::.:.::::::.:.... :
CCDS11 YVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVN-E
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE0 DLVLKIGDFGLAR-IVDQHYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCIL
. :::::::.:: . . :. ...: ..:.:::.:.:.:: ..::.:::.:..:::.
CCDS11 NCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIF
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 AEMLTGRMLFAGAHELEQMQLILETI----PVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLR
.:::. :.:: : . ..:.:::. .. :.. . : .:.. . . : : .
CCDS11 GEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPV--PWE
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 KLLPEVNSEAIDFLEKILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEID
. : .. .:...: ..: :.: :..: .:.::... : :.::: ::
CCDS11 TVYPGADRQALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDRE
320 330 340 350 360 370
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 DIVLMAANQSQLSNWDTCSSRYPVSLSSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSAPLAEDVQV
CCDS11 ALTRERIKEAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCA
380 390 400 410 420 430
>>CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 (544 aa)
initn: 651 init1: 263 opt: 697 Z-score: 407.5 bits: 85.3 E(32554): 2.2e-16
Smith-Waterman score: 705; 32.7% identity (59.2% similar) in 532 aa overlap (19-525:12-499)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRACRKVAVKKI--ALSDARS
:.. . :: :. :.: .::: :. . ::.::: :. : .
CCDS64 MCTVVDPRIVRRYLLRRQLGQGAYGIVWKAVDRRTGEVVAIKKIFDAFRDKTD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 MKHALREIKIIRRL-DHDNIVKVYEVL-GPKGTDLQGELFKFSVAYIVQEYMETDLARLL
....::: ..... :: ::... .:. . . :. :.: :.:.::: ..
CCDS64 AQRTFREITLLQEFGDHPNIISLLDVIRAENDRDI----------YLVFEFMDTDLNAVI
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 EQGTLAEE-HAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTEDLVLKIGDFGLARIV
..: : .. :.. ..:::::. ...::..:.::: ::.:..... . ..:. :::::: .
CCDS64 RKGGLLQDVHVRSIFYQLLRATRFLHSGHVVHRDQKPSNVLLDA-NCTVKLCDFGLARSL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 DQ--HYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAEMLTGRMLFAGAH
. . . ..: ..:.:::.:..::: . :: ..:::. ::::.::: :: :: :.
CCDS64 GDLPEGPEDQAVTEYVATRWYRAPEVLLSSHRYTLGVDMWSLGCILGEMLRGRPLFPGTS
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE0 ELEQMQLILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEV--KRP---LRKLLP-EVNSEAID
:.:..::::::: ::: :: . . .:. . .:: : ::: ... ::.:
CCDS64 TLHQLELILETIPPPSEED---LLALGSGCRASVLHQLGSRPRQTLDALLPPDTSPEALD
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 FLEKILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMAANQSQL
.:...:.: : ::.: ..:::::.. . :: :: . . :. : . ::
CCDS64 LLRRLLVFAPDKRLSATQALQHPYVQRFHCPSDEWARE---------ADVRPRAHEGVQL
280 290 300 310 320 330
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pF1KE0 SNWDTCSSRYPVSL------SSDLEWRPDRCQDASEVQRDPRAGSA-PLAEDVQVDPRKD
: . : : . : ... : :. . .. . ::: : :: ::
CCDS64 SVPEYRSRVYQMILECGGSSGTSREKGPEGVSPSQAHLHKPRADPQLPSRTPVQ-GPRPR
340 350 360 370 380
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.:: .:. :. ... . ..: :: ..: .: : : :.
CCDS64 PQSSP------GHDPAEHE-SPRAAKNVPRQNSAPLLQTALLGNGERPPGAKEAPPLTLS
390 400 410 420 430 440
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: . .. :: :. :. : . . :. : ..: .. :: . :: :: ::
CCDS64 LVK-PSGRGAAPSLTSQAAA-----QVANQALIRGDWNRG--GGVRVASVQQVPPRLPPE
450 460 470 480 490
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: :::
CCDS64 AR-----PGRRMFSTSALQGAQGGARALLGGYSQAYGTVCHSALGHLPLLEGHHV
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>>CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (335 aa)
initn: 705 init1: 318 opt: 692 Z-score: 407.3 bits: 84.5 E(32554): 2.3e-16
Smith-Waterman score: 785; 40.8% identity (68.4% similar) in 326 aa overlap (14-337:36-311)
10 20 30 40
pF1KE0 MAEKGDCIASVYGYDLGGRFVDFQPLGFGVNGLVLSAVDSRAC
.:.: :....: .: :. :.: :: :
CCDS42 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 RKVAVKKIALSDARSM-KHALREIKIIRRLDHDNIVKVYEVLGPKGTDLQGELFKFSVAY
.::.:::. . ... ...::::.:. :. :.:.. . ..: ... :.. . .:
CCDS42 TRVAIKKISPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDIL--RASTLEA----MRDVY
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 IVQEYMETDLARLLEQGTLAEEHAKLFMYQLLRGLKYIHSANVLHRDLKPANIFISTE-D
:::. ::::: .::.. :...: :.::.:::::::::::::::::::.:..:.: :
CCDS42 IVQDLMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCD
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 LVLKIGDFGLARIVDQHYSHKGYLSEGLVTKWYRSPRLLLSPNNYTKAIDMWAAGCILAE
: :: :::::::.: ...: :.:.: ..:.:::.:...:. ..:::.::.:..::::::
CCDS42 L--KICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAE
180 190 200 210 220 230
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pF1KE0 MLTGRMLFAGAHELEQMQLILETIPVIREEDKDELLRVMPSFVSSTWEVKRPLRKLLPEV
::..: .: : : :.:.. ::
CCDS42 MLSNRPIFPGKHYLDQLNHIL---------------------------------------
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pF1KE0 NSEAIDFLEKILTFNPMDRLTAEMGLQHPYMSPYSCPEDEPTSQHPFRIEDEIDDIVLMA
:.:.:...::::: :.:.: .: :::. : : :::....:: . :.::.
CCDS42 ---ALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKER
260 270 280 290 300 310
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587 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]