Result of FASTA (ccds) for
pFN21AE0500
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KE0500, 725 aa
1>>>pF1KE0500 725 - 725 aa - 725 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.1583+/- 0.001; mu= 11.8129+/- 0.060
mean_var=115.3033+/-23.729, 0's: 0 Z-trim(107.2): 80 B-trim: 453 in 2/52
Lambda= 0.119441
statistics sampled from 9364 (9444) to 9364 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.649), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 3.130
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 725) 4706 822.4 0
CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 ( 671) 4354 761.7 0
CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 686) 2024 360.2 5.9e-99
CCDS3980.2 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 706) 2024 360.2 6.1e-99
CCDS47216.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 ( 744) 2022 359.9 8.1e-99
CCDS32685.1 KIF2B gene_id:84643|Hs108|chr17 ( 673) 1750 313.0 9.5e-85
CCDS6551.2 KIF24 gene_id:347240|Hs108|chr9 (1368) 1133 206.8 1.8e-52
CCDS32718.2 KIF19 gene_id:124602|Hs108|chr17 ( 998) 640 121.8 5e-27
CCDS75295.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 702) 614 117.3 8.3e-26
CCDS34235.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 699) 612 116.9 1.1e-25
CCDS75296.1 KIF3A gene_id:11127|Hs108|chr5 ( 726) 597 114.3 6.5e-25
CCDS44079.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1028) 590 113.2 2e-24
CCDS213.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 (1029) 590 113.2 2e-24
CCDS14401.1 KIF4A gene_id:24137|Hs108|chrX (1232) 588 112.9 3e-24
CCDS47324.1 KIF4B gene_id:285643|Hs108|chr5 (1234) 572 110.1 2e-23
CCDS13200.1 KIF3B gene_id:9371|Hs108|chr20 ( 747) 562 108.3 4.4e-23
CCDS74586.1 KIF5C gene_id:3800|Hs108|chr2 ( 957) 537 104.1 1.1e-21
CCDS7171.1 KIF5B gene_id:3799|Hs108|chr10 ( 963) 524 101.8 5.1e-21
CCDS8945.1 KIF5A gene_id:3798|Hs108|chr12 (1032) 522 101.5 6.9e-21
CCDS45494.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 687) 516 100.4 9.9e-21
CCDS81988.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 724) 516 100.4 1e-20
CCDS45493.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 826) 516 100.4 1.2e-20
CCDS10789.2 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 833) 516 100.4 1.2e-20
CCDS81989.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 848) 516 100.4 1.2e-20
CCDS2751.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 725) 507 98.8 3e-20
CCDS2752.1 KIF9 gene_id:64147|Hs108|chr3 ( 790) 507 98.8 3.3e-20
CCDS81987.1 KIFC3 gene_id:3801|Hs108|chr16 ( 684) 505 98.5 3.7e-20
CCDS68768.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2580) 483 95.0 1.6e-18
CCDS34042.1 CENPE gene_id:1062|Hs108|chr4 (2701) 483 95.0 1.6e-18
CCDS7867.1 KIF18A gene_id:81930|Hs108|chr11 ( 898) 474 93.2 1.9e-18
CCDS58555.1 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 833) 471 92.7 2.5e-18
CCDS45709.2 KIF18B gene_id:146909|Hs108|chr17 ( 852) 471 92.7 2.6e-18
CCDS10653.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 665) 462 91.1 6.1e-18
CCDS58444.1 KIF22 gene_id:3835|Hs108|chr16 ( 597) 448 88.6 3e-17
CCDS46561.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1690) 444 88.1 1.2e-16
CCDS58757.1 KIF1A gene_id:547|Hs108|chr2 (1791) 444 88.2 1.2e-16
CCDS72722.1 KIF17 gene_id:57576|Hs108|chr1 ( 929) 420 83.9 1.2e-15
CCDS82598.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1266) 420 84.0 1.6e-15
CCDS13122.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1317) 420 84.0 1.7e-15
CCDS56178.1 KIF16B gene_id:55614|Hs108|chr20 (1392) 420 84.0 1.7e-15
CCDS112.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1153) 387 78.2 7.6e-14
CCDS65072.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1304) 386 78.1 9.5e-14
CCDS65071.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1335) 386 78.1 9.7e-14
CCDS6665.1 KIF27 gene_id:55582|Hs108|chr9 (1401) 386 78.1 1e-13
CCDS111.1 KIF1B gene_id:23095|Hs108|chr1 (1770) 387 78.3 1.1e-13
CCDS1719.1 KIF3C gene_id:3797|Hs108|chr2 ( 793) 362 73.9 1.1e-12
CCDS53935.1 STARD9 gene_id:57519|Hs108|chr15 (4700) 373 76.1 1.3e-12
CCDS4844.1 KIF6 gene_id:221458|Hs108|chr6 ( 814) 353 72.3 3.3e-12
CCDS32325.2 KIF7 gene_id:374654|Hs108|chr15 (1343) 356 72.9 3.5e-12
CCDS30963.1 KIF14 gene_id:9928|Hs108|chr1 (1648) 353 72.5 6e-12
>>CCDS512.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 (725 aa)
initn: 4706 init1: 4706 opt: 4706 Z-score: 4387.3 bits: 822.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4706; 100.0% identity (100.0% similar) in 725 aa overlap (1-725:1-725)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAMDSSLQARLFPGLAIKIQRSNGLIHSANVRTVNLEKSCVSVEWAEGGATKGKEIDFDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 MAMDSSLQARLFPGLAIKIQRSNGLIHSANVRTVNLEKSCVSVEWAEGGATKGKEIDFDD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAAINPELLQLLPLHPKDNLPLQENVTIQKQKRRSVNSKIPAPKESLRSRSTRMSTVSEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VAAINPELLQLLPLHPKDNLPLQENVTIQKQKRRSVNSKIPAPKESLRSRSTRMSTVSEL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KE0 RITAQENDMEVELPAAANSRKQFSVPPAPTRPSCPAVAEIPLRMVSEEMEEQVHSIRGSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 RITAQENDMEVELPAAANSRKQFSVPPAPTRPSCPAVAEIPLRMVSEEMEEQVHSIRGSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KE0 SANPVNSVRRKSCLVKEVEKMKNKREEKKAQNSEMRMKRAQEYDSSFPNWEFARMIKEFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 SANPVNSVRRKSCLVKEVEKMKNKREEKKAQNSEMRMKRAQEYDSSFPNWEFARMIKEFR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KE0 ATLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRKRPLNKQELAKKEIDVISIPSKCLLLVHEPKLKVDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ATLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRKRPLNKQELAKKEIDVISIPSKCLLLVHEPKLKVDL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KE0 TKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVYRFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHTMGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 TKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVYRFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHTMGG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KE0 DLSGKAQNASKGIYAMASRDVFLLKNQPCYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKAKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 DLSGKAQNASKGIYAMASRDVFLLKNQPCYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKAKLR
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KE0 VLEDGKQQVQVVGLQEHLVNSADDVIKMIDMGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQIILRA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 VLEDGKQQVQVVGLQEHLVNSADDVIKMIDMGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQIILRA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KE0 KGRMHGKFSLVDLAGNERGADTSSADRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHTPFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 KGRMHGKFSLVDLAGNERGADTSSADRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHTPFR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KE0 ESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGEQLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 ESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGEQLI
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KE0 QMETEEMEACSNGALIPGNLSKEEEELSSQMSSFNEAMTQIRELEEKAMEELKEIIQQGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 QMETEEMEACSNGALIPGNLSKEEEELSSQMSSFNEAMTQIRELEEKAMEELKEIIQQGP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 DWLELSEMTEQPDYDLETFVNKAESALAQQAKHFSALRDVIKALRLAMQLEEQASRQISS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS51 DWLELSEMTEQPDYDLETFVNKAESALAQQAKHFSALRDVIKALRLAMQLEEQASRQISS
670 680 690 700 710 720
pF1KE0 KKRPQ
:::::
CCDS51 KKRPQ
>>CCDS72774.1 KIF2C gene_id:11004|Hs108|chr1 (671 aa)
initn: 4354 init1: 4354 opt: 4354 Z-score: 4060.0 bits: 761.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4354; 100.0% identity (100.0% similar) in 670 aa overlap (56-725:2-671)
30 40 50 60 70 80
pF1KE0 IHSANVRTVNLEKSCVSVEWAEGGATKGKEIDFDDVAAINPELLQLLPLHPKDNLPLQEN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MIDFDDVAAINPELLQLLPLHPKDNLPLQEN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KE0 VTIQKQKRRSVNSKIPAPKESLRSRSTRMSTVSELRITAQENDMEVELPAAANSRKQFSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VTIQKQKRRSVNSKIPAPKESLRSRSTRMSTVSELRITAQENDMEVELPAAANSRKQFSV
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KE0 PPAPTRPSCPAVAEIPLRMVSEEMEEQVHSIRGSSSANPVNSVRRKSCLVKEVEKMKNKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PPAPTRPSCPAVAEIPLRMVSEEMEEQVHSIRGSSSANPVNSVRRKSCLVKEVEKMKNKR
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KE0 EEKKAQNSEMRMKRAQEYDSSFPNWEFARMIKEFRATLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EEKKAQNSEMRMKRAQEYDSSFPNWEFARMIKEFRATLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRK
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KE0 RPLNKQELAKKEIDVISIPSKCLLLVHEPKLKVDLTKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RPLNKQELAKKEIDVISIPSKCLLLVHEPKLKVDLTKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVY
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KE0 RFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHTMGGDLSGKAQNASKGIYAMASRDVFLLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 RFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHTMGGDLSGKAQNASKGIYAMASRDVFLLK
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KE0 NQPCYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKAKLRVLEDGKQQVQVVGLQEHLVNSADDV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NQPCYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKAKLRVLEDGKQQVQVVGLQEHLVNSADDV
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KE0 IKMIDMGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQIILRAKGRMHGKFSLVDLAGNERGADTSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IKMIDMGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQIILRAKGRMHGKFSLVDLAGNERGADTSSA
400 410 420 430 440 450
510 520 530 540 550 560
pF1KE0 DRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHTPFRESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHTPFRESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATI
460 470 480 490 500 510
570 580 590 600 610 620
pF1KE0 SPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGEQLIQMETEEMEACSNGALIPGNLSKEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 SPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGEQLIQMETEEMEACSNGALIPGNLSKEEE
520 530 540 550 560 570
630 640 650 660 670 680
pF1KE0 ELSSQMSSFNEAMTQIRELEEKAMEELKEIIQQGPDWLELSEMTEQPDYDLETFVNKAES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ELSSQMSSFNEAMTQIRELEEKAMEELKEIIQQGPDWLELSEMTEQPDYDLETFVNKAES
580 590 600 610 620 630
690 700 710 720
pF1KE0 ALAQQAKHFSALRDVIKALRLAMQLEEQASRQISSKKRPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ALAQQAKHFSALRDVIKALRLAMQLEEQASRQISSKKRPQ
640 650 660 670
>>CCDS58949.1 KIF2A gene_id:3796|Hs108|chr5 (686 aa)
initn: 2434 init1: 2013 opt: 2024 Z-score: 1890.0 bits: 360.2 E(32554): 5.9e-99
Smith-Waterman score: 2374; 54.6% identity (76.8% similar) in 720 aa overlap (24-725:2-684)
10 20 30 40 50 60
pF1KE0 MAMDSSLQARLFPGLAIKIQRSNGLIHSANVRTVNLEKSCVSVEWAEGGATKGKEIDFDD
: ::.: : ..: .. :.::: :.: :::::::...
CCDS58 MGRIHQAMVTSLNEDNESVTVEWIENGDTKGKEIDLES
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KE0 VAAINPELLQLLPLHPKDNLPLQENVTIQKQKRRSVNSKIPAPKESLRSRSTRMSTVSEL
. ..::.:. ..:. . : : : : . . :..
CCDS58 IFSLNPDLVPDEEIEPSPETP-------------------PPPASSAKVNK----IVKNR
40 50 60 70
130 140 150 160 170
pF1KE0 RITAQ-ENDMEVELPAAANSRKQFSVPPAPTRPSCPAVAEIPLRMVSEEMEEQVHSIRGS
: .:. .:: : . ..: : : .::: ..: . : ... .: .:
CCDS58 RTVASIKND-----PPSRDNR---VVGSARARPS-----QFPEQSSSAQQNGSVSDISPV
80 90 100 110 120
180 190 200 210 220 230
pF1KE0 SSANPV--NSVRRKSCLVKEVEKMKNKREEKKAQNSEMRMKRAQEYDSSFPNWEFARMIK
..:. :::: ::::::...:::... :..:.: ::::. :.. ::.:. ::.
CCDS58 QAAKKEFGPPSRRKSNCVKEVEKLQEKREKRRLQQQELREKRAQDVDATNPNYEIMCMIR
130 140 150 160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KE0 EFRATLECHPLTMTDPIEEHRICVCVRKRPLNKQELAKKEIDVISIPSKCLLLVHEPKLK
.::..:. .::: .:::.:::::::::::::::.: :..:::.:::: ...::::: :
CCDS58 DFRGSLDYRPLTTADPIDEHRICVCVRKRPLNKKETQMKDLDVITIPSKDVVMVHEPKQK
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KE0 VDLTKYLENQAFCFDFAFDETASNEVVYRFTARPLVQTIFEGGKATCFAYGQTGSGKTHT
::::.:::::.: ::.:::..: ::.::::::::::.:::: : ::::::::::::::::
CCDS58 VDLTRYLENQTFRFDYAFDDSAPNEMVYRFTARPLVETIFERGMATCFAYGQTGSGKTHT
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KE0 MGGDLSGKAQNASKGIYAMASRDVFLLKNQPCYRKLGLEVYVTFFEIYNGKLFDLLNKKA
::::.::: :. ::::::.:.:::::. ..: :.:: :.::.::::::.::.:::::.:.
CCDS58 MGGDFSGKNQDCSKGIYALAARDVFLMLKKPNYKKLELQVYATFFEIYSGKVFDLLNRKT
310 320 330 340 350 360
420 430 440 450 460 470
pF1KE0 KLRVLEDGKQQVQVVGLQEHLVNSADDVIKMIDMGSACRTSGQTFANSNSSRSHACFQII
:::::::::::::::::::. :. ..::.:.::.:..::::::: ::..:::::: ::::
CCDS58 KLRVLEDGKQQVQVVGLQEREVKCVEDVLKLIDIGNSCRTSGQTSANAHSSRSHAVFQII
370 380 390 400 410 420
480 490 500 510 520 530
pF1KE0 LRAKGRMHGKFSLVDLAGNERGADTSSADRQTRMEGAEINKSLLALKECIRALGQNKAHT
:: ::..::::::.:::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:: ::
CCDS58 LRRKGKLHGKFSLIDLAGNERGADTSSADRQTRLEGAEINKSLLALKECIRALGRNKPHT
430 440 450 460 470 480
540 550 560 570 580 590
pF1KE0 PFRESKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGISSCEYTLNTLRYADRVKELSPHSGPSGE
::: :::::::::::::::::::::::::::..::: ::::::::.:::::. .:.
CCDS58 PFRASKLTQVLRDSFIGENSRTCMIATISPGMASCENTLNTLRYANRVKELTVDPTAAGD
490 500 510 520 530 540
600 610 620 630 640
pF1KE0 QLIQM-----ETEEMEACSNGALIP--GNLS----KEEEELSSQMSSFNEAMTQIRELEE
: . ...:. . . : .:. ..:::.: :. .:.::..:. :.::
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...:. . ..:.. ::: : ::::. :::....... :. : :. .. ::: .:
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CCDS39 QVVEDHRAVFQESIRWLEDEKALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVK
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710 720
pF1KE0 ALRLAMQLEEQASRQISSKKRPQ
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CCDS39 SFRAALQEEEQASKQINPK-RPRAL
690 700
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CCDS47 ALLEMTEEVDYDVDSYATQLEAILEQKIDILTELRDKVKSFRAALQEEEQASKQINPKRP
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CCDS47 RAL
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CCDS32 EIQKKLKLLLADLHVKSKVE
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CCDS65 ALKECIRALDQEHTHTPFRQSKLTQVLKDSFIG-NAKTCMIANISPSHVATEHTLNTLRY
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CCDS65 ADRVKELKKGIKCCTSVTSRNRTSGNSSPKRIQSSPGALSEDKCSPKKVKLGFQQSLTVA
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CCDS32 ATVFAYGPTGCGKTYTMLGT------DQEPGIYVQTLNDLFRAIEETS-NDMEYEVSMSY
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CCDS32 LEIYNEMIRDLLNPSLGYLELREDSKGVIQVAGITEVSTINAKEIMQLLMKGNRQRTQEP
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CCDS32 TAANQTSSRSHAVLQVTVRQRSRVKNILQEVRQGRLFMIDLAGSERASQTQ--NRGQRMK
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