Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0842
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0842, 389 aa
1>>>pF1KE0842 389 - 389 aa - 389 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7772+/-0.000728; mu= 12.0757+/- 0.044
mean_var=151.7608+/-36.143, 0's: 0 Z-trim(114.4): 252 B-trim: 1739 in 2/50
Lambda= 0.104110
statistics sampled from 14569 (15008) to 14569 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.767), E-opt: 0.2 (0.461), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 ( 389) 2602 402.1 4.5e-112
CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 ( 388) 608 102.6 6.4e-22
CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 ( 387) 539 92.2 8.4e-19
CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 ( 418) 515 88.7 1.1e-17
CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 ( 391) 514 88.5 1.1e-17
CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 ( 364) 497 85.9 6.4e-17
CCDS11691.1 SSTR2 gene_id:6752|Hs108|chr17 ( 369) 489 84.7 1.5e-16
CCDS329.1 OPRD1 gene_id:4985|Hs108|chr1 ( 372) 488 84.6 1.7e-16
CCDS43517.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 418) 467 81.4 1.6e-15
CCDS13958.1 GALR3 gene_id:8484|Hs108|chr22 ( 368) 459 80.2 3.4e-15
CCDS55069.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 389) 459 80.2 3.5e-15
CCDS47508.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 392) 459 80.2 3.5e-15
CCDS47505.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 397) 459 80.2 3.6e-15
CCDS55070.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 400) 459 80.2 3.6e-15
CCDS47506.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 403) 459 80.2 3.6e-15
CCDS47504.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 406) 459 80.2 3.6e-15
CCDS47507.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 420) 459 80.2 3.7e-15
CCDS43518.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 446) 459 80.3 3.9e-15
CCDS47503.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 493) 459 80.3 4.2e-15
CCDS6151.1 NPBWR1 gene_id:2831|Hs108|chr8 ( 328) 446 78.2 1.2e-14
CCDS12012.1 GALR1 gene_id:2587|Hs108|chr18 ( 349) 433 76.3 4.9e-14
CCDS13556.1 OPRL1 gene_id:4987|Hs108|chr20 ( 370) 431 76.0 6.3e-14
CCDS6152.1 OPRK1 gene_id:4986|Hs108|chr8 ( 380) 405 72.1 9.5e-13
CCDS9626.1 LTB4R gene_id:1241|Hs108|chr14 ( 352) 402 71.6 1.2e-12
CCDS13557.1 NPBWR2 gene_id:2832|Hs108|chr20 ( 333) 401 71.4 1.3e-12
CCDS14004.1 MCHR1 gene_id:2847|Hs108|chr22 ( 422) 399 71.2 1.9e-12
CCDS2408.1 CXCR2 gene_id:3579|Hs108|chr2 ( 360) 380 68.3 1.2e-11
CCDS2148.1 GPR17 gene_id:2840|Hs108|chr2 ( 367) 379 68.2 1.4e-11
CCDS2684.1 CCR8 gene_id:1237|Hs108|chr3 ( 355) 372 67.1 2.8e-11
CCDS14398.1 P2RY4 gene_id:5030|Hs108|chrX ( 365) 371 67.0 3.2e-11
CCDS55068.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 319) 369 66.6 3.6e-11
CCDS55071.1 OPRM1 gene_id:4988|Hs108|chr6 ( 300) 368 66.4 3.8e-11
CCDS2516.1 ACKR3 gene_id:57007|Hs108|chr2 ( 362) 367 66.4 4.8e-11
CCDS11435.1 CCR10 gene_id:2826|Hs108|chr17 ( 362) 366 66.2 5.4e-11
>>CCDS11810.1 UTS2R gene_id:2837|Hs108|chr17 (389 aa)
initn: 2602 init1: 2602 opt: 2602 Z-score: 2125.6 bits: 402.1 E(32554): 4.5e-112
Smith-Waterman score: 2602; 100.0% identity (100.0% similar) in 389 aa overlap (1-389:1-389)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGGPNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTLLSA
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CCDS11 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGGPNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTLLSA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSIPFIVATYVTKEWHFGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSIPFIVATYVTKEWHFGD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLDTVQRPKGYRKLLALGTWLLALLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLDTVQRPKGYRKLLALGTWLLALLL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TLPVMLAMRLVRRGPKSLCLPAWGPRAHRAYLTLLFATSIAGPGLLIGLLYARLARAYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TLPVMLAMRLVRRGPKSLCLPAWGPRAHRAYLTLLFATSIAGPGLLIGLLYARLARAYRR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SQRASFKRARRPGARALRLVLGIVLLFWACFLPFWLWQLLAQYHQAPLAPRTARIVNYLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQRASFKRARRPGARALRLVLGIVLLFWACFLPFWLWQLLAQYHQAPLAPRTARIVNYLT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRGPGSGGGRGPVPSLQPRARFQRCSGRSLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 TCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRGPGSGGGRGPVPSLQPRARFQRCSGRSLS
310 320 330 340 350 360
370 380
pF1KE0 SCSPQPTDSLVLAPAAPARPAPEGPRAPA
:::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SCSPQPTDSLVLAPAAPARPAPEGPRAPA
370 380
>>CCDS42856.1 SSTR4 gene_id:6754|Hs108|chr20 (388 aa)
initn: 489 init1: 305 opt: 608 Z-score: 507.0 bits: 102.6 E(32554): 6.4e-22
Smith-Waterman score: 614; 33.6% identity (60.9% similar) in 381 aa overlap (24-379:8-377)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGGPNATLNSSWASP----TEPSSLEDLVA------
:::: .. :...: : . :. :. ::
CCDS42 MSAPSTLPPGGEEG-LGTAWPSAANASSAPAEAEEAVAGPGDAR
10 20 30 40
60 70 80 90 100
pF1KE0 -TGTIGT--LLSAMGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSIPFI
.: .. . . . .::.:::: .. : : . .. .:..:::.:: :..::.::.
CCDS42 AAGMVAIQCIYALVCLVGLVGNALVIFVILRYAKMKTATNIYLLNLAVADELFMLSVPFV
50 60 70 80 90 100
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 VATYVTKEWHFGDVGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLD--TVQRPKGY
... . ..: ::.: ::.....: :.: .:.: :::.: .::.::..:: : .::.
CCDS42 ASSAALRHWPFGSVLCRAVLSVDGLNMFTSVFCLTVLSVDRYVAVVHPLRAATYRRPS-V
110 120 130 140 150 160
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 RKLLALGTWLLALLLTLPVML--AMRLVRRGPKSLCLPAWG-PRAHRAYLTLLFATSIAG
::. ::.:: .::.:::. . : .: : : : : .... : ..
CCDS42 AKLINLGVWLASLLVTLPIAIFADTRPARGGQAVACNLQWPHPAWSAVFVVYTFLLGFLL
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 PGLLIGLLYARLARAYRR-SQRASFKRARRPGARALRLVLGIVLLFWACFLPFWLWQLLA
: : ::: : .. .: . ::.... :: . :::: .:..: :..::.. :::
CCDS42 PVLAIGLCYLLIVGKMRAVALRAGWQQRRRSEKKITRLVLMVVVVFVLCWMPFYVVQLLN
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330
pF1KE0 QYHQAPLAPRTARIVNYLTTCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRG------PGS
. . : ::... :.:.::::::.:: .:. :.: .. :: :.
CCDS42 LFVTSLDAT-----VNHVSLILSYANSCANPILYGFLSDNFRRFFQ-RVLCLRCCLLEGA
290 300 310 320 330
340 350 360 370 380
pF1KE0 GGGRGPVPSLQPRARFQRCSGRSLSSCSPQPTDSLVLAPAAPARPAPEGPRAPA
::.. : :. : . .: . : : : .. .: : :.:
CCDS42 GGAE-EEP-LDYYATALKSKGGAGCMCPPLPCQQEALQPE-PGRKRIPLTRTTTF
340 350 360 370 380
>>CCDS11739.1 GALR2 gene_id:8811|Hs108|chr17 (387 aa)
initn: 340 init1: 164 opt: 539 Z-score: 451.0 bits: 92.2 E(32554): 8.4e-19
Smith-Waterman score: 539; 33.3% identity (60.3% similar) in 345 aa overlap (54-388:28-361)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 PPGGPNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTLLSAMGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAV
. :.. . .::.:::. .:.: :. .::
CCDS11 MNVSGCPGAGNASQAGGGGGWHPEAVIVPLLFALIFLVGTVGNTLVLAVLLRGGQAV
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 ASMYVYVVNLALADLLYLLS-IPFIVATYVTKEWHFGDVGCRVLFGLDFLTMHASIFTLT
.. ....::..::: ..: .:: .. :. : ::.. :... : ::::::: :::.
CCDS11 STTNLFILNLGVADLCFILCCVPFQATIYTLDGWVFGSLLCKAVHFLIFLTMHASSFTLA
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 VMSSERYAAVLRPLDTVQRPKGYRKLLALGT-WLLALLLTLPVMLAMRLVRRGPKSLCLP
..: .:: :. :: . . : :.: : :.::.. : . .: . . ..: :
CCDS11 AVSLDRYLAIRYPLHSRELRTPRNALAAIGLIWGLSLLFSGPYLSYYRQSQLANLTVCHP
120 130 140 150 160 170
210 220 230 240 250
pF1KE0 AWGPRAHRAYLTLLFATSIAGPGLLIGLLYARLARAYRRS--QRASFKRARRPGARALRL
::. .::. :. : : :..:: ::: : :. :. . ::: .. :.
CCDS11 AWSAPRRRAMDICTFVFSYLLPVLVLGLTYARTLRYLWRAVDPVAAGSGARRAKRKVTRM
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 VLGIVLLFWACFLPFWLWQLLAQYHQAPLAPRTARIVNYLTTCLTYGNSCANPFLYTLLT
.: .. :: :..: : . . : ::. :.. . :. ..:.:::.::..:.:..
CCDS11 ILIVAALFCLCWMPHHALILCVWFGQFPLT-RATYALRILSHLVSYANSCVNPIVYALVS
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 RNYRDHLR----GRV-RGPGSGGGRGPVPSLQPRARFQRCSGRSLSSCSPQPTDSLVLAP
...: .: : . :.:: ..:: . :: . :: : : .: : ..
CCDS11 KHFRKGFRTICAGLLGRAPGRASGR-----VCAAARGTH-SGSVLERES---SDLLHMSE
300 310 320 330 340
380
pF1KE0 AAPA-RPAPEGPRAPA
:: : :: : : :
CCDS11 AAGALRPCP-GASQPCILEPCPGPSWQGPKAGDSILTVDVA
350 360 370 380
>>CCDS13944.1 SSTR3 gene_id:6753|Hs108|chr22 (418 aa)
initn: 442 init1: 257 opt: 515 Z-score: 431.1 bits: 88.7 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 515; 32.2% identity (62.6% similar) in 345 aa overlap (15-347:8-344)
10 20 30 40 50
pF1KE0 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGG---PNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTL
... .: :: .. :.:::.. :.:. :..: ...:.. :
CCDS13 MDMLHPSSVSTTSEPENASSAWPPDATLGNVSAGPS-PAGL---AVSGVLIPL
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KE0 LS-AMGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSIPFIVATYVTKEW
. .. :::..::. .. :. : . . ::..:::::: :..:..::..: . . :
CCDS13 VYLVVCVVGLLGNSLVIYVVLRHTASPSVTNVYILNLALADELFMLGLPFLAAQNALSYW
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 HFGDVGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLDTVQ-RPKGYRKLLALGTWL
::.. ::.....: ... .::: ::::: .:: ::..: ... : . .. ..:.
CCDS13 PFGSLMCRLVMAVDGINQFTSIFCLTVMSVDRYLAVVHPTRSARWRTAPVARTVSAAVWV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 LALLLTLPVMLAMRLVRRGPKSLCLPAWG-PRAH-RA-YLTLLFATSIAGPGLLIGLLY-
. ...:::.. . : :: : : : : : :: .. : .. :: :.: : :
CCDS13 ASAVVVLPVVV-FSGVPRG-MSTCHMQWPEPAAAWRAGFIIYTAALGFFGPLLVICLCYL
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280
pF1KE0 ---ARLARAYRRSQRASFKRARRPGARALRLVLGIVLLFWACFLPFWLWQLLAQYHQAPL
... : :: : .: :: :. :.:...: :: :..::.. ... :
CCDS13 LIVVKVRSAGRRVWAPSCQRRRRSERRVTRMVVAVVALFVLCWMPFYVLNIVNVVCPLPE
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 APRTARIVNYLTTCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRGPGSGGGRGPVPSLQPR
: . .:.. : :.::::::.:: .:. ... .: :: : :. :.. :
CCDS13 EPAFFGLY-FLVVALPYANSCANPILYGFLSYRFKQGFR-RVLLRPSRRVRSQEPTVGPP
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380
pF1KE0 ARFQRCSGRSLSSCSPQPTDSLVLAPAAPARPAPEGPRAPA
CCDS13 EKTEEEDEEEEDGEESREGGKGKEMNGRVSQITQPGTSGQERPPSRVASKEQQLLPQEAS
350 360 370 380 390 400
>>CCDS9666.1 SSTR1 gene_id:6751|Hs108|chr14 (391 aa)
initn: 406 init1: 269 opt: 514 Z-score: 430.6 bits: 88.5 E(32554): 1.1e-17
Smith-Waterman score: 519; 30.1% identity (61.9% similar) in 336 aa overlap (11-323:2-331)
10 20 30 40
pF1KE0 MALTPESPSSFP-GLAATGSSVPEP-PG---------GPNATLNSSWASPTEPSSLEDLV
:: : :.. :: : : :: ::.: .. : . .: . .
CCDS96 MFPNGTASSPSSSPSPSPGSCGEGGGSRGPGAGAADGMEEPGRNASQNGTL
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 ATGT-----IGTLLSAMGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSI
. : :. . :.. .::. ::.... : : . .. .:..:::.:: : .::.
CCDS96 SEGQGSAILISFIYSVVCLVGLCGNSMVIYVILRYAKMKTATNIYILNLAIADELLMLSV
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 PFIVATYVTKEWHFGDVGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLDTVQ--RP
::.:.. . ..: :: . ::.....: ..: .::. :::.: .::.::..:. ... ::
CCDS96 PFLVTSTLLRHWPFGALLCRLVLSVDAVNMFTSIYCLTVLSVDRYVAVVHPIKAARYRRP
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 KGYRKLLALGTWLLALLLTLPVMLAMRLVRRGPKSLCLPAWGPR-AHRAYLTLLFATSIA
:.. ::.:.:.::. ::... : . . .. :. :.: . ... : .
CCDS96 T-VAKVVNLGVWVLSLLVILPIVVFSRTAANSDGTVACNMLMPEPAQRWLVGFVLYTFLM
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KE0 GPGLLIG---LLYARLARAYRR-SQRASFKRARRPGARALRLVLGIVLLFWACFLPFWLW
: : .: : :. . .: . .:.... .: . .:. .:..: :..::..
CCDS96 GFLLPVGAICLCYVLIIAKMRMVALKAGWQQRKRSERKITLMVMMVVMVFVICWMPFYVV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 QLLAQYHQAPLAPRTARIVNYLTTCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRGPGSGG
::. . : . :. :.. : :.::::::.:: .:. :..
CCDS96 QLVNVF-----AEQDDATVSQLSVILGYANSCANPILYGFLSDNFKRSFQRILCLSWMDN
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380
pF1KE0 GRGPVPSLQPRARFQRCSGRSLSSCSPQPTDSLVLAPAAPARPAPEGPRAPA
CCDS96 AAEEPVDYYATALKSRAYSVEDFQPENLESGGVFRNGTCTSRITTL
350 360 370 380 390
>>CCDS10429.1 SSTR5 gene_id:6755|Hs108|chr16 (364 aa)
initn: 382 init1: 278 opt: 497 Z-score: 417.2 bits: 85.9 E(32554): 6.4e-17
Smith-Waterman score: 512; 31.5% identity (62.8% similar) in 352 aa overlap (3-348:1-336)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MALTPESPSSFPGLAATGSSVPEPPGGPNATLNSSWASPTEPSSLEDLVATGTIGTLLSA
. : :.: :. :.. .. :: : :: ..:. ::. : . .. :. :
CCDS10 MEPLFPASTPSWNASSPGAASG-GGDNRTL----VGPA-PSAGARAVLVPVLYLLVCA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 MGVVGVVGNAYTLVVTCRSLRAVASMYVYVVNLALADLLYLLSIPFIVATYVTKEWHFGD
:. : ::. .. :. : . . .:..:::.::.::.:..::... ... : ::
CCDS10 AGL-G--GNTLVIYVVLRFAKMKTVTNIYILNLAVADVLYMLGLPFLATQNAASFWPFGP
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KE0 VGCRVLFGLDFLTMHASIFTLTVMSSERYAAVLRPLDTVQ--RPKGYRKLLALGTWLLAL
: ::... :: ... .:.: ::::: .:: ::..::.... ::. :: . ..:.:.:
CCDS10 VLCRLVMTLDGVNQFTSVFCLTVMSVDRYLAVVHPLSSARWRRPR-VAKLASAAAWVLSL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
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..:: .:.. :..: . : .: . .... :.. : : :.: : : ..
CCDS10 CMSLP-LLVFADVQEG--GTCNASWPEPVGLWGAVFIIYTAVLGFFAPLLVICLCYLLIV
170 180 190 200 210 220
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: . :.. : :: .. :.:: .::.: .:.:::. ... : : .:
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pF1KE0 IVNYLTTCLTYGNSCANPFLYTLLTRNYRDHLRGRVRGPGSGGGRGPVPSLQPRARFQRC
. .... :.:.:::::: :: .:. :.:. .. .: .:.: . . .::
CCDS10 LY-FFVVILSYANSCANPVLYGFLSDNFRQSFQ-KVLCLRKGSGAKDADATEPRPDRIRQ
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360 370 380
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CCDS10 QQEATPPAHRAAANGLMQTSKL
350 360
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. ..:. ::. .. : : . . .:..:::.:: :..:..::.. . .: ::
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:. ::.:. ..: . : .: : : .. : ... : : : : .: : :
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. . : :.. .. .. .. :.: .: .: :.:::..... . .:
CCDS11 IIIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPAL
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. ..... :::.::::::.::..:. :.. ... :. :. :. : : ..
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:... .
CCDS11 RLNETTETQRTLLNGDLQTSI
350 360
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: :: : .. :. : : :.:: .: : .:. :. . : :. ..
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::: : ...:.:
CCDS32 SFSRAREATARER-VTACTPSDGPGGGAAA
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CCDS43 TSSNIEQQNSTRIRQNTRDHPSTANTVDRTNHQPPLAVSMAQIFTRYPPPTHREKTCNDY
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CCDS43 MKR
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CCDS13 MADAQNISLDSPGSVGAVAVPVVFALIFLLGTVGNGLVLAVLLQ
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]