Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0732
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0732, 420 aa
1>>>pF1KE0732 420 - 420 aa - 420 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.6828+/-0.000901; mu= 9.0160+/- 0.054
mean_var=215.7421+/-45.485, 0's: 0 Z-trim(113.6): 96 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.087319
statistics sampled from 14152 (14252) to 14152 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.761), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 2.500
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3593.1 HNRNPDL gene_id:9987|Hs108|chr4 ( 420) 2873 374.4 1.1e-103
CCDS75153.1 HNRNPDL gene_id:9987|Hs108|chr4 ( 363) 2305 302.8 3.6e-82
CCDS3591.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 ( 336) 1263 171.5 1.1e-42
CCDS34309.1 HNRNPAB gene_id:3182|Hs108|chr5 ( 332) 1205 164.2 1.7e-40
CCDS3592.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 ( 355) 1205 164.2 1.8e-40
CCDS34310.1 HNRNPAB gene_id:3182|Hs108|chr5 ( 285) 1016 140.3 2.3e-33
CCDS3590.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 ( 306) 988 136.8 2.8e-32
CCDS43557.1 HNRNPA2B1 gene_id:3181|Hs108|chr7 ( 353) 669 96.7 3.8e-20
CCDS5397.1 HNRNPA2B1 gene_id:3181|Hs108|chr7 ( 341) 667 96.4 4.5e-20
CCDS31980.1 HNRNPA1L2 gene_id:144983|Hs108|chr13 ( 320) 662 95.7 6.6e-20
CCDS2273.1 HNRNPA3 gene_id:220988|Hs108|chr2 ( 378) 661 95.7 8.1e-20
CCDS82536.1 HNRNPA3 gene_id:220988|Hs108|chr2 ( 356) 659 95.4 9.3e-20
CCDS44909.1 HNRNPA1 gene_id:3178|Hs108|chr12 ( 372) 659 95.4 9.5e-20
CCDS41793.1 HNRNPA1 gene_id:3178|Hs108|chr12 ( 320) 648 94.0 2.3e-19
CCDS11596.1 MSI2 gene_id:124540|Hs108|chr17 ( 328) 623 90.8 2e-18
CCDS82168.1 MSI2 gene_id:124540|Hs108|chr17 ( 324) 594 87.2 2.5e-17
CCDS4193.1 HNRNPA0 gene_id:10949|Hs108|chr5 ( 305) 588 86.4 4.1e-17
CCDS11597.1 MSI2 gene_id:124540|Hs108|chr17 ( 251) 581 85.4 6.6e-17
CCDS9196.1 MSI1 gene_id:4440|Hs108|chr12 ( 362) 550 81.7 1.3e-15
>>CCDS3593.1 HNRNPDL gene_id:9987|Hs108|chr4 (420 aa)
initn: 2873 init1: 2873 opt: 2873 Z-score: 1974.7 bits: 374.4 E(32554): 1.1e-103
Smith-Waterman score: 2873; 100.0% identity (100.0% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-420)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLASRSLSHWRPRPPRQLAPLLPSLAPSSARQGARRAQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLASRSLSHWRPRPPRQLAPLLPSLAPSSARQGARRAQRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VTAQQPSRLAGGAAIKGGRRRRPDLFRRHFKSSSIQRSAAAAAATRTARQHPPADSSVTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VTAQQPSRLAGGAAIKGGRRRRPDLFRRHFKSSSIQRSAAAAAATRTARQHPPADSSVTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 GKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGN
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
370 380 390 400 410 420
>>CCDS75153.1 HNRNPDL gene_id:9987|Hs108|chr4 (363 aa)
initn: 2627 init1: 2294 opt: 2305 Z-score: 1588.8 bits: 302.8 E(32554): 3.6e-82
Smith-Waterman score: 2319; 86.4% identity (86.4% similar) in 420 aa overlap (1-420:1-363)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLASRSLSHWRPRPPRQLAPLLPSLAPSSARQGARRAQRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 MEVPPRLSHVPPPLFPSAPATLASRSLSHWRPRPPRQLAPLLPSLAPSSARQGARRAQRH
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VTAQQPSRLAGGAAIKGGRRRRPDLFRRHFKSSSIQRSAAAAAATRTARQHPPADSSVTM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 VTAQQPSRLAGGAAIKGGRRRRPDLFRRHFKSSSIQRSAAAAAATRTARQHPPADSSVTM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 EDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 EDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 TDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 SPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 GKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQ------------------
310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 YNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
:::::::::::::::::::::
CCDS75 ---------------------------------------QSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
350 360
>>CCDS3591.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 (336 aa)
initn: 1480 init1: 1022 opt: 1263 Z-score: 879.8 bits: 171.5 E(32554): 1.1e-42
Smith-Waterman score: 1360; 69.8% identity (88.9% similar) in 288 aa overlap (133-420:63-336)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AATRTARQHPPADSSVTMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKK
.::.::.::::..:.::::::::::::.::
CCDS35 ATQGAAAAAGSGAGTGGGTASGGTEGGSAESEGAKIDASKNEEDEGKMFIGGLSWDTTKK
40 50 60 70 80 90
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKR
:: .:.:.::::::::.: ::.:::::::::::::.. :::::.. :::::.::.:::::
CCDS35 DLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVDKVMDQKEHKLNGKVIDPKR
100 110 120 130 140 150
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYT
:::.: ::: ::.::::::::: ::.:.::::.:::.:.::::::.:::.::::::::.
CCDS35 AKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIELPMDNKTNKRRGFCFITFK
160 170 180 190 200 210
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 DEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQ
.::::::..:..::..: .:::::::. :: : ::::: :.::. :: : .:::: :
CCDS35 EEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQY--QQQQQWGSRGGFAG-R--ARGRGGGP
220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQST
.::::::..::..:::::: .:.. :.:.::::::::::: . :::: :::.:::
CCDS35 SQNWNQGYSNYWNQGYGNY--GYNS-QGYGGYGGYDYTGYN-NYYGYG----DYSNQQSG
270 280 290 300 310
410 420
pF1KE0 YGKASRGGGNHQNNYQPY
:::.:: :: :::.:.::
CCDS35 YGKVSRRGG-HQNSYKPY
320 330
>>CCDS34309.1 HNRNPAB gene_id:3182|Hs108|chr5 (332 aa)
initn: 1188 init1: 557 opt: 1205 Z-score: 840.3 bits: 164.2 E(32554): 1.7e-40
Smith-Waterman score: 1287; 66.2% identity (85.2% similar) in 290 aa overlap (133-420:55-332)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AATRTARQHPPADSSVTMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKK
:::..::::::..: ::::.::::::::::
CCDS34 EGESPAGAGTGAAAGAGGATAAPPSGNQNGAEGDQINASKNEEDAGKMFVGGLSWDTSKK
30 40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKR
:: .:...:::::::::: :: :::::::::.::::::::.:::. :::.:::..::::.
CCDS34 DLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDAASVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKK
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYT
: :.: :.: ::.:::::.:...::.:.:::: ::::: :::::: : :.:::: :::.
CCDS34 AMAMK-KDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKLNKRRGFVFITFK
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 DEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAA-GGRG-GTRGRGR
.::::::.::...: ....::::::::::::: :::: .:::: :.:: : : :
CCDS34 EEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVY-QQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGGG
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQ
::.:.::::..::..:::: :...:: :::::::. :.: :::: :: ::: .
CCDS34 GQSQSWNQGYGNYWNQGYG-YQQGYG-----PGYGGYDYSPYGY--YGYGPGY-DYSQGS
270 280 290 300 310
410 420
pF1KE0 STYGKASRGGGNHQNNYQPY
..:::..: :: :::::.::
CCDS34 TNYGKSQRRGG-HQNNYKPY
320 330
>>CCDS3592.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 (355 aa)
initn: 1420 init1: 962 opt: 1205 Z-score: 840.0 bits: 164.2 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1312; 65.5% identity (83.4% similar) in 307 aa overlap (133-420:63-355)
110 120 130 140
pF1KE0 AATRTARQHPPADSSVTMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDG--------------
.::.::.::::..:.:
CCDS35 ATQGAAAAAGSGAGTGGGTASGGTEGGSAESEGAKIDASKNEEDEGHSNSSPRHSEAATA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 -----KMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVD
:::::::::::.:::: .:.:.::::::::.: ::.:::::::::::::.. :::
CCDS35 QREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 KVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIE
::.. :::::.::.::::::::.: ::: ::.::::::::: ::.:.::::.:::.:.::
CCDS35 KVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIE
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 LPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKG
::::.:::.::::::::. .::::::..:..::..: .:::::::. :: : ::::: :
CCDS35 LPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQY--QQQQQWG
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 GRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYN
.::. :: : .:::: : .::::::..::..:::::: .:.. :.:.:::::::::::
CCDS35 SRGGFAG-R--ARGRGGGPSQNWNQGYSNYWNQGYGNY--GYNS-QGYGGYGGYDYTGYN
280 290 300 310 320
390 400 410 420
pF1KE0 YGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
. :::: :::.::: :::.:: :: :::.:.::
CCDS35 -NYYGYG----DYSNQQSGYGKVSRRGG-HQNSYKPY
330 340 350
>>CCDS34310.1 HNRNPAB gene_id:3182|Hs108|chr5 (285 aa)
initn: 986 init1: 513 opt: 1016 Z-score: 712.4 bits: 140.3 E(32554): 2.3e-33
Smith-Waterman score: 1016; 65.0% identity (83.8% similar) in 234 aa overlap (133-365:55-282)
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 AATRTARQHPPADSSVTMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDGKMFIGGLSWDTSKK
:::..::::::..: ::::.::::::::::
CCDS34 EGESPAGAGTGAAAGAGGATAAPPSGNQNGAEGDQINASKNEEDAGKMFVGGLSWDTSKK
30 40 50 60 70 80
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 DLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKR
:: .:...:::::::::: :: :::::::::.::::::::.:::. :::.:::..::::.
CCDS34 DLKDYFTKFGEVVDCTIKMDPNTGRSRGFGFILFKDAASVEKVLDQKEHRLDGRVIDPKK
90 100 110 120 130 140
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 AKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFITYT
: :.: :.: ::.:::::.:...::.:.:::: ::::: :::::: : :.:::: :::.
CCDS34 AMAMK-KDPVKKIFVGGLNPEATEEKIREYFGEFGEIEAIELPMDPKLNKRRGFVFITFK
150 160 170 180 190 200
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 DEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKGGRGAAAGGRGGTRGRGRGQ
.::::::.::...: ....::::::::::::: :::: .:::: : :. : : :
CCDS34 EEEPVKKVLEKKFHTVSGSKCEIKVAQPKEVY-QQQQYGSGGRGNRNRGNRGSGGGGGGG
210 220 230 240 250 260
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 GQNWNQGFNNY-YDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYNYGNYGYGQGYADYSGQQS
:: : .:: .: :.... :
CCDS34 GQ----GSTNYGKSQRRGGHQNNYKPY
270 280
>>CCDS3590.1 HNRNPD gene_id:3184|Hs108|chr4 (306 aa)
initn: 1107 init1: 934 opt: 988 Z-score: 693.0 bits: 136.8 E(32554): 2.8e-32
Smith-Waterman score: 1007; 60.8% identity (80.4% similar) in 250 aa overlap (133-363:63-302)
110 120 130 140
pF1KE0 AATRTARQHPPADSSVTMEDMNEYSNIEEFAEGSKINASKNQQDDG--------------
.::.::.::::..:.:
CCDS35 ATQGAAAAAGSGAGTGGGTASGGTEGGSAESEGAKIDASKNEEDEGHSNSSPRHSEAATA
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 -----KMFIGGLSWDTSKKDLTEYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVD
:::::::::::.:::: .:.:.::::::::.: ::.:::::::::::::.. :::
CCDS35 QREEWKMFIGGLSWDTTKKDLKDYFSKFGEVVDCTLKLDPITGRSRGFGFVLFKESESVD
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 KVLELKEHKLDGKLIDPKRAKALKGKEPPKKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIE
::.. :::::.::.::::::::.: ::: ::.::::::::: ::.:.::::.:::.:.::
CCDS35 KVMDQKEHKLNGKVIDPKRAKAMKTKEPVKKIFVGGLSPDTPEEKIREYFGGFGEVESIE
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 LPMDTKTNERRGFCFITYTDEEPVKKLLESRYHQIGSGKCEIKVAQPKEVYRQQQQQQKG
::::.:::.::::::::. .::::::..:..::..: .:::::::. :: :.::::
CCDS35 LPMDNKTNKRRGFCFITFKEEEPVKKIMEKKYHNVGLSKCEIKVAMSKEQYQQQQQW---
220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 GRGAAAGGRGGTRGRGRGQGQNWNQGFNNYYDQGYGNYNSAYGGDQNYSGYGGYDYTGYN
:.::: ::.::.: . ..:... .: :. ::
CCDS35 ------GSRGGFAGRARGRGGDQQSGYGKVSRRG-GHQNSYKPY
270 280 290 300
390 400 410 420
pF1KE0 YGNYGYGQGYADYSGQQSTYGKASRGGGNHQNNYQPY
>>CCDS43557.1 HNRNPA2B1 gene_id:3181|Hs108|chr7 (353 aa)
initn: 354 init1: 306 opt: 669 Z-score: 475.1 bits: 96.7 E(32554): 3.8e-20
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CCDS43 GGPYGGGNYGPGGSGGSGGYGGRSRY
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>>CCDS5397.1 HNRNPA2B1 gene_id:3181|Hs108|chr7 (341 aa)
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CCDS53 VMRDPASKRSRGFGFVTFSSMAEVDAAMAARPHSIDGRVVEPKRAVAREESGKPGAHVTV
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CCDS53 KKLFVGGIKEDTEEHHLRDYFEEYGKIDTIEIITDRQSGKKRGFGFVTFDDHDPVDKIVL
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CCDS53 SDGYGSGRGFGDGYNGYGGGPGGGNFGGS--PGYGGGRGGYGGGGPGYGNQGGGYGGGYD
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CCDS53 NYGGGNYGSGNYNDFGNYNQQPSNYGPMKSGNFGGSRNMGGPYGGGNYGPGGSGGSGGYG
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>>CCDS31980.1 HNRNPA1L2 gene_id:144983|Hs108|chr13 (320 aa)
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CCDS31 MSKSASPKEPEQLRKLFIGGLSFETTDESLR
10 20 30
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 EYLSRFGEVVDCTIKTDPVTGRSRGFGFVLFKDAASVDKVLELKEHKLDGKLIDPKRAKA
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CCDS31 SHFEQWGTLTDCVVMRDPNTKRSRGFGFVTYATVEEVDAAMNTTPHKVDGRVVEPKRAVS
40 50 60 70 80 90
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pF1KE0 LKGKEPP------KKVFVGGLSPDTSEEQIKEYFGAFGEIENIELPMDTKTNERRGFCFI
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CCDS31 REDSQRPGAHLTVKKIFVGGIKEDTEEHHLRDYFEQYGKIEVIEIMTDRGSGKKRGFAFV
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CCDS31 TFDDHDSVDKIVIQKYHTVKGHNCEVRKALPKQEMASASSSQRGRRGS--GNFGGGRGDG
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CCDS31 FGGNDNFGRGGNFSGRGGFGGSCGGGGYGGSGD--GYNGFGNDGSNFGGGGSYNDFGNYN
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CCDS31 NQSSNFGPM-KGGNFGGRSSGPYGGGGQYFAKPQNQGGYGVSSSSSSYGSGRRF
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]