Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0929
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0929, 385 aa
1>>>pF1KE0929 385 - 385 aa - 385 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4688+/-0.000788; mu= 7.3918+/- 0.048
mean_var=122.1203+/-24.405, 0's: 0 Z-trim(112.5): 31 B-trim: 94 in 1/49
Lambda= 0.116059
statistics sampled from 13209 (13240) to 13209 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.75), E-opt: 0.2 (0.407), width: 16
Scan time: 2.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 ( 385) 2643 453.2 1.9e-127
CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 495) 1322 232.0 8.8e-61
CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 372) 1277 224.4 1.3e-58
CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 ( 398) 1277 224.5 1.4e-58
CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 ( 447) 839 151.1 1.8e-36
CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 545) 824 148.7 1.2e-35
CCDS82180.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 ( 546) 816 147.3 3.1e-35
CCDS34495.1 TBX18 gene_id:9096|Hs108|chr6 ( 607) 805 145.5 1.2e-34
CCDS11627.2 TBX2 gene_id:6909|Hs108|chr17 ( 712) 789 142.9 8.9e-34
CCDS81360.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 602) 787 142.5 9.7e-34
CCDS9173.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 518) 785 142.1 1.1e-33
CCDS9175.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 723) 784 142.0 1.6e-33
CCDS9174.1 TBX5 gene_id:6910|Hs108|chr12 ( 468) 769 139.4 6.3e-33
CCDS30816.1 TBX15 gene_id:6913|Hs108|chr1 ( 496) 768 139.3 7.4e-33
CCDS14445.1 TBX22 gene_id:50945|Hs108|chrX ( 520) 754 136.9 3.9e-32
CCDS10670.1 TBX6 gene_id:6911|Hs108|chr16 ( 436) 744 135.2 1.1e-31
CCDS55960.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (2856) 648 119.5 3.8e-26
CCDS55959.1 MGA gene_id:23269|Hs108|chr15 (3065) 648 119.5 4e-26
CCDS11514.1 TBX21 gene_id:30009|Hs108|chr17 ( 535) 634 116.8 4.5e-26
CCDS33310.1 TBR1 gene_id:10716|Hs108|chr2 ( 682) 628 115.9 1.1e-25
CCDS63585.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 705) 586 108.9 1.5e-23
CCDS2646.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 686) 583 108.4 2.1e-23
CCDS9176.1 TBX3 gene_id:6926|Hs108|chr12 ( 743) 516 97.2 5.3e-20
CCDS59045.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 377) 489 92.5 6.8e-19
CCDS63584.1 EOMES gene_id:8320|Hs108|chr3 ( 410) 470 89.3 6.6e-18
CCDS1272.1 TBX19 gene_id:9095|Hs108|chr1 ( 448) 470 89.4 7.1e-18
CCDS5290.1 T gene_id:6862|Hs108|chr6 ( 435) 465 88.5 1.2e-17
>>CCDS31621.1 TBX10 gene_id:347853|Hs108|chr11 (385 aa)
initn: 2643 init1: 2643 opt: 2643 Z-score: 2401.8 bits: 453.2 E(32554): 1.9e-127
Smith-Waterman score: 2643; 100.0% identity (100.0% similar) in 385 aa overlap (1-385:1-385)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSSTGAQAVAEPTGQGPKNP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSSTGAQAVAEPTGQGPKNP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 RVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 RVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 DDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 NGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 IASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQG
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 GLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ
:::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GLPLPAGLGLLSPTVVCLGPGQDSQ
370 380
>>CCDS13767.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 (495 aa)
initn: 1309 init1: 1244 opt: 1322 Z-score: 1204.7 bits: 232.0 E(32554): 8.8e-61
Smith-Waterman score: 1325; 58.0% identity (71.2% similar) in 386 aa overlap (6-364:32-411)
10 20 30
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTT---SSGWEPRLG
: : .: : : : .. :
CCDS13 HFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KE0 SPFP---SGPCTSSTGA--QAVAEPTGQG---------P--KNPRVSRVTVQLEMKPLWE
.: : . : . ..:: .:.::: : : : :: .:. :.:::::: ::.
CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV
:::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.:::
CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
:::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD
:::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : .
CCDS13 HVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPE
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KE0 SWPVAPRP----LLSVPARSHSSL-SPCVLKGATDREKDPNKASASTSKT---PAWLHHQ
.:: :: :.:. :::.. . :: .:. ::: .: .. :: :
CCDS13 DWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGT---EKDAAEARREFQRDAGGPAVLGDP
310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGL
:: ::: . . . .: : : ::.: : :..: . .. ::
CCDS13 AHPPQ--LLARVLSPSLPGAGGAGGLVPLPGAPGGRPSP-PNPELRLEAPGASEPLHHHP
360 370 380 390 400 410
370 380
pF1KE0 GLLSPTVVCLGPGQDSQ
CCDS13 YKYPAAAYDHYLGAKSRPAPYPLPGLRGHGYHPHAHPHHHHHPVSPAAAAAAAAAAAAAA
420 430 440 450 460 470
>>CCDS13765.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 (372 aa)
initn: 1244 init1: 1244 opt: 1277 Z-score: 1165.9 bits: 224.4 E(32554): 1.3e-58
Smith-Waterman score: 1280; 61.8% identity (76.7% similar) in 330 aa overlap (6-312:32-357)
10 20 30
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTT---SSGWEPRLG
: : .: : : : .. :
CCDS13 HFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KE0 SPFP---SGPCTSSTGA--QAVAEPTGQG---------P--KNPRVSRVTVQLEMKPLWE
.: : . : . ..:: .:.::: : : : :: .:. :.:::::: ::.
CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV
:::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.:::
CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
:::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD
:::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : .
CCDS13 HVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPE
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 SWPVAPRP----LLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPP
.:: :: :.:. :::.. .. . ..:.. . .. ... :. : : ::
CCDS13 DWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEK----GLVTEGSGLQPGLLDVLLKPP
310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 PEVLLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGLLS
CCDS13 SKKSESLRPPHCKDT
360 370
>>CCDS13766.1 TBX1 gene_id:6899|Hs108|chr22 (398 aa)
initn: 1266 init1: 1244 opt: 1277 Z-score: 1165.4 bits: 224.5 E(32554): 1.4e-58
Smith-Waterman score: 1282; 58.8% identity (73.3% similar) in 359 aa overlap (6-333:32-390)
10 20 30
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTT---SSGWEPRLG
: : .: : : : .. :
CCDS13 HFSTVTRDMEAFTASSLSSLGAAGGFPGAASPGADPYGPREPPPPPPRYDPCAAAAPGAP
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70
pF1KE0 SPFP---SGPCTSSTGA--QAVAEPTGQG---------P--KNPRVSRVTVQLEMKPLWE
.: : . : . ..:: .:.::: : : : :: .:. :.:::::: ::.
CCDS13 GPPPPPHAYPFAPAAGAATSAAAEPEGPGASCAAAAKAPVKKNAKVAGVSVQLEMKALWD
70 80 90 100 110 120
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV
:::::::::::::::::::: ::::..::: .::: :::::.:.::::::::::::.:::
CCDS13 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPTFQVKLFGMDPMADYMLLMDFVPVDDKRYRYAFHSSSWLV
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
:::::::::::::.::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AGKADPATPGRVHYHPDSPAKGAQWMKQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
190 200 210 220 230 240
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 HVVFVDPRKDSERYAQENFKSFIFTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLD
:::.::::::::.::.::::.:.: ::.:::::::::::::::::::::::::::. : .
CCDS13 HVVYVDPRKDSEKYAEENFKTFVFEETRFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRDCDPE
250 260 270 280 290 300
260 270 280 290 300
pF1KE0 SWPVAPRP----LLSVPARSHSSLSPCVLKGATDRE----KDPNKASASTSKTPAWLHHQ
.:: :: :.:. :::.. .. . ..:.. :: . . .. .:: .
CCDS13 DWPRNHRPGALPLMSAFARSRNPVASPTQPSGTEKGGHVLKDKEVKAETSRNTPEREVEL
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LLPPPEV----LLAPATYRPVTYQSLYSGAPSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPL
: : :: .: . :.: .:
CCDS13 LRDAGGCVNLGLPCPAECQPFNTQGLVAGRTAGDRLC
370 380 390
>>CCDS43568.1 TBX20 gene_id:57057|Hs108|chr7 (447 aa)
initn: 811 init1: 624 opt: 839 Z-score: 768.3 bits: 151.1 E(32554): 1.8e-36
Smith-Waterman score: 847; 41.4% identity (65.2% similar) in 374 aa overlap (15-376:50-402)
10 20 30 40
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPL-PTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSS
: . :: :: . ..:. :.: .::
CCDS43 IAALMSSGGSKEKEATENTIKPLEQFVEKSSCAQPLGELTSLDAHGEFGGGSGSSPSSSS
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TGAQAVAEPTGQGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKIL
.. . : :.. ...... .:: : ::..:..::::::.::.:::::: ..:..
CCDS43 LCTEPLIPTTPIIPSE-EMAKIACSLETKELWDKFHELGTEMIITKSGRRMFPTIRVSFS
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 GMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMR
:.: : : .:::..:.:.::::::.: :.::::::::: :.:.. ::::: : : ..
CCDS43 GVDPEAKYIVLMDIVPVDNKRYRYAYHRSSWLVAGKADPPLPARLYVHPDSPFTGEQLLK
140 150 160 170 180 190
170 180 190 200 210
pF1KE0 QIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSE----RYAQENFKSFI
:.:::.:.::::: ::..:::::::::.:::: :.. .:: .:.:..::
CCDS43 QMVSFEKVKLTNNELDQHGHIILNSMHKYQPRVHII---KKKDHTASLLNLKSEEFRTFI
200 210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 FTETQFTAVTAYQNHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPC
: :: :::::::::. ::.::: :::::::::.:. . . . . :. . . ::
CCDS43 FPETVFTAVTAYQNQLITKLKIDSNPFAKGFRDSSRLT-DIERESVESLIQKHSYARSPI
260 270 280 290 300 310
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 VLKGATD------REKDPNKASASTSKTPAWLHHQLLPPPEVLLAPATYRPVTYQSLYSG
:. . . ::..:: :.. : . :. .: ::: .
CCDS43 RTYGGEEDVLGDESQTTPNRGSAFTTSDNLSLSSWVSSSSSF---PGFQHP---QSLTAL
320 330 340 350 360
340 350 360 370 380
pF1KE0 APSHLGIPRTRPAPYPLPNIRADRDQGGLPLPAGLGL-LSPTVVCLGPGQDSQ
. : .: . : :.:. ::.:: . ::. :.:...
CCDS43 GTSTASI--ATPIPHPI--------QGSLPPYSRLGMPLTPSAIASSMQGSGPTFPSFHM
370 380 390 400 410
CCDS43 PRYHHYFQQGPYAAIQGLRHSSAVMTPFV
420 430 440
>>CCDS11629.1 TBX4 gene_id:9496|Hs108|chr17 (545 aa)
initn: 621 init1: 395 opt: 824 Z-score: 753.4 bits: 148.7 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 824; 39.9% identity (63.2% similar) in 378 aa overlap (13-374:16-381)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MAAFLSAGLGILAPSETYPLPTTSSGWEPRLGSPFPSGPCTSST---GAQAVAEPTG
::. . ..... :: :..: :: .: ::..:: ..
CCDS11 MLQDKGLSESEEAFRAPGPALGEASAANAPEPALAAPGLSGAALGSPPGPGADVVAAAAA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 QGPKNPRVSRVTVQLEMKPLWEEFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALL
. . . : :. : ::..:.. :::::.::::::::: ..::. ::. . : ::
CCDS11 E----QTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILL
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 MDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLT
.:..: ::.::. : .. :.:::::.:: :::.. :::::: ::.::::.:::.:::::
CCDS11 IDIVPADDHRYK--FCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 NNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKDSERYAQEN--FKSFIFTETQFTAVTAYQ
:: :: :::::::::.::::.:.: .: ... ....: : . .: ::.: .::.::
CCDS11 NNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVKAD---ENNAFGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQ
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 NHRITQLKIASNPFAKGFRESDLDSWPVAPRPLLSVPARSHSSLSPCVLKGATDREKDPN
::.:::::: .:::::::: :: .. :: :. :.: . ... . : .
CCDS11 NHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVG
240 250 260 270 280 290
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CCDS11 PLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDL--PLSTFPTQRDSSLFYHCLKRRDGTRHLDLP
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CCDS11 CKR-SYLEAPSSVGEDHYFRSPPPYDQQMLSPSYCSEVTPREACMYSGSGPEIAGVSGVD
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CCDS82 E----QTIENIKVGLHEKELWKKFHEAGTEMIITKAGRRMFPSYKVKVTGMNPKTKYILL
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CCDS82 IDIVPADDHRYK--FCDNKWMVAGKAEPAMPGRLYVHPDSPATGAHWMRQLVSFQKLKLT
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CCDS82 NNHLDPFGHIILNSMHKYQPRLHIVKAD---ENNAFGSKNTAFCTHVFPETSFISVTSYQ
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CCDS82 NHKITQLKIENNPFAKGFRGSDDSDLRVARLQSKEYPVISKSIMRQRLISPQLSATPDVG
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.. . . :. :: : .. :. : : . :. : : . :: .:
CCDS82 PLLGTHQALQHYQHENGAHSQLAEPQDLPLSTFPTQRDSSLFYHCLKRRADGTRHLDLPC
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CCDS82 KR-SYLEAPSSVGEDHYFRSPPPYDQQMLSPSYCSEVTPREACMYSGSGPEIAGVSGVDD
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CCDS82 LPPPPLSCNMWTSVSPYTSYSVQTMETVPYQPFPTHFTATTMMPRLPTLSAQSSQPPGNA
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CCDS34 APR--VDLQGAELWKRFHEIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKISGLDPHQQYYIAMDIVPVD
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CCDS34 NKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSPASGETWMRQVISFDKLKLTNNELDDQ
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CCDS34 GHIILHSMHKYQPRVHVIRKDCGDDLSPIKPVPSGEGVKAFSFPETVFTTVTAYQNQQIT
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240 250 260 270 280
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CCDS34 RLKIDRNPFAKGFRDSGRNRMGLEALVESYAFWRPSLRTLTFEDIPGIPKQGNAS-SSTL
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CCDS34 LQGTGNGVPATHPHLLSGSSCSSPAF---HLGPNTSQLCSLAPADYSACARSGLTLNRYS
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CCDS34 TSLAETYNRLTNQAGETFAPPRTPSYVGVSSSTSVNMSMGGTDGDTFSCPQTSLSMQISG
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CCDS11 MREPALAASAMAYHPFHAPRPADFPMSAFLAAAQPSFFPALALP-PGALA--KP-LPDPG
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40 50 60 70
pF1KE0 PSGPCTSSTGAQAVAEP----TGQGPKNPRVSRVT---------------VQLEMKPLWE
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CCDS11 LAGAAAAAAAAAAAAEAGLHVSALGPHPPAAHLRSLKSLEPEDEVEDDPKVTLEAKELWD
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80 90 100 110 120 130
pF1KE0 EFNQLGTEMIVTKAGRRMFPPFQVKILGMDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLV
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CCDS11 QFHKLGTEMVITKSGRRMFPPFKVRVSGLDKKAKYILLMDIVAADDCRYK--FHNSRWMV
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140 150 160 170 180 190
pF1KE0 AGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQIVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRF
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CCDS11 AGKADPEMPKRMYIHPDSPATGEQWMAKPVAFHKLKLTNNISDKHGFTILNSMHKYQPRF
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200 210 220 230 240 250
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CCDS11 HIVRAN---DILKLPYSTFRTYVFPETDFIAVTAYQNDKITQLKIDNNPFAKGFR--DTG
240 250 260 270 280
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CCDS11 NGRREKRKQLTLP-----SLR--LYEEHCKPERDGAESDASSCDPPPARE----PPTSPG
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CCDS11 AAPSPLR------LHRARAEEKSCAADSDPEPERLSEERAGAPLGRSPAPDSASPTRLTE
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pF1KE0 VCLGPGQDSQ
CCDS11 PERARERRSPERGKEPAESGGDGPFGLRSLEKERAEARRKDEGRKEAAEGKEQGLAPLVV
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CCDS81 WEEKGLDLSMEALSPAGPLGDTEDAAAHGLEPHPDSEQSTGSDSEVLTERTS--CSFSTH
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CCDS81 TDLASGAAGPVPAAMSSMEEIQVELQCADLWKRFHDIGTEMIITKAGRRMFPAMRVKITG
100 110 120 130 140 150
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pF1KE0 MDSLADYALLMDFIPLDDKRYRYAFHSSAWLVAGKADPATPGRVHFHPDSPAKGAQWMRQ
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CCDS81 LDPHQQYYIAMDIVPVDNKRYRYVYHSSKWMVAGNADSPVPPRVYIHPDSLASGDTWMRQ
160 170 180 190 200 210
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pF1KE0 IVSFDKLKLTNNLLDDNGHIILNSMHRYQPRFHVVFVDPRKD----SERYAQENFKSFIF
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CCDS81 VVSFDKLKLTNNELDDQGHIILHSMHKYQPRVHVIRKDFSSDLSPTKPVPVGDGVKTFNF
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CCDS81 PETVFTTVTAYQNQQITRLKIDRNPFAKGFRDSGRNRTGLEAIMETYAFWRPPVRTLTFE
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CCDS81 DFTTMQKQQGGSTGTSPTTSSTGTPSPSASSHLLSPSCSPPTFHLAPNTFNVGCRESQLC
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CCDS81 NLNLSDYPPCARSNMAALQSYPGLSDSGYNRLQSGTTSATQPSETFMPQRTPSLISGIPT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]