Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0972
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0972, 520 aa
1>>>pF1KE0972 520 - 520 aa - 520 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.9334+/-0.00107; mu= 1.6388+/- 0.062
mean_var=335.2463+/-76.362, 0's: 0 Z-trim(112.3): 491 B-trim: 339 in 1/50
Lambda= 0.070047
statistics sampled from 12365 (13049) to 12365 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.739), E-opt: 0.2 (0.401), width: 16
Scan time: 3.810
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11039.1 CAMKK1 gene_id:84254|Hs108|chr17 ( 520) 3472 365.3 9.8e-101
CCDS11038.1 CAMKK1 gene_id:84254|Hs108|chr17 ( 505) 1713 187.5 3.1e-47
CCDS44999.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 533) 1266 142.3 1.3e-33
CCDS9218.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 541) 1266 142.3 1.3e-33
CCDS58283.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 556) 1266 142.4 1.3e-33
CCDS9216.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 588) 1266 142.4 1.4e-33
CCDS53837.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 490) 873 102.6 1.1e-21
CCDS9219.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 498) 873 102.6 1.1e-21
CCDS9217.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 ( 545) 873 102.6 1.2e-21
>>CCDS11039.1 CAMKK1 gene_id:84254|Hs108|chr17 (520 aa)
initn: 3472 init1: 3472 opt: 3472 Z-score: 1922.0 bits: 365.3 E(32554): 9.8e-101
Smith-Waterman score: 3472; 99.8% identity (99.8% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-520)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGGPAVCCQDPRAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEGGPAVCCQDPRAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLPARPSLSARKLSLQERPAGSYLEAQAGPYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLPARPSLSARKLSLQERPAGSYLEAQAGPYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DCVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DCVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AAQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 STNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LEYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SDSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEGPEISEEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS11 SDSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEEPEISEEL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KDLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 SWTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
490 500 510 520
>>CCDS11038.1 CAMKK1 gene_id:84254|Hs108|chr17 (505 aa)
initn: 1700 init1: 1700 opt: 1713 Z-score: 961.4 bits: 187.5 E(32554): 3.1e-47
Smith-Waterman score: 3140; 92.5% identity (92.5% similar) in 520 aa overlap (1-520:1-482)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEGGPAVCCQDPRAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MEGGPAVCCQDPRAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LLPARPSLSARKLSLQERPAGSYLEAQAGPYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LLPARPSLSARKLSLQERPAGSYLEAQAGPYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DCVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 DCVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AAQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AAQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYL------------
190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 STNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILG
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 --------------------------VFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILG
230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LEYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 LEYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAI
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 SDSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEGPEISEEL
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::
CCDS11 SDSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEEPEISEEL
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 KDLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KDLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIP
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520
pF1KE0 SWTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SWTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLVKEGFGEGGKSPELPGVQEDE
450 460 470 480 490 500
CCDS11 AAS
>>CCDS44999.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 (533 aa)
initn: 1894 init1: 1193 opt: 1266 Z-score: 717.0 bits: 142.3 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1864; 60.5% identity (77.9% similar) in 488 aa overlap (43-519:71-517)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 RAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSRLLPARPSLSARK
: : .: . : : .:: ::: ::.::
CCDS44 SSLSIHLGMESFIVVTECEPGCAVDLGLARDRPLEADGQEV-PLDTSGS-QARPHLSGRK
50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KE0 LSLQERP-----AGSYLEAQAG------PYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAED
:::::: ::. :. .. ::. . . ::: ::::.:::::.:. .:
CCDS44 LSLQERSQGGLAAGGSLDMNGRCICPSLPYSPVSSPQSSPRLPRRPTVESHHVSITGMQD
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQA
::::::: :..:::::.::::.:::::... .:::::::::::..: ::::::::::..
CCDS44 CVQLNQYTLKDEIGKGSYGVVKLAYNENDNTYYAMKVLSKKKLIRQAGFPRRPPPRGTRP
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLDS
: :: . :.:.::::::::::::: :::::.:::::: ::.::.
CCDS44 APGGCIQPRGPIEQVYQEIAILKKLDHPNVVKLVEVLDDPNEDHLYM-------------
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILGL
::.:. .::::::: ::.::.:::.:..:.: :.
CCDS44 -------------------------VFELVNQGPVMEVPTLKPLSEDQARFYFQDLIKGI
270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAIS
:::: :::.::::::::::.:.:::.:::::::::.:.:.:: ::.:.:::::::::..:
CCDS44 EYLHYQKIIHRDIKPSNLLVGEDGHIKIADFGVSNEFKGSDALLSNTVGTPAFMAPESLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEGPEISEELK
.. . :::::::::: ::::::::.:.:::.:. :. :: :::.. . ::. :.:.:.::
CCDS44 ETRKIFSGKALDVWAMGVTLYCFVFGQCPFMDERIMCLHSKIKSQALEFPDQPDIAEDLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIPS
::: .:::::::.:: ::.::::::::..: ::::::.:.:..::::::::.:::. :::
CCDS44 DLITRMLDKNPESRIVVPEIKLHPWVTRHGAEPLPSEDENCTLVEVTEEEVENSVKHIPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 WTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
.::::::.:.:::::::::: .::::::.:::::::
CCDS44 LATVILVKTMIRKRSFGNPFEG-SRREERSLSAPGNLLTKKPTRECESLSELKT
490 500 510 520 530
>>CCDS9218.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 (541 aa)
initn: 1894 init1: 1193 opt: 1266 Z-score: 717.0 bits: 142.3 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1864; 60.5% identity (77.9% similar) in 488 aa overlap (43-519:71-517)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 RAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSRLLPARPSLSARK
: : .: . : : .:: ::: ::.::
CCDS92 SSLSIHLGMESFIVVTECEPGCAVDLGLARDRPLEADGQEV-PLDTSGS-QARPHLSGRK
50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KE0 LSLQERP-----AGSYLEAQAG------PYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAED
:::::: ::. :. .. ::. . . ::: ::::.:::::.:. .:
CCDS92 LSLQERSQGGLAAGGSLDMNGRCICPSLPYSPVSSPQSSPRLPRRPTVESHHVSITGMQD
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQA
::::::: :..:::::.::::.:::::... .:::::::::::..: ::::::::::..
CCDS92 CVQLNQYTLKDEIGKGSYGVVKLAYNENDNTYYAMKVLSKKKLIRQAGFPRRPPPRGTRP
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLDS
: :: . :.:.::::::::::::: :::::.:::::: ::.::.
CCDS92 APGGCIQPRGPIEQVYQEIAILKKLDHPNVVKLVEVLDDPNEDHLYM-------------
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILGL
::.:. .::::::: ::.::.:::.:..:.: :.
CCDS92 -------------------------VFELVNQGPVMEVPTLKPLSEDQARFYFQDLIKGI
270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAIS
:::: :::.::::::::::.:.:::.:::::::::.:.:.:: ::.:.:::::::::..:
CCDS92 EYLHYQKIIHRDIKPSNLLVGEDGHIKIADFGVSNEFKGSDALLSNTVGTPAFMAPESLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEGPEISEELK
.. . :::::::::: ::::::::.:.:::.:. :. :: :::.. . ::. :.:.:.::
CCDS92 ETRKIFSGKALDVWAMGVTLYCFVFGQCPFMDERIMCLHSKIKSQALEFPDQPDIAEDLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIPS
::: .:::::::.:: ::.::::::::..: ::::::.:.:..::::::::.:::. :::
CCDS92 DLITRMLDKNPESRIVVPEIKLHPWVTRHGAEPLPSEDENCTLVEVTEEEVENSVKHIPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 WTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
.::::::.:.:::::::::: .::::::.:::::::
CCDS92 LATVILVKTMIRKRSFGNPFEG-SRREERSLSAPGNLLTKQGSEDNLQGTDPPPVGEEEV
490 500 510 520 530
CCDS92 LL
540
>>CCDS58283.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 (556 aa)
initn: 1894 init1: 1193 opt: 1266 Z-score: 716.8 bits: 142.4 E(32554): 1.3e-33
Smith-Waterman score: 1864; 60.5% identity (77.9% similar) in 488 aa overlap (43-519:71-517)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 RAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSRLLPARPSLSARK
: : .: . : : .:: ::: ::.::
CCDS58 SSLSIHLGMESFIVVTECEPGCAVDLGLARDRPLEADGQEV-PLDTSGS-QARPHLSGRK
50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KE0 LSLQERP-----AGSYLEAQAG------PYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAED
:::::: ::. :. .. ::. . . ::: ::::.:::::.:. .:
CCDS58 LSLQERSQGGLAAGGSLDMNGRCICPSLPYSPVSSPQSSPRLPRRPTVESHHVSITGMQD
100 110 120 130 140 150
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 CVQLNQYKLQSEIGKGAYGVVRLAYNESEDRHYAMKVLSKKKLLKQYGFPRRPPPRGSQA
::::::: :..:::::.::::.:::::... .:::::::::::..: ::::::::::..
CCDS58 CVQLNQYTLKDEIGKGSYGVVKLAYNENDNTYYAMKVLSKKKLIRQAGFPRRPPPRGTRP
160 170 180 190 200 210
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 AQGGPAKQLLPLERVYQEIAILKKLDHVNVVKLIEVLDDPAEDNLYLALQNQAQNIQLDS
: :: . :.:.::::::::::::: :::::.:::::: ::.::.
CCDS58 APGGCIQPRGPIEQVYQEIAILKKLDHPNVVKLVEVLDDPNEDHLYM-------------
220 230 240 250 260
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TNIAKPHSLLPSEQQDSGSTWAARSVFDLLRKGPVMEVPCDKPFSEEQARLYLRDVILGL
::.:. .::::::: ::.::.:::.:..:.: :.
CCDS58 -------------------------VFELVNQGPVMEVPTLKPLSEDQARFYFQDLIKGI
270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 EYLHCQKIVHRDIKPSNLLLGDDGHVKIADFGVSNQFEGNDAQLSSTAGTPAFMAPEAIS
:::: :::.::::::::::.:.:::.:::::::::.:.:.:: ::.:.:::::::::..:
CCDS58 EYLHYQKIIHRDIKPSNLLVGEDGHIKIADFGVSNEFKGSDALLSNTVGTPAFMAPESLS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DSGQSFSGKALDVWATGVTLYCFVYGKCPFIDDFILALHRKIKNEPVVFPEGPEISEELK
.. . :::::::::: ::::::::.:.:::.:. :. :: :::.. . ::. :.:.:.::
CCDS58 ETRKIFSGKALDVWAMGVTLYCFVFGQCPFMDERIMCLHSKIKSQALEFPDQPDIAEDLK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 DLILKMLDKNPETRIGVPDIKLHPWVTKNGEEPLPSEEEHCSVVEVTEEEVKNSVRLIPS
::: .:::::::.:: ::.::::::::..: ::::::.:.:..::::::::.:::. :::
CCDS58 DLITRMLDKNPESRIVVPEIKLHPWVTRHGAEPLPSEDENCTLVEVTEEEVENSVKHIPS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520
pF1KE0 WTTVILVKSMLRKRSFGNPFEPQARREERSMSAPGNLLV
.::::::.:.:::::::::: .::::::.:::::::
CCDS58 LATVILVKTMIRKRSFGNPFEG-SRREERSLSAPGNLLTKKPTRECESLSELKGTKKKKG
490 500 510 520 530
CCDS58 LDSMTSTVAAGWLDRRV
540 550
>>CCDS9216.1 CAMKK2 gene_id:10645|Hs108|chr12 (588 aa)
initn: 1894 init1: 1193 opt: 1266 Z-score: 716.6 bits: 142.4 E(32554): 1.4e-33
Smith-Waterman score: 1864; 60.5% identity (77.9% similar) in 488 aa overlap (43-519:71-517)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 RAELVERVAAIDVTHLEEADGGPEPTRNGVDPPPRARAASVIPGSTSRLLPARPSLSARK
: : .: . : : .:: ::: ::.::
CCDS92 SSLSIHLGMESFIVVTECEPGCAVDLGLARDRPLEADGQEV-PLDTSGS-QARPHLSGRK
50 60 70 80 90
80 90 100 110 120
pF1KE0 LSLQERP-----AGSYLEAQAG------PYATGPASHISPRAWRRPTIESHHVAISDAED
:::::: ::. :. .. ::. . . ::: ::::.:::::.:. .:
CCDS92 LSLQERSQGGLAAGGSLDMNGRCICPSLPYSPVSSPQSSPRLPRRPTVESHHVSITGMQD
100 110 120 130 140 150
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::.:. .::::::: ::.::.:::.:..:.: :.
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::: .:::::::.:: ::.::::::::..: ::::::.:.:..::::::::.:::. :::
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190 200 210 220 230 240
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]