FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0718, 414 aa
1>>>pF1KE0718 414 - 414 aa - 414 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.5563+/-0.000939; mu= 3.2381+/- 0.056
mean_var=232.4043+/-51.500, 0's: 0 Z-trim(113.6): 630 B-trim: 182 in 1/50
Lambda= 0.084130
statistics sampled from 13442 (14207) to 13442 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.436), width: 16
Scan time: 3.400
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 ( 414) 2720 342.9 3.3e-94
CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 ( 372) 1230 162.0 8.5e-40
CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 ( 454) 856 116.7 4.5e-26
CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 ( 370) 852 116.1 5.5e-26
CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430) 857 117.3 9.5e-26
CCDS76861.1 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 478) 726 100.9 2.6e-21
CCDS10723.2 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 ( 819) 726 101.2 3.9e-21
CCDS13191.1 MYLK2 gene_id:85366|Hs108|chr20 ( 596) 721 100.4 4.7e-21
CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 ( 388) 699 97.6 2.2e-20
CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845) 699 98.2 6.8e-20
CCDS46896.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1914) 699 98.2 7e-20
CCDS3028.1 KALRN gene_id:8997|Hs108|chr3 (1289) 685 96.4 1.7e-19
CCDS54421.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (26926) 663 94.9 9.7e-18
CCDS54423.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27051) 663 94.9 9.7e-18
CCDS54422.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (27118) 663 94.9 9.7e-18
CCDS54424.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (33423) 663 95.0 1.1e-17
CCDS74610.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (34350) 663 95.0 1.2e-17
CCDS59435.1 TTN gene_id:7273|Hs108|chr2 (35991) 663 95.0 1.2e-17
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 617 87.6 2.1e-17
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 617 87.6 2.2e-17
CCDS3883.1 TRIO gene_id:7204|Hs108|chr5 (3097) 633 90.4 2.5e-17
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 608 86.6 5.4e-17
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 608 86.6 5.4e-17
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 608 86.6 5.5e-17
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 608 86.6 5.5e-17
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 608 86.6 5.6e-17
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 608 86.6 5.6e-17
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 607 86.5 6e-17
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 607 86.5 6.3e-17
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 606 86.4 6.4e-17
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 607 86.5 6.4e-17
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 607 86.6 6.6e-17
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 604 86.2 8e-17
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 604 86.2 8.2e-17
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 591 84.5 2.1e-16
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 588 84.1 2.4e-16
CCDS6240.1 PSKH2 gene_id:85481|Hs108|chr8 ( 385) 586 83.9 3e-16
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 583 83.6 4.4e-16
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 581 83.3 4.8e-16
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 582 83.5 4.8e-16
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 582 83.5 4.9e-16
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 574 82.6 1.2e-15
CCDS42824.1 SPEG gene_id:10290|Hs108|chr2 (3267) 580 84.0 2.3e-15
CCDS58065.1 OBSCN gene_id:84033|Hs108|chr1 (7968) 584 84.8 3.1e-15
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 563 81.3 3.4e-15
CCDS59204.1 OBSCN gene_id:84033|Hs108|chr1 (8923) 584 84.9 3.4e-15
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 563 81.4 3.4e-15
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 557 80.4 3.8e-15
CCDS5525.1 PHKG1 gene_id:5260|Hs108|chr7 ( 387) 554 80.0 4.4e-15
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 552 79.8 6e-15
>>CCDS5470.1 STK17A gene_id:9263|Hs108|chr7 (414 aa)
initn: 2720 init1: 2720 opt: 2720 Z-score: 1804.7 bits: 342.9 E(32554): 3.3e-94
Smith-Waterman score: 2720; 99.8% identity (100.0% similar) in 414 aa overlap (1-414:1-414)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYS
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 LCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPW
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 VINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 DVVHLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DVVHLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 SMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 LLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410
pF1KE0 TEESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TKESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
370 380 390 400 410
>>CCDS2315.1 STK17B gene_id:9262|Hs108|chr2 (372 aa)
initn: 1259 init1: 1202 opt: 1230 Z-score: 828.0 bits: 162.0 E(32554): 8.5e-40
Smith-Waterman score: 1247; 54.1% identity (77.2% similar) in 377 aa overlap (41-413:13-367)
20 30 40 50 60
pF1KE0 GSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAV-VRTEPFQDGYSLCPGRELGR
:::: . .. : :.. : : ..::::
CCDS23 MSRRRFDCRSISGLLTTTPQIPIKMENFNNFYILT-SKELGR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYE
:::::::.::.:..:.:.::::..:::.::::: ::.:::::::::.. : :::::::::
CCDS23 GKFAVVRQCISKSTGQEYAAKFLKKRRRGQDCRAEILHEIAVLELAKSCPRVINLHEVYE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 TASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKP
..::.::.::::::::::. :. . : .:.:: ::..::::::..:: ..:::::::
CCDS23 NTSEIILILEYAAGGEIFSLCLPELAEMVSENDVIRLIKQILEGVYYLHQNNIVHLDLKP
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 QNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSI
:::::.: :::::::::::.:: . .. :::::::::::.:::::.::::. :::::.:
CCDS23 QNILLSSIYPLGDIKIVDFGMSRKIGHACELREIMGTPEYLAPEILNYDPITTATDMWNI
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 GVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDR
:...:..:: :::.:.:.:::.:::::.:..:::: :. .:. :.:::..::::.:: :
CCDS23 GIIAYMLLTHTSPFVGEDNQETYLNISQVNVDYSEETFSSVSQLATDFIQSLLVKNPEKR
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 ATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEE
::: ::.: :: : .. : :. :.. ... . ::: .. :.:: .
CCDS23 PTAEICLSHSWLQQWDF-ENLFHPEET--SSSSQTQDHSVRSSEDKTSKSSCN-------
290 300 310 320 330
370 380 390 400 410
pF1KE0 LIVVTSYTLGQCRQSE-KEKMEQKA--ISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
: : . : ::.. . . .::::.:.. : : :..
CCDS23 ---------GTCGDREDKENIPEDSSMVSKRFRFDDSL--PNPHELVSDLLC
340 350 360 370
>>CCDS12116.1 DAPK3 gene_id:1613|Hs108|chr19 (454 aa)
initn: 880 init1: 454 opt: 856 Z-score: 581.5 bits: 116.7 E(32554): 4.5e-26
Smith-Waterman score: 865; 41.4% identity (73.4% similar) in 338 aa overlap (51-369:5-337)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 GRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKCIK
: : .: : . :.::: :.::.:::: .
CCDS12 MSTFRQEDVEDHYEM--GEELGSGQFAIVRKCRQ
10 20 30
90 100 110 120 130
pF1KE0 KDSGKEFAAKFMRKRRKGQD----CRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETASEMIL
: .:::.::::..::: ... : :: .:. .:. . .: .:.::...:. ....:
CCDS12 KGTGKEYAAKFIKKRRLSSSRRGVSREEIEREVNILREIR-HPNIITLHDIFENKTDVVL
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 VLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILLTS
.:: ..:::.:: .:..: .. : .. ....:::.:::.::.. ..:.::::.::.: .
CCDS12 ILELVSGGELFD-FLAEKE-SLTEDEATQFLKQILDGVHYLHSKRIAHFDLKPENIMLLD
100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 ES-PLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYV
.. : ::..:::... .. ..:...:.::::.:::::..:.:... .:::::::.::.
CCDS12 KNVPNPRIKLIDFGIAHKIEAGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVITYI
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 MLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAEEC
.:.: :::::. ::::. ::: .: ...:: :. :: : :::: :::: :. : : .
CCDS12 LLSGASPFLGETKQETLTNISAVNYDFDEEYFSNTSELAKDFIRRLLVKDPKRRMTIAQS
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360
pF1KE0 LKHPWLT---------QSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHS-VPEINSDTD----KSET
:.: :. ..: ..: : :. . . ..:: .: :: .: ..
CCDS12 LEHSWIKAIRRRNVRGEDSGRKPERRRLKTTRLKEYTIKSHSSLPPNNSYADFERFSKVL
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410
pF1KE0 EESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
::. ..::
CCDS12 EEAAAAEEGLRELQRSRRLCHEDVEALAAIYEEKEAWYREESDSLGQDLRRLRQELLKTE
330 340 350 360 370 380
>>CCDS10188.1 DAPK2 gene_id:23604|Hs108|chr15 (370 aa)
initn: 831 init1: 468 opt: 852 Z-score: 580.0 bits: 116.1 E(32554): 5.5e-26
Smith-Waterman score: 852; 44.0% identity (77.7% similar) in 300 aa overlap (53-341:12-305)
30 40 50 60 70
pF1KE0 AGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQ-----DGYSLCPGRELGRGKFAVVRK
:::. : :.. :.::: :.::.:.:
CCDS10 MFQASMRSPNMEPFKQQKVEDFYDI--GEELGSGQFAIVKK
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 CIKKDSGKEFAAKFMRKR-----RKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETAS
: .:..: :.::::..:: :.: . : :: .:...:. . . ::.::.:::. .
CCDS10 CREKSTGLEYAAKFIKKRQSRASRRGVS-REEIEREVSILRQVLHHN-VITLHDVYENRT
40 50 60 70 80 90
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 EMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNI
...:.:: ..:::.:: ..:...:... ...:::.::..:::. ..:.::::.::
CCDS10 DVVLILELVSGGELFD--FLAQKESLSEEEATSFIKQILDGVNYLHTKKIAHFDLKPENI
100 110 120 130 140 150
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 LLTSES-PLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGV
.: ... :. ::..::::.. .... :...:.::::.:::::..:.:... .:::::::
CCDS10 MLLDKNIPIPHIKLIDFGLAHEIEDGVEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGV
160 170 180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 LTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRAT
.::..:.: :::::. ::::. ::. .. ...:: :. :: : :::: ::::. . : :
CCDS10 ITYILLSGASPFLGDTKQETLANITAVSYDFDEEFFSQTSELAKDFIRKLLVKETRKRLT
220 230 240 250 260 270
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 AEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEELI
.: :.:::.: . :. : :.... :
CCDS10 IQEALRHPWITPVDNQQAMVRRESVVNLENFRKQYVRRRWKLSFSIVSLCNHLTRSLMKK
280 290 300 310 320 330
>>CCDS43842.1 DAPK1 gene_id:1612|Hs108|chr9 (1430 aa)
initn: 717 init1: 469 opt: 857 Z-score: 575.7 bits: 117.3 E(32554): 9.5e-26
Smith-Waterman score: 857; 45.2% identity (76.9% similar) in 294 aa overlap (49-337:3-291)
20 30 40 50 60 70
pF1KE0 GSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKC
: : : .: :. :.::: :.::::.::
CCDS43 MTVFRQENVDDYYDT--GEELGSGQFAVVKKC
10 20 30
80 90 100 110 120 130
pF1KE0 IKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQD----CRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETASEM
.:..: ..::::..::: .. : .: .:...:. : .: ::.::::::. ...
CCDS43 REKSTGLQYAAKFIKKRRTKSSRRGVSREDIEREVSILKEIQ-HPNVITLHEVYENKTDV
40 50 60 70 80
140 150 160 170 180 190
pF1KE0 ILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILL
::.:: .::::.:: .:..: .. :... ....:::.::..::. ...:.::::.::.:
CCDS43 ILILELVAGGELFD-FLAEKE-SLTEEEATEFLKQILNGVYYLHSLQIAHFDLKPENIML
90 100 110 120 130 140
200 210 220 230 240 250
pF1KE0 TSES-PLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLT
... : :::.::::.. . ..:...:.::::.:::::..:.:... .:::::::.:
CCDS43 LDRNVPKPRIKIIDFGLAHKIDFGNEFKNIFGTPEFVAPEIVNYEPLGLEADMWSIGVIT
150 160 170 180 190 200
260 270 280 290 300 310
pF1KE0 YVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAE
:..:.: :::::. ::::. :.: .: . .: :. : : :::: :::: :. : : .
CCDS43 YILLSGASPFLGDTKQETLANVSAVNYEFEDEYFSNTSALAKDFIRRLLVKDPKKRMTIQ
210 220 230 240 250 260
320 330 340 350 360 370
pF1KE0 ECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEELIVV
. :.:::. .. :. : .:.
CCDS43 DSLQHPWIKPKDTQQALSRKASAVNMEKFKKFAARKKWKQSVRLISLCQRLSRSFLSRSN
270 280 290 300 310 320
>>CCDS76861.1 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 (478 aa)
initn: 686 init1: 396 opt: 726 Z-score: 495.9 bits: 100.9 E(32554): 2.6e-21
Smith-Waterman score: 727; 40.1% identity (69.3% similar) in 309 aa overlap (14-321:137-429)
10 20 30 40
pF1KE0 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLL
::: .:: :. :: : . : .
CCDS76 GKSPGAGNPEPEQDCAARAPVRAEAVRRMPPGAEAGSVV----LDDSPAPPAPFEHRVV-
110 120 130 140 150 160
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRM
:. .. :: .: . :: :.:. :..: .:..: .:::.. : ....: :
CCDS76 -----SVKETSISAGYEVCQHEVLGGGRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKII-KVKSAKD-RE
170 180 190 200 210
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EIIHEIAVL-ELAQDNPWVINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKD
.. .:: .. .:.. : .:.:....:. ::.::. :::.::. ..:.. . : :
CCDS76 DVKNEINIMNQLSHVN--LIQLYDAFESKHSCTLVMEYVDGGELFDR-ITDEKYHLTELD
220 230 240 250 260 270
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELRE
: . ::: ::::.:: . ..::::::.::: .... .:::.::::.: : :.:.
CCDS76 VVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENILCVNQTG-HQIKIIDFGLARRYKPREKLKV
280 290 300 310 320 330
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 IMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSY
.::::..:::...:. .:. :::::.::.::..:.:.:::::. ::. : . . ..
CCDS76 NFGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDF
340 350 360 370 380 390
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANA
. . :. ::: : ::. ::::. : .: .:::: ::
CCDS76 DADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQ
400 410 420 430 440 450
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 LQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEE
CCDS76 KYIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP
460 470
>>CCDS10723.2 MYLK3 gene_id:91807|Hs108|chr16 (819 aa)
initn: 616 init1: 396 opt: 726 Z-score: 492.9 bits: 101.2 E(32554): 3.9e-21
Smith-Waterman score: 727; 40.1% identity (69.3% similar) in 309 aa overlap (14-321:478-770)
10 20 30 40
pF1KE0 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLL
::: .:: :. :: : . : .
CCDS10 GKSPGAGNPEPEQDCAARAPVRAEAVRRMPPGAEAGSVV----LDDSPAPPAPFEHRVV-
450 460 470 480 490 500
50 60 70 80 90 100
pF1KE0 TEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRM
:. .. :: .: . :: :.:. :..: .:..: .:::.. : ....: :
CCDS10 -----SVKETSISAGYEVCQHEVLGGGRFGQVHRCTEKSTGLPLAAKII-KVKSAKD-RE
510 520 530 540 550
110 120 130 140 150 160
pF1KE0 EIIHEIAVL-ELAQDNPWVINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKD
.. .:: .. .:.. : .:.:....:. ::.::. :::.::. ..:.. . : :
CCDS10 DVKNEINIMNQLSHVN--LIQLYDAFESKHSCTLVMEYVDGGELFDR-ITDEKYHLTELD
560 570 580 590 600 610
170 180 190 200 210 220
pF1KE0 VQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELRE
: . ::: ::::.:: . ..::::::.::: .... .:::.::::.: : :.:.
CCDS10 VVLFTRQICEGVHYLHQHYILHLDLKPENILCVNQTG-HQIKIIDFGLARRYKPREKLKV
620 630 640 650 660 670
230 240 250 260 270 280
pF1KE0 IMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSY
.::::..:::...:. .:. :::::.::.::..:.:.:::::. ::. : . . ..
CCDS10 NFGTPEFLAPEVVNYEFVSFPTDMWSVGVITYMLLSGLSPFLGETDAETMNFIVNCSWDF
680 690 700 710 720 730
290 300 310 320 330 340
pF1KE0 SEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANA
. . :. ::: : ::. ::::. : .: .:::: ::
CCDS10 DADTFEGLSEEAKDFVSRLLVKEKSCRMSATQCLKHEWLNNLPAKASRSKTRLKSQLLLQ
740 750 760 770 780 790
350 360 370 380 390 400
pF1KE0 LQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEE
CCDS10 KYIAQRKWKKHFYVVTAANRLRKFPTSP
800 810
>>CCDS13191.1 MYLK2 gene_id:85366|Hs108|chr20 (596 aa)
initn: 651 init1: 423 opt: 721 Z-score: 491.4 bits: 100.4 E(32554): 4.7e-21
Smith-Waterman score: 732; 38.5% identity (69.4% similar) in 317 aa overlap (31-345:260-562)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MIPLEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYS
: ::: : . .. .:: .. .:
CCDS13 FQAVPSEKSEVGQALCLTAREEDCFQILDDCPPPPAPFPHRMVE-----LRTGNVSSEFS
230 240 250 260 270 280
70 80 90 100 110
pF1KE0 LCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVL-ELAQDNP
. . :: :::..: :..: .: ..::: ..:. .: .: .. :: :. .: . :
CCDS13 MNSKEALGGGKFGAVCTCMEKATGLKLAAKVIKKQTP-KDKEM-VLLEIEVMNQLNHRN-
290 300 310 320 330 340
120 130 140 150 160 170
pF1KE0 WVINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHT
.:.:. . :: :..: .:: :::.:.. ..:.. . : :.. ..::: .:. :.:
CCDS13 -LIQLYAAIETPHEIVLFMEYIEGGELFER-IVDEDYHLTEVDTMVFVRQICDGILFMHK
350 360 370 380 390
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 RDVVHLDLKPQNILLTSESPLGD-IKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYD
:.::::::.::: .. . : .::.::::.: . .:.:. .::::...::...::
CCDS13 MRVLHLDLKPENILCVNTT--GHLVKIIDFGLARRYNPNEKLKVNFGTPEFLSPEVVNYD
400 410 420 430 440 450
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 PISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFI
:: :::::.::.::..:.:.:::::.: ::. :. . : ..:: :...:. : ::.
CCDS13 QISDKTDMWSMGVITYMLLSGLSPFLGDDDTETLNNVLSGNWYFDEETFEAVSDEAKDFV
460 470 480 490 500 510
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 RTLLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDK
.:.:: . : .: .:: :::: ... : . : .. :. :..
CCDS13 SNLIVKDQRARMNAAQCLAHPWL--NNLAEKAKRCNRRLKSQILLKKYLMKRRWKKNFIA
520 530 540 550 560 570
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 SETEESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQKAISKRFKFEEPLLQEIPGEFIY
CCDS13 VSAANRFKKISSSGALMALGV
580 590
>>CCDS34330.1 MYLK4 gene_id:340156|Hs108|chr6 (388 aa)
initn: 630 init1: 411 opt: 699 Z-score: 479.4 bits: 97.6 E(32554): 2.2e-20
Smith-Waterman score: 708; 39.1% identity (71.4% similar) in 294 aa overlap (34-327:84-367)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 LEKPGSGGSSPGATSGSGRAGRGLSGPCRPPPPPQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYSLCP
:: : . ..: ...: . : :..
CCDS34 AKEVWSNADLTERMPVKSKRTSALAVDIPAPPAPFDHRIVTAKQGAVNS--F---YTVSK
60 70 80 90 100
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 GRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRRKGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPWVIN
. :: :.:. :.:: . .: ..:::... : :. . :. .::.:.. :. .:.
CCDS34 TEILGGGRFGQVHKCEETATGLKLAAKIIKTR--GMKDKEEVKNEISVMN-QLDHANLIQ
110 120 130 140 150 160
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 LHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREEAFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVV
:....:. ....::.::. :::.::. . :. . : :. .:.:: ::.. .: ..
CCDS34 LYDAFESKNDIVLVMEYVDGGELFDR-IIDESYNLTELDTILFMKQICEGIRHMHQMYIL
170 180 190 200 210 220
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 HLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKNSEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMA
::::::.::: .... .:::.::::.: : :.:. .::::..:::...:: .:.
CCDS34 HLDLKPENILCVNRDA-KQIKIIDFGLARRYKPREKLKVNFGTPEFLAPEVVNYDFVSFP
230 240 250 260 270 280
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 TDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNISQMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLV
:::::.::..:..:.:.:::::.. ::. :: . .:::. .:: : .:: ::.
CCDS34 TDMWSVGVIAYMLLSGLSPFLGDNDAETLNNILACRWDLEDEEFQDISEEAKEFISKLLI
290 300 310 320 330 340
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 KKPEDRATAEECLKHPWLTQSSIQEPSFRMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSETEE
:. : .: : ::::::.. ...
CCDS34 KEKSWRISASEALKHPWLSDHKLHSRLNAQKKKNRGSDAQDFVTK
350 360 370 380
>>CCDS43141.1 MYLK gene_id:4638|Hs108|chr3 (1845 aa)
initn: 629 init1: 441 opt: 699 Z-score: 470.6 bits: 98.2 E(32554): 6.8e-20
Smith-Waterman score: 699; 36.1% identity (73.5% similar) in 291 aa overlap (67-352:1401-1686)
40 50 60 70 80 90
pF1KE0 PQARGLLTEIRAVVRTEPFQDGYSLCPGRELGRGKFAVVRKCIKKDSGKEFAAKFMRKRR
:: :::. : . ..: . : .:.::..
CCDS43 DDEKEPEVDYRTVTINTEQKVSDFYDIEERLGSGKFGQVFRLVEKKTRKVWAGKFFKAYS
1380 1390 1400 1410 1420 1430
100 110 120 130 140 150
pF1KE0 KGQDCRMEIIHEIAVLELAQDNPWVINLHEVYETASEMILVLEYAAGGEIFDQCVADREE
. . .: .::.... . .: ... ...: .....::: ..:::.:.. . :..
CCDS43 AKE--KENIRQEISIMNCLH-HPKLVQCVDAFEEKANIVMVLEIVSGGELFER-IIDEDF
1440 1450 1460 1470 1480
160 170 180 190 200 210
pF1KE0 AFKEKDVQRLMRQILEGVHFLHTRDVVHLDLKPQNILLTSESPLGDIKIVDFGLSRILKN
. :.. . :::: :::...: . .:::::::.::. .... ::..::::.: :.:
CCDS43 ELTERECIKYMRQISEGVEYIHKQGIVHLDLKPENIMCVNKTGT-RIKLIDFGLARRLEN
1490 1500 1510 1520 1530 1540
220 230 240 250 260 270
pF1KE0 SEELREIMGTPEYVAPEILSYDPISMATDMWSIGVLTYVMLTGISPFLGNDKQETFLNIS
. :. ..::::.::::...:.::..:::::::::. :....:.:::.:.. .::. :..
CCDS43 AGSLKVLFGTPEFVAPEVINYEPIGYATDMWSIGVICYILVSGLSPFMGDNDNETLANVT
1550 1560 1570 1580 1590 1600
280 290 300 310 320 330
pF1KE0 QMNLSYSEEEFDVLSESAVDFIRTLLVKKPEDRATAEECLKHPWLTQSS--IQEPSF---
. . ....: :: .:..: ::: .:: : ..: .::.:::: ... .. ..
CCDS43 SATWDFDDEAFDEISDDAKDFISNLLKKDMKNRLDCTQCLQHPWLMKDTKNMEAKKLSKD
1610 1620 1630 1640 1650 1660
340 350 360 370 380 390
pF1KE0 RMEKALEEANALQEGHSVPEINSDTDKSETEESIVTEELIVVTSYTLGQCRQSEKEKMEQ
::.: . . . . :..: :
CCDS43 RMKKYMARRKWQKTGNAVRAIGRLSSMAMISGLSGRKSSTGSPTSPLNAEKLESEEDVSQ
1670 1680 1690 1700 1710 1720
414 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 05:49:59 2016 done: Sun Nov 6 05:49:59 2016
Total Scan time: 3.400 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]